MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Vibrio fischeri ES114 chromosome II

Total Repeats: 457

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006841	CGTTTC	2	12	2010	2021	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	59713184
2	NC_006841	GATCAA	2	12	2078	2089	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	59713184
3	NC_006841	AATGAA	2	12	4822	4833	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	59713186
4	NC_006841	CTGGTA	2	12	6900	6911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	59713187
5	NC_006841	ATTTGT	2	12	8393	8404	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	59713188
6	NC_006841	TGAGTT	2	12	11691	11702	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59713192
7	NC_006841	TGAAGA	2	12	12051	12062	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	59713192
8	NC_006841	AGCACA	2	12	13350	13361	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	59713196
9	NC_006841	TAAAGT	2	12	22871	22882	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	172087790
10	NC_006841	AATGCA	2	12	39893	39904	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	59713220
11	NC_006841	CAATGG	2	12	45067	45078	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	59713224
12	NC_006841	GCACCA	2	12	46581	46592	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	59713225
13	NC_006841	TTCTAT	2	12	48990	49001	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59713227
14	NC_006841	TAATGC	2	12	54712	54723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59713233
15	NC_006841	CTTTAG	2	12	55029	55040	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59713233
16	NC_006841	TGCCAT	2	12	55255	55266	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	59713233
17	NC_006841	GAGCAA	2	12	56257	56268	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	59713235
18	NC_006841	GTTCTT	2	12	58317	58328	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	59713238
19	NC_006841	CAGATA	2	12	62376	62387	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	59713241
20	NC_006841	TAGGCT	2	12	63543	63554	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	59713242
21	NC_006841	CGACAT	2	12	70847	70858	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59713248
22	NC_006841	CACCCA	2	12	77101	77112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59713256
23	NC_006841	ATCGTT	2	12	78451	78462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59713257
24	NC_006841	TGGTCT	2	12	79903	79914	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	59713258
25	NC_006841	AACATC	2	12	81345	81356	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	59713258
26	NC_006841	AATAGA	2	12	85117	85128	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	59713261
27	NC_006841	ATCAAA	2	12	85640	85651	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	59713262
28	NC_006841	GATATT	2	12	96587	96598	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	59713271
29	NC_006841	TGGTAT	2	12	104608	104619	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59713276
30	NC_006841	ACTTAA	2	12	108535	108546	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	59713280
31	NC_006841	TCATGT	2	12	120162	120173	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59713289
32	NC_006841	AGCCAA	2	12	127150	127161	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	59713295
33	NC_006841	ACCATG	2	12	127244	127255	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59713295
34	NC_006841	TTGATG	2	12	128614	128625	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59713296
35	NC_006841	GTTGAT	2	12	137365	137376	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59713304
36	NC_006841	TTGTGT	2	12	138420	138431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59713305
37	NC_006841	AAGAGC	2	12	139535	139546	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	59713306
38	NC_006841	ACGGGT	2	12	140458	140469	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	59713306
39	NC_006841	GTAGCC	2	12	147438	147449	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	59713314
40	NC_006841	GCTGTA	2	12	148217	148228	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	59713316
41	NC_006841	AATATC	2	12	153956	153967	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	59713322
42	NC_006841	TTTGCG	2	12	157969	157980	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	59713325
43	NC_006841	CATCTT	2	12	158033	158044	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	59713325
44	NC_006841	AAAGAG	2	12	163832	163843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59713328
45	NC_006841	GACAGG	2	12	166927	166938	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	59713334
46	NC_006841	ATCACG	2	12	172080	172091	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59713337
47	NC_006841	AAAAGA	2	12	173506	173517	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	59713338
48	NC_006841	ATAAAG	2	12	174456	174467	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	59713338
49	NC_006841	TTATCT	2	12	175680	175691	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59713340
50	NC_006841	AGAAAG	2	12	176526	176537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59713340
51	NC_006841	CAATAA	2	12	185143	185154	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	59713346
52	NC_006841	TGAATT	2	12	186250	186261	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	59713347
53	NC_006841	GTTATC	2	12	187843	187854	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59713348
54	NC_006841	TTGGCC	2	12	196987	196998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59713356
55	NC_006841	TGAGCA	2	12	199090	199101	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	59713358
56	NC_006841	TAAGCC	2	12	200341	200352	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59713361
57	NC_006841	TGAGTC	2	12	200834	200845	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	59713361
58	NC_006841	AGCAAA	2	12	201953	201964	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	59713362
59	NC_006841	TGAAGC	2	12	206659	206670	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	59713367
60	NC_006841	GTTACC	2	12	210165	210176	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	59713371
61	NC_006841	TAGTCA	2	12	212525	212536	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59713371
