MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 plasmid pSC138

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006856	G	6	6	3236	3241	0 %	0 %	100 %	0 %	60115518
2	NC_006856	T	6	6	8854	8859	0 %	100 %	0 %	0 %	60115523
3	NC_006856	T	6	6	14853	14858	0 %	100 %	0 %	0 %	60115532
4	NC_006856	T	6	6	15260	15265	0 %	100 %	0 %	0 %	60115532
5	NC_006856	T	6	6	22795	22800	0 %	100 %	0 %	0 %	60115541
6	NC_006856	T	6	6	25365	25370	0 %	100 %	0 %	0 %	60115545
7	NC_006856	T	6	6	30699	30704	0 %	100 %	0 %	0 %	60115553
8	NC_006856	T	7	7	30723	30729	0 %	100 %	0 %	0 %	60115553
9	NC_006856	T	6	6	30792	30797	0 %	100 %	0 %	0 %	60115553
10	NC_006856	T	7	7	31240	31246	0 %	100 %	0 %	0 %	60115553
11	NC_006856	T	8	8	31617	31624	0 %	100 %	0 %	0 %	60115553
12	NC_006856	A	6	6	31721	31726	100 %	0 %	0 %	0 %	60115554
13	NC_006856	T	6	6	31915	31920	0 %	100 %	0 %	0 %	60115554
14	NC_006856	T	6	6	32176	32181	0 %	100 %	0 %	0 %	60115555
15	NC_006856	T	8	8	32838	32845	0 %	100 %	0 %	0 %	60115555
16	NC_006856	T	6	6	32964	32969	0 %	100 %	0 %	0 %	60115555
17	NC_006856	T	6	6	33359	33364	0 %	100 %	0 %	0 %	60115556
18	NC_006856	T	6	6	33866	33871	0 %	100 %	0 %	0 %	60115556
19	NC_006856	T	8	8	33974	33981	0 %	100 %	0 %	0 %	60115556
20	NC_006856	T	6	6	33985	33990	0 %	100 %	0 %	0 %	60115556
21	NC_006856	A	6	6	35489	35494	100 %	0 %	0 %	0 %	60115559
22	NC_006856	T	6	6	35840	35845	0 %	100 %	0 %	0 %	60115560
23	NC_006856	T	6	6	35974	35979	0 %	100 %	0 %	0 %	60115560
24	NC_006856	T	6	6	36610	36615	0 %	100 %	0 %	0 %	60115561
25	NC_006856	T	6	6	37700	37705	0 %	100 %	0 %	0 %	60115562
26	NC_006856	A	6	6	37961	37966	100 %	0 %	0 %	0 %	60115562
27	NC_006856	A	6	6	38906	38911	100 %	0 %	0 %	0 %	60115563
28	NC_006856	T	6	6	41853	41858	0 %	100 %	0 %	0 %	60115566
29	NC_006856	C	6	6	44210	44215	0 %	0 %	0 %	100 %	60115570
30	NC_006856	A	7	7	44668	44674	100 %	0 %	0 %	0 %	60115570
31	NC_006856	T	8	8	47519	47526	0 %	100 %	0 %	0 %	60115573
32	NC_006856	A	6	6	49515	49520	100 %	0 %	0 %	0 %	60115576
33	NC_006856	T	6	6	50588	50593	0 %	100 %	0 %	0 %	60115578
34	NC_006856	A	6	6	51108	51113	100 %	0 %	0 %	0 %	60115579
35	NC_006856	T	8	8	51245	51252	0 %	100 %	0 %	0 %	60115579
36	NC_006856	T	7	7	53440	53446	0 %	100 %	0 %	0 %	60115582
37	NC_006856	T	6	6	53565	53570	0 %	100 %	0 %	0 %	60115582
38	NC_006856	T	6	6	53626	53631	0 %	100 %	0 %	0 %	60115582
39	NC_006856	T	7	7	57083	57089	0 %	100 %	0 %	0 %	60115586
40	NC_006856	T	6	6	57346	57351	0 %	100 %	0 %	0 %	60115587
41	NC_006856	A	6	6	60297	60302	100 %	0 %	0 %	0 %	60115590
42	NC_006856	A	6	6	62044	62049	100 %	0 %	0 %	0 %	60115592
43	NC_006856	A	6	6	62091	62096	100 %	0 %	0 %	0 %	60115592
44	NC_006856	A	6	6	62203	62208	100 %	0 %	0 %	0 %	60115592
