MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio fischeri ES114 plasmid pES100

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006842	ATTCA	2	10	230	239	40 %	40 %	0 %	20 %	59714357
2	NC_006842	CATGC	2	10	912	921	20 %	20 %	20 %	40 %	59714358
3	NC_006842	CATTA	2	10	1249	1258	40 %	40 %	0 %	20 %	59714358
4	NC_006842	CATTT	2	10	1540	1549	20 %	60 %	0 %	20 %	59714358
5	NC_006842	TAAAA	2	10	3679	3688	80 %	20 %	0 %	0 %	59714362
6	NC_006842	TTTTA	2	10	4298	4307	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006842	AAAAT	2	10	4459	4468	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006842	GATCA	2	10	4766	4775	40 %	20 %	20 %	20 %	59714364
9	NC_006842	GATGT	2	10	6752	6761	20 %	40 %	40 %	0 %	59714367
10	NC_006842	GGATA	2	10	7240	7249	40 %	20 %	40 %	0 %	59714367
11	NC_006842	GAATT	2	10	7431	7440	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006842	TTTTC	2	10	9469	9478	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_006842	TCAAG	2	10	11723	11732	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_006842	TCTCT	2	10	12230	12239	0 %	60 %	0 %	40 %	59714374
15	NC_006842	TTTTC	2	10	13403	13412	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_006842	ATTAC	2	10	13464	13473	40 %	40 %	0 %	20 %	59714378
17	NC_006842	CAAAA	2	10	19018	19027	80 %	0 %	0 %	20 %	59714385
18	NC_006842	AGCAC	2	10	20866	20875	40 %	0 %	20 %	40 %	59714386
19	NC_006842	CGCTA	2	10	21443	21452	20 %	20 %	20 %	40 %	59714387
20	NC_006842	TGTCT	2	10	21679	21688	0 %	60 %	20 %	20 %	59714388
21	NC_006842	ACAAA	2	10	22162	22171	80 %	0 %	0 %	20 %	59714389
22	NC_006842	ATTTA	2	10	23558	23567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006842	CACTT	2	10	24525	24534	20 %	40 %	0 %	40 %	59714391
24	NC_006842	AGCGA	2	10	25620	25629	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_006842	TAAAG	2	10	25652	25661	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006842	AACCC	2	10	27820	27829	40 %	0 %	0 %	60 %	59714395
27	NC_006842	AAAGC	2	10	28426	28435	60 %	0 %	20 %	20 %	59714395
28	NC_006842	GAATA	2	10	29511	29520	60 %	20 %	20 %	0 %	59714396
29	NC_006842	TGTTT	2	10	29550	29559	0 %	80 %	20 %	0 %	59714397
30	NC_006842	AAGAT	2	10	29998	30007	60 %	20 %	20 %	0 %	59714397
31	NC_006842	TCAAA	2	10	30479	30488	60 %	20 %	0 %	20 %	59714398
32	NC_006842	TCAAT	2	10	31790	31799	40 %	40 %	0 %	20 %	59714399
33	NC_006842	CGGCT	2	10	32890	32899	0 %	20 %	40 %	40 %	59714400
34	NC_006842	AAAAT	2	10	34891	34900	80 %	20 %	0 %	0 %	59714401
35	NC_006842	CTGAG	2	10	37261	37270	20 %	20 %	40 %	20 %	59714403
36	NC_006842	CTTTT	2	10	38064	38073	0 %	80 %	0 %	20 %	59714405
37	NC_006842	GTCGA	2	10	38844	38853	20 %	20 %	40 %	20 %	59714406
38	NC_006842	AAAAC	2	10	41120	41129	80 %	0 %	0 %	20 %	59714406
39	NC_006842	GAAAA	2	10	41241	41250	80 %	0 %	20 %	0 %	59714406
40	NC_006842	ACCAA	2	10	41367	41376	60 %	0 %	0 %	40 %	59714406
41	NC_006842	AACGA	2	10	43135	43144	60 %	0 %	20 %	20 %	59714408
42	NC_006842	CAAAC	2	10	44666	44675	60 %	0 %	0 %	40 %	59714410

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.