MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio fischeri ES114 chromosome I

Total Repeats: 363

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006840	TTAAA	2	10	13875	13884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006840	AAGGA	2	10	20908	20917	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006840	GAAAA	2	10	24712	24721	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006840	TTTCA	2	10	24926	24935	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_006840	TAATG	2	10	25008	25017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006840	TTAAG	2	10	25197	25206	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006840	AAATT	2	10	28847	28856	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006840	TCTCT	2	10	35577	35586	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_006840	CATTT	2	10	37249	37258	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_006840	TGCGC	2	10	61249	61258	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_006840	GAAGC	2	10	61433	61442	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006840	GTTTT	2	10	64771	64780	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006840	AGCTA	2	10	64786	64795	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_006840	ATTTC	2	10	64868	64877	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_006840	ACTTA	2	10	66343	66352	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_006840	CATTT	2	10	69427	69436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_006840	GGTGA	2	10	74723	74732	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006840	AATAA	2	10	79760	79769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006840	TTATT	2	10	84857	84866	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006840	GTTAC	2	10	89402	89411	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_006840	ATTAA	2	10	89893	89902	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006840	AGTGG	2	10	91777	91786	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006840	TAAGA	2	10	95645	95654	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006840	AGCGC	2	10	107105	107114	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_006840	CTTTA	2	10	114305	114314	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_006840	TATAA	2	10	115765	115774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006840	ATTAA	2	10	116145	116154	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006840	TCGCT	2	10	121230	121239	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_006840	GCGCT	2	10	129915	129924	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_006840	AAGCG	2	10	130028	130037	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_006840	AGCGA	2	10	132785	132794	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_006840	CAGCG	2	10	134292	134301	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_006840	TCGCT	2	10	136068	136077	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_006840	ATTTA	2	10	140713	140722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006840	TCGCT	2	10	140786	140795	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_006840	TCGCT	2	10	143032	143041	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_006840	AAGCG	2	10	153400	153409	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_006840	TCGCT	2	10	171918	171927	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_006840	TCGCT	2	10	173918	173927	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_006840	GATTA	2	10	173950	173959	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006840	AAGCG	2	10	174358	174367	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_006840	AATAA	2	10	181136	181145	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006840	GAAAA	2	10	219518	219527	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006840	GTTGA	2	10	219923	219932	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006840	TTCAA	2	10	220769	220778	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_006840	CGCTT	2	10	225236	225245	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_006840	AAGCG	2	10	231978	231987	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_006840	TAGAA	2	10	233309	233318	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006840	AGCGT	2	10	243960	243969	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_006840	GTTTC	2	10	264794	264803	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_006840	TTAAT	2	10	268130	268139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006840	TTTAT	2	10	271417	271426	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006840	AGCGT	2	10	289480	289489	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_006840	TTTGT	2	10	327106	327115	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006840	TTGTT	2	10	339760	339769	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006840	TAGCG	2	10	348952	348961	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_006840	GGTTA	2	10	353880	353889	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006840	TCAAA	2	10	354210	354219	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_006840	TAGCG	2	10	354538	354547	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_006840	AATGA	2	10	357959	357968	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006840	AGTTC	2	10	358166	358175	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_006840	ATTTT	2	10	359654	359663	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006840	CTTTT	2	10	365172	365181	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_006840	AAAAC	2	10	371270	371279	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_006840	ATGAA	2	10	372288	372297	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006840	TAAAA	2	10	385046	385055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006840	AGAAT	2	10	388019	388028	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006840	TAGAT	2	10	418886	418895	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006840	GAGAA	2	10	433726	433735	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006840	GTTTT	2	10	448845	448854	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006840	CAATC	2	10	452298	452307	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_006840	AAGCG	2	10	454107	454116	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_006840	ACGCT	2	10	461108	461117	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_006840	CGAAG	2	10	472897	472906	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_006840	CTTTT	2	10	476712	476721	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_006840	CAAAG	2	10	486597	486606	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_006840	CTTTA	2	10	486609	486618	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_006840	CATTT	2	10	498371	498380	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_006840	TAAAT	2	10	504316	504325	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006840	AGATT	2	10	509234	509243	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006840	TTTTG	2	10	512087	512096	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006840	CTTTT	2	10	528335	528344	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_006840	TATTT	2	10	541113	541122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006840	ATTAT	2	10	571310	571319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006840	GAATA	2	10	574031	574040	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006840	