MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 plasmid pSCV50

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006855	GTTCA	2	10	1838	1847	20 %	40 %	20 %	20 %	60115464
2	NC_006855	CTGAC	2	10	3176	3185	20 %	20 %	20 %	40 %	60115465
3	NC_006855	TAATA	2	10	4987	4996	60 %	40 %	0 %	0 %	60115466
4	NC_006855	ACTCA	2	10	5278	5287	40 %	20 %	0 %	40 %	60115466
5	NC_006855	ACCAG	2	10	6050	6059	40 %	0 %	20 %	40 %	60115467
6	NC_006855	ACGTC	2	10	11428	11437	20 %	20 %	20 %	40 %	60115476
7	NC_006855	TGTCA	2	10	17097	17106	20 %	40 %	20 %	20 %	60115483
8	NC_006855	CGCAG	2	10	18682	18691	20 %	0 %	40 %	40 %	60115485
9	NC_006855	TGACC	2	10	19094	19103	20 %	20 %	20 %	40 %	60115486
10	NC_006855	CAGTT	2	10	19379	19388	20 %	40 %	20 %	20 %	60115486
11	NC_006855	GCCCG	2	10	20601	20610	0 %	0 %	40 %	60 %	60115487
12	NC_006855	GAACG	2	10	22759	22768	40 %	0 %	40 %	20 %	60115488
13	NC_006855	CCCGG	2	10	28627	28636	0 %	0 %	40 %	60 %	60115495
14	NC_006855	GCTGC	2	10	28788	28797	0 %	20 %	40 %	40 %	60115495
15	NC_006855	CAGGT	2	10	30984	30993	20 %	20 %	40 %	20 %	60115497
16	NC_006855	CGTCC	2	10	41464	41473	0 %	20 %	20 %	60 %	60115506
17	NC_006855	TGTGC	2	10	42766	42775	0 %	40 %	40 %	20 %	60115508
18	NC_006855	CCGGA	2	10	45837	45846	20 %	0 %	40 %	40 %	60115511
19	NC_006855	AACAG	2	10	45990	45999	60 %	0 %	20 %	20 %	60115511
20	NC_006855	CTGCG	2	10	46914	46923	0 %	20 %	40 %	40 %	60115512
21	NC_006855	AAAAT	2	10	48115	48124	80 %	20 %	0 %	0 %	60115513

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.