MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 15316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006834	GC	3	6	10	15	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006834	CG	3	6	784	789	0 %	0 %	50 %	50 %	58579624
3	NC_006834	GC	3	6	982	987	0 %	0 %	50 %	50 %	58579624
4	NC_006834	CG	3	6	1003	1008	0 %	0 %	50 %	50 %	58579624
5	NC_006834	GC	4	8	1070	1077	0 %	0 %	50 %	50 %	58579624
6	NC_006834	CG	3	6	1812	1817	0 %	0 %	50 %	50 %	58579625
7	NC_006834	GC	3	6	1884	1889	0 %	0 %	50 %	50 %	58579625
8	NC_006834	GC	3	6	2454	2459	0 %	0 %	50 %	50 %	58579625
9	NC_006834	GC	3	6	2876	2881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_006834	CA	3	6	3018	3023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_006834	CG	4	8	3109	3116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_006834	AG	3	6	3203	3208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006834	TC	3	6	3367	3372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_006834	TG	3	6	4337	4342	0 %	50 %	50 %	0 %	58579626
15	NC_006834	GC	4	8	4479	4486	0 %	0 %	50 %	50 %	58579626
16	NC_006834	GC	3	6	4517	4522	0 %	0 %	50 %	50 %	58579626
17	NC_006834	CG	3	6	4777	4782	0 %	0 %	50 %	50 %	58579626
18	NC_006834	GC	3	6	4960	4965	0 %	0 %	50 %	50 %	58579626
19	NC_006834	CG	3	6	6123	6128	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
20	NC_006834	GC	3	6	6317	6322	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
21	NC_006834	CG	3	6	6388	6393	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
22	NC_006834	GC	3	6	6395	6400	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
23	NC_006834	CG	3	6	6406	6411	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
24	NC_006834	GC	3	6	6416	6421	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
25	NC_006834	GC	3	6	6441	6446	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
26	NC_006834	GC	3	6	6620	6625	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
27	NC_006834	GC	3	6	7037	7042	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
28	NC_006834	CG	3	6	7186	7191	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
29	NC_006834	GC	3	6	7365	7370	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
30	NC_006834	CG	3	6	8090	8095	0 %	0 %	50 %	50 %	58579628
31	NC_006834	GC	3	6	8884	8889	0 %	0 %	50 %	50 %	58579629
32	NC_006834	GC	3	6	9196	9201	0 %	0 %	50 %	50 %	58579629
33	NC_006834	GC	3	6	9223	9228	0 %	0 %	50 %	50 %	58579629
34	NC_006834	AG	3	6	10358	10363	50 %	0 %	50 %	0 %	58579630
35	NC_006834	CA	4	8	11923	11930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_006834	GC	3	6	12299	12304	0 %	0 %	50 %	50 %	58579632
37	NC_006834	CG	3	6	12694	12699	0 %	0 %	50 %	50 %	58579632
38	NC_006834	CG	3	6	13824	13829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_006834	GC	3	6	13846	13851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_006834	CG	3	6	13928	13933	0 %	0 %	50 %	50 %	58579635
41	NC_006834	GC	3	6	14085	14090	0 %	0 %	50 %	50 %	58579635
42	NC_006834	CG	3	6	14408	14413	0 %	0 %	50 %	50 %	58579635
43	NC_006834	CG	3	6	14813	14818	0 %	0 %	50 %	50 %	58579636
44	NC_006834	GC	3	6	15416	15421	0 %	0 %	50 %	50 %	58579637
45	NC_006834	CG	3	6	15611	15616	0 %	0 %	50 %	50 %	58579637
46	NC_006834	CG	3	6	16045	16050	0 %	0 %	50 %	50 %	58579637
47	NC_006834	CG	3	6	16547	16552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006834	CG	3	6	17429	17434	0 %	0 %	50 %	50 %	122878976
