MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 plasmid pSC138

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006856	CG	3	6	1273	1278	0 %	0 %	50 %	50 %	60115516
2	NC_006856	CG	4	8	3322	3329	0 %	0 %	50 %	50 %	60115518
3	NC_006856	GC	3	6	3518	3523	0 %	0 %	50 %	50 %	60115518
4	NC_006856	GC	4	8	4105	4112	0 %	0 %	50 %	50 %	60115519
5	NC_006856	CT	3	6	4624	4629	0 %	50 %	0 %	50 %	60115520
6	NC_006856	CG	3	6	4685	4690	0 %	0 %	50 %	50 %	60115520
7	NC_006856	GC	3	6	5113	5118	0 %	0 %	50 %	50 %	60115521
8	NC_006856	GC	3	6	6126	6131	0 %	0 %	50 %	50 %	60115522
9	NC_006856	GT	3	6	6993	6998	0 %	50 %	50 %	0 %	60115522
10	NC_006856	GC	4	8	7506	7513	0 %	0 %	50 %	50 %	60115522
11	NC_006856	GC	3	6	8293	8298	0 %	0 %	50 %	50 %	60115522
12	NC_006856	GC	3	6	8988	8993	0 %	0 %	50 %	50 %	60115523
13	NC_006856	CA	3	6	10031	10036	50 %	0 %	0 %	50 %	60115525
14	NC_006856	AT	3	6	10232	10237	50 %	50 %	0 %	0 %	60115525
15	NC_006856	TC	3	6	11699	11704	0 %	50 %	0 %	50 %	60115527
16	NC_006856	CG	3	6	11817	11822	0 %	0 %	50 %	50 %	60115527
17	NC_006856	GC	3	6	13157	13162	0 %	0 %	50 %	50 %	60115529
18	NC_006856	GC	3	6	13312	13317	0 %	0 %	50 %	50 %	60115529
19	NC_006856	GC	3	6	13746	13751	0 %	0 %	50 %	50 %	60115531
20	NC_006856	GA	3	6	13865	13870	50 %	0 %	50 %	0 %	60115531
21	NC_006856	TG	3	6	16259	16264	0 %	50 %	50 %	0 %	60115534
22	NC_006856	AC	3	6	16825	16830	50 %	0 %	0 %	50 %	60115534
23	NC_006856	GC	3	6	16906	16911	0 %	0 %	50 %	50 %	60115534
24	NC_006856	CG	3	6	16937	16942	0 %	0 %	50 %	50 %	60115534
25	NC_006856	AC	3	6	16947	16952	50 %	0 %	0 %	50 %	60115534
26	NC_006856	CG	4	8	17274	17281	0 %	0 %	50 %	50 %	60115534
27	NC_006856	CG	3	6	17298	17303	0 %	0 %	50 %	50 %	60115534
28	NC_006856	GC	3	6	17712	17717	0 %	0 %	50 %	50 %	60115535
29	NC_006856	CG	3	6	17839	17844	0 %	0 %	50 %	50 %	60115535
30	NC_006856	GC	3	6	18125	18130	0 %	0 %	50 %	50 %	60115536
31	NC_006856	GC	3	6	18200	18205	0 %	0 %	50 %	50 %	60115537
32	NC_006856	GC	3	6	18598	18603	0 %	0 %	50 %	50 %	60115537
33	NC_006856	GC	3	6	18997	19002	0 %	0 %	50 %	50 %	60115538
34	NC_006856	GC	3	6	19327	19332	0 %	0 %	50 %	50 %	60115538
35	NC_006856	CG	3	6	20031	20036	0 %	0 %	50 %	50 %	60115538
36	NC_006856	TC	3	6	20557	20562	0 %	50 %	0 %	50 %	60115539
37	NC_006856	CG	3	6	20675	20680	0 %	0 %	50 %	50 %	60115539
38	NC_006856	TC	3	6	22417	22422	0 %	50 %	0 %	50 %	60115541
39	NC_006856	CG	3	6	22535	22540	0 %	0 %	50 %	50 %	60115541
40	NC_006856	GC	3	6	23655	23660	0 %	0 %	50 %	50 %	60115543
41	NC_006856	GC	3	6	23766	23771	0 %	0 %	50 %	50 %	60115543
42	NC_006856	CA	3	6	24767	24772	50 %	0 %	0 %	50 %	60115544
43	NC_006856	CG	3	6	27868	27873	0 %	0 %	50 %	50 %	60115549
44	NC_006856	CG	3	6	28096	28101	0 %	0 %	50 %	50 %	60115549
45	NC_006856	CG	3	6	28640	28645	0 %	0 %	50 %	50 %	60115550
46	NC_006856	GC	3	6	29083	29088	0 %	0 %	50 %	50 %	60115550
47	NC_006856	TC	3	6	29699	29704	0 %	50 %	0 %	50 %	60115552
48	NC_006856	CG	3	6	29817	29822	0 %	0 %	50 %	50 %	60115552
