MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacteroides fragilis NCTC 9343 plasmid pBF9343

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006873	TAGA	2	8	316	323	50 %	25 %	25 %	0 %	60650142
2	NC_006873	GAAC	2	8	489	496	50 %	0 %	25 %	25 %	60650142
3	NC_006873	AATA	2	8	714	721	75 %	25 %	0 %	0 %	60650142
4	NC_006873	TCAA	2	8	1373	1380	50 %	25 %	0 %	25 %	60650143
5	NC_006873	CAAA	2	8	1573	1580	75 %	0 %	0 %	25 %	60650143
6	NC_006873	AGAA	2	8	1655	1662	75 %	0 %	25 %	0 %	60650143
7	NC_006873	ATGT	2	8	1663	1670	25 %	50 %	25 %	0 %	60650143
8	NC_006873	TTTA	2	8	2043	2050	25 %	75 %	0 %	0 %	60650143
9	NC_006873	TAAA	2	8	3454	3461	75 %	25 %	0 %	0 %	60650144
10	NC_006873	ATAA	2	8	3881	3888	75 %	25 %	0 %	0 %	60650146
11	NC_006873	TCAT	2	8	4073	4080	25 %	50 %	0 %	25 %	60650146
12	NC_006873	ATGA	2	8	4124	4131	50 %	25 %	25 %	0 %	60650146
13	NC_006873	AAAG	2	8	4449	4456	75 %	0 %	25 %	0 %	60650148
14	NC_006873	ATGA	2	8	4796	4803	50 %	25 %	25 %	0 %	60650149
15	NC_006873	GATA	2	8	4825	4832	50 %	25 %	25 %	0 %	60650149
16	NC_006873	ATAG	2	8	5063	5070	50 %	25 %	25 %	0 %	60650150
17	NC_006873	CTTC	2	8	5138	5145	0 %	50 %	0 %	50 %	60650150
18	NC_006873	GAAA	2	8	5160	5167	75 %	0 %	25 %	0 %	60650150
19	NC_006873	ATAA	2	8	5252	5259	75 %	25 %	0 %	0 %	60650150
20	NC_006873	GATA	2	8	5519	5526	50 %	25 %	25 %	0 %	60650150
21	NC_006873	GAAA	2	8	6546	6553	75 %	0 %	25 %	0 %	60650153
22	NC_006873	GAAG	2	8	6777	6784	50 %	0 %	50 %	0 %	60650153
23	NC_006873	TTTA	2	8	6920	6927	25 %	75 %	0 %	0 %	60650153
24	NC_006873	CTAA	2	8	8280	8287	50 %	25 %	0 %	25 %	60650154
25	NC_006873	ATGT	2	8	8306	8313	25 %	50 %	25 %	0 %	60650154
26	NC_006873	TTCG	2	8	8377	8384	0 %	50 %	25 %	25 %	60650154
27	NC_006873	TTTG	2	8	8395	8402	0 %	75 %	25 %	0 %	60650154
28	NC_006873	TCAA	2	8	8562	8569	50 %	25 %	0 %	25 %	60650154
29	NC_006873	TCTG	2	8	9164	9171	0 %	50 %	25 %	25 %	60650155
30	NC_006873	AATG	2	8	9436	9443	50 %	25 %	25 %	0 %	60650155
31	NC_006873	GGAT	2	8	9559	9566	25 %	25 %	50 %	0 %	60650155
32	NC_006873	AGAA	2	8	9655	9662	75 %	0 %	25 %	0 %	60650155
33	NC_006873	TTTA	2	8	9682	9689	25 %	75 %	0 %	0 %	60650155
34	NC_006873	TAAT	2	8	9912	9919	50 %	50 %	0 %	0 %	60650155
35	NC_006873	AATG	2	8	9997	10004	50 %	25 %	25 %	0 %	60650155
36	NC_006873	AAAT	2	8	10099	10106	75 %	25 %	0 %	0 %	60650155
37	NC_006873	TGAT	2	8	10473	10480	25 %	50 %	25 %	0 %	60650155
38	NC_006873	TTCA	2	8	12673	12680	25 %	50 %	0 %	25 %	60650159