49	NC_006834	GC	4	8	17723	17730	0 %	0 %	50 %	50 %	122878976
50	NC_006834	GC	3	6	18031	18036	0 %	0 %	50 %	50 %	122878976
51	NC_006834	TG	3	6	18228	18233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006834	GC	3	6	18344	18349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_006834	CG	3	6	18625	18630	0 %	0 %	50 %	50 %	161899024
54	NC_006834	CA	3	6	18674	18679	50 %	0 %	0 %	50 %	161899024
55	NC_006834	CG	3	6	19192	19197	0 %	0 %	50 %	50 %	161899024
56	NC_006834	CG	3	6	19407	19412	0 %	0 %	50 %	50 %	161899024
57	NC_006834	GC	3	6	19454	19459	0 %	0 %	50 %	50 %	161899024
58	NC_006834	GC	3	6	19879	19884	0 %	0 %	50 %	50 %	122878977
59	NC_006834	GC	3	6	19958	19963	0 %	0 %	50 %	50 %	122878977
60	NC_006834	CG	3	6	20003	20008	0 %	0 %	50 %	50 %	122878977
61	NC_006834	GC	4	8	20057	20064	0 %	0 %	50 %	50 %	122878977
62	NC_006834	CG	3	6	20772	20777	0 %	0 %	50 %	50 %	122878977
63	NC_006834	CG	3	6	21382	21387	0 %	0 %	50 %	50 %	122878977
64	NC_006834	GC	3	6	21547	21552	0 %	0 %	50 %	50 %	122878977
65	NC_006834	CA	3	6	21988	21993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_006834	CG	3	6	22831	22836	0 %	0 %	50 %	50 %	58579642
67	NC_006834	CG	3	6	23330	23335	0 %	0 %	50 %	50 %	58579643
68	NC_006834	CG	4	8	23665	23672	0 %	0 %	50 %	50 %	58579643
69	NC_006834	GC	3	6	23753	23758	0 %	0 %	50 %	50 %	58579643
70	NC_006834	GC	5	10	24491	24500	0 %	0 %	50 %	50 %	58579645
71	NC_006834	GC	4	8	24865	24872	0 %	0 %	50 %	50 %	58579645
72	NC_006834	GC	3	6	24926	24931	0 %	0 %	50 %	50 %	58579645
73	NC_006834	CG	3	6	25059	25064	0 %	0 %	50 %	50 %	58579645
74	NC_006834	GC	3	6	25785	25790	0 %	0 %	50 %	50 %	58579646
75	NC_006834	CA	3	6	25807	25812	50 %	0 %	0 %	50 %	58579646
76	NC_006834	GC	3	6	25973	25978	0 %	0 %	50 %	50 %	58579646
77	NC_006834	GC	3	6	26492	26497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_006834	CG	3	6	26629	26634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_006834	GC	3	6	26791	26796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_006834	CG	4	8	27488	27495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006834	GC	3	6	27640	27645	0 %	0 %	50 %	50 %	122878978
82	NC_006834	GC	5	10	27892	27901	0 %	0 %	50 %	50 %	122878978
83	NC_006834	GC	3	6	28100	28105	0 %	0 %	50 %	50 %	122878978
84	NC_006834	GC	4	8	28196	28203	0 %	0 %	50 %	50 %	122878978
85	NC_006834	CG	3	6	28311	28316	0 %	0 %	50 %	50 %	122878978
86	NC_006834	GA	3	6	28772	28777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006834	GC	3	6	29010	29015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_006834	CG	3	6	29256	29261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_006834	GC	3	6	29275	29280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_006834	CA	3	6	29419	29424	50 %	0 %	0 %	50 %	58579651
91	NC_006834	CG	3	6	29862	29867	0 %	0 %	50 %	50 %	58579651
92	NC_006834	CG	3	6	29935	29940	0 %	0 %	50 %	50 %	58579651
93	NC_006834	TG	3	6	30429	30434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006834	GC	3	6	31705	31710	0 %	0 %	50 %	50 %	58579653
95	NC_006834	GC	4	8	31992	31999	0 %	0 %	50 %	50 %	58579653
96	NC_006834	GC	3	6	32040	32045	0 %	0 %	50 %	50 %	58579653
97	NC_006834	GC	3	6	32989	32994	0 %	0 %	50 %	50 %	58579654
98	NC_006834	GC	3	6	34975	34980	0 %	0 %	50 %	50 %	58579655
99	NC_006834	CG	3	6	36191	36196	0 %	0 %	50 %	50 %	58579656
