MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Vibrio fischeri ES114 plasmid pES100

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006842	TA	4	8	271	278	50 %	50 %	0 %	0 %	59714357
2	NC_006842	TA	3	6	407	412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006842	CG	3	6	613	618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_006842	TA	3	6	1736	1741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006842	AT	3	6	2262	2267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006842	CA	3	6	3673	3678	50 %	0 %	0 %	50 %	59714362
7	NC_006842	CA	3	6	4262	4267	50 %	0 %	0 %	50 %	59714363
8	NC_006842	TC	3	6	4578	4583	0 %	50 %	0 %	50 %	59714364
9	NC_006842	TG	3	6	5620	5625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006842	AT	3	6	5830	5835	50 %	50 %	0 %	0 %	59714365
11	NC_006842	GT	3	6	6568	6573	0 %	50 %	50 %	0 %	59714367
12	NC_006842	AT	3	6	7628	7633	50 %	50 %	0 %	0 %	59714368
13	NC_006842	AC	3	6	9373	9378	50 %	0 %	0 %	50 %	59714371
14	NC_006842	CA	3	6	9484	9489	50 %	0 %	0 %	50 %	59714372
15	NC_006842	CA	3	6	9628	9633	50 %	0 %	0 %	50 %	59714372
16	NC_006842	AG	3	6	9859	9864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006842	TA	3	6	10238	10243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006842	CG	3	6	11109	11114	0 %	0 %	50 %	50 %	59714373
19	NC_006842	AG	3	6	11309	11314	50 %	0 %	50 %	0 %	59714373
20	NC_006842	AT	3	6	11802	11807	50 %	50 %	0 %	0 %	59714374
21	NC_006842	AT	3	6	12053	12058	50 %	50 %	0 %	0 %	59714374
22	NC_006842	CA	3	6	12077	12082	50 %	0 %	0 %	50 %	59714374
23	NC_006842	GT	3	6	13202	13207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006842	AT	3	6	13367	13372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006842	CT	3	6	13645	13650	0 %	50 %	0 %	50 %	59714378
26	NC_006842	CT	3	6	14923	14928	0 %	50 %	0 %	50 %	59714381
27	NC_006842	CA	3	6	16580	16585	50 %	0 %	0 %	50 %	59714382
28	NC_006842	CA	3	6	17116	17121	50 %	0 %	0 %	50 %	59714383
29	NC_006842	CA	3	6	17157	17162	50 %	0 %	0 %	50 %	59714383
30	NC_006842	CT	3	6	20445	20450	0 %	50 %	0 %	50 %	59714386
31	NC_006842	GC	3	6	20926	20931	0 %	0 %	50 %	50 %	59714386
32	NC_006842	TG	3	6	21316	21321	0 %	50 %	50 %	0 %	59714387
33	NC_006842	GT	3	6	22210	22215	0 %	50 %	50 %	0 %	59714389
34	NC_006842	AC	3	6	22279	22284	50 %	0 %	0 %	50 %	59714389
35	NC_006842	AG	3	6	22518	22523	50 %	0 %	50 %	0 %	59714389
36	NC_006842	TA	3	6	23510	23515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006842	CA	3	6	25187	25192	50 %	0 %	0 %	50 %	59714393
38	NC_006842	AC	3	6	25546	25551	50 %	0 %	0 %	50 %	59714393
39	NC_006842	CT	3	6	26065	26070	0 %	50 %	0 %	50 %	172087628
40	NC_006842	TA	3	6	26264	26269	50 %	50 %	0 %	0 %	172087628
41	NC_006842	TA	3	6	26498	26503	50 %	50 %	0 %	0 %	59714395
42	NC_006842	AC	3	6	26562	26567	50 %	0 %	0 %	50 %	59714395
43	NC_006842	TA	3	6	26615	26620	50 %	50 %	0 %	0 %	59714395
44	NC_006842	TC	3	6	26844	26849	0 %	50 %	0 %	50 %	59714395
45	NC_006842	GA	4	8	28012	28019	50 %	0 %	50 %	0 %	59714395
46	NC_006842	CT	3	6	28616	28621	0 %	50 %	0 %	50 %	59714395
47	NC_006842	AT	3	6	32762	32767	50 %	50 %	0 %	0 %	59714400
48	NC_006842	AC	3	6	33218	33223	50 %	0 %	0 %	50 %	59714400
49	NC_006842	CG	3	6	35446	35451	0 %	0 %	50 %	50 %	59714402
50	NC_006842	CT	3	6	36320	36325	0 %	50 %	0 %	50 %	59714402
51	NC_006842	AC	3	6	37054	37059	50 %	0 %	0 %	50 %	59714403
52	NC_006842	GT	3	6	37840	37845	0 %	50 %	50 %	0 %	59714404
53	NC_006842	CA	3	6	38317	38322	50 %	0 %	0 %	50 %	59714405
54	NC_006842	CT	3	6	38339	38344	0 %	50 %	0 %	50 %	59714405
55	NC_006842	CT	3	6	38601	38606	0 %	50 %	0 %	50 %	59714406
56	NC_006842	GA	3	6	40250	40255	50 %	0 %	50 %	0 %	59714406
57	NC_006842	AC	3	6	40616	40621	50 %	0 %	0 %	50 %	59714406
58	NC_006842	AT	3	6	44891	44896	50 %	50 %	0 %	0 %	59714411

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.