MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Vibrio fischeri ES114 chromosome I

Total Repeats: 1103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006840	TATCAA	2	12	606	617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	59710608
2	NC_006840	CAATAC	2	12	1323	1334	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	59710609
3	NC_006840	CTTTTG	2	12	2091	2102	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	59710609
4	NC_006840	TTGTGA	2	12	3693	3704	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59710610
5	NC_006840	GTTTGT	2	12	3779	3790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710610
6	NC_006840	TTTGGT	2	12	6820	6831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59710615
7	NC_006840	TTCAGT	2	12	11254	11265	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59710619
8	NC_006840	AAAGCA	2	12	11969	11980	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	59710619
9	NC_006840	GCTCGT	2	12	12191	12202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710619
10	NC_006840	CCGATG	2	12	12546	12557	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	59710619
11	NC_006840	AAGATG	2	12	12696	12707	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	59710619
12	NC_006840	CTTCCT	2	12	16735	16746	0 %	50 %	0 %	50 %	59710622
13	NC_006840	GCGAGT	2	12	20245	20256	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	59710624
14	NC_006840	AAAGAG	2	12	32760	32771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710636
15	NC_006840	TTATCA	2	12	33434	33445	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	59710636
16	NC_006840	ATTGGT	2	12	36498	36509	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59710638
17	NC_006840	TAAAAG	2	12	39965	39976	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	59710640
18	NC_006840	CTGAGG	2	12	40187	40198	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	59710640
19	NC_006840	TTTCAA	2	12	46247	46258	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	59710645
20	NC_006840	ATCATA	2	12	46431	46442	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	59710645
21	NC_006840	TTAAGG	2	12	51325	51336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710650
22	NC_006840	ATTGTT	2	12	51660	51671	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	59710650
23	NC_006840	GTTTTG	2	12	52399	52410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172087634
24	NC_006840	CAAAAC	2	12	53013	53024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172087634
25	NC_006840	GATAAA	2	12	53817	53828	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	59710653
26	NC_006840	ACTGAT	2	12	56724	56735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59710657
27	NC_006840	TCTTGT	2	12	59558	59569	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	59710659
28	NC_006840	ATGGTG	2	12	60905	60916	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	59710660
29	NC_006840	GTGCTG	2	12	61086	61097	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	59710660
30	NC_006840	GCAATG	2	12	61878	61889	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	59710661
31	NC_006840	GTGCTT	2	12	62472	62483	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	59710661
32	NC_006840	GATTTG	2	12	72744	72755	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59710671
33	NC_006840	AGACCT	2	12	74390	74401	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59710673
34	NC_006840	CAAGGT	2	12	75939	75950	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	172087636
35	NC_006840	TGAAAC	2	12	76624	76635	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	172087636
36	NC_006840	AATCAT	2	12	84147	84158	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	59710679
37	NC_006840	AGGTAA	2	12	88001	88012	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	59710681
38	NC_006840	TCAACT	2	12	90203	90214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710682
39	NC_006840	CGGTGC	2	12	98167	98178	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	59710693
40	NC_006840	TTATCG	2	12	98512	98523	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59710693
41	NC_006840	GTTGCT	2	12	99958	99969	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	59710694
42	NC_006840	TTTATT	2	12	106259	106270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	172087637
43	NC_006840	TTATTT	2	12	106494	106505	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	172087637
44	NC_006840	AATTTG	2	12	107204	107215	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	172087639
45	NC_006840	GCAATG	2	12	109340	109351	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	59710701
46	NC_006840	TACCAG	2	12	111851	111862	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59710702
47	NC_006840	TTATTT	2	12	112409	112420	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	59710703
48	NC_006840	ACGTTG	2	12	116887	116898	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	59710706
49	NC_006840	ATCCGT	2	12	118050	118061	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	59710706
50	NC_006840	ACGCTG	2	12	121696	121707	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	59710710
51	NC_006840	GCATCT	2	12	122013	122024	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	59710710
52	NC_006840	GTTAGC	2	12	126169	126180	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	59710714
53	NC_006840	ATGAAA	2	12	130080	130091	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	172087640
54	NC_006840	CAGTGT	2	12	137726	137737	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	59710726
55	NC_006840	CTTCGC	2	12	138390	138401	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	59710727
56	NC_006840	TTGGCT	2	12	139275	139286	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	59710727
57	NC_006840	GAATCC	2	12	142277	142288	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59710729
58	NC_006840	GCAGCC	2	12	148932	148943	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	59710738
59	NC_006840	GAAGCG	2	12	149085	149096	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	59710738
60	NC_006840	CGTAAA	2	12	152204	152215	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	59710742
61	NC_006840	AAGTTG	2	12	162970	162981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710750
62	NC_006840	TTTTAT	2	12	167304	167315	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	59710755
63	NC_006840	AAAAAT	2	12	170281	170292	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	59710758
64	NC_006840	AAAGAG	2	12	172818	172829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59710760
65	NC_006840	CCTTTG	2	12	176899	176910	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	172087642
66	NC_006840	CAGCTG	2	12	179261	179272	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	59710768
