MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio fischeri ES114 chromosome II

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006841	AATTA	2	10	22241	22250	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006841	AACAT	2	10	36141	36150	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_006841	ATTGA	2	10	41944	41953	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006841	TGAAA	2	10	42089	42098	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006841	GTTTT	2	10	55555	55564	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006841	ATAAA	2	10	56147	56156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006841	TTTGT	2	10	65530	65539	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006841	AACTG	2	10	70934	70943	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_006841	TAATT	2	10	90432	90441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006841	AAATC	2	10	103810	103819	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_006841	AAACA	2	10	114251	114260	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006841	AATGA	2	10	118743	118752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006841	CTTAT	2	10	128035	128044	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_006841	ATTTG	2	10	131239	131248	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006841	TTAAT	2	10	134782	134791	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006841	TTTTA	2	10	138833	138842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006841	AATAG	2	10	142557	142566	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006841	AAAAT	2	10	144380	144389	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006841	AGATA	2	10	150770	150779	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006841	TTAAT	2	10	153331	153340	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006841	AGGAT	2	10	154480	154489	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006841	TAAAA	2	10	155970	155979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006841	AGCAG	2	10	156268	156277	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_006841	GAATT	2	10	157657	157666	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006841	TCTAT	2	10	165372	165381	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_006841	TATTT	2	10	190477	190486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006841	TTTAA	2	10	192061	192070	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006841	ATTTT	2	10	192112	192121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006841	TATTT	3	15	194203	194217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006841	ATTGA	2	10	195962	195971	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006841	CAATA	2	10	202311	202320	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_006841	TGTGT	2	10	202859	202868	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006841	AATTC	2	10	202874	202883	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_006841	AAAAT	2	10	213717	213726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006841	CAATA	2	10	223652	223661	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_006841	AAAAT	2	10	239748	239757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006841	TGTTT	2	10	254332	254341	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006841	TTTTC	2	10	264163	264172	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_006841	TAATT	2	10	275173	275182	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006841	TAAAA	2	10	283993	284002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006841	CATTC	2	10	286240	286249	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_006841	AGCTT	2	10	288537	288546	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_006841	AATAA	2	10	291544	291553	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006841	AGTAA	2	10	295306	295315	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006841	TATAA	2	10	301081	301090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006841	CAAAA	2	10	301137	301146	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_006841	TGATG	2	10	301588	301597	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006841	GCGGA	2	10	307306	307315	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_006841	GCGGA	2	10	307512	307521	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_006841	AAGTA	2	10	307749	307758	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006841	AGCTA	2	10	319855	319864	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_006841	ATAAA	2	10	361474	361483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006841	TGATT	2	10	376467	376476	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006841	GTTAG	2	10	378219	378228	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006841	TTTGA	2	10	394167	394176	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006841	AGAGT	2	10	395447	395456	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006841	TCGCT	2	10	396655	396664	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_006841	TTTAT	2	10	403368	403377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006841	TAAAA	2	10	408347	408356	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006841	AATTG	2	10	415717	415726	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006841	TATTT	2	10	421517	421526	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006841	TGATT	2	10	423154	423163	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006841	CCTGT	2	10	434017	434026	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_006841	ATTAA	2	10	445728	445737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006841	ACGTT	2	10	445760	445769	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_006841	TGATA	2	10	448724	448733	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006841	AAAAG	2	10	460207	460216	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006841	ATTTA	2	10	463938	463947	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006841	TAATG	2	10	469467	469476	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006841	TAGCG	2	10	477811	477820	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_006841	ATTTT	2	10	524664	524673	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006841	ATGAA	2	10	525857	525866	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006841	GAAAT	2	10	525874	525883	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006841	CAATA	2	10	538215	538224	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_006841	ATAAA	2	10	542025	542034	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006841	GTAAG	2	10	542803	542812	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006841	AATCA	2	10	543250	543259	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_006841	TACAC	2	10	562917	562926	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_006841	TTTTA	2	10	568475	568484	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006841	CTTTT	2	10	572168	572177	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_006841	ATGGA	2	10	572185	572194	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006841	TGATT	2	10	578734	578743	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006841	ATAAA	2	10	584463	584472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006841	TAACA	2	10	598450	598459	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_006841	ATGGA	2	10	602333	602342	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006841	AATAC	2	10	602466	602475	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_006841	TAGGT	2	10	620891	