MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 plasmid pSCV50

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006855	ACAA	2	8	1575	1582	75 %	0 %	0 %	25 %	60115464
2	NC_006855	TTAT	2	8	1662	1669	25 %	75 %	0 %	0 %	60115464
3	NC_006855	TTCT	2	8	1680	1687	0 %	75 %	0 %	25 %	60115464
4	NC_006855	TTAT	2	8	2560	2567	25 %	75 %	0 %	0 %	60115465
5	NC_006855	CCGA	2	8	3148	3155	25 %	0 %	25 %	50 %	60115465
6	NC_006855	AGTC	2	8	3596	3603	25 %	25 %	25 %	25 %	60115466
7	NC_006855	CGGA	2	8	3807	3814	25 %	0 %	50 %	25 %	60115466
8	NC_006855	TGGG	2	8	3959	3966	0 %	25 %	75 %	0 %	60115466
9	NC_006855	CGCC	2	8	4375	4382	0 %	0 %	25 %	75 %	60115466
10	NC_006855	AGTA	2	8	6292	6299	50 %	25 %	25 %	0 %	60115467
11	NC_006855	ACAT	2	8	6804	6811	50 %	25 %	0 %	25 %	60115468
12	NC_006855	TCTG	2	8	7348	7355	0 %	50 %	25 %	25 %	60115469
13	NC_006855	CCAT	2	8	7569	7576	25 %	25 %	0 %	50 %	60115469
14	NC_006855	CTTA	2	8	7700	7707	25 %	50 %	0 %	25 %	60115469
15	NC_006855	GTCA	2	8	8287	8294	25 %	25 %	25 %	25 %	60115471
16	NC_006855	GCTG	2	8	8348	8355	0 %	25 %	50 %	25 %	60115471
17	NC_006855	TGGC	2	8	8847	8854	0 %	25 %	50 %	25 %	60115472
18	NC_006855	TCGC	2	8	9611	9618	0 %	25 %	25 %	50 %	60115473
19	NC_006855	CAGC	2	8	9668	9675	25 %	0 %	25 %	50 %	60115473
20	NC_006855	CTGC	2	8	9876	9883	0 %	25 %	25 %	50 %	60115473
21	NC_006855	CTGC	2	8	10020	10027	0 %	25 %	25 %	50 %	60115474
22	NC_006855	CGGG	2	8	10060	10067	0 %	0 %	75 %	25 %	60115474
23	NC_006855	TCAC	2	8	10106	10113	25 %	25 %	0 %	50 %	60115474
24	NC_006855	CCCG	2	8	10117	10124	0 %	0 %	25 %	75 %	60115474
25	NC_006855	CGGG	2	8	10156	10163	0 %	0 %	75 %	25 %	60115474
26	NC_006855	CTGC	2	8	10438	10445	0 %	25 %	25 %	50 %	60115474
27	NC_006855	CGGA	2	8	10872	10879	25 %	0 %	50 %	25 %	60115475
28	NC_006855	CGGC	2	8	10933	10940	0 %	0 %	50 %	50 %	60115475
29	NC_006855	CAGC	2	8	11070	11077	25 %	0 %	25 %	50 %	60115475
30	NC_006855	CGGT	2	8	11487	11494	0 %	25 %	50 %	25 %	60115476
31	NC_006855	GCTG	2	8	11629	11636	0 %	25 %	50 %	25 %	60115476
32	NC_006855	CCGC	2	8	11674	11681	0 %	0 %	25 %	75 %	60115476
33	NC_006855	CTGC	2	8	11947	11954	0 %	25 %	25 %	50 %	60115476
34	NC_006855	ACAG	2	8	11957	11964	50 %	0 %	25 %	25 %	60115476
35	NC_006855	GTCT	2	8	16004	16011	0 %	50 %	25 %	25 %	60115482
36	NC_006855	CAGT	2	8	16185	16192	25 %	25 %	25 %	25 %	60115482
37	NC_006855	GCCA	2	8	16707	16714	25 %	0 %	25 %	50 %	60115482
38	NC_006855	ATCT	2	8	17345	17352	25 %	50 %	0 %	25 %	60115484
39	NC_006855	TGGG	2	8	17571	17578	0 %	25 %	75 %	0 %	60115484
