MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 9402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006905	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006905	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	62178572
3	NC_006905	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	62178572
4	NC_006905	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	62178572
5	NC_006905	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	62178572
6	NC_006905	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	62178572
7	NC_006905	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	62178572
8	NC_006905	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	62178572
9	NC_006905	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	62178572
10	NC_006905	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	62178573
11	NC_006905	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	62178573
12	NC_006905	TC	3	6	3907	3912	0 %	50 %	0 %	50 %	62178574
13	NC_006905	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	62178574
14	NC_006905	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	62178574
15	NC_006905	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	62178574
16	NC_006905	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	62178575
17	NC_006905	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	62178575
18	NC_006905	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	62178575
19	NC_006905	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	62178575
20	NC_006905	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	62178576
21	NC_006905	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	62178576
22	NC_006905	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	162139625
23	NC_006905	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	162139625
24	NC_006905	CG	3	6	7958	7963	0 %	0 %	50 %	50 %	162139625
25	NC_006905	CT	3	6	8451	8456	0 %	50 %	0 %	50 %	162139625
26	NC_006905	TG	3	6	8901	8906	0 %	50 %	50 %	0 %	62178578
27	NC_006905	GC	3	6	9573	9578	0 %	0 %	50 %	50 %	62178579
28	NC_006905	CG	3	6	10533	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	62178580
29	NC_006905	CG	3	6	12990	12995	0 %	0 %	50 %	50 %	62178582
30	NC_006905	GC	3	6	14551	14556	0 %	0 %	50 %	50 %	62178583
31	NC_006905	GA	3	6	14662	14667	50 %	0 %	50 %	0 %	62178583
32	NC_006905	AT	3	6	15373	15378	50 %	50 %	0 %	0 %	62178584
33	NC_006905	AT	3	6	15648	15653	50 %	50 %	0 %	0 %	62178584
34	NC_006905	AT	3	6	15901	15906	50 %	50 %	0 %	0 %	62178584
35	NC_006905	GA	3	6	17065	17070	50 %	0 %	50 %	0 %	62178587
36	NC_006905	GC	3	6	18368	18373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_006905	CT	3	6	20341	20346	0 %	50 %	0 %	50 %	62178588
38	NC_006905	GC	3	6	20657	20662	0 %	0 %	50 %	50 %	62178588
39	NC_006905	GC	3	6	20777	20782	0 %	0 %	50 %	50 %	62178588
40	NC_006905	GC	3	6	21182	21187	0 %	0 %	50 %	50 %	62178588
41	NC_006905	GC	3	6	22040	22045	0 %	0 %	50 %	50 %	62178588
42	NC_006905	CT	3	6	22795	22800	0 %	50 %	0 %	50 %	62178588
43	NC_006905	AT	3	6	23583	23588	50 %	50 %	0 %	0 %	62178589
44	NC_006905	CG	3	6	23653	23658	0 %	0 %	50 %	50 %	62178589
45	NC_006905	GC	4	8	23796	23803	0 %	0 %	50 %	50 %	62178589
46	NC_006905	AT	3	6	24057	24062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006905	CG	3	6	25065	25070	0 %	0 %	50 %	50 %	62178591
48	NC_006905	CT	3	6	25351	25356	0 %	50 %	0 %	50 %	62178591
49	NC_006905	AT	3	6	25381	25386	50 %	50 %	0 %	0 %	62178591
50	NC_006905	GC	3	6	26084	26089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_006905	CG	3	6	28014	28019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006905	GC	3	6	28142	28147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_006905	GC	3	6	28178	28183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_006905	GT	3	6	28356	28361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006905	TC	3	6	28374	28379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_006905	GT	3	6	28492	28497	0 %	50 %	50 %	0 %	62178592
