MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 plasmid pSC138

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006856	G	6	6	3236	3241	0 %	0 %	100 %	0 %	60115518
2	NC_006856	A	6	6	4788	4793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006856	T	6	6	8854	8859	0 %	100 %	0 %	0 %	60115523
4	NC_006856	A	8	8	9958	9965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006856	T	6	6	11267	11272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006856	T	6	6	14853	14858	0 %	100 %	0 %	0 %	60115532
7	NC_006856	T	6	6	15260	15265	0 %	100 %	0 %	0 %	60115532
8	NC_006856	T	6	6	22795	22800	0 %	100 %	0 %	0 %	60115541
9	NC_006856	T	7	7	24449	24455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006856	T	6	6	25242	25247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006856	T	6	6	25365	25370	0 %	100 %	0 %	0 %	60115545
12	NC_006856	T	6	6	30699	30704	0 %	100 %	0 %	0 %	60115553
13	NC_006856	T	7	7	30723	30729	0 %	100 %	0 %	0 %	60115553
14	NC_006856	T	6	6	30792	30797	0 %	100 %	0 %	0 %	60115553
15	NC_006856	T	7	7	31240	31246	0 %	100 %	0 %	0 %	60115553
16	NC_006856	T	8	8	31617	31624	0 %	100 %	0 %	0 %	60115553
17	NC_006856	A	6	6	31721	31726	100 %	0 %	0 %	0 %	60115554
18	NC_006856	T	6	6	31915	31920	0 %	100 %	0 %	0 %	60115554
19	NC_006856	T	6	6	32176	32181	0 %	100 %	0 %	0 %	60115555
20	NC_006856	T	8	8	32838	32845	0 %	100 %	0 %	0 %	60115555
21	NC_006856	T	6	6	32964	32969	0 %	100 %	0 %	0 %	60115555
22	NC_006856	T	6	6	33359	33364	0 %	100 %	0 %	0 %	60115556
23	NC_006856	T	6	6	33866	33871	0 %	100 %	0 %	0 %	60115556
24	NC_006856	T	8	8	33974	33981	0 %	100 %	0 %	0 %	60115556
25	NC_006856	T	6	6	33985	33990	0 %	100 %	0 %	0 %	60115556
26	NC_006856	A	6	6	35489	35494	100 %	0 %	0 %	0 %	60115559
27	NC_006856	T	6	6	35840	35845	0 %	100 %	0 %	0 %	60115560
28	NC_006856	T	6	6	35974	35979	0 %	100 %	0 %	0 %	60115560
29	NC_006856	T	6	6	36610	36615	0 %	100 %	0 %	0 %	60115561
30	NC_006856	A	6	6	37072	37077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006856	A	7	7	37149	37155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006856	T	6	6	37700	37705	0 %	100 %	0 %	0 %	60115562
33	NC_006856	A	6	6	37961	37966	100 %	0 %	0 %	0 %	60115562
34	NC_006856	T	7	7	38047	38053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006856	A	6	6	38906	38911	100 %	0 %	0 %	0 %	60115563
36	NC_006856	T	6	6	39125	39130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006856	T	6	6	41853	41858	0 %	100 %	0 %	0 %	60115566
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39	NC_006856	A	7	7	44668	44674	100 %	0 %	0 %	0 %	60115570
40	NC_006856	T	8	8	47519	47526	0 %	100 %	0 %	0 %	60115573
41	NC_006856	A	6	6	49515	49520	100 %	0 %	0 %	0 %	60115576
42	NC_006856	A	6	6	50119	50124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006856	T	6	6	50588	50593	0 %	100 %	0 %	0 %	60115578
44	NC_006856	T	6	6	50953	50958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006856	A	6	6	51108	51113	100 %	0 %	0 %	0 %	60115579
46	NC_006856	T	8	8	51245	51252	0 %	100 %	0 %	0 %	60115579
47	NC_006856	A	7	7	52730	52736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006856	T	7	7	53440	53446	0 %	100 %	0 %	0 %	60115582
49	NC_006856	T	6	6	53565	53570	0 %	100 %	0 %	0 %	60115582
50	NC_006856	T	6	6	53626	53631	0 %	100 %	0 %	0 %	60115582
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67	NC_006856	A	6	6	67086	67091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_006856	A	6	6	68033	68038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006856	A	7	7	68115	68121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73	NC_006856	A	6	6	69113	69118	100 %	0 %	0 %	0 %	60115602
74	NC_006856	A	6	6	69911	69916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_006856	T	8	8	97740	97747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006856	T	7	7	98557	98563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006856	A	6	6	98731	98736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006856	A	6	6	99181	99186	100 %	0 %	0 %	0 %	60115643
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.