MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden

Total Repeats: 448

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006832	CTTTAT	2	12	3756	3767	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	58578669
2	NC_006832	CATGAA	2	12	10860	10871	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	58578676
3	NC_006832	CATGAA	2	12	11058	11069	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	58578676
4	NC_006832	TCATCT	3	18	12514	12531	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	58578677
5	NC_006832	AAAATC	2	12	12651	12662	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	58578677
6	NC_006832	ATTTTC	2	12	12762	12773	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	58578677
7	NC_006832	TAGAAA	2	12	14469	14480	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	58578677
8	NC_006832	TATCCT	2	12	15788	15799	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	58578679
9	NC_006832	TCTTTA	3	18	15808	15825	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	58578679
10	NC_006832	CTATTG	2	12	17653	17664	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	58578680
11	NC_006832	GTAGGA	2	12	28929	28940	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	58578688
12	NC_006832	TCCATA	2	12	35872	35883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578694
13	NC_006832	CATTAT	2	12	37066	37077	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	58578695
14	NC_006832	AATTAT	2	12	45549	45560	50 %	50 %	0 %	0 %	58578700
15	NC_006832	TTTAAG	2	12	58361	58372	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	58578708
16	NC_006832	ATCTGA	2	12	58465	58476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58578708
17	NC_006832	TGATCT	2	12	61071	61082	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	58578711
18	NC_006832	GGATGT	2	12	68812	68823	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	58578716
19	NC_006832	ATGTTA	2	12	69349	69360	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	58578716
20	NC_006832	AAGATG	2	12	71352	71363	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	58578717
21	NC_006832	CTTGAA	2	12	72125	72136	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58578718
22	NC_006832	TACTCC	2	12	72964	72975	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	58578718
23	NC_006832	GTTTTG	2	12	76203	76214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578722
24	NC_006832	TTGAAT	2	12	81283	81294	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	58578724
25	NC_006832	ATCATA	2	12	82906	82917	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	58578724
26	NC_006832	TAAAGA	2	12	83486	83497	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	58578724
27	NC_006832	AAATTT	2	12	85889	85900	50 %	50 %	0 %	0 %	58578724
28	NC_006832	AGTACT	2	12	86304	86315	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58578724
29	NC_006832	CAAGTA	2	12	86782	86793	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	58578724
30	NC_006832	AATCTA	2	12	100552	100563	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	58578729
31	NC_006832	GTTGAG	2	12	116424	116435	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	58578735
32	NC_006832	GATGTT	2	12	117240	117251	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	58578735
33	NC_006832	TCATGA	2	12	118010	118021	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58578735
34	NC_006832	TTGTTT	2	12	122698	122709	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	58578741
35	NC_006832	TACACT	2	12	125808	125819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578744
36	NC_006832	TTACCA	2	12	130702	130713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578747
37	NC_006832	GAAATA	2	12	131478	131489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	58578747
38	NC_006832	TTTTGG	2	12	133551	133562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578748
39	NC_006832	TGTTAA	2	12	134411	134422	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	58578748
40	NC_006832	AGGTAT	2	12	138565	138576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578750
41	NC_006832	TAATGC	2	12	148532	148543	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58578756
42	NC_006832	TAGGTG	2	12	155286	155297	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	58578760
43	NC_006832	TGTTAT	2	12	158585	158596	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	58578762
44	NC_006832	TATAAT	2	12	160402	160413	50 %	50 %	0 %	0 %	58578763
45	NC_006832	ATCAGA	2	12	165264	165275	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	58578765
46	NC_006832	TATTGA	2	12	168899	168910	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	58578767
47	NC_006832	TTATTT	2	12	169207	169218	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	58578768
48	NC_006832	TAGATA	2	12	170410	170421	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	58578770
49	NC_006832	TAATAG	2	12	170507	170518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	58578770
50	NC_006832	TATGAT	2	12	181141	181152	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	58578776
51	NC_006832	ATCCTG	2	12	190744	190755	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58578781
52	NC_006832	TGCTAT	2	12	190928	190939	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	58578781
53	NC_006832	ATATTG	2	12	193233	193244	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	58578782
54	NC_006832	AATGAT	2	12	193462	193473	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	58578782
55	NC_006832	TTTTGT	2	12	201146	201157	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	58578784
56	NC_006832	GTTTAA	2	12	201487	201498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	58578784
57	NC_006832	TCTACT	2	12	202041	202052	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	58578785
