MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella abortus bv. 1 str. 9-941 chromosome I

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006932	ACGGTT	2	12	34702	34713	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_006932	TCGGCG	2	12	47885	47896	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006932	GGCATG	2	12	48061	48072	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_006932	GATCTG	2	12	48240	48251	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_006932	CCTGGC	2	12	82720	82731	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_006932	TTTTGC	2	12	95871	95882	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_006932	CTATGC	2	12	96133	96144	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006932	CGGCGA	2	12	96300	96311	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006932	GCTTTT	2	12	104648	104659	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_006932	CTGGCG	2	12	148071	148082	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_006932	GCCGAG	2	12	163921	163932	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006932	GGGGAA	2	12	171134	171145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006932	TCTGGC	2	12	187613	187624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006932	TTCCGA	2	12	219836	219847	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006932	GCCGGA	2	12	220238	220249	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006932	CAGCGA	2	12	221222	221233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_006932	CGCATG	2	12	242413	242424	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_006932	AGCCGG	2	12	243632	243643	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_006932	CGGTGC	2	12	244422	244433	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006932	CAAGGC	2	12	244542	244553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_006932	GGTGTA	2	12	269882	269893	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006932	CTCCCG	2	12	275318	275329	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_006932	TTCTGC	2	12	278039	278050	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006932	CACGCG	2	12	280865	280876	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006932	ACGCGC	2	12	280986	280997	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006932	CTGATG	2	12	297413	297424	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_006932	GGCACA	2	12	307859	307870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006932	CTCGAT	2	12	309780	309791	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_006932	CTGAAA	2	12	353497	353508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_006932	CTTTTT	2	12	360026	360037	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_006932	TGATTT	2	12	360045	360056	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006932	GTCTCT	2	12	364260	364271	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006932	TTGCCT	2	12	364563	364574	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006932	TTCCTC	2	12	369687	369698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_006932	ATGCCG	2	12	422253	422264	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006932	ACGGTC	2	12	451478	451489	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_006932	TTTAAC	2	12	454891	454902	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_006932	GGCGCG	2	12	490746	490757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006932	TCGCGC	2	12	491591	491602	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_006932	AAGCCG	2	12	492237	492248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_006932	TCATCC	2	12	493672	493683	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_006932	CGTTTT	2	12	528366	528377	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_006932	ATGACC	2	12	537280	537291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006932	ACGGTC	2	12	548447	548458	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_006932	CTTGGC	2	12	578026	578037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006932	TTACGT	2	12	578548	578559	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_006932	GCCTAT	2	12	609387	609398	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006932	CAGTTC	2	12	610430	610441	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006932	AGCGAA	2	12	625706	625717	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_006932	GCTGAC	2	12	720550	720561	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_006932	ATTGAA	2	12	773881	773892	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006932	CTTTTC	2	12	789867	789878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006932	TCGCGC	2	12	829704	829715	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_006932	GAAATT	2	12	921758	921769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006932	GCGCAG	2	12	935887	935898	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006932	GCCAAA	2	12	950929	950940	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_006932	AGACGC	2	12	953408	953419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_006932	GCCGGT	2	12	955100	955111	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006932	CGCTGG	2	12	961085	961096	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006932	GGATGA	2	12	971507	971518	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006932	TGCCGG	2	12	999235	999246	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006932	GCTGAT	2	12	1017343	1017354	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_006932	TATTTT	2	12	1036683	1036694	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006932	GAGGAA	2	12	1049214	1049225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006932	TTTTCC	2	12	1159665	1159676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_006932	CAAAAA	2	12	1198135	1198146	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_006932	ACCGCC	2	12	1249189	1249200	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_006932	TGAATT	2	12	1253662	1253673	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006932	GTCAGC	2	12	1271218	1271229	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006932	GCCTGC	2	12	1298160	1298171	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_006932	CGTTTC	2	12	1310539	1310550	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006932	CACCGC	2	12	1311592	1311603	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_006932	AAAACA	2	12	1311781	1311792	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_006932	CAACCT	2	12	1329255	1329266	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_006932	TGGAAC	2	12	1332435	1332446	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_006932	TTCCCC	2	12	1364280	1364291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_006932	CAGCAC	2	12	1373786	1373797	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_006932	GCGCCA	2	12	1373911	1373922	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_006932	CCGCGC	2	12	1402525	1402536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_006932	GTAAAA	2	12	1420719	1420730	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006932	GCATTT	2	12	1426696	1426707	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_006932	GCGCAT	2	12	1444793	1444804	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_006932	CATCGG	2	12	1452345	1452356	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006932	ATGCCA	2	12	1454760	1454771	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_006932	AAGGAA	2	12	1487025	1487036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006932	GCTCTG	2	12	1489106	1489117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006932	AAAAGC	2	12	1561637	1561648	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_006932	CTTCCC	2	12	1583940	1583951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_006932	ACTTTC	2	12	1585433	1585444	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_006932	TGAAAA	2	12	1591309	1591320	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006932	CTGCCG	2	12	1608427	1608438	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_006932	GCATCC	2	12	1633580	1633591	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_006932	GGAGCC	2	12	1633612	1633623	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_006932	AATGCC	2	12	1667210	1667221	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006932	TCAGCG	2	12	1765673	1765684	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_006932	ATGAAA	2	12	1766380	1766391	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006932	ATGGCG	2	12	1766653	1766664	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_006932	CTGCCG	2	12	1812533	1812544	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_006932	CATCCA	2	12	1834087	1834098	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_006932	AGAAAC	2	12	1858969	1858980	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_006932	AACTCA	2	12	1875100	1875111	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_006932	TCCTGC	2	12	1896291	1896302	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_006932	GAAGCC	2	12	1914108	1914119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_006932	GAAACG	2	12	1918417	1918428	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_006932	CCAACA	2	12	1955717	1955728	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_006932	CCTGGC	2	12	2033933	2033944	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_006932	AGCGTG	2	12	2056277	2056288	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_006932	TTCTTT	2	12	2078723	2078734	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_006932	GGAAAC	2	12	2102721	2102732	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_006932	TCTTTG	2	12	2116456	2116467	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.