39	NC_006873	TTGC	2	8	12780	12787	0 %	50 %	25 %	25 %	60650159
40	NC_006873	CAAA	2	8	12877	12884	75 %	0 %	0 %	25 %	60650159
41	NC_006873	AAAT	2	8	13364	13371	75 %	25 %	0 %	0 %	60650159
42	NC_006873	CCAT	2	8	13780	13787	25 %	25 %	0 %	50 %	60650159
43	NC_006873	ATCT	2	8	13890	13897	25 %	50 %	0 %	25 %	60650159
44	NC_006873	ATAG	2	8	14191	14198	50 %	25 %	25 %	0 %	60650159
45	NC_006873	AATG	2	8	14290	14297	50 %	25 %	25 %	0 %	60650159
46	NC_006873	CTTT	2	8	14846	14853	0 %	75 %	0 %	25 %	60650160
47	NC_006873	AATA	2	8	15232	15239	75 %	25 %	0 %	0 %	60650160
48	NC_006873	TTTG	2	8	15420	15427	0 %	75 %	25 %	0 %	60650161
49	NC_006873	AGAT	2	8	15430	15437	50 %	25 %	25 %	0 %	60650161
50	NC_006873	GCTG	2	8	15637	15644	0 %	25 %	50 %	25 %	60650162
51	NC_006873	CTAT	2	8	15724	15731	25 %	50 %	0 %	25 %	60650162
52	NC_006873	ATTC	2	8	16039	16046	25 %	50 %	0 %	25 %	60650163
53	NC_006873	ATTG	2	8	16220	16227	25 %	50 %	25 %	0 %	60650164
54	NC_006873	TTCA	2	8	16714	16721	25 %	50 %	0 %	25 %	60650164
55	NC_006873	ATGA	2	8	16869	16876	50 %	25 %	25 %	0 %	60650164
56	NC_006873	TCAT	2	8	16898	16905	25 %	50 %	0 %	25 %	60650164
57	NC_006873	TTCA	2	8	17182	17189	25 %	50 %	0 %	25 %	60650165
58	NC_006873	ATAA	2	8	17407	17414	75 %	25 %	0 %	0 %	60650165
59	NC_006873	TTAT	2	8	17844	17851	25 %	75 %	0 %	0 %	60650166
60	NC_006873	TTTC	2	8	18869	18876	0 %	75 %	0 %	25 %	60650167
61	NC_006873	TATC	2	8	18923	18930	25 %	50 %	0 %	25 %	60650167
62	NC_006873	CTAT	2	8	19401	19408	25 %	50 %	0 %	25 %	60650168
63	NC_006873	GTTT	2	8	19443	19450	0 %	75 %	25 %	0 %	60650168
64	NC_006873	TCTT	2	8	19610	19617	0 %	75 %	0 %	25 %	60650168
65	NC_006873	CTTT	2	8	19632	19639	0 %	75 %	0 %	25 %	60650168
66	NC_006873	TTGT	2	8	19645	19652	0 %	75 %	25 %	0 %	60650168
67	NC_006873	TCTT	2	8	19653	19660	0 %	75 %	0 %	25 %	60650168
68	NC_006873	TGAT	2	8	19696	19703	25 %	50 %	25 %	0 %	60650168
69	NC_006873	TTCT	2	8	19906	19913	0 %	75 %	0 %	25 %	60650168
70	NC_006873	ATTT	2	8	20149	20156	25 %	75 %	0 %	0 %	60650168
71	NC_006873	CTTT	2	8	20649	20656	0 %	75 %	0 %	25 %	60650168
72	NC_006873	AATT	2	8	21105	21112	50 %	50 %	0 %	0 %	60650169
73	NC_006873	GTTT	2	8	21213	21220	0 %	75 %	25 %	0 %	60650169
74	NC_006873	TCAT	2	8	21319	21326	25 %	50 %	0 %	25 %	60650169
75	NC_006873	AAAG	2	8	21433	21440	75 %	0 %	25 %	0 %	60650169
76	NC_006873	GCTT	2	8	21571	21578	0 %	50 %	25 %	25 %	60650169
77	NC_006873	AAAT	2	8	21756	21763	75 %	25 %	0 %	0 %	60650170
78	NC_006873	TTCT	2	8	22594	22601	0 %	75 %	0 %	25 %	60650171