62	NC_006841	CCTGCT	2	12	215175	215186	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	59713374
63	NC_006841	AGAGTT	2	12	217478	217489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59713376
64	NC_006841	CTCAAA	2	12	219481	219492	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	59713379
65	NC_006841	ATCAGG	2	12	221734	221745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	59713382
66	NC_006841	ATCGTT	2	12	224494	224505	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59713384
67	NC_006841	TTGTTT	2	12	225169	225180	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	59713385
68	NC_006841	AGCAAG	2	12	227036	227047	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	59713388
69	NC_006841	GGGATT	2	12	228061	228072	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	59713389
70	NC_006841	GATGTT	2	12	244583	244594	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59713403
71	NC_006841	TAATGC	20	120	253529	253648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59713413
72	NC_006841	CTTTGA	2	12	256242	256253	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59713416
73	NC_006841	TTTTCT	2	12	256412	256423	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	59713416
74	NC_006841	CAGGTA	2	12	257888	257899	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	59713417
75	NC_006841	TTTACC	2	12	262060	262071	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	59713420
76	NC_006841	CTTTTT	2	12	262917	262928	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	59713420
77	NC_006841	AAATGG	2	12	271586	271597	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	59713428
78	NC_006841	AAAAGC	2	12	272479	272490	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	59713429
79	NC_006841	TGCTTC	2	12	273073	273084	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	59713429
80	NC_006841	TTAAAT	2	12	274281	274292	50 %	50 %	0 %	0 %	59713430
81	NC_006841	CTTTTT	2	12	274619	274630	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	59713430
82	NC_006841	TTAACA	2	12	283046	283057	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	172087798
83	NC_006841	TTTCTA	2	12	288042	288053	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59713440
84	NC_006841	CAGCAC	2	12	291991	292002	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	59713443
85	NC_006841	TGCTGT	2	12	292862	292873	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	59713443
86	NC_006841	TTGTTT	2	12	294870	294881	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	59713446
87	NC_006841	CTTCAA	2	12	295190	295201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59713446
88	NC_006841	TTCTTT	2	12	295686	295697	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	59713447
89	NC_006841	GTCAAT	2	12	298389	298400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59713449
90	NC_006841	GTTGAT	2	12	299376	299387	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59713450
91	NC_006841	TGCAAC	2	12	305765	305776	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59713458
92	NC_006841	CTGCTC	2	12	306688	306699	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	59713459
93	NC_006841	TGGTTA	2	12	310585	310596	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59713462
94	NC_006841	AAAAAT	2	12	311733	311744	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	59713463
95	NC_006841	TTTCAT	2	12	311973	311984	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59713463
96	NC_006841	TGCAAC	2	12	312753	312764	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59713464
97	NC_006841	GCTCAA	2	12	312925	312936	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59713464
98	NC_006841	TTTGGT	2	12	313027	313038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59713464
99	NC_006841	TGGCTT	2	12	313755	313766	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	59713464
100	NC_006841	ATTGTC	2	12	314474	314485	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59713465
101	NC_006841	TTAAGT	2	12	316442	316453	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	59713467
102	NC_006841	AAAACT	2	12	316585	316596	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	59713467
103	NC_006841	TGATAT	2	12	317158	317169	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	59713468
104	NC_006841	AGCTTG	2	12	317731	317742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	59713468
105	NC_006841	AGGGAT	2	12	317945	317956	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	59713468
106	NC_006841	GTGTGG	2	12	327512	327523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59713480
107	NC_006841	GCAAAA	2	12	333279	333290	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	59713483
108	NC_006841	AGCAAA	2	12	348301	348312	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	59713497
109	NC_006841	CTTGGT	2	12	352115	352126	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	59713501
110	NC_006841	GATGCA	2	12	353372	353383	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	59713502
111	NC_006841	TCAGAG	2	12	353951	353962	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	59713503
112	NC_006841	AGCGAC	2	12	360294	360305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59713508
113	NC_006841	CATTTC	2	12	365194	365205	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	59713514
114	NC_006841	TTATTT	2	12	366545	366556	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	59713514
115	NC_006841	CTTGAG	2	12	366705	366716	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	59713514
116	NC_006841	ACAATA	2	12	368660	368671	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	59713515
117	NC_006841	ACCGTA	2	12	369644	369655	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59713516
118	NC_006841	AAGCTG	2	12	376771	376782	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	59713523
119	NC_006841	AGTTGT	2	12	386554	386565	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59713530
120	NC_006841	TTTCAT	2	12	390524	390535	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59713533
121	NC_006841	AGCATT	2	12	407688	407699	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59713544
122	NC_006841	AGCAAA	2	12	408177	408188	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	59713545