ATAGA	2	10	576697	576706	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006840	TTAAT	2	10	583142	583151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006840	AATTT	2	10	598486	598495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006840	ATAAA	2	10	600589	600598	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006840	TATTT	2	10	611009	611018	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006840	TCCTT	2	10	613928	613937	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_006840	AAAGC	2	10	616830	616839	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_006840	TAGCG	2	10	619114	619123	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_006840	ATTTT	2	10	631936	631945	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006840	GAAGC	2	10	647226	647235	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_006840	TATTT	2	10	667981	667990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006840	TAATT	2	10	668145	668154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006840	TTGTT	2	10	682034	682043	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006840	TGTAA	2	10	697286	697295	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006840	GCAAT	2	10	701613	701622	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_006840	TTAAA	2	10	708143	708152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006840	TTTAA	2	10	717125	717134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006840	ATTGA	2	10	717184	717193	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006840	TTTTG	2	10	721012	721021	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006840	AAATA	2	10	724319	724328	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006840	GAATA	2	10	724382	724391	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006840	TAGAT	2	10	757705	757714	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006840	TGAAC	2	10	760279	760288	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_006840	ATAAA	2	10	791373	791382	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006840	AATTT	2	10	803454	803463	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006840	ATTCT	2	10	803727	803736	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_006840	GAAGG	2	10	811551	811560	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006840	ATTTT	2	10	832126	832135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006840	TAGGT	2	10	867733	867742	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006840	GTTTT	2	10	869784	869793	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006840	CATTC	2	10	876342	876351	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_006840	TTGGT	2	10	880563	880572	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006840	ATTCA	2	10	891458	891467	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_006840	TTATA	2	10	898521	898530	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006840	AAAGC	2	10	946952	946961	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_006840	ATTCA	2	10	947447	947456	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_006840	TTTCG	2	10	948070	948079	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_006840	CAAAT	2	10	948182	948191	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_006840	CCTTT	2	10	953549	953558	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_006840	AGCTT	2	10	953717	953726	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_006840	CTAAT	2	10	956232	956241	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_006840	TTTGA	2	10	956247	956256	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006840	CAATT	2	10	957712	957721	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_006840	CAAAA	2	10	958220	958229	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_006840	TCCTG	2	10	966584	966593	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_006840	TTTTA	2	10	966597	966606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006840	GATAA	2	10	975992	976001	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006840	AGAAA	2	10	977795	977804	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006840	TTTTA	2	10	996872	996881	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006840	GTATC	2	10	996946	996955	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_006840	GAAGT	2	10	1000404	1000413	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006840	TTTAA	2	10	1008784	1008793	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006840	ATAAA	2	10	1009236	1009245	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006840	CTTTT	2	10	1024274	1024283	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_006840	CTGAG	2	10	1057767	1057776	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_006840	ATTTT	2	10	1058882	1058891	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006840	CATTC	2	10	1059501	1059510	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_006840	TGAAA	2	10	1059549	1059558	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006840	TACAT	2	10	1060968	1060977	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_006840	TAATT	2	10	1060992	1061001	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006840	TTTAG	2	10	1062247	1062256	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006840	TGTGA	2	10	1063077	1063086	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006840	TTAAG	2	10	1065412	1065421	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006840	ATCTC	2	10	1078266	1078275	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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166	NC_006840	TTTAA	2	10	1278282	1278291	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_006840	AGTTT	2	10	1281017	1281026	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_006840	TCAGC	2	10	1361110	1361119	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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183	NC_006840	CTGCA	2	10	1409619	1409628	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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231	NC_006840	AAGCG	2	10	1919641	1919650	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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283	NC_006840	CGAAT	2	10	2318583	2318592	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_006840	CTTAA	2	10	2340670	2340679	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_006840	CATTT	2	10	2344050	2344059	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_006840	TCGGT	2	10	2371163	2371172	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
290	NC_006840	CGCTA	2	10	2371717	2371726	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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292	NC_006840	CTTTT	2	10	2385937	2385946	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
293	NC_006840	AACAA	2	10	2411223	2411232	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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295	NC_006840	CGCTA	2	10	2424065	2424074	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
296	NC_006840	TGTTT	2	10	2424473	2424482	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_006840	CTTCT	2	10	2513572	2513581	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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335	NC_006840	CGCTA	2	10	2729476	2729485	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.