49	NC_006856	AT	3	6	30394	30399	50 %	50 %	0 %	0 %	60115553
50	NC_006856	TA	3	6	31336	31341	50 %	50 %	0 %	0 %	60115553
51	NC_006856	GT	3	6	32524	32529	0 %	50 %	50 %	0 %	60115555
52	NC_006856	TC	3	6	34801	34806	0 %	50 %	0 %	50 %	60115558
53	NC_006856	CG	3	6	34919	34924	0 %	0 %	50 %	50 %	60115558
54	NC_006856	AG	3	6	35793	35798	50 %	0 %	50 %	0 %	60115560
55	NC_006856	GA	3	6	36481	36486	50 %	0 %	50 %	0 %	60115560
56	NC_006856	AT	3	6	36690	36695	50 %	50 %	0 %	0 %	60115561
57	NC_006856	GC	3	6	38818	38823	0 %	0 %	50 %	50 %	60115563
58	NC_006856	GA	4	8	39407	39414	50 %	0 %	50 %	0 %	60115564
59	NC_006856	CT	3	6	40276	40281	0 %	50 %	0 %	50 %	60115565
60	NC_006856	TG	3	6	40379	40384	0 %	50 %	50 %	0 %	60115565
61	NC_006856	TC	3	6	40603	40608	0 %	50 %	0 %	50 %	60115566
62	NC_006856	AC	3	6	41128	41133	50 %	0 %	0 %	50 %	60115566
63	NC_006856	GA	3	6	43577	43582	50 %	0 %	50 %	0 %	60115568
64	NC_006856	TC	3	6	43885	43890	0 %	50 %	0 %	50 %	60115570
65	NC_006856	CG	3	6	45351	45356	0 %	0 %	50 %	50 %	60115569
66	NC_006856	GC	3	6	45463	45468	0 %	0 %	50 %	50 %	60115569
67	NC_006856	TC	3	6	46855	46860	0 %	50 %	0 %	50 %	60115572
68	NC_006856	CG	3	6	46973	46978	0 %	0 %	50 %	50 %	60115572
69	NC_006856	CG	3	6	47297	47302	0 %	0 %	50 %	50 %	60115573
70	NC_006856	CG	3	6	47433	47438	0 %	0 %	50 %	50 %	60115573
71	NC_006856	GC	3	6	47672	47677	0 %	0 %	50 %	50 %	60115573
72	NC_006856	GA	3	6	51126	51131	50 %	0 %	50 %	0 %	60115579
73	NC_006856	TC	3	6	52287	52292	0 %	50 %	0 %	50 %	60115580
74	NC_006856	CG	3	6	52405	52410	0 %	0 %	50 %	50 %	60115580
75	NC_006856	AT	3	6	54638	54643	50 %	50 %	0 %	0 %	60115583
76	NC_006856	AG	3	6	55906	55911	50 %	0 %	50 %	0 %	60115584
77	NC_006856	GA	3	6	57327	57332	50 %	0 %	50 %	0 %	60115587
78	NC_006856	GC	3	6	57898	57903	0 %	0 %	50 %	50 %	60115588
79	NC_006856	GA	3	6	58017	58022	50 %	0 %	50 %	0 %	60115588
80	NC_006856	TG	3	6	58976	58981	0 %	50 %	50 %	0 %	60115589
81	NC_006856	CT	3	6	58982	58987	0 %	50 %	0 %	50 %	60115589
82	NC_006856	CT	3	6	59819	59824	0 %	50 %	0 %	50 %	60115589
83	NC_006856	AC	3	6	61431	61436	50 %	0 %	0 %	50 %	60115591
84	NC_006856	AT	3	6	61744	61749	50 %	50 %	0 %	0 %	60115591
85	NC_006856	TG	3	6	62688	62693	0 %	50 %	50 %	0 %	60115593
86	NC_006856	AG	3	6	63646	63651	50 %	0 %	50 %	0 %	60115593
87	NC_006856	TA	4	8	64154	64161	50 %	50 %	0 %	0 %	60115593
88	NC_006856	TA	4	8	64476	64483	50 %	50 %	0 %	0 %	60115593
89	NC_006856	GA	3	6	65211	65216	50 %	0 %	50 %	0 %	60115594
90	NC_006856	TA	3	6	69411	69416	50 %	50 %	0 %	0 %	60115602
91	NC_006856	GC	3	6	70585	70590	0 %	0 %	50 %	50 %	162139492
92	NC_006856	GC	3	6	71427	71432	0 %	0 %	50 %	50 %	60115604
93	NC_006856	AG	3	6	71996	72001	50 %	0 %	50 %	0 %	60115605
94	NC_006856	TG	3	6	72205	72210	0 %	50 %	50 %	0 %	60115605
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96	NC_006856	TC	3	6	74991	74996	0 %	50 %	0 %	50 %	60115608
97	NC_006856	TG	3	6	75429	75434	0 %	50 %	50 %	0 %	60115608