58	NC_006832	CTTTTT	2	12	205923	205934	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	58578789
59	NC_006832	TTTAAA	2	12	209147	209158	50 %	50 %	0 %	0 %	58578790
60	NC_006832	TCTTAG	2	12	209936	209947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	58578790
61	NC_006832	AGTTAA	2	12	210935	210946	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	58578790
62	NC_006832	ACTTTT	2	12	214451	214462	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	58578792
63	NC_006832	GGAAAG	2	12	221293	221304	50 %	0 %	50 %	0 %	58578799
64	NC_006832	CTATAG	2	12	225171	225182	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58578802
65	NC_006832	TGGTTC	2	12	233014	233025	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	58578807
66	NC_006832	TACGAA	2	12	239307	239318	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	58578810
67	NC_006832	TGTTTT	2	12	245190	245201	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	58578814
68	NC_006832	CTAAAA	2	12	245319	245330	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	58578814
69	NC_006832	TCAATA	2	12	245556	245567	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	58578814
70	NC_006832	TTATCT	2	12	248957	248968	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	58578817
71	NC_006832	CTGAAG	2	12	249126	249137	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	58578817
72	NC_006832	ATATGT	2	12	250734	250745	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	58578818
73	NC_006832	TAGTGT	2	12	251421	251432	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	58578818
74	NC_006832	GTTAAT	2	12	254753	254764	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	58578820
75	NC_006832	TGTATT	2	12	254830	254841	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	58578820
76	NC_006832	TACATG	2	12	256777	256788	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58578821
77	NC_006832	TTAATA	2	12	265957	265968	50 %	50 %	0 %	0 %	58578832
78	NC_006832	GATCCT	2	12	275275	275286	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58578836
79	NC_006832	ATGTAG	2	12	275471	275482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578836
80	NC_006832	GGAGCT	2	12	277079	277090	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	58578837
81	NC_006832	GTTATA	2	12	278537	278548	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	58578838
82	NC_006832	TTTGTT	2	12	280188	280199	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	58578839
83	NC_006832	ATCTAT	2	12	280368	280379	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	58578839
84	NC_006832	CAAGAC	2	12	291052	291063	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	58578845
85	NC_006832	CTGTTG	2	12	293239	293250	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	58578846
86	NC_006832	TGTAAC	2	12	309297	309308	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58578854
87	NC_006832	CAAGGT	2	12	310285	310296	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	58578855
88	NC_006832	AAGTTT	2	12	310530	310541	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	58578855
89	NC_006832	TTTATC	2	12	318377	318388	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	58578862
90	NC_006832	GAAAAT	2	12	322468	322479	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	58578865
91	NC_006832	ATACTG	2	12	326720	326731	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58578868
92	NC_006832	TAGCAA	2	12	334411	334422	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	58578872
93	NC_006832	TCTTTA	2	12	336380	336391	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	58578873
94	NC_006832	ATGATT	2	12	338801	338812	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	58578875
95	NC_006832	AAGTGC	2	12	340532	340543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	58578876
96	NC_006832	CCTTTT	2	12	341608	341619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578877
97	NC_006832	GGTATT	2	12	345249	345260	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	58578879
98	NC_006832	CTAACC	2	12	350843	350854	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	58578881
99	NC_006832	TAATGG	2	12	359165	359176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578886
100	NC_006832	TATTGT	2	12	361447	361458	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	58578889
101	NC_006832	TTTAAC	2	12	361502	361513	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	58578889
102	NC_006832	AGGTTT	2	12	363579	363590	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	58578890
103	NC_006832	ATTTTA	2	12	376215	376226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578896
104	NC_006832	AATAGG	2	12	381533	381544	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	58578900
105	NC_006832	GTTGAA	2	12	383290	383301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578901
106	NC_006832	AGATGA	2	12	383409	383420	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	58578901
107	NC_006832	TGTAGA	2	12	386440	386451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578904
108	NC_006832	ATTAAT	2	12	386530	386541	50 %	50 %	0 %	0 %	58578904
109	NC_006832	CTGTTG	2	12	398330	398341	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	58578911
110	NC_006832	AAAGTA	2	12	398546	398557	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	58578911
111	NC_006832	TAAATT	2	12	399128	399139	50 %	50 %	0 %	0 %	58578912
112	NC_006832	GATAAG	2	12	399780	399791	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	58578913
113	NC_006832	AATTAA	2	12	402075	402086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578914
114	NC_006832	TTAATT	2	12	408055	408066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578916