79	NC_006873	CTGT	2	8	23006	23013	0 %	50 %	25 %	25 %	60650171
80	NC_006873	TCTT	2	8	23055	23062	0 %	75 %	0 %	25 %	60650171
81	NC_006873	ATCT	2	8	23385	23392	25 %	50 %	0 %	25 %	60650172
82	NC_006873	TCTT	2	8	25961	25968	0 %	75 %	0 %	25 %	60650175
83	NC_006873	ACCA	2	8	26292	26299	50 %	0 %	0 %	50 %	60650176
84	NC_006873	AACC	2	8	26390	26397	50 %	0 %	0 %	50 %	60650176
85	NC_006873	TTTG	2	8	27553	27560	0 %	75 %	25 %	0 %	60650178
86	NC_006873	ATTT	2	8	27716	27723	25 %	75 %	0 %	0 %	60650178
87	NC_006873	TTAA	2	8	29195	29202	50 %	50 %	0 %	0 %	60650179
88	NC_006873	TATT	2	8	29285	29292	25 %	75 %	0 %	0 %	60650180
89	NC_006873	TTCT	2	8	29348	29355	0 %	75 %	0 %	25 %	60650180
90	NC_006873	AAAG	2	8	29525	29532	75 %	0 %	25 %	0 %	60650180
91	NC_006873	ATCT	2	8	29913	29920	25 %	50 %	0 %	25 %	60650181
92	NC_006873	TGTT	2	8	30150	30157	0 %	75 %	25 %	0 %	60650181
93	NC_006873	TTTC	3	12	30195	30206	0 %	75 %	0 %	25 %	60650181
94	NC_006873	GAAG	2	8	30532	30539	50 %	0 %	50 %	0 %	60650182
95	NC_006873	ACAT	2	8	30567	30574	50 %	25 %	0 %	25 %	60650182
96	NC_006873	TACA	2	8	30899	30906	50 %	25 %	0 %	25 %	60650182
97	NC_006873	ATTC	2	8	31375	31382	25 %	50 %	0 %	25 %	60650182
98	NC_006873	AATC	2	8	31658	31665	50 %	25 %	0 %	25 %	60650183
99	NC_006873	AGAA	2	8	32577	32584	75 %	0 %	25 %	0 %	60650184
100	NC_006873	AAAT	2	8	32688	32695	75 %	25 %	0 %	0 %	60650184
101	NC_006873	TTCT	2	8	32963	32970	0 %	75 %	0 %	25 %	60650185
102	NC_006873	TTGA	2	8	33084	33091	25 %	50 %	25 %	0 %	60650185
103	NC_006873	GTAT	2	8	33308	33315	25 %	50 %	25 %	0 %	60650185
104	NC_006873	GGCT	2	8	33329	33336	0 %	25 %	50 %	25 %	60650185
105	NC_006873	TAGT	2	8	33571	33578	25 %	50 %	25 %	0 %	60650185
106	NC_006873	AATC	2	8	33587	33594	50 %	25 %	0 %	25 %	60650185
107	NC_006873	TTTC	2	8	33674	33681	0 %	75 %	0 %	25 %	60650185
108	NC_006873	GAAT	2	8	33996	34003	50 %	25 %	25 %	0 %	60650185
109	NC_006873	GCTT	2	8	34160	34167	0 %	50 %	25 %	25 %	60650185
110	NC_006873	TGTC	2	8	34396	34403	0 %	50 %	25 %	25 %	60650185
111	NC_006873	TAAG	2	8	34411	34418	50 %	25 %	25 %	0 %	60650185
112	NC_006873	TTTG	2	8	34785	34792	0 %	75 %	25 %	0 %	60650185
113	NC_006873	GATA	2	8	35052	35059	50 %	25 %	25 %	0 %	60650185
114	NC_006873	TCTT	2	8	35625	35632	0 %	75 %	0 %	25 %	60650186
115	NC_006873	TAAA	2	8	35979	35986	75 %	25 %	0 %	0 %	60650187
116	NC_006873	GTTA	2	8	36111	36118	25 %	50 %	25 %	0 %	60650187

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.