620900	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006841	ATTTA	2	10	634948	634957	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006841	AATTA	2	10	635965	635974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006841	TTAAT	2	10	658645	658654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006841	TTAAT	2	10	659203	659212	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006841	TTAAT	2	10	659759	659768	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006841	AATTA	2	10	662940	662949	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006841	TATTC	2	10	685429	685438	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_006841	TTAAA	2	10	688398	688407	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006841	AATAG	2	10	695958	695967	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006841	CTTTT	2	10	698170	698179	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_006841	TAAAA	2	10	700413	700422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006841	AACTG	2	10	705174	705183	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_006841	CGCTT	2	10	707901	707910	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_006841	CGCTT	2	10	713870	713879	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_006841	AAAAC	2	10	717744	717753	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_006841	TATAC	2	10	719844	719853	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_006841	CCTTT	2	10	721422	721431	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_006841	ACCAA	2	10	723594	723603	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_006841	TTTAA	2	10	723729	723738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006841	TTTTA	2	10	724278	724287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006841	GAAAC	2	10	729088	729097	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_006841	CTGAA	2	10	729385	729394	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_006841	CGCTT	2	10	731916	731925	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_006841	CGAAA	2	10	732026	732035	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_006841	AAATG	2	10	732243	732252	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006841	TTAAA	2	10	740292	740301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006841	TTTCT	2	10	741142	741151	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_006841	AAAAT	2	10	746281	746290	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006841	AAGCG	2	10	758121	758130	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_006841	ATTTT	2	10	770190	770199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006841	AATGT	2	10	778487	778496	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006841	ATTTT	2	10	789998	790007	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006841	ATTCA	2	10	803886	803895	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_006841	TTCGA	2	10	803933	803942	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_006841	AGATA	2	10	804089	804098	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006841	TTTAT	2	10	820698	820707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006841	ATTTT	2	10	824416	824425	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006841	AAAGA	2	10	845215	845224	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006841	TAAAA	2	10	881034	881043	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006841	CCTCC	2	10	896229	896238	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
128	NC_006841	GTGTA	2	10	897614	897623	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006841	CAATG	2	10	907549	907558	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_006841	AGCTA	2	10	936965	936974	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_006841	AGATT	2	10	938156	938165	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006841	ATTTT	2	10	942277	942286	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006841	CTAAA	2	10	958472	958481	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_006841	TAAAT	2	10	963781	963790	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006841	AATAA	2	10	965846	965855	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006841	ATAAA	2	10	969012	969021	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006841	TTAAC	2	10	976264	976273	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_006841	AATAA	2	10	987863	987872	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006841	AATAA	2	10	1007893	1007902	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006841	TAAAA	2	10	1040247	1040256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006841	AATTA	2	10	1055716	1055725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006841	GTATG	2	10	1056250	1056259	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006841	TCTCC	2	10	1067005	1067014	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
144	NC_006841	TAAAA	2	10	1073894	1073903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006841	TATTT	2	10	1075635	1075644	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006841	TGATT	2	10	1101235	1101244	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006841	TTTAT	2	10	1119641	1119650	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006841	CAATT	2	10	1131032	1131041	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_006841	TAATT	2	10	1136208	1136217	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006841	TAATT	2	10	1141946	1141955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_006841	GCCAT	2	10	1149237	1149246	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_006841	TAATT	2	10	1149529	1149538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_006841	GAATA	2	10	1172191	1172200	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_006841	ATTTT	2	10	1204928	1204937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_006841	TTAAT	2	10	1213446	1213455	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_006841	ATAAA	2	10	1213589	1213598	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_006841	ATTAA	2	10	1216155	1216164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_006841	TAATT	2	10	1220533	1220542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_006841	TTAGA	2	10	1221284	1221293	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_006841	AAATA	2	10	1221307	1221316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_006841	TTTAC	2	10	1221385	1221394	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_006841	TAATT	2	10	1233118	1233127	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_006841	ACTTT	2	10	1243052	1243061	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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176	NC_006841	AAAAT	2	10	1264958	1264967	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_006841	TATTT	2	10	1280645	1280654	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_006841	AATAA	2	10	1284316	1284325	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_006841	GCCTC	2	10	1285055	1285064	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
183	NC_006841	AAAAT	2	10	1285125	1285134	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_006841	CTGAA	2	10	1286747	1286756	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
185	NC_006841	GATTT	2	10	1291175	1291184	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_006841	TTTAT	3	15	1316655	1316669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_006841	AAGAA	2	10	1327384	1327393	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.