MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacteroides fragilis NCTC 9343 plasmid pBF9343

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006873	TA	3	6	351	356	50 %	50 %	0 %	0 %	60650142
2	NC_006873	AT	3	6	1610	1615	50 %	50 %	0 %	0 %	60650143
3	NC_006873	GT	5	10	3665	3674	0 %	50 %	50 %	0 %	60650145
4	NC_006873	AT	3	6	4233	4238	50 %	50 %	0 %	0 %	60650147
5	NC_006873	TG	3	6	4963	4968	0 %	50 %	50 %	0 %	60650149
6	NC_006873	TA	3	6	5819	5824	50 %	50 %	0 %	0 %	60650152
7	NC_006873	AG	3	6	6427	6432	50 %	0 %	50 %	0 %	60650153
8	NC_006873	TA	3	6	6475	6480	50 %	50 %	0 %	0 %	60650153
9	NC_006873	AT	3	6	6933	6938	50 %	50 %	0 %	0 %	60650153
10	NC_006873	AG	3	6	6940	6945	50 %	0 %	50 %	0 %	60650153
11	NC_006873	AG	3	6	8329	8334	50 %	0 %	50 %	0 %	60650154
12	NC_006873	TA	3	6	9146	9151	50 %	50 %	0 %	0 %	60650155
13	NC_006873	AT	3	6	9271	9276	50 %	50 %	0 %	0 %	60650155
14	NC_006873	AT	3	6	9311	9316	50 %	50 %	0 %	0 %	60650155
15	NC_006873	AG	3	6	9822	9827	50 %	0 %	50 %	0 %	60650155
16	NC_006873	AT	3	6	10782	10787	50 %	50 %	0 %	0 %	60650156
17	NC_006873	TC	3	6	12456	12461	0 %	50 %	0 %	50 %	60650159
18	NC_006873	TA	3	6	12483	12488	50 %	50 %	0 %	0 %	60650159
19	NC_006873	TA	3	6	13498	13503	50 %	50 %	0 %	0 %	60650159
20	NC_006873	AT	3	6	13770	13775	50 %	50 %	0 %	0 %	60650159
21	NC_006873	TA	3	6	14284	14289	50 %	50 %	0 %	0 %	60650159
22	NC_006873	AT	3	6	14770	14775	50 %	50 %	0 %	0 %	60650160
23	NC_006873	AT	3	6	15929	15934	50 %	50 %	0 %	0 %	60650163
24	NC_006873	CT	3	6	16131	16136	0 %	50 %	0 %	50 %	60650163
25	NC_006873	TA	4	8	16393	16400	50 %	50 %	0 %	0 %	60650164
26	NC_006873	GT	3	6	16431	16436	0 %	50 %	50 %	0 %	60650164
27	NC_006873	TA	3	6	16594	16599	50 %	50 %	0 %	0 %	60650164
28	NC_006873	AG	3	6	17449	17454	50 %	0 %	50 %	0 %	60650165
29	NC_006873	AT	3	6	17711	17716	50 %	50 %	0 %	0 %	60650165
30	NC_006873	AT	3	6	17888	17893	50 %	50 %	0 %	0 %	60650166
31	NC_006873	AT	3	6	17939	17944	50 %	50 %	0 %	0 %	60650166
32	NC_006873	CT	3	6	17954	17959	0 %	50 %	0 %	50 %	60650166
33	NC_006873	AT	3	6	17994	17999	50 %	50 %	0 %	0 %	60650166
34	NC_006873	TA	3	6	18071	18076	50 %	50 %	0 %	0 %	60650166
35	NC_006873	AT	4	8	18625	18632	50 %	50 %	0 %	0 %	60650167
36	NC_006873	TG	3	6	18878	18883	0 %	50 %	50 %	0 %	60650167
37	NC_006873	AT	4	8	19624	19631	50 %	50 %	0 %	0 %	60650168
38	NC_006873	TA	3	6	20177	20182	50 %	50 %	0 %	0 %	60650168
39	NC_006873	TA	3	6	20943	20948	50 %	50 %	0 %	0 %	60650169
40	NC_006873	AT	3	6	22797	22802	50 %	50 %	0 %	0 %	60650171
41	NC_006873	CT	3	6	23748	23753	0 %	50 %	0 %	50 %	60650173
42	NC_006873	AT	3	6	23989	23994	50 %	50 %	0 %	0 %	60650174
43	NC_006873	TG	4	8	24006	24013	0 %	50 %	50 %	0 %	60650174
44	NC_006873	TA	4	8	24273	24280	50 %	50 %	0 %	0 %	60650174
45	NC_006873	TC	3	6	24336	24341	0 %	50 %	0 %	50 %	60650174
46	NC_006873	TA	4	8	26794	26801	50 %	50 %	0 %	0 %	60650176
47	NC_006873	AT	3	6	27145	27150	50 %	50 %	0 %	0 %	60650177
48	NC_006873	TA	3	6	27854	27859	50 %	50 %	0 %	0 %	60650178
49	NC_006873	AT	3	6	27865	27870	50 %	50 %	0 %	0 %	60650178
50	NC_006873	AG	3	6	27940	27945	50 %	0 %	50 %	0 %	60650178
51	NC_006873	AT	3	6	27983	27988	50 %	50 %	0 %	0 %	60650178
52	NC_006873	TA	3	6	28045	28050	50 %	50 %	0 %	0 %	60650178
53	NC_006873	TA	3	6	28789	28794	50 %	50 %	0 %	0 %	60650179
54	NC_006873	TC	4	8	29097	29104	0 %	50 %	0 %	50 %	60650179
55	NC_006873	AT	3	6	30189	30194	50 %	50 %	0 %	0 %	60650181
56	NC_006873	TA	3	6	30668	30673	50 %	50 %	0 %	0 %	60650182
57	NC_006873	TA	3	6	30722	30727	50 %	50 %	0 %	0 %	60650182
58	NC_006873	GA	3	6	31060	31065	50 %	0 %	50 %	0 %	60650182
59	NC_006873	TC	3	6	31471	31476	0 %	50 %	0 %	50 %	60650183
60	NC_006873	TA	3	6	32762	32767	50 %	50 %	0 %	0 %	60650185
61	NC_006873	TA	4	8	35070	35077	50 %	50 %	0 %	0 %	60650185
62	NC_006873	TA	3	6	35246	35251	50 %	50 %	0 %	0 %	60650185
63	NC_006873	TA	4	8	35603	35610	50 %	50 %	0 %	0 %	60650186
64	NC_006873	TA	3	6	35833	35838	50 %	50 %	0 %	0 %	60650186

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.