MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 plasmid pSC138

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006856	TGCTC	2	10	9606	9615	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_006856	AGGCC	2	10	9795	9804	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_006856	CCGTC	2	10	21078	21087	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_006856	AATCA	2	10	34107	34116	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_006856	ACAAA	2	10	35538	35547	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_006856	TGGTT	2	10	39113	39122	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006856	GCCGC	2	10	39169	39178	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_006856	GCCGC	2	10	39680	39689	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_006856	GCCGC	2	10	42941	42950	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_006856	AGGAT	2	10	46301	46310	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006856	ATACT	2	10	72435	72444	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006856	AAAAG	2	10	72562	72571	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006856	GGGCG	2	10	91742	91751	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
14	NC_006856	GTGCC	2	10	94192	94201	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_006856	GGCAC	2	10	94409	94418	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_006856	CCCGT	2	10	96973	96982	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_006856	GCCGC	2	10	97024	97033	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_006856	GAAAA	2	10	97080	97089	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006856	AGTTC	2	10	97116	97125	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_006856	TCACT	2	10	109956	109965	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_006856	TCAAA	2	10	109966	109975	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_006856	AGGCC	2	10	116068	116077	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_006856	CATCC	2	10	119584	119593	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_006856	CACAG	2	10	125548	125557	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.