40	NC_006855	GAAA	2	8	17660	17667	75 %	0 %	25 %	0 %	60115484
41	NC_006855	TCAG	2	8	18672	18679	25 %	25 %	25 %	25 %	60115485
42	NC_006855	CCGG	2	8	19885	19892	0 %	0 %	50 %	50 %	60115487
43	NC_006855	GACG	2	8	21934	21941	25 %	0 %	50 %	25 %	60115487
44	NC_006855	ACCA	2	8	22268	22275	50 %	0 %	0 %	50 %	60115488
45	NC_006855	GCGG	2	8	23840	23847	0 %	0 %	75 %	25 %	229037897
46	NC_006855	TCGG	2	8	23907	23914	0 %	25 %	50 %	25 %	229037897
47	NC_006855	GGTA	2	8	23950	23957	25 %	25 %	50 %	0 %	229037897
48	NC_006855	CGAA	3	12	24179	24190	50 %	0 %	25 %	25 %	229037897
49	NC_006855	GTCA	2	8	24344	24351	25 %	25 %	25 %	25 %	229037897
50	NC_006855	CTGC	2	8	24355	24362	0 %	25 %	25 %	50 %	60115490
51	NC_006855	CACG	2	8	26090	26097	25 %	0 %	25 %	50 %	60115492
52	NC_006855	ACTG	2	8	26176	26183	25 %	25 %	25 %	25 %	60115492
53	NC_006855	CCAG	2	8	27450	27457	25 %	0 %	25 %	50 %	60115494
54	NC_006855	CGGC	2	8	27714	27721	0 %	0 %	50 %	50 %	60115494
55	NC_006855	GACA	2	8	28531	28538	50 %	0 %	25 %	25 %	60115495
56	NC_006855	CGTC	2	8	29319	29326	0 %	25 %	25 %	50 %	60115495
57	NC_006855	TCAG	2	8	29393	29400	25 %	25 %	25 %	25 %	60115495
58	NC_006855	GCCG	2	8	29907	29914	0 %	0 %	50 %	50 %	60115496
59	NC_006855	GAAA	2	8	30171	30178	75 %	0 %	25 %	0 %	60115496
60	NC_006855	GTTT	2	8	30197	30204	0 %	75 %	25 %	0 %	60115496
61	NC_006855	GCCG	2	8	30233	30240	0 %	0 %	50 %	50 %	60115496
62	NC_006855	CACG	2	8	30321	30328	25 %	0 %	25 %	50 %	60115496
63	NC_006855	GTGG	2	8	30378	30385	0 %	25 %	75 %	0 %	60115496
64	NC_006855	CAGC	2	8	31472	31479	25 %	0 %	25 %	50 %	60115497
65	NC_006855	AGGT	2	8	31659	31666	25 %	25 %	50 %	0 %	60115497
66	NC_006855	CTTC	2	8	31795	31802	0 %	50 %	0 %	50 %	60115497
67	NC_006855	AGCC	2	8	32000	32007	25 %	0 %	25 %	50 %	60115497
68	NC_006855	ACTG	2	8	32033	32040	25 %	25 %	25 %	25 %	60115497
69	NC_006855	ATAG	2	8	32381	32388	50 %	25 %	25 %	0 %	60115497
70	NC_006855	TTAA	2	8	32397	32404	50 %	50 %	0 %	0 %	60115497
71	NC_006855	CCGT	2	8	33564	33571	0 %	25 %	25 %	50 %	60115498
72	NC_006855	TGGC	2	8	34989	34996	0 %	25 %	50 %	25 %	60115499
73	NC_006855	CTGG	2	8	35000	35007	0 %	25 %	50 %	25 %	60115499
74	NC_006855	GCCG	2	8	35351	35358	0 %	0 %	50 %	50 %	60115500
75	NC_006855	GAAA	2	8	35450	35457	75 %	0 %	25 %	0 %	60115500
76	NC_006855	CGTT	2	8	36064	36071	0 %	50 %	25 %	25 %	60115501
77	NC_006855	GACC	2	8	36105	36112	25 %	0 %	25 %	50 %	60115501
78	NC_006855	AACG	2	8	36198	36205	50 %	0 %	25 %	25 %	60115501