98	NC_006856	GT	3	6	76520	76525	0 %	50 %	50 %	0 %	60115609
99	NC_006856	TC	3	6	76739	76744	0 %	50 %	0 %	50 %	60115609
100	NC_006856	TG	3	6	78783	78788	0 %	50 %	50 %	0 %	60115611
101	NC_006856	TG	3	6	79226	79231	0 %	50 %	50 %	0 %	60115611
102	NC_006856	GA	3	6	81010	81015	50 %	0 %	50 %	0 %	60115612
103	NC_006856	GA	3	6	81521	81526	50 %	0 %	50 %	0 %	60115613
104	NC_006856	GC	3	6	82441	82446	0 %	0 %	50 %	50 %	60115614
105	NC_006856	TC	3	6	82793	82798	0 %	50 %	0 %	50 %	60115615
106	NC_006856	AC	3	6	82922	82927	50 %	0 %	0 %	50 %	60115615
107	NC_006856	TG	3	6	83412	83417	0 %	50 %	50 %	0 %	60115617
108	NC_006856	GC	3	6	85208	85213	0 %	0 %	50 %	50 %	60115621
109	NC_006856	AC	3	6	86310	86315	50 %	0 %	0 %	50 %	60115623
110	NC_006856	GA	3	6	89158	89163	50 %	0 %	50 %	0 %	60115627
111	NC_006856	AC	4	8	90241	90248	50 %	0 %	0 %	50 %	162139493
112	NC_006856	CG	3	6	90799	90804	0 %	0 %	50 %	50 %	162139493
113	NC_006856	CT	3	6	91475	91480	0 %	50 %	0 %	50 %	60115629
114	NC_006856	CA	3	6	92651	92656	50 %	0 %	0 %	50 %	60115631
115	NC_006856	CG	3	6	93028	93033	0 %	0 %	50 %	50 %	60115633
116	NC_006856	GC	3	6	93439	93444	0 %	0 %	50 %	50 %	60115635
117	NC_006856	GA	3	6	94097	94102	50 %	0 %	50 %	0 %	60115636
118	NC_006856	CA	3	6	94726	94731	50 %	0 %	0 %	50 %	60115637
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120	NC_006856	GC	3	6	95655	95660	0 %	0 %	50 %	50 %	60115638
121	NC_006856	GT	3	6	95756	95761	0 %	50 %	50 %	0 %	60115638
122	NC_006856	CA	3	6	95988	95993	50 %	0 %	0 %	50 %	60115639
123	NC_006856	CA	3	6	96199	96204	50 %	0 %	0 %	50 %	60115640
124	NC_006856	GT	3	6	96250	96255	0 %	50 %	50 %	0 %	60115640
125	NC_006856	CA	3	6	97416	97421	50 %	0 %	0 %	50 %	60115642
126	NC_006856	CA	3	6	98930	98935	50 %	0 %	0 %	50 %	60115643
127	NC_006856	CA	3	6	99759	99764	50 %	0 %	0 %	50 %	60115644
128	NC_006856	GT	3	6	99964	99969	0 %	50 %	50 %	0 %	60115644
129	NC_006856	GC	3	6	101036	101041	0 %	0 %	50 %	50 %	60115646
130	NC_006856	AT	3	6	101993	101998	50 %	50 %	0 %	0 %	60115647
131	NC_006856	AC	3	6	102137	102142	50 %	0 %	0 %	50 %	60115647
132	NC_006856	AT	3	6	102757	102762	50 %	50 %	0 %	0 %	60115647
133	NC_006856	AC	3	6	103555	103560	50 %	0 %	0 %	50 %	60115649
134	NC_006856	GA	4	8	103586	103593	50 %	0 %	50 %	0 %	60115649
135	NC_006856	CT	3	6	104058	104063	0 %	50 %	0 %	50 %	60115649
136	NC_006856	GA	3	6	104437	104442	50 %	0 %	50 %	0 %	60115649
137	NC_006856	AT	3	6	104637	104642	50 %	50 %	0 %	0 %	60115649
138	NC_006856	AT	3	6	105171	105176	50 %	50 %	0 %	0 %	60115650
139	NC_006856	TA	3	6	105516	105521	50 %	50 %	0 %	0 %	60115650
140	NC_006856	AC	3	6	105838	105843	50 %	0 %	0 %	50 %	60115650
141	NC_006856	TA	3	6	106493	106498	50 %	50 %	0 %	0 %	60115650
142	NC_006856	GT	3	6	106597	106602	0 %	50 %	50 %	0 %	60115650
143	NC_006856	TC	3	6	107298	107303	0 %	50 %	0 %	50 %	60115651
144	NC_006856	CT	3	6	110276	110281	0 %	50 %	0 %	50 %	60115654
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.