MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 plasmid pSC138

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006856	GCCG	2	8	12	19	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006856	CGGC	2	8	986	993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006856	CGGC	2	8	1058	1065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_006856	GCCG	2	8	5500	5507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_006856	TTTA	2	8	25175	25182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006856	TTTG	2	8	36792	36799	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006856	TGAA	2	8	39194	39201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006856	CCGA	2	8	40537	40544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_006856	GCTT	2	8	49107	49114	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_006856	CTCC	2	8	65638	65645	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_006856	AATC	2	8	65913	65920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_006856	CACT	2	8	65943	65950	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006856	TGAA	2	8	66005	66012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006856	CAGA	2	8	66112	66119	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_006856	CCAC	2	8	66933	66940	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_006856	GAAA	2	8	68366	68373	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006856	TTCT	2	8	71228	71235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006856	CATA	2	8	72977	72984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_006856	AAAC	2	8	73075	73082	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_006856	AAAT	2	8	73366	73373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006856	CAGG	2	8	81615	81622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_006856	ATAG	2	8	85461	85468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006856	CAGG	2	8	86632	86639	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_006856	CCGT	2	8	93713	93720	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006856	CCGG	2	8	96985	96992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006856	GGCA	2	8	98060	98067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_006856	TCAG	2	8	98400	98407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_006856	ATAA	2	8	98543	98550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006856	AACA	2	8	98689	98696	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_006856	GCCC	2	8	99276	99283	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_006856	TGAA	2	8	101477	101484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006856	CTAA	2	8	109930	109937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_006856	GGCA	2	8	111822	111829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_006856	ATTG	2	8	113877	113884	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006856	TGAT	2	8	116374	116381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006856	ACGT	2	8	116889	116896	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_006856	GTCT	2	8	117228	117235	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_006856	GTAT	2	8	117313	117320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006856	TGAT	2	8	119011	119018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006856	CTTC	2	8	125736	125743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_006856	CTAA	2	8	128649	128656	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_006856	AGTG	2	8	128803	128810	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006856	TTTA	2	8	129219	129226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006856	TTGT	2	8	135986	135993	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006856	TCCG	2	8	136991	136998	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_006856	GCCG	2	8	137792	137799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.