115	NC_006832	ATTGGA	2	12	408540	408551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578916
116	NC_006832	TTTGAT	2	12	411942	411953	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	58578917
117	NC_006832	TCCAAT	2	12	417569	417580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578920
118	NC_006832	CCTTTT	2	12	417846	417857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578920
119	NC_006832	TATAAA	2	12	420625	420636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578922
120	NC_006832	TATAAA	2	12	421125	421136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578923
121	NC_006832	TTTTGT	2	12	426587	426598	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	58578927
122	NC_006832	CAATAT	2	12	427724	427735	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	58578928
123	NC_006832	TAGTAT	2	12	428079	428090	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	58578928
124	NC_006832	GTTAAA	2	12	435303	435314	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	58578931
125	NC_006832	GCTATT	2	12	435865	435876	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	58578931
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233	NC_006832	TATCAA	2	12	786225	786236	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	58579157
234	NC_006832	ATAAGA	2	12	788281	788292	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	58579157
235	NC_006832	TTTTAC	2	12	791432	791443	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	58579160
236	NC_006832	AGTAAT	2	12	794214	794225	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	58579161
237	NC_006832	TAACAT	2	12	794297	794308	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	58579161
238	NC_006832	GAAATA	2	12	795984	795995	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	58579162
239	NC_006832	TGCTAA	2	12	798403	798414	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58579164
240	NC_006832	CAATAG	2	12	798663	798674	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	58579164
241	NC_006832	TCAATA	2	12	799668	799679	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	58579165
242	NC_006832	ATAGTA	2	12	801913	801924	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	58579167
243	NC_006832	AATATA	2	12	802449	802460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58579167
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251	NC_006832	GTTTGT	2	12	824070	824081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579183
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255	NC_006832	AAACCT	2	12	832044	832055	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	58579188
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259	NC_006832	AGCTTG	2	12	845289	845300	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58579201
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262	NC_006832	ACCTTC	2	12	850155	850166	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	58579204
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264	NC_006832	TAAAAT	2	12	852891	852902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58579205
265	NC_006832	AGAAGT	2	12	855873	855884	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	58579207
266	NC_006832	TCAAAC	2	12	856549	856560	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	58579207
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269	NC_006832	AATATT	2	12	866416	866427	50 %	50 %	0 %	0 %	58579211
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345	NC_006832	TGGATA	2	12	1159960	1159971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579397
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347	NC_006832	TGCTTG	2	12	1169032	1169043	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	58579402
348	NC_006832	AATATA	2	12	1171346	1171357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58579403
349	NC_006832	TTAGCA	2	12	1171627	1171638	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58579403
350	NC_006832	ACACTA	2	12	1178860	1178871	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	58579406
351	NC_006832	TACACT	2	12	1179141	1179152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579406
352	NC_006832	AGCACT	2	12	1179783	1179794	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	58579406
353	NC_006832	AGCACT	2	12	1179981	1179992	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	58579406
354	NC_006832	AGCACT	2	12	1180179	1180190	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	58579406
355	NC_006832	AGCACT	2	12	1180374	1180385	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	58579406
356	NC_006832	AGCACT	2	12	1180569	1180580	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	58579406
357	NC_006832	AACACC	2	12	1180731	1180742	50 %	0 %	0 %	50 %	58579406
358	NC_006832	GATTTT	2	12	1180852	1180863	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	58579406
359	NC_006832	CACTAT	2	12	1180883	1180894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579406
360	NC_006832	CTTGTG	2	12	1187259	1187270	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	58579409
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362	NC_006832	TTACAT	2	12	1206509	1206520	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	58579422
363	NC_006832	CAATAT	2	12	1206719	1206730	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	58579422
364	NC_006832	AGCTCT	2	12	1211028	1211039	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58579425
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380	NC_006832	CTTCCT	2	12	1294478	1294489	0 %	50 %	0 %	50 %	58579473
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447	NC_006832	AATTAT	2	12	1508207	1508218	50 %	50 %	0 %	0 %	58579618
448	NC_006832	TGGAAG	2	12	1512041	1512052	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	58579622