MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 plasmid pSCV50

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006855	AG	3	6	1290	1295	50 %	0 %	50 %	0 %	60115464
2	NC_006855	TA	3	6	4862	4867	50 %	50 %	0 %	0 %	60115466
3	NC_006855	AT	3	6	5542	5547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006855	TA	3	6	6042	6047	50 %	50 %	0 %	0 %	60115467
5	NC_006855	AG	3	6	6679	6684	50 %	0 %	50 %	0 %	60115468
6	NC_006855	AT	3	6	6822	6827	50 %	50 %	0 %	0 %	60115468
7	NC_006855	AG	3	6	7248	7253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006855	AT	3	6	7795	7800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006855	AT	3	6	7840	7845	50 %	50 %	0 %	0 %	60115470
10	NC_006855	GC	3	6	8425	8430	0 %	0 %	50 %	50 %	60115471
11	NC_006855	GT	3	6	9345	9350	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006855	GC	3	6	9515	9520	0 %	0 %	50 %	50 %	60115473
13	NC_006855	GC	3	6	9572	9577	0 %	0 %	50 %	50 %	60115473
14	NC_006855	CA	3	6	9598	9603	50 %	0 %	0 %	50 %	60115473
15	NC_006855	GA	3	6	9624	9629	50 %	0 %	50 %	0 %	60115473
16	NC_006855	GC	3	6	10668	10673	0 %	0 %	50 %	50 %	60115475
17	NC_006855	GC	3	6	11507	11512	0 %	0 %	50 %	50 %	60115476
18	NC_006855	CT	3	6	11990	11995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_006855	GC	3	6	12229	12234	0 %	0 %	50 %	50 %	60115477
20	NC_006855	CA	3	6	12776	12781	50 %	0 %	0 %	50 %	60115478
21	NC_006855	GC	3	6	13751	13756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006855	CT	3	6	14281	14286	0 %	50 %	0 %	50 %	60115481
23	NC_006855	AT	3	6	14574	14579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006855	AT	3	6	14610	14615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006855	GC	3	6	14777	14782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006855	AC	3	6	15965	15970	50 %	0 %	0 %	50 %	60115482
27	NC_006855	AG	3	6	16467	16472	50 %	0 %	50 %	0 %	60115482
28	NC_006855	TA	3	6	16902	16907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006855	TA	3	6	17073	17078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006855	CT	3	6	17159	17164	0 %	50 %	0 %	50 %	60115483
31	NC_006855	AT	3	6	18132	18137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006855	TA	3	6	18333	18338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006855	GT	3	6	18591	18596	0 %	50 %	50 %	0 %	60115485
34	NC_006855	TA	3	6	18980	18985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006855	GT	3	6	21281	21286	0 %	50 %	50 %	0 %	60115487
36	NC_006855	GC	3	6	21688	21693	0 %	0 %	50 %	50 %	60115487
37	NC_006855	GC	3	6	21959	21964	0 %	0 %	50 %	50 %	60115487
38	NC_006855	GC	3	6	22031	22036	0 %	0 %	50 %	50 %	60115487
39	NC_006855	GC	3	6	22416	22421	0 %	0 %	50 %	50 %	60115488
40	NC_006855	AG	3	6	23168	23173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006855	GA	3	6	23373	23378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006855	TC	3	6	24279	24284	0 %	50 %	0 %	50 %	229037897
43	NC_006855	GC	3	6	25571	25576	0 %	0 %	50 %	50 %	60115491
44	NC_006855	CG	3	6	25851	25856	0 %	0 %	50 %	50 %	60115492
45	NC_006855	TG	3	6	26042	26047	0 %	50 %	50 %	0 %	60115492
46	NC_006855	TC	3	6	27094	27099	0 %	50 %	0 %	50 %	60115493
47	NC_006855	GC	3	6	28158	28163	0 %	0 %	50 %	50 %	60115495
48	NC_006855	CG	3	6	29098	29103	0 %	0 %	50 %	50 %	60115495
49	NC_006855	TG	3	6	29385	29390	0 %	50 %	50 %	0 %	60115495
50	NC_006855	TG	3	6	31446	31451	0 %	50 %	50 %	0 %	60115497
51	NC_006855	CG	3	6	31887	31892	0 %	0 %	50 %	50 %	60115497
52	NC_006855	CA	3	6	32264	32269	50 %	0 %	0 %	50 %	60115497
53	NC_006855	GA	3	6	32896	32901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006855	AT	3	6	33891	33896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006855	AT	3	6	33935	33940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006855	AG	3	6	34001	34006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006855	TA	3	6	35233	35238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006855	CG	3	6	35800	35805	0 %	0 %	50 %	50 %	60115501
59	NC_006855	GC	3	6	36129	36134	0 %	0 %	50 %	50 %	60115501
60	NC_006855	CG	3	6	36311	36316	0 %	0 %	50 %	50 %	60115501
61	NC_006855	GA	3	6	36356	36361	50 %	0 %	50 %	0 %	60115501
62	NC_006855	TC	3	6	37058	37063	0 %	50 %	0 %	50 %	60115502
63	NC_006855	GC	3	6	37157	37162	0 %	0 %	50 %	50 %	60115502
64	NC_006855	GT	3	6	38312	38317	0 %	50 %	50 %	0 %	60115503
65	NC_006855	CA	3	6	38562	38567	50 %	0 %	0 %	50 %	60115503
66	NC_006855	TA	3	6	39081	39086	50 %	50 %	0 %	0 %	60115503
67	NC_006855	AT	3	6	39864	39869	50 %	50 %	0 %	0 %	60115504
68	NC_006855	TA	3	6	40282	40287	50 %	50 %	0 %	0 %	60115504
69	NC_006855	GA	3	6	40764	40769	50 %	0 %	50 %	0 %	60115505
70	NC_006855	GA	3	6	41091	41096	50 %	0 %	50 %	0 %	60115505
71	NC_006855	AG	3	6	41610	41615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006855	GC	3	6	41904	41909	0 %	0 %	50 %	50 %	60115507
73	NC_006855	TG	3	6	42411	42416	0 %	50 %	50 %	0 %	60115508
74	NC_006855	GC	4	8	42543	42550	0 %	0 %	50 %	50 %	60115508
75	NC_006855	AC	3	6	44423	44428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_006855	AC	3	6	45217	45222	50 %	0 %	0 %	50 %	60115510
77	NC_006855	GT	4	8	46888	46895	0 %	50 %	50 %	0 %	60115512
78	NC_006855	AT	3	6	48509	48514	50 %	50 %	0 %	0 %	60115513

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.