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101	NC_006834	GC	3	6	36940	36945	0 %	0 %	50 %	50 %	122878979
102	NC_006834	CG	4	8	37002	37009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_006834	CA	3	6	37122	37127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_006834	CG	3	6	37180	37185	0 %	0 %	50 %	50 %	58579658
105	NC_006834	CG	3	6	37239	37244	0 %	0 %	50 %	50 %	58579658
106	NC_006834	CG	3	6	37365	37370	0 %	0 %	50 %	50 %	58579658
107	NC_006834	GC	3	6	37779	37784	0 %	0 %	50 %	50 %	58579658
108	NC_006834	GC	4	8	38461	38468	0 %	0 %	50 %	50 %	58579659
109	NC_006834	GC	3	6	38524	38529	0 %	0 %	50 %	50 %	58579659
110	NC_006834	GC	4	8	38578	38585	0 %	0 %	50 %	50 %	58579659
111	NC_006834	AC	3	6	38659	38664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_006834	CG	4	8	38683	38690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_006834	GC	3	6	39019	39024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_006834	CG	3	6	40149	40154	0 %	0 %	50 %	50 %	58579661
115	NC_006834	TG	3	6	40166	40171	0 %	50 %	50 %	0 %	58579661
116	NC_006834	TG	3	6	41224	41229	0 %	50 %	50 %	0 %	58579662
117	NC_006834	GC	3	6	41344	41349	0 %	0 %	50 %	50 %	58579662
118	NC_006834	GC	3	6	41807	41812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_006834	CG	4	8	41932	41939	0 %	0 %	50 %	50 %	58579663
120	NC_006834	CG	3	6	42215	42220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_006834	GC	3	6	42232	42237	0 %	0 %	50 %	50 %	58579664
122	NC_006834	GC	3	6	42507	42512	0 %	0 %	50 %	50 %	58579664
123	NC_006834	GC	3	6	42899	42904	0 %	0 %	50 %	50 %	58579665
124	NC_006834	GC	3	6	43093	43098	0 %	0 %	50 %	50 %	58579665
125	NC_006834	CG	3	6	43140	43145	0 %	0 %	50 %	50 %	58579665
126	NC_006834	CG	3	6	43344	43349	0 %	0 %	50 %	50 %	58579665
127	NC_006834	GC	4	8	43362	43369	0 %	0 %	50 %	50 %	58579665
128	NC_006834	GC	3	6	43466	43471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_006834	GC	3	6	43529	43534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_006834	GC	3	6	43590	43595	0 %	0 %	50 %	50 %	58579666
131	NC_006834	GC	3	6	44146	44151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_006834	CG	3	6	44215	44220	0 %	0 %	50 %	50 %	58579667
133	NC_006834	CG	3	6	44348	44353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_006834	GC	3	6	44531	44536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_006834	GC	3	6	44603	44608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_006834	GT	3	6	44797	44802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006834	CG	3	6	45363	45368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_006834	CG	3	6	45881	45886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_006834	CG	3	6	45917	45922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_006834	GC	3	6	46019	46024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_006834	CG	3	6	46655	46660	0 %	0 %	50 %	50 %	58579671
142	NC_006834	CG	3	6	46967	46972	0 %	0 %	50 %	50 %	58579671
143	NC_006834	GC	3	6	47294	47299	0 %	0 %	50 %	50 %	58579672
144	NC_006834	TC	3	6	48183	48188	0 %	50 %	0 %	50 %	58579672
145	NC_006834	GC	3	6	48254	48259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_006834	CA	3	6	48577	48582	50 %	0 %	0 %	50 %	58579673
147	NC_006834	CG	3	6	48777	48782	0 %	0 %	50 %	50 %	58579674
148	NC_006834	GC	3	6	49944	49949	0 %	0 %	50 %	50 %	58579677
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