MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella abortus bv. 1 str. 9-941 chromosome II

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006933	AAAAG	2	10	3050	3059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006933	AGCGG	2	10	21948	21957	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_006933	GGCCT	2	10	37295	37304	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_006933	ATGAA	2	10	39866	39875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006933	TTTGT	2	10	41027	41036	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006933	CGCTC	2	10	43236	43245	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_006933	TGCGG	2	10	60602	60611	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_006933	TATCT	2	10	72855	72864	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_006933	TCGGT	2	10	81516	81525	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_006933	TTCTC	2	10	81545	81554	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_006933	ACTTG	2	10	87074	87083	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006933	CGGTA	2	10	96940	96949	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_006933	CCAAG	2	10	97115	97124	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_006933	ATGAA	2	10	103201	103210	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006933	CTTGC	2	10	107773	107782	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_006933	CCTGC	2	10	112447	112456	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_006933	CGGTG	2	10	114616	114625	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_006933	GCCCG	2	10	115640	115649	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_006933	GCACA	2	10	116655	116664	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_006933	GTTCG	2	10	116676	116685	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_006933	CGATA	2	10	120761	120770	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_006933	GCCCG	2	10	121175	121184	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_006933	AGATA	2	10	133958	133967	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006933	GCCGC	2	10	141064	141073	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_006933	TTGGC	2	10	144598	144607	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_006933	CCGGG	2	10	151748	151757	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_006933	CGGAT	2	10	162354	162363	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_006933	TGGGC	2	10	162485	162494	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_006933	TGTTT	2	10	162938	162947	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006933	CCCGT	2	10	163663	163672	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_006933	GGATA	2	10	190773	190782	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006933	TGACG	2	10	194519	194528	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_006933	AGCAG	2	10	206317	206326	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_006933	TTTTG	2	10	211900	211909	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006933	ATCAA	2	10	212068	212077	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_006933	TGAAA	2	10	212078	212087	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006933	TGAAG	2	10	212524	212533	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006933	TTCGA	2	10	212834	212843	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_006933	CGCCT	2	10	213050	213059	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_006933	CGGGC	2	10	213492	213501	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_006933	TAAGT	2	10	217195	217204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006933	GCGCA	2	10	222132	222141	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_006933	CGCAA	2	10	222771	222780	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_006933	GCGTG	2	10	224815	224824	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_006933	GCCGT	2	10	225779	225788	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_006933	CCAGA	2	10	225808	225817	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_006933	ATCGC	2	10	226408	226417	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_006933	CGGGG	2	10	227831	227840	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
49	NC_006933	TGCCG	2	10	233096	233105	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_006933	ATTGT	2	10	239828	239837	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006933	AAGGG	2	10	243507	243516	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006933	GCGCG	3	15	244943	244957	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_006933	TAGGG	2	10	247270	247279	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006933	GGCCT	2	10	248112	248121	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_006933	TGGTT	2	10	249544	249553	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006933	GGCAT	2	10	254698	254707	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_006933	CTGAA	2	10	254710	254719	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_006933	TTTCG	2	10	261524	261533	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_006933	AGATG	2	10	261650	261659	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006933	CAGGC	2	10	262298	262307	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_006933	CCGGC	3	15	262835	262849	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_006933	GCCCG	2	10	291453	291462	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_006933	TTTGT	2	10	295051	295060	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006933	TATCA	2	10	328395	328404	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_006933	AGGCG	2	10	332973	332982	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_006933	AAACC	2	10	335361	335370	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_006933	CTTTT	2	10	343309	343318	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_006933	AATTG	2	10	348495	348504	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006933	TTGCC	2	10	376187	376196	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_006933	GGTGC	2	10	376626	376635	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_006933	TTCAA	2	10	382109	382118	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_006933	ATGAA	2	10	410545	410554	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006933	GAATG	2	10	412519	412528	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006933	ATGGC	2	10	413610	413619	