MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Vibrio fischeri ES114 plasmid pES100

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006842	CTTT	2	8	69	76	0 %	75 %	0 %	25 %	59714357
2	NC_006842	CTTG	2	8	683	690	0 %	50 %	25 %	25 %	59714358
3	NC_006842	GCTT	2	8	1274	1281	0 %	50 %	25 %	25 %	59714358
4	NC_006842	CATT	2	8	1397	1404	25 %	50 %	0 %	25 %	59714358
5	NC_006842	TTCT	2	8	2439	2446	0 %	75 %	0 %	25 %	59714359
6	NC_006842	AATG	2	8	2553	2560	50 %	25 %	25 %	0 %	59714359
7	NC_006842	TTTG	2	8	2746	2753	0 %	75 %	25 %	0 %	59714360
8	NC_006842	CAAA	2	8	2757	2764	75 %	0 %	0 %	25 %	59714360
9	NC_006842	AACC	2	8	3127	3134	50 %	0 %	0 %	50 %	59714361
10	NC_006842	TTAA	2	8	4033	4040	50 %	50 %	0 %	0 %	59714363
11	NC_006842	GTTG	2	8	4046	4053	0 %	50 %	50 %	0 %	59714363
12	NC_006842	CATT	2	8	4824	4831	25 %	50 %	0 %	25 %	59714364
13	NC_006842	TTTG	2	8	4832	4839	0 %	75 %	25 %	0 %	59714364
14	NC_006842	TAAA	2	8	6175	6182	75 %	25 %	0 %	0 %	59714366
15	NC_006842	TAAT	2	8	6765	6772	50 %	50 %	0 %	0 %	59714367
16	NC_006842	CATA	2	8	7212	7219	50 %	25 %	0 %	25 %	59714367
17	NC_006842	ATAG	2	8	7304	7311	50 %	25 %	25 %	0 %	59714367
18	NC_006842	CTTT	2	8	7589	7596	0 %	75 %	0 %	25 %	59714368
19	NC_006842	TCTA	2	8	8030	8037	25 %	50 %	0 %	25 %	59714369
20	NC_006842	TTGC	2	8	8901	8908	0 %	50 %	25 %	25 %	59714371
21	NC_006842	TCAA	2	8	9523	9530	50 %	25 %	0 %	25 %	59714372
22	NC_006842	GTAA	2	8	10525	10532	50 %	25 %	25 %	0 %	59714373
23	NC_006842	CAAG	2	8	10986	10993	50 %	0 %	25 %	25 %	59714373
24	NC_006842	ACAT	2	8	11902	11909	50 %	25 %	0 %	25 %	59714374
25	NC_006842	CTAA	2	8	12202	12209	50 %	25 %	0 %	25 %	59714374
26	NC_006842	CTTT	2	8	12312	12319	0 %	75 %	0 %	25 %	59714374
27	NC_006842	TTTC	2	8	12341	12348	0 %	75 %	0 %	25 %	59714374
28	NC_006842	CAAA	2	8	12397	12404	75 %	0 %	0 %	25 %	59714375
29	NC_006842	GAAA	2	8	12511	12518	75 %	0 %	25 %	0 %	59714376
30	NC_006842	ATCG	2	8	13034	13041	25 %	25 %	25 %	25 %	59714377
31	NC_006842	TTCA	2	8	13475	13482	25 %	50 %	0 %	25 %	59714378
32	NC_006842	TACC	2	8	13555	13562	25 %	25 %	0 %	50 %	59714378
33	NC_006842	AGTG	2	8	13790	13797	25 %	25 %	50 %	0 %	59714378
34	NC_006842	CAAA	2	8	14120	14127	75 %	0 %	0 %	25 %	59714379
35	NC_006842	TAGA	2	8	14463	14470	50 %	25 %	25 %	0 %	59714380
36	NC_006842	CAAC	3	12	14791	14802	50 %	0 %	0 %	50 %	59714381
37	NC_006842	ACTA	2	8	15187	15194	50 %	25 %	0 %	25 %	59714381
38	NC_006842	ATTC	2	8	15312	15319	25 %	50 %	0 %	25 %	59714381
39	NC_006842	ATTT	2	8	15624	15631	25 %	75 %	0 %	0 %	59714382
40	NC_006842	CAAA	2	8	16606	16613	75 %	0 %	0 %	25 %	59714382
41	NC_006842	AAAC	2	8	16650	16657	75 %	0 %	0 %	25 %	59714382
42	NC_006842	CAAA	2	8	16674	16681	75 %	0 %	0 %	25 %	59714382
43	NC_006842	CTTT	2	8	16790	16797	0 %	75 %	0 %	25 %	59714383
