MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio fischeri ES114 chromosome II

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006841	TCCATT	2	12	995	1006	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006841	AATTTT	2	12	8460	8471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006841	GGAAAA	2	12	24986	24997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006841	AAAACA	2	12	25026	25037	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_006841	AATATA	2	12	45619	45630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006841	AATATA	2	12	72772	72783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006841	TTAAAA	2	12	105542	105553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006841	AAAAAT	2	12	154749	154760	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006841	TTGTTA	2	12	157484	157495	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006841	CTTTTT	2	12	166685	166696	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_006841	AATCCA	2	12	169995	170006	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006841	GCATTC	2	12	180672	180683	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_006841	TGGAAT	2	12	198230	198241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006841	TTTTAT	2	12	242625	242636	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006841	TCGAAA	2	12	265143	265154	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_006841	TTTGAT	2	12	275069	275080	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006841	TCGTTT	2	12	279625	279636	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_006841	ATTTTC	2	12	307245	307256	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_006841	ATTTTC	2	12	307451	307462	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_006841	AGGGAT	2	12	307632	307643	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006841	CTATCG	2	12	308415	308426	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006841	AATAGT	2	12	319911	319922	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006841	TCATTT	2	12	371052	371063	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_006841	TATTGT	2	12	371069	371080	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006841	CTTTTA	2	12	388399	388410	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_006841	TTTTTG	2	12	412695	412706	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006841	AAATGT	2	12	423078	423089	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006841	AAATGT	4	24	440368	440391	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006841	TGAAAT	2	12	479645	479656	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006841	TTTTAT	2	12	518975	518986	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006841	AAACAT	2	12	536708	536719	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_006841	TTGGTT	2	12	544182	544193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006841	TAAAAA	2	12	598608	598619	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006841	TATCGA	2	12	602229	602240	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_006841	AACTAA	2	12	620805	620816	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_006841	TTTTAT	2	12	636915	636926	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006841	CCATAT	2	12	659018	659029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_006841	CCATAT	2	12	659576	659587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006841	TAATGA	2	12	699919	699930	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006841	ACTAAA	2	12	716467	716478	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_006841	TTAAAT	2	12	719855	719866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006841	TTTCCT	2	12	733435	733446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006841	ATCGAA	2	12	738840	738851	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_006841	AAAATC	2	12	739886	739897	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_006841	AACTGA	2	12	747203	747214	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_006841	ATAATG	2	12	790013	790024	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006841	TCACAA	2	12	820541	820552	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006841	ACTTAA	2	12	868945	868956	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_006841	CATGAT	2	12	937966	937977	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_006841	AACAAA	2	12	1007162	1007173	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_006841	TAAAAC	2	12	1010442	1010453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_006841	TCCCTA	2	12	1073813	1073824	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_006841	TATAAT	2	12	1085318	1085329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006841	TAAAAT	2	12	1122536	1122547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006841	AGGGAT	2	12	1137560	1137571	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006841	AAAACA	2	12	1169002	1169013	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_006841	TTCTAT	2	12	1208701	1208712	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_006841	ATAATT	2	12	1215507	1215518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006841	ATTTTT	2	12	1223685	1223696	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006841	GCTTGA	2	12	1233451	1233462	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_006841	TTACTT	2	12	1233534	1233545	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_006841	ATATTT	2	12	1238711	1238722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006841	TTTTAT	2	12	1243006	1243017	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006841	TAATAT	2	12	1243437	1243448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006841	ACAAAT	2	12	1250531	1250542	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_006841	CAATCT	2	12	1258653	1258664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_006841	TAAATG	2	12	1264852	1264863	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006841	AAAAAT	2	12	1278837	1278848	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.