57	NC_006905	GT	3	6	28621	28626	0 %	50 %	50 %	0 %	62178592
58	NC_006905	GA	3	6	29114	29119	50 %	0 %	50 %	0 %	62178592
59	NC_006905	CT	3	6	30106	30111	0 %	50 %	0 %	50 %	62178594
60	NC_006905	CG	3	6	30432	30437	0 %	0 %	50 %	50 %	62178594
61	NC_006905	AT	3	6	30533	30538	50 %	50 %	0 %	0 %	62178595
62	NC_006905	GC	3	6	30764	30769	0 %	0 %	50 %	50 %	62178595
63	NC_006905	GC	3	6	31054	31059	0 %	0 %	50 %	50 %	62178595
64	NC_006905	AT	3	6	34900	34905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006905	AT	3	6	35236	35241	50 %	50 %	0 %	0 %	62178601
66	NC_006905	CT	3	6	36155	36160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_006905	GT	3	6	37335	37340	0 %	50 %	50 %	0 %	62178602
68	NC_006905	GC	3	6	38224	38229	0 %	0 %	50 %	50 %	62178602
69	NC_006905	TC	3	6	38395	38400	0 %	50 %	0 %	50 %	62178602
70	NC_006905	GC	3	6	39209	39214	0 %	0 %	50 %	50 %	62178603
71	NC_006905	TA	3	6	39255	39260	50 %	50 %	0 %	0 %	62178603
72	NC_006905	GT	3	6	39566	39571	0 %	50 %	50 %	0 %	62178603
73	NC_006905	GA	3	6	39868	39873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006905	TA	3	6	40365	40370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006905	GA	3	6	40432	40437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006905	TA	3	6	41064	41069	50 %	50 %	0 %	0 %	62178604
77	NC_006905	TG	3	6	41445	41450	0 %	50 %	50 %	0 %	62178604
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80	NC_006905	GC	3	6	43307	43312	0 %	0 %	50 %	50 %	62178606
81	NC_006905	CG	4	8	43565	43572	0 %	0 %	50 %	50 %	62178606
82	NC_006905	CG	3	6	43778	43783	0 %	0 %	50 %	50 %	62178606
83	NC_006905	TG	3	6	44396	44401	0 %	50 %	50 %	0 %	62178606
84	NC_006905	GC	3	6	45464	45469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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89	NC_006905	GC	3	6	49280	49285	0 %	0 %	50 %	50 %	62178610
90	NC_006905	CG	3	6	49354	49359	0 %	0 %	50 %	50 %	62178610
91	NC_006905	CG	3	6	50088	50093	0 %	0 %	50 %	50 %	62178610
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102	NC_006905	GC	3	6	63866	63871	0 %	0 %	50 %	50 %	62178622
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104	NC_006905	AG	3	6	64064	64069	50 %	0 %	50 %	0 %	62178623
105	NC_006905	CG	3	6	64143	64148	0 %	0 %	50 %	50 %	62178623
106	NC_006905	GC	3	6	64171	64176	0 %	0 %	50 %	50 %	62178623
107	NC_006905	GC	3	6	64217	64222	0 %	0 %	50 %	50 %	62178623
108	NC_006905	CG	3	6	64800	64805	0 %	0 %	50 %	50 %	62178624
109	NC_006905	CG	3	6	65080	65085	0 %	0 %	50 %	50 %	62178624
110	NC_006905	TG	3	6	65721	65726	0 %	50 %	50 %	0 %	62178625
111	NC_006905	GC	3	6	66232	66237	0 %	0 %	50 %	50 %	62178625
112	NC_006905	GC	3	6	66539	66544	0 %	0 %	50 %	50 %	62178625
113	NC_006905	GC	3	6	66716	66721	0 %	0 %	50 %	50 %	62178626
114	NC_006905	CG	3	6	67577	67582	0 %	0 %	50 %	50 %	62178627
115	NC_006905	GC	3	6	67723	67728	0 %	0 %	50 %	50 %	62178627
116	NC_006905	TC	3	6	68110	68115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_006905	GC	3	6	68219	68224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_006905	AT	3	6	69154	69159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006905	AT	3	6	69543	69548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006905	CT	3	6	70250	70255	0 %	50 %	0 %	50 %	62178630
121	NC_006905	GC	3	6	71418	71423	0 %	0 %	50 %	50 %	62178631
122	NC_006905	CG	3	6	71554	71559	0 %	0 %	50 %	50 %	62178631
123	NC_006905	TC	3	6	71716	71721	0 %	50 %	0 %	50 %	62178631
124	NC_006905	CG	3	6	72030	72035	0 %	0 %	50 %	50 %	62178631
125	NC_006905	GC	5	10	73076	73085	0 %	0 %	50 %	50 %	62178631
126	NC_006905	CG	3	6	73136	73141	0 %	0 %	50 %	50 %	62178631
127	NC_006905	GC	3	6	73721	73726	0 %	0 %	50 %	50 %	62178631
128	NC_006905	GC	3	6	74220	74225	0 %	0 %	50 %	50 %	62178631
129	NC_006905	TG	3	6	74628	74633	0 %	50 %	50 %	0 %	62178632
130	NC_006905	CG	3	6	75279	75284	0 %	0 %	50 %	50 %	62178633
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