MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 plasmid pSCV50

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006855	T	6	6	855	860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006855	T	6	6	1123	1128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006855	A	10	10	1142	1151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006855	A	6	6	1179	1184	100 %	0 %	0 %	0 %	60115464
5	NC_006855	A	6	6	1478	1483	100 %	0 %	0 %	0 %	60115464
6	NC_006855	A	6	6	1516	1521	100 %	0 %	0 %	0 %	60115464
7	NC_006855	A	6	6	1674	1679	100 %	0 %	0 %	0 %	60115464
8	NC_006855	T	7	7	1778	1784	0 %	100 %	0 %	0 %	60115464
9	NC_006855	T	6	6	5455	5460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006855	A	6	6	5469	5474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006855	A	8	8	5506	5513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006855	C	6	6	6399	6404	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_006855	T	6	6	6496	6501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006855	A	6	6	6610	6615	100 %	0 %	0 %	0 %	60115468
15	NC_006855	A	6	6	7076	7081	100 %	0 %	0 %	0 %	60115468
16	NC_006855	A	7	7	7144	7150	100 %	0 %	0 %	0 %	60115468
17	NC_006855	T	6	6	7212	7217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006855	A	6	6	7999	8004	100 %	0 %	0 %	0 %	60115470
19	NC_006855	T	6	6	9059	9064	0 %	100 %	0 %	0 %	60115472
20	NC_006855	T	6	6	10524	10529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006855	C	6	6	10746	10751	0 %	0 %	0 %	100 %	60115475
22	NC_006855	T	6	6	12026	12031	0 %	100 %	0 %	0 %	60115477
23	NC_006855	T	6	6	13367	13372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006855	T	6	6	13679	13684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006855	A	7	7	13974	13980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006855	T	6	6	14425	14430	0 %	100 %	0 %	0 %	60115481
27	NC_006855	A	7	7	15357	15363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006855	A	6	6	15819	15824	100 %	0 %	0 %	0 %	60115482
29	NC_006855	T	6	6	17244	17249	0 %	100 %	0 %	0 %	60115483
30	NC_006855	T	6	6	17337	17342	0 %	100 %	0 %	0 %	60115484
31	NC_006855	T	6	6	17546	17551	0 %	100 %	0 %	0 %	60115484
32	NC_006855	T	7	7	17695	17701	0 %	100 %	0 %	0 %	60115484
33	NC_006855	A	7	7	17719	17725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006855	T	7	7	17940	17946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006855	T	6	6	18065	18070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006855	T	6	6	18118	18123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006855	T	6	6	18125	18130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006855	T	6	6	18180	18185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006855	T	7	7	18242	18248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006855	T	6	6	18251	18256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006855	A	6	6	18959	18964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006855	A	6	6	20788	20793	100 %	0 %	0 %	0 %	60115487
43	NC_006855	G	6	6	20928	20933	0 %	0 %	100 %	0 %	60115487
44	NC_006855	G	6	6	22058	22063	0 %	0 %	100 %	0 %	60115487
45	NC_006855	T	6	6	24811	24816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006855	T	8	8	26223	26230	0 %	100 %	0 %	0 %	60115492
47	NC_006855	A	6	6	26500	26505	100 %	0 %	0 %	0 %	60115493
48	NC_006855	C	20	20	27985	28004	0 %	0 %	0 %	100 %	60115495
49	NC_006855	G	6	6	28053	28058	0 %	0 %	100 %	0 %	60115495
50	NC_006855	A	6	6	30056	30061	100 %	0 %	0 %	0 %	60115496
51	NC_006855	A	6	6	30154	30159	100 %	0 %	0 %	0 %	60115496
52	NC_006855	G	6	6	30584	30589	0 %	0 %	100 %	0 %	60115497
53	NC_006855	T	6	6	30680	30685	0 %	100 %	0 %	0 %	60115497
54	NC_006855	T	7	7	31482	31488	0 %	100 %	0 %	0 %	60115497
55	NC_006855	T	6	6	31621	31626	0 %	100 %	0 %	0 %	60115497
56	NC_006855	T	6	6	32123	32128	0 %	100 %	0 %	0 %	60115497
57	NC_006855	A	6	6	32234	32239	100 %	0 %	0 %	0 %	60115497
58	NC_006855	T	6	6	32692	32697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006855	T	7	7	33705	33711	0 %	100 %	0 %	0 %	60115498
60	NC_006855	A	8	8	34037	34044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006855	A	7	7	34053	34059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006855	A	7	7	34122	34128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006855	A	6	6	34152	34157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006855	A	7	7	34179	34185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006855	T	6	6	34216	34221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006855	T	7	7	34239	34245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006855	T	6	6	34289	34294	0 %	100 %	0 %	0 %	60115499
68	NC_006855	T	6	6	34381	34386	0 %	100 %	0 %	0 %	60115499
69	NC_006855	T	7	7	34395	34401	0 %	100 %	0 %	0 %	60115499
70	NC_006855	A	7	7	35818	35824	100 %	0 %	0 %	0 %	60115501
71	NC_006855	C	6	6	36413	36418	0 %	0 %	0 %	100 %	60115501
72	NC_006855	T	8	8	39237	39244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006855	A	6	6	39527	39532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006855	T	6	6	39588	39593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006855	A	6	6	39973	39978	100 %	0 %	0 %	0 %	60115504
76	NC_006855	C	6	6	44463	44468	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_006855	A	6	6	45373	45378	100 %	0 %	0 %	0 %	60115510
78	NC_006855	T	6	6	45592	45597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006855	A	6	6	48273	48278	100 %	0 %	0 %	0 %	60115513
80	NC_006855	G	6	6	49031	49036	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.