123	NC_006841	AAGCAA	2	12	424556	424567	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	59713559
124	NC_006841	CTTTAT	2	12	428965	428976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59713562
125	NC_006841	GCAATA	2	12	433083	433094	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	59713566
126	NC_006841	GTAAAG	2	12	435125	435136	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	59713567
127	NC_006841	TATCGA	2	12	442591	442602	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59713573
128	NC_006841	CTTTTG	2	12	443519	443530	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	59713574
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130	NC_006841	CCATTG	2	12	444710	444721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	59713575
131	NC_006841	TTGATT	2	12	447811	447822	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	59713578
132	NC_006841	CCAGAT	2	12	449351	449362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59713579
133	NC_006841	TTTCAG	2	12	451793	451804	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59713581
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138	NC_006841	ATATCA	2	12	465654	465665	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	59713595
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142	NC_006841	ATTTAA	2	12	468121	468132	50 %	50 %	0 %	0 %	59713597
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146	NC_006841	CAATGT	2	12	481257	481268	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59713604
147	NC_006841	CAGATT	2	12	481290	481301	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59713604
148	NC_006841	ATTCTT	2	12	483223	483234	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59713606
149	NC_006841	TTGATA	2	12	485096	485107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	59713606
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225	NC_006841	TGAAAC	2	12	662331	662342	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	59713761
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227	NC_006841	TCCTTT	2	12	667459	667470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59713767
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229	NC_006841	CTGCCG	2	12	668909	668920	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	59713768
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231	NC_006841	ACCAGC	2	12	670622	670633	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	59713769
232	NC_006841	CAGTTG	2	12	671653	671664	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	59713770
233	NC_006841	GTGTTG	2	12	674484	674495	0 %	50 %	50 %	0 %	59713773
234	NC_006841	GATCGA	2	12	674535	674546	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	59713773
235	NC_006841	AAAACC	2	12	678588	678599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59713778
236	NC_006841	GATGAA	2	12	683827	683838	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	59713785
237	NC_006841	TATTAA	2	12	683883	683894	50 %	50 %	0 %	0 %	59713785
238	NC_006841	TGATGC	2	12	684315	684326	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	59713785
239	NC_006841	CTGAAG	2	12	685615	685626	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	59713788
240	NC_006841	CAGCTG	2	12	689013	689024	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	59713793
241	NC_006841	TTGGTT	2	12	689851	689862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59713794
242	NC_006841	TGGTTT	2	12	689939	689950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59713794
243	NC_006841	ATGCAG	2	12	709727	709738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	59713814
244	NC_006841	TTTATC	2	12	709836	709847	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59713814
245	NC_006841	GAACCT	2	12	717360	717371	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59713824
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249	NC_006841	ATAGCA	2	12	743639	743650	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	59713855
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260	NC_006841	ATTGAT	2	12	805728	805739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	59713898
261	NC_006841	ACACCA	2	12	810196	810207	50 %	0 %	0 %	50 %	59713901
262	NC_006841	TTATCT	2	12	811783	811794	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59713902
263	NC_006841	TCTTAT	2	12	812879	812890	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59713902
264	NC_006841	TAGCTT	2	12	815087	815098	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59713902
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342	NC_006841	GCTAAA	2	12	1008134	1008145	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	59714072
343	NC_006841	AATAGC	2	12	1009348	1009359	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	59714074
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345	NC_006841	AATGAC	2	12	1013213	1013224	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	59714077
346	NC_006841	ATAACC	2	12	1014326	1014337	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	59714077
347	NC_006841	GTGCTC	2	12	1022333	1022344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59714084
348	NC_006841	AATTTT	2	12	1032958	1032969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59714091
349	NC_006841	TACAAC	2	12	1033087	1033098	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	59714091
350	NC_006841	TATCGA	2	12	1035671	1035682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59714094
351	NC_006841	CTTCAT	2	12	1042608	1042619	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	59714101
352	NC_006841	AATGAA	2	12	1044057	1044068	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	59714102
353	NC_006841	TACTAT	2	12	1045900	1045911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	59714104
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355	NC_006841	CTATTG	2	12	1048917	1048928	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59714107
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452	NC_006841	TTTGGT	2	12	1322304	1322315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59714349
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455	NC_006841	CTTTTA	2	12	1323592	1323603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59714351
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