MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 plasmid pSCV50

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006855	GCGCTG	2	12	3671	3682	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	60115466
2	NC_006855	GCCACC	2	12	4612	4623	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	60115466
3	NC_006855	CAAAAT	2	12	4659	4670	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	60115466
4	NC_006855	AATCTA	2	12	5589	5600	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	60115467
5	NC_006855	TGCGCC	2	12	9087	9098	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	60115472
6	NC_006855	ACAGGG	2	12	10377	10388	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	60115474
7	NC_006855	CAGGCT	2	12	10896	10907	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	60115475
8	NC_006855	GCTGTC	2	12	13318	13329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115480
9	NC_006855	CACTGT	2	12	13330	13341	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	60115480
10	NC_006855	GGACAA	2	12	15798	15809	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	60115482
11	NC_006855	TGGATA	2	12	16061	16072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115482
12	NC_006855	AACCTG	2	12	21187	21198	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	60115487
13	NC_006855	CGGATT	2	12	24296	24307	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	229037897
14	NC_006855	ACCAGC	2	12	26701	26712	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	60115493
15	NC_006855	CATCGT	2	12	27180	27191	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	60115493
16	NC_006855	CCCGCT	2	12	28362	28373	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	60115495
17	NC_006855	GGCTGT	2	12	30702	30713	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	60115497
18	NC_006855	ACGGTT	2	12	31364	31375	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	60115497
19	NC_006855	CCAGCG	2	12	42925	42936	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	60115508
20	NC_006855	GGTAAG	2	12	48540	48551	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	60115513

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.