67	NC_006840	TACCTC	2	12	182644	182655	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	59710772
68	NC_006840	TGTTTA	2	12	188513	188524	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	59710777
69	NC_006840	TAAAAT	2	12	189458	189469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710777
70	NC_006840	TTTTAT	2	12	189626	189637	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	59710778
71	NC_006840	CATTAT	2	12	192395	192406	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	172087644
72	NC_006840	TGTTTT	2	12	192776	192787	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	172087644
73	NC_006840	TTATAT	2	12	194268	194279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59710781
74	NC_006840	ATAAAG	2	12	194493	194504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	59710781
75	NC_006840	TGCAAA	2	12	200706	200717	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	59710788
76	NC_006840	AGAATT	2	12	200730	200741	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	59710788
77	NC_006840	AAAACC	2	12	201328	201339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59710789
78	NC_006840	ATGGTG	2	12	201648	201659	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	59710789
79	NC_006840	AAGATG	2	12	202836	202847	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	59710790
80	NC_006840	TGTTGA	2	12	203535	203546	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59710791
81	NC_006840	TAAAGA	2	12	203823	203834	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	59710791
82	NC_006840	ATTGAT	2	12	205381	205392	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	59710792
83	NC_006840	AAAATA	2	12	206214	206225	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	59710793
84	NC_006840	AAATAT	2	12	207882	207893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59710794
85	NC_006840	AGTTAA	2	12	209587	209598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	59710796
86	NC_006840	ATGTGG	2	12	211417	211428	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	59710797
87	NC_006840	TAGATG	2	12	212565	212576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710798
88	NC_006840	TTTGGA	2	12	215743	215754	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59710801
89	NC_006840	TGGTGA	2	12	215881	215892	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	59710801
90	NC_006840	TGTTTT	2	12	219106	219117	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	59710804
91	NC_006840	TTTCAG	2	12	224141	224152	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59710809
92	NC_006840	CAATCT	2	12	234291	234302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710818
93	NC_006840	TCTAAG	2	12	239836	239847	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59710825
94	NC_006840	CTTTAT	2	12	240807	240818	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59710826
95	NC_006840	AAAGCC	2	12	242522	242533	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	172087646
96	NC_006840	TCACGA	2	12	243751	243762	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59710830
97	NC_006840	ATTCCC	2	12	244861	244872	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	59710832
98	NC_006840	ATCTTG	2	12	244959	244970	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59710832
99	NC_006840	GCAAGA	2	12	249588	249599	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	59710839
100	NC_006840	CTGCAG	2	12	254762	254773	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	59710844
101	NC_006840	TGAAGT	2	12	254951	254962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710845
102	NC_006840	AGACTT	2	12	255071	255082	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59710845
103	NC_006840	AAAAGC	2	12	258152	258163	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	59710852
104	NC_006840	AAAGGT	2	12	260815	260826	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	59710859
105	NC_006840	AGGTCT	2	12	261835	261846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	59710862
106	NC_006840	CAAAAG	2	12	266610	266621	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	59710870
107	NC_006840	AAGTTG	2	12	271131	271142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710874
108	NC_006840	TTTGAT	2	12	272128	272139	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	59710875
109	NC_006840	TTTAGG	2	12	273978	273989	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59710877
110	NC_006840	TTATGA	2	12	274938	274949	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	59710877
111	NC_006840	ACAAGC	2	12	275121	275132	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	59710877
112	NC_006840	AATCAA	2	12	278316	278327	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	59710880
113	NC_006840	AGCACC	2	12	280096	280107	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	59710880
114	NC_006840	CCATTT	2	12	282635	282646	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	59710882
115	NC_006840	AAAGAT	2	12	283587	283598	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	59710883
116	NC_006840	ACCATT	2	12	284308	284319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710884
117	NC_006840	ATTGAT	2	12	286487	286498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	59710887
118	NC_006840	GTATTG	2	12	288217	288228	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	172087652
119	NC_006840	AGCAAT	2	12	292131	292142	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	59710894
120	NC_006840	TACCGA	2	12	299558	299569	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59710900
121	NC_006840	ACCTTC	2	12	300636	300647	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	59710901
122	NC_006840	GTTGCC	2	12	305047	305058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59710904
123	NC_006840	TTTCTT	2	12	306769	306780	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	59710905
124	NC_006840	TTTTGA	2	12	307712	307723	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	59710905
125	NC_006840	CTGAAT	2	12	314380	314391	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59710911
126	NC_006840	AGCGTT	2	12	314678	314689	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	59710911
127	NC_006840	TTTTGT	2	12	316114	316125	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	59710913
128	NC_006840	GTATTG	2	12	316722	316733	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59710914
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131	NC_006840	AGATAA	2	12	319712	319723	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	59710917
132	NC_006840	CATTGC	2	12	321196	321207	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	59710918
133	NC_006840	AATGAA	2	12	322118	322129	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	59710918