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_006933	TCCTC	2	10	418240	418249	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_006933	AGGGG	2	10	426567	426576	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006933	TTTGT	2	10	435360	435369	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006933	CGATG	2	10	435476	435485	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_006933	GGCAC	2	10	435576	435585	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_006933	TTTGA	2	10	438835	438844	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006933	ATCGC	2	10	452180	452189	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_006933	TGCGC	2	10	464138	464147	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_006933	CAGGG	2	10	464469	464478	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_006933	GCTTT	2	10	490534	490543	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_006933	CCTGA	2	10	497162	497171	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_006933	CGTAA	2	10	508414	508423	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_006933	GATTA	2	10	513724	513733	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006933	GGTGC	2	10	535173	535182	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_006933	GTCCG	2	10	546774	546783	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_006933	AGCGA	2	10	580783	580792	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_006933	TCGGG	2	10	585851	585860	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_006933	TTTGT	2	10	587300	587309	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006933	CGATG	2	10	594641	594650	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_006933	GGTGC	2	10	598379	598388	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_006933	GGGCA	2	10	599381	599390	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_006933	CAAAA	2	10	599459	599468	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_006933	AAGGC	2	10	609855	609864	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_006933	TGCTC	2	10	611301	611310	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_006933	ATGAA	2	10	615197	615206	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006933	GCAAA	2	10	618031	618040	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_006933	TTTGT	2	10	618492	618501	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006933	TTTGT	2	10	641964	641973	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006933	CCGCT	2	10	644270	644279	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_006933	CGGCA	2	10	667049	667058	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_006933	TGCGA	2	10	682395	682404	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_006933	GGCCG	2	10	703819	703828	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
107	NC_006933	AGCAA	2	10	708332	708341	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_006933	CCAGT	2	10	712825	712834	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_006933	ATTTT	2	10	718626	718635	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006933	CGAGC	2	10	720157	720166	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_006933	GGCTT	2	10	739676	739685	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_006933	TTCCA	2	10	747104	747113	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_006933	GCGAG	2	10	747394	747403	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_006933	GGGAT	2	10	759523	759532	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006933	TCACT	2	10	764102	764111	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_006933	TTGCC	2	10	764709	764718	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_006933	CGGCG	2	10	766995	767004	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
118	NC_006933	GCTGG	2	10	771885	771894	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_006933	TTCCG	2	10	772048	772057	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_006933	GGGCT	2	10	776080	776089	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_006933	ATGCC	2	10	776454	776463	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_006933	TGCGC	2	10	782099	782108	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_006933	CGATC	2	10	798376	798385	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_006933	GCTTG	2	10	798484	798493	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_006933	GTGCG	2	10	798647	798656	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_006933	ACAAA	2	10	824559	824568	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_006933	GCCAT	2	10	840809	840818	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_006933	ACAAA	2	10	848727	848736	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_006933	TGACC	2	10	852585	852594	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_006933	GCTTT	2	10	859139	859148	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_006933	AAAGC	2	10	866716	866725	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_006933	GGCGA	2	10	897063	897072	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_006933	CACAT	2	10	897147	897156	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_006933	CGCGC	2	10	897250	897259	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
135	NC_006933	CAGCG	2	10	918393	918402	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_006933	TTGAC	2	10	935709	935718	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_006933	CGATG	2	10	949568	949577	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_006933	CGGCT	2	10	950148	950157	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_006933	AGCGA	2	10	979581	979590	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_006933	ACCGA	2	10	981747	981756	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_006933	CGCTT	2	10	989422	989431	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_006933	TGCGC	2	10	993133	993142	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_006933	CGCCT	2	10	1008779	1008788	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_006933	ATTAA	2	10	1010187	1010196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006933	AACCG	2	10	1012016	1012025	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_006933	TTTTC	2	10	1021954	1021963	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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171	NC_006933	AGCCA	2	10	1156391	1156400	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.