44	NC_006842	GATT	2	8	17253	17260	25 %	50 %	25 %	0 %	59714383
45	NC_006842	ATTG	2	8	17383	17390	25 %	50 %	25 %	0 %	59714383
46	NC_006842	CACT	2	8	17731	17738	25 %	25 %	0 %	50 %	59714383
47	NC_006842	CAAG	2	8	18159	18166	50 %	0 %	25 %	25 %	59714384
48	NC_006842	AAAC	2	8	18880	18887	75 %	0 %	0 %	25 %	59714385
49	NC_006842	CTAT	2	8	18972	18979	25 %	50 %	0 %	25 %	59714385
50	NC_006842	TTGG	2	8	19181	19188	0 %	50 %	50 %	0 %	59714385
51	NC_006842	ACAT	2	8	19569	19576	50 %	25 %	0 %	25 %	59714385
52	NC_006842	TTTA	2	8	19878	19885	25 %	75 %	0 %	0 %	59714385
53	NC_006842	ATTT	2	8	19988	19995	25 %	75 %	0 %	0 %	59714385
54	NC_006842	ATGA	2	8	20063	20070	50 %	25 %	25 %	0 %	59714385
55	NC_006842	GTTC	2	8	20318	20325	0 %	50 %	25 %	25 %	59714386
56	NC_006842	TTGG	2	8	20712	20719	0 %	50 %	50 %	0 %	59714386
57	NC_006842	TCAT	2	8	20932	20939	25 %	50 %	0 %	25 %	59714386
58	NC_006842	TTAC	2	8	20949	20956	25 %	50 %	0 %	25 %	59714386
59	NC_006842	TGTT	2	8	21187	21194	0 %	75 %	25 %	0 %	59714387
60	NC_006842	CTAC	2	8	22329	22336	25 %	25 %	0 %	50 %	59714389
61	NC_006842	TAAA	2	8	23024	23031	75 %	25 %	0 %	0 %	59714389
62	NC_006842	GGAT	2	8	23350	23357	25 %	25 %	50 %	0 %	59714390
63	NC_006842	CAAT	2	8	23960	23967	50 %	25 %	0 %	25 %	59714391
64	NC_006842	TAAA	2	8	24204	24211	75 %	25 %	0 %	0 %	59714391
65	NC_006842	CAAC	2	8	24276	24283	50 %	0 %	0 %	50 %	59714391
66	NC_006842	ATTT	2	8	24301	24308	25 %	75 %	0 %	0 %	59714391
67	NC_006842	TCAA	2	8	24554	24561	50 %	25 %	0 %	25 %	59714391
68	NC_006842	AAAG	2	8	24690	24697	75 %	0 %	25 %	0 %	59714392
69	NC_006842	GAAT	2	8	26228	26235	50 %	25 %	25 %	0 %	172087628
70	NC_006842	ATCA	2	8	26326	26333	50 %	25 %	0 %	25 %	59714395
71	NC_006842	CTCA	2	8	27088	27095	25 %	25 %	0 %	50 %	59714395
72	NC_006842	TGGT	2	8	27422	27429	0 %	50 %	50 %	0 %	59714395
73	NC_006842	CTAC	2	8	27768	27775	25 %	25 %	0 %	50 %	59714395
74	NC_006842	CAAA	2	8	27789	27796	75 %	0 %	0 %	25 %	59714395
75	NC_006842	TTAA	2	8	27973	27980	50 %	50 %	0 %	0 %	59714395
76	NC_006842	CAAC	2	8	28115	28122	50 %	0 %	0 %	50 %	59714395
77	NC_006842	AAAC	2	8	28290	28297	75 %	0 %	0 %	25 %	59714395
78	NC_006842	ATTT	2	8	28408	28415	25 %	75 %	0 %	0 %	59714395
79	NC_006842	CAAT	2	8	28533	28540	50 %	25 %	0 %	25 %	59714395
80	NC_006842	CTCA	2	8	28551	28558	25 %	25 %	0 %	50 %	59714395
81	NC_006842	ATCA	2	8	28629	28636	50 %	25 %	0 %	25 %	59714395
82	NC_006842	TCTT	2	8	28993	29000	0 %	75 %	0 %	25 %	59714396
83	NC_006842	TGAA	2	8	29038	29045	50 %	25 %	25 %	0 %	59714396
84	NC_006842	CCTT	2	8	29908	29915	0 %	50 %	0 %	50 %	59714397
85	NC_006842	ACTC	2	8	30060	30067	25 %	25 %	0 %	50 %	59714397
86	NC_006842	AAAG	2	8	30578	30585	75 %	0 %	25 %	0 %	59714398
87	NC_006842	TCAA	2	8	30643	30650	50 %	25 %	0 %	25 %	59714398
88	NC_006842	TTAC	2	8	31060	31067	25 %	50 %	0 %	25 %	59714398