79	NC_006855	GGCA	2	8	36480	36487	25 %	0 %	50 %	25 %	60115501
80	NC_006855	AGGC	2	8	36714	36721	25 %	0 %	50 %	25 %	60115501
81	NC_006855	TTTG	2	8	36766	36773	0 %	75 %	25 %	0 %	60115501
82	NC_006855	GAGC	2	8	36796	36803	25 %	0 %	50 %	25 %	60115501
83	NC_006855	TTGA	2	8	37529	37536	25 %	50 %	25 %	0 %	60115502
84	NC_006855	GTCA	2	8	37946	37953	25 %	25 %	25 %	25 %	60115502
85	NC_006855	TCGA	2	8	38327	38334	25 %	25 %	25 %	25 %	60115503
86	NC_006855	GGCT	2	8	38352	38359	0 %	25 %	50 %	25 %	60115503
87	NC_006855	TACA	2	8	38880	38887	50 %	25 %	0 %	25 %	60115503
88	NC_006855	GCTG	2	8	40043	40050	0 %	25 %	50 %	25 %	60115504
89	NC_006855	GCAG	2	8	40290	40297	25 %	0 %	50 %	25 %	60115504
90	NC_006855	CTGA	2	8	40543	40550	25 %	25 %	25 %	25 %	60115504
91	NC_006855	GCCA	2	8	40648	40655	25 %	0 %	25 %	50 %	60115505
92	NC_006855	CCGG	2	8	40808	40815	0 %	0 %	50 %	50 %	60115505
93	NC_006855	GCCA	2	8	41052	41059	25 %	0 %	25 %	50 %	60115505
94	NC_006855	CCTG	2	8	41107	41114	0 %	25 %	25 %	50 %	60115505
95	NC_006855	GCCA	2	8	41388	41395	25 %	0 %	25 %	50 %	60115506
96	NC_006855	CTGA	2	8	41762	41769	25 %	25 %	25 %	25 %	60115507
97	NC_006855	TCTG	2	8	42050	42057	0 %	50 %	25 %	25 %	60115507
98	NC_006855	CAGC	2	8	42087	42094	25 %	0 %	25 %	50 %	60115507
99	NC_006855	GGCT	2	8	42157	42164	0 %	25 %	50 %	25 %	60115507
100	NC_006855	TTTC	2	8	42358	42365	0 %	75 %	0 %	25 %	60115508
101	NC_006855	CAGG	2	8	43903	43910	25 %	0 %	50 %	25 %	60115509
102	NC_006855	ACAG	2	8	44091	44098	50 %	0 %	25 %	25 %	60115509
103	NC_006855	ACCA	2	8	44781	44788	50 %	0 %	0 %	50 %	60115510
104	NC_006855	AAAC	2	8	44816	44823	75 %	0 %	0 %	25 %	60115510
105	NC_006855	TGTC	2	8	44841	44848	0 %	50 %	25 %	25 %	60115510
106	NC_006855	GTAT	2	8	45465	45472	25 %	50 %	25 %	0 %	60115510
107	NC_006855	GGAA	2	8	46135	46142	50 %	0 %	50 %	0 %	60115511
108	NC_006855	CGCC	2	8	46209	46216	0 %	0 %	25 %	75 %	60115511
109	NC_006855	AAAT	2	8	46537	46544	75 %	25 %	0 %	0 %	60115512
110	NC_006855	GATT	2	8	46614	46621	25 %	50 %	25 %	0 %	60115512
111	NC_006855	GGCA	2	8	47080	47087	25 %	0 %	50 %	25 %	60115512
112	NC_006855	CTGG	2	8	47284	47291	0 %	25 %	50 %	25 %	60115512
113	NC_006855	GGTG	2	8	47374	47381	0 %	25 %	75 %	0 %	60115512
114	NC_006855	ATGT	2	8	47480	47487	25 %	50 %	25 %	0 %	60115512
115	NC_006855	CTGA	2	8	47837	47844	25 %	25 %	25 %	25 %	60115512
116	NC_006855	TGTT	2	8	48298	48305	0 %	75 %	25 %	0 %	60115513
117	NC_006855	CGGT	2	8	48865	48872	0 %	25 %	50 %	25 %	60115513

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.