45	NC_006856	A	6	6	63595	63600	100 %	0 %	0 %	0 %	60115593
46	NC_006856	T	6	6	64526	64531	0 %	100 %	0 %	0 %	60115593
47	NC_006856	A	6	6	64978	64983	100 %	0 %	0 %	0 %	60115594
48	NC_006856	T	7	7	65061	65067	0 %	100 %	0 %	0 %	60115594
49	NC_006856	A	6	6	65216	65221	100 %	0 %	0 %	0 %	60115594
50	NC_006856	A	6	6	66296	66301	100 %	0 %	0 %	0 %	60115596
51	NC_006856	A	6	6	66328	66333	100 %	0 %	0 %	0 %	60115596
52	NC_006856	A	7	7	67701	67707	100 %	0 %	0 %	0 %	60115600
53	NC_006856	A	7	7	67975	67981	100 %	0 %	0 %	0 %	60115601
54	NC_006856	A	6	6	68809	68814	100 %	0 %	0 %	0 %	60115602
55	NC_006856	A	6	6	69113	69118	100 %	0 %	0 %	0 %	60115602
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57	NC_006856	A	7	7	71101	71107	100 %	0 %	0 %	0 %	162139492
58	NC_006856	T	6	6	71609	71614	0 %	100 %	0 %	0 %	60115604
59	NC_006856	A	7	7	73214	73220	100 %	0 %	0 %	0 %	60115606
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62	NC_006856	A	6	6	76354	76359	100 %	0 %	0 %	0 %	60115609
63	NC_006856	G	6	6	76454	76459	0 %	0 %	100 %	0 %	60115609
64	NC_006856	A	6	6	76998	77003	100 %	0 %	0 %	0 %	60115609
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68	NC_006856	T	7	7	79806	79812	0 %	100 %	0 %	0 %	60115611
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74	NC_006856	T	7	7	83083	83089	0 %	100 %	0 %	0 %	60115616
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79	NC_006856	T	6	6	86147	86152	0 %	100 %	0 %	0 %	60115623
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93	NC_006856	A	8	8	104310	104317	100 %	0 %	0 %	0 %	60115649
94	NC_006856	A	7	7	105530	105536	100 %	0 %	0 %	0 %	60115650
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96	NC_006856	A	7	7	105961	105967	100 %	0 %	0 %	0 %	60115650
97	NC_006856	A	6	6	106053	106058	100 %	0 %	0 %	0 %	60115650
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101	NC_006856	T	6	6	112936	112941	0 %	100 %	0 %	0 %	60115655
102	NC_006856	T	8	8	113386	113393	0 %	100 %	0 %	0 %	60115656
103	NC_006856	A	7	7	117782	117788	100 %	0 %	0 %	0 %	60115660
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105	NC_006856	A	7	7	119810	119816	100 %	0 %	0 %	0 %	60115663
106	NC_006856	A	6	6	120111	120116	100 %	0 %	0 %	0 %	60115663
107	NC_006856	A	7	7	120471	120477	100 %	0 %	0 %	0 %	60115664
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109	NC_006856	A	6	6	125874	125879	100 %	0 %	0 %	0 %	60115671
110	NC_006856	T	6	6	127524	127529	0 %	100 %	0 %	0 %	60115675
111	NC_006856	A	8	8	129577	129584	100 %	0 %	0 %	0 %	60115676
112	NC_006856	T	6	6	130096	130101	0 %	100 %	0 %	0 %	60115676
113	NC_006856	A	6	6	132490	132495	100 %	0 %	0 %	0 %	60115677

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.