MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 68467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006905	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006905	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006905	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178571
4	NC_006905	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178571
5	NC_006905	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_006905	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178572
7	NC_006905	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178572
8	NC_006905	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178572
9	NC_006905	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178572
10	NC_006905	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178572
11	NC_006905	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178572
12	NC_006905	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178572
13	NC_006905	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178572
14	NC_006905	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178572
15	NC_006905	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178572
16	NC_006905	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178572
17	NC_006905	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178572
18	NC_006905	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178572
19	NC_006905	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178572
20	NC_006905	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178572
21	NC_006905	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178572
22	NC_006905	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178572
23	NC_006905	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178572
24	NC_006905	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178572
25	NC_006905	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178572
26	NC_006905	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178572
27	NC_006905	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178572
28	NC_006905	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178572
29	NC_006905	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178572
30	NC_006905	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178572
31	NC_006905	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178572
32	NC_006905	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178572
33	NC_006905	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178572
34	NC_006905	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178572
35	NC_006905	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178572
36	NC_006905	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178572
37	NC_006905	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178572
38	NC_006905	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178572
39	NC_006905	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178572
40	NC_006905	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178572
41	NC_006905	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178572
42	NC_006905	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178572
43	NC_006905	ACC	2	6	2482	2487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178572
44	NC_006905	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178572
45	NC_006905	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178572
46	NC_006905	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178572
47	NC_006905	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178572
48	NC_006905	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178572
49	NC_006905	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178572
50	NC_006905	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178572
51	NC_006905	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178573
52	NC_006905	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178573
53	NC_006905	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178573
54	NC_006905	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178573
55	NC_006905	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178573
56	NC_006905	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178573
57	NC_006905	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178573
58	NC_006905	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178573
59	NC_006905	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178573
60	NC_006905	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178573
61	NC_006905	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178573
62	NC_006905	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178573
63	NC_006905	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178573
64	NC_006905	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178573
65	NC_006905	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178574
66	NC_006905	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178574
67	NC_006905	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178574
68	NC_006905	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178574
69	NC_006905	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178574
70	NC_006905	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178574
71	NC_006905	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178574
72	NC_006905	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178574
73	NC_006905	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178574
74	NC_006905	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178574
75	NC_006905	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178574
76	NC_006905	GCT	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178574
77	NC_006905	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178574
78	NC_006905	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62178574
79	NC_006905	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178574
80	NC_006905	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178574
81	NC_006905	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178574
82	NC_006905	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178574
83	NC_006905	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178574
84	NC_006905	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178574
85	NC_006905	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178574
86	NC_006905	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178574
87	NC_006905	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006905	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178575
89	NC_006905	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178575
90	NC_006905	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178575
91	NC_006905	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178575
92	NC_006905	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178575
93	NC_006905	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178575
94	NC_006905	ACC	2	6	5388	5393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178575
95	NC_006905	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178575
96	NC_006905	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178575
97	NC_006905	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178575
98	NC_006905	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178575
99	NC_006905	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_006905	GCC	2	6	5979	5984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178576
101	NC_006905	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178576
102	NC_006905	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178576
103	NC_006905	TGA	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178576
104	NC_006905	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178576
105	NC_006905	CAG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178576
106	NC_006905	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178576
107	NC_006905	GAT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178576
108	NC_006905	ACG	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178576
109	NC_006905	GAT	2	6	6764	6769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178576
110	NC_006905	GAT	2	6	6815	6820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178576
111	NC_006905	GCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178576
112	NC_006905	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178576
113	NC_006905	GCC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178576
114	NC_006905	AGG	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62178576
115	NC_006905	ATG	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178576
116	NC_006905	GCG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178576
117	NC_006905	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178576
118	NC_006905	AGC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178576
119	NC_006905	TAA	2	6	7372	7377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178576
120	NC_006905	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006905	TGA	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006905	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006905	CGG	2	6	7505	7510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_006905	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_006905	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_006905	CAC	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162139625
127	NC_006905	CAG	2	6	7845	7850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139625
128	NC_006905	AGC	2	6	7851	7856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139625
129	NC_006905	CAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139625
130	NC_006905	GTT	2	6	7872	7877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162139625
131	NC_006905	ATG	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162139625
132	NC_006905	AAG	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162139625
133	NC_006905	GCT	2	6	8132	8137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139625
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287	NC_006905	TTA	2	6	18039	18044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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