89	NC_006842	CAAG	2	8	31241	31248	50 %	0 %	25 %	25 %	59714398
90	NC_006842	TGTT	2	8	31251	31258	0 %	75 %	25 %	0 %	59714398
91	NC_006842	CTGG	2	8	31412	31419	0 %	25 %	50 %	25 %	59714398
92	NC_006842	ATCA	2	8	31645	31652	50 %	25 %	0 %	25 %	59714399
93	NC_006842	AATG	2	8	31669	31676	50 %	25 %	25 %	0 %	59714399
94	NC_006842	ATCA	2	8	31708	31715	50 %	25 %	0 %	25 %	59714399
95	NC_006842	TCAG	3	12	31837	31848	25 %	25 %	25 %	25 %	59714399
96	NC_006842	ACAA	2	8	32036	32043	75 %	0 %	0 %	25 %	59714399
97	NC_006842	ATCT	2	8	32066	32073	25 %	50 %	0 %	25 %	59714399
98	NC_006842	AACA	2	8	32938	32945	75 %	0 %	0 %	25 %	59714400
99	NC_006842	CAAT	2	8	33104	33111	50 %	25 %	0 %	25 %	59714400
100	NC_006842	AAGA	2	8	33658	33665	75 %	0 %	25 %	0 %	59714400
101	NC_006842	AATT	2	8	33744	33751	50 %	50 %	0 %	0 %	59714400
102	NC_006842	AAAC	2	8	33963	33970	75 %	0 %	0 %	25 %	59714400
103	NC_006842	AAAC	2	8	34088	34095	75 %	0 %	0 %	25 %	59714400
104	NC_006842	GAAA	2	8	34162	34169	75 %	0 %	25 %	0 %	59714400
105	NC_006842	TAAA	2	8	34566	34573	75 %	25 %	0 %	0 %	59714401
106	NC_006842	GATT	2	8	36341	36348	25 %	50 %	25 %	0 %	59714402
107	NC_006842	GAAA	2	8	36473	36480	75 %	0 %	25 %	0 %	59714402
108	NC_006842	ATGT	2	8	36862	36869	25 %	50 %	25 %	0 %	59714402
109	NC_006842	CAAA	2	8	37127	37134	75 %	0 %	0 %	25 %	59714403
110	NC_006842	ACAG	2	8	37344	37351	50 %	0 %	25 %	25 %	59714403
111	NC_006842	AACA	2	8	37858	37865	75 %	0 %	0 %	25 %	59714404
112	NC_006842	TTGC	2	8	37923	37930	0 %	50 %	25 %	25 %	59714404
113	NC_006842	GGAA	2	8	39930	39937	50 %	0 %	50 %	0 %	59714406
114	NC_006842	AAGC	2	8	40058	40065	50 %	0 %	25 %	25 %	59714406
115	NC_006842	AAAG	2	8	40493	40500	75 %	0 %	25 %	0 %	59714406
116	NC_006842	GAAC	2	8	40646	40653	50 %	0 %	25 %	25 %	59714406
117	NC_006842	AAGC	2	8	40971	40978	50 %	0 %	25 %	25 %	59714406
118	NC_006842	ATTA	2	8	40984	40991	50 %	50 %	0 %	0 %	59714406
119	NC_006842	ATTT	2	8	41060	41067	25 %	75 %	0 %	0 %	59714406
120	NC_006842	GAAA	2	8	41101	41108	75 %	0 %	25 %	0 %	59714406
121	NC_006842	TGAT	2	8	41421	41428	25 %	50 %	25 %	0 %	59714406
122	NC_006842	AAGA	2	8	41684	41691	75 %	0 %	25 %	0 %	59714406
123	NC_006842	TTAA	2	8	42027	42034	50 %	50 %	0 %	0 %	59714407
124	NC_006842	ATCA	2	8	42339	42346	50 %	25 %	0 %	25 %	59714407
125	NC_006842	ATGA	2	8	42587	42594	50 %	25 %	25 %	0 %	59714408
126	NC_006842	TAAA	2	8	42807	42814	75 %	25 %	0 %	0 %	59714408
127	NC_006842	AATT	2	8	43047	43054	50 %	50 %	0 %	0 %	59714408
128	NC_006842	AATG	2	8	44575	44582	50 %	25 %	25 %	0 %	59714410
129	NC_006842	AGCA	2	8	44643	44650	50 %	0 %	25 %	25 %	59714410
130	NC_006842	AACA	2	8	44850	44857	75 %	0 %	0 %	25 %	59714411
131	NC_006842	CTGG	2	8	45589	45596	0 %	25 %	50 %	25 %	59714411

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.