134	NC_006840	GGTATA	2	12	327753	327764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710926
135	NC_006840	ATCGGT	2	12	329017	329028	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	59710926
136	NC_006840	TAGACC	2	12	329059	329070	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59710926
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139	NC_006840	CATGGT	4	24	338248	338271	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	59710935
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141	NC_006840	GTTGAT	2	12	344268	344279	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59710940
142	NC_006840	TGATAT	2	12	345140	345151	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	59710940
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144	NC_006840	TGCTAA	2	12	358470	358481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59710943
145	NC_006840	TGGAAT	2	12	358636	358647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59710943
146	NC_006840	TCTTAT	2	12	360292	360303	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59710944
147	NC_006840	TTCAAC	2	12	363709	363720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59710945
148	NC_006840	ACCATA	2	12	367265	367276	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	59710947
149	NC_006840	TGAAAA	2	12	367844	367855	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	59710947
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152	NC_006840	ACCTGA	2	12	371048	371059	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59710948
153	NC_006840	TTCATT	2	12	377468	377479	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59710954
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230	NC_006840	CGATAT	2	12	549373	549384	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59711120
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234	NC_006840	TTTATT	2	12	563752	563763	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	59711134
235	NC_006840	GCAAAA	2	12	564647	564658	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	59711135
236	NC_006840	GTTGAA	2	12	567899	567910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59711136
237	NC_006840	GCTAAA	2	12	568277	568288	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	59711136
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450	NC_006840	TTTAAA	2	12	1137552	1137563	50 %	50 %	0 %	0 %	59711640
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456	NC_006840	TCTGCT	2	12	1167595	1167606	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	59711664
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459	NC_006840	TGTACC	2	12	1173898	1173909	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	59711669
460	NC_006840	TTTGGC	2	12	1177610	1177621	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	59711672
461	NC_006840	GATGGT	2	12	1180923	1180934	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	59711675
462	NC_006840	CGCACC	2	12	1181047	1181058	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	59711675
463	NC_006840	TCTTTA	2	12	1183963	1183974	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59711678
464	NC_006840	AGCTCC	2	12	1183992	1184003	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	59711678
465	NC_006840	AGAAAT	2	12	1187570	1187581	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	59711681
466	NC_006840	CCTAAA	2	12	1188578	1188589	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	59711682
467	NC_006840	CCTTTT	2	12	1190579	1190590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59711686
468	NC_006840	TCTTTC	2	12	1192085	1192096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59711688
469	NC_006840	ACATGC	2	12	1192227	1192238	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59711688
470	NC_006840	TTATGC	2	12	1193912	1193923	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59711690
471	NC_006840	TTGGTT	2	12	1195304	1195315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59711691
472	NC_006840	GCTATT	2	12	1195957	1195968	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59711691
473	NC_006840	TCAATA	2	12	1196445	1196456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	172087689
474	NC_006840	TTCTCA	2	12	1201430	1201441	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	59711697
475	NC_006840	TGCTAA	2	12	1202817	1202828	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59711697
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480	NC_006840	GCAGGT	2	12	1228859	1228870	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	59711722
481	NC_006840	TGAAGC	2	12	1230839	1230850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	59711723
482	NC_006840	CTTTAC	2	12	1239035	1239046	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	59711729
483	NC_006840	TTGTCA	2	12	1240299	1240310	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59711730
484	NC_006840	AGGAGA	2	12	1250220	1250231	50 %	0 %	50 %	0 %	59711735
485	NC_006840	ATGTGG	2	12	1253882	1253893	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	59711739
486	NC_006840	TCAGAT	2	12	1261090	1261101	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59711745
487	NC_006840	ATTGTT	2	12	1265924	1265935	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	59711750
488	NC_006840	TGATTA	2	12	1266241	1266252	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	59711750
489	NC_006840	TCTGAA	2	12	1268901	1268912	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59711752
490	NC_006840	AATCGC	2	12	1272844	1272855	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59711754
491	NC_006840	TTTGGT	2	12	1277539	1277550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59711759
492	NC_006840	TTGGTA	2	12	1277681	1277692	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59711759
493	NC_006840	TGAAGC	2	12	1277808	1277819	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	59711759
494	NC_006840	ATGCGG	2	12	1278083	1278094	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	59711759
495	NC_006840	ATCTTG	2	12	1289169	1289180	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59711769
496	NC_006840	TTATTG	2	12	1291862	1291873	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	59711771
497	NC_006840	TTGAAG	2	12	1295440	1295451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59711774
498	NC_006840	GATACG	2	12	1297805	1297816	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	59711775
499	NC_006840	GCGTTA	2	12	1299158	1299169	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	59711775
500	NC_006840	GATAAA	2	12	1300264	1300275	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	59711777

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