MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 plasmid pSCV50

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006855	CTGC	2	8	135	142	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006855	CAGC	2	8	235	242	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006855	TTCG	2	8	704	711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_006855	GAAT	2	8	2299	2306	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006855	ATAA	2	8	2452	2459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006855	GCGG	2	8	7288	7295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_006855	CAGG	2	8	9470	9477	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_006855	GGCT	2	8	10517	10524	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_006855	ACTG	2	8	14721	14728	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_006855	CTGT	2	8	14739	14746	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_006855	AAAT	2	8	14832	14839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006855	GATG	2	8	15036	15043	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006855	GTGA	2	8	17086	17093	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006855	TATT	2	8	18112	18119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006855	TTGT	2	8	18269	18276	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006855	TTTG	2	8	18277	18284	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006855	AAAC	2	8	18320	18327	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006855	GTTT	2	8	18353	18360	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006855	GGGA	2	8	18897	18904	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006855	AGCC	2	8	18909	18916	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006855	TTTA	2	8	19532	19539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006855	AGAA	2	8	22850	22857	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006855	TGCG	2	8	22886	22893	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_006855	GGGC	2	8	23105	23112	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_006855	TTAT	3	12	23155	23166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006855	GCCA	2	8	24586	24593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_006855	CTTT	2	8	24760	24767	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_006855	ATGT	2	8	24768	24775	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006855	ACTT	2	8	24984	24991	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_006855	CCCG	2	8	27214	27221	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_006855	AAAG	2	8	32630	32637	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006855	AATT	2	8	32657	32664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006855	ATTT	2	8	32877	32884	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006855	ATTT	2	8	32908	32915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006855	GTCA	2	8	32949	32956	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_006855	CATT	2	8	33811	33818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_006855	AAAT	2	8	39277	39284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006855	GCAA	2	8	39509	39516	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_006855	CCAG	2	8	41604	41611	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_006855	CAAA	2	8	43410	43417	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_006855	ACTA	2	8	43429	43436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_006855	ACAA	2	8	43437	43444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_006855	CGGG	2	8	43528	43535	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_006855	AGAC	2	8	43620	43627	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_006855	AAAT	2	8	44173	44180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006855	CCAG	2	8	49285	49292	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_006855	CGCC	2	8	49352	49359	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_006855	TGTA	2	8	49360	49367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006855	ATAA	2	8	49392	49399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.