MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden

Total Repeats: 854

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006832	AAAAT	2	10	1519	1528	80 %	20 %	0 %	0 %	58578666
2	NC_006832	GCATA	2	10	1775	1784	40 %	20 %	20 %	20 %	58578667
3	NC_006832	ACTAA	2	10	5562	5571	60 %	20 %	0 %	20 %	58578671
4	NC_006832	CTATA	2	10	6962	6971	40 %	40 %	0 %	20 %	161598458
5	NC_006832	TTTGT	2	10	8370	8379	0 %	80 %	20 %	0 %	58578673
6	NC_006832	ATATA	2	10	8475	8484	60 %	40 %	0 %	0 %	58578673
7	NC_006832	ATGTA	2	10	11258	11267	40 %	40 %	20 %	0 %	58578676
8	NC_006832	GTAGA	2	10	14757	14766	40 %	20 %	40 %	0 %	58578678
9	NC_006832	TGGTA	2	10	15004	15013	20 %	40 %	40 %	0 %	58578678
10	NC_006832	TTTAT	2	10	17271	17280	20 %	80 %	0 %	0 %	58578680
11	NC_006832	TTGAC	2	10	17788	17797	20 %	40 %	20 %	20 %	58578681
12	NC_006832	CTATC	2	10	17846	17855	20 %	40 %	0 %	40 %	58578681
13	NC_006832	TTATT	2	10	18871	18880	20 %	80 %	0 %	0 %	58578682
14	NC_006832	ATGTA	2	10	21730	21739	40 %	40 %	20 %	0 %	58578683
15	NC_006832	GTGTT	2	10	22110	22119	0 %	60 %	40 %	0 %	58578683
16	NC_006832	TGCCT	2	10	22228	22237	0 %	40 %	20 %	40 %	58578683
17	NC_006832	ATTTT	2	10	22447	22456	20 %	80 %	0 %	0 %	58578683
18	NC_006832	ATACT	2	10	22940	22949	40 %	40 %	0 %	20 %	58578684
19	NC_006832	ATTTT	2	10	23030	23039	20 %	80 %	0 %	0 %	58578684
20	NC_006832	TTCTT	2	10	28638	28647	0 %	80 %	0 %	20 %	58578688
21	NC_006832	TATAA	2	10	28666	28675	60 %	40 %	0 %	0 %	58578688
22	NC_006832	TTTTA	2	10	28766	28775	20 %	80 %	0 %	0 %	58578688
23	NC_006832	TTTTA	2	10	28853	28862	20 %	80 %	0 %	0 %	58578688
24	NC_006832	TCTAT	2	10	30702	30711	20 %	60 %	0 %	20 %	58578691
25	NC_006832	ATTCT	2	10	30733	30742	20 %	60 %	0 %	20 %	58578691
26	NC_006832	CAAGC	2	10	32745	32754	40 %	0 %	20 %	40 %	58578693
27	NC_006832	TTGAT	2	10	35959	35968	20 %	60 %	20 %	0 %	58578694
28	NC_006832	TTAAT	2	10	37582	37591	40 %	60 %	0 %	0 %	58578695
29	NC_006832	ATTTC	2	10	43883	43892	20 %	60 %	0 %	20 %	58578698
30	NC_006832	ATAGT	2	10	44102	44111	40 %	40 %	20 %	0 %	58578698
31	NC_006832	TTTTA	2	10	44317	44326	20 %	80 %	0 %	0 %	58578699
32	NC_006832	AGTTT	2	10	44849	44858	20 %	60 %	20 %	0 %	58578699
33	NC_006832	TTATA	2	10	44859	44868	40 %	60 %	0 %	0 %	58578699
34	NC_006832	TTTTG	2	10	46440	46449	0 %	80 %	20 %	0 %	58578701
35	NC_006832	TATGA	2	10	46786	46795	40 %	40 %	20 %	0 %	58578701
36	NC_006832	TGGAG	2	10	49967	49976	20 %	20 %	60 %	0 %	58578703
37	NC_006832	AAACA	2	10	53777	53786	80 %	0 %	0 %	20 %	58578704
38	NC_006832	ATGCT	2	10	57797	57806	20 %	40 %	20 %	20 %	58578708
39	NC_006832	TTGAT	2	10	58381	58390	20 %	60 %	20 %	0 %	58578708
40	NC_006832	TGTAT	2	10	63682	63691	20 %	60 %	20 %	0 %	58578713
41	NC_006832	ACGAT	2	10	65015	65024	40 %	20 %	20 %	20 %	58578714
42	NC_006832	ACCAA	2	10	65680	65689	60 %	0 %	0 %	40 %	58578714
43	NC_006832	TCTGA	2	10	69607	69616	20 %	40 %	20 %	20 %	58578716
44	NC_006832	ATTAC	2	10	69910	69919	40 %	40 %	0 %	20 %	58578716
45	NC_006832	AAATC	2	10	73462	73471	60 %	20 %	0 %	20 %	58578720
46	NC_006832	GTTTT	2	10	76032	76041	0 %	80 %	20 %	0 %	58578722
47	NC_006832	TTATT	2	10	79048	79057	20 %	80 %	0 %	0 %	58578724
48	NC_006832	GAAAA	2	10	79589	79598	80 %	0 %	20 %	0 %	58578724
49	NC_006832	CATTA	2	10	80352	80361	40 %	40 %	0 %	20 %	58578724
50	NC_006832	TATGA	2	10	81684	81693	40 %	40 %	20 %	0 %	58578724
51	NC_006832	TCATA	2	10	82160	82169	40 %	40 %	0 %	20 %	58578724
52	NC_006832	AAAAT	2	10	82558	82567	80 %	20 %	0 %	0 %	58578724
53	NC_006832	AGTTT	2	10	83103	83112	20 %	60 %	20 %	0 %	58578724
54	NC_006832	ATCAC	2	10	83832	83841	40 %	20 %	0 %	40 %	58578724
55	NC_006832	AAGTA	2	10	84701	84710	60 %	20 %	20 %	0 %	58578724
56	NC_006832	TGTAT	2	10	85465	85474	20 %	60 %	20 %	0 %	58578724
57	NC_006832	ACTTT	2	10	85586	85595	20 %	60 %	0 %	20 %	58578724
58	NC_006832	GAACA	2	10	86257	86266	60 %	0 %	20 %	20 %	58578724
59	NC_006832	AAATT	2	10	93405	93414	60 %	40 %	0 %	0 %	58578726
60	NC_006832	GAGCA	2	10	93868	93877	40 %	0 %	40 %	20 %	58578726
61	NC_006832	GTATA	2	10	94111	94120	40 %	40 %	20 %	0 %	58578726
62	NC_006832	CTACC	2	10	99855	99864	20 %	20 %	0 %	60 %	58578728
63	NC_006832	TACTA	2	10	100022	100031	40 %	40 %	0 %	20 %	58578728
64	NC_006832	AGTCA	2	10	101083	101092	40 %	20 %	20 %	20 %	58578730
65	NC_006832	ATGGC	2	10	101844	101853	20 %	20 %	40 %	20 %	58578730
66	NC_006832	AGATG	2	10	102014	102023	40 %	20 %	40 %	0 %	58578730
67	NC_006832	AAACT	2	10	102511	102520	60 %	20 %	0 %	20 %	58578730
68	NC_006832	AGCTG	2	10	104072	104081	20 %	20 %	40 %	20 %	58578731
69	NC_006832	TAATC	2	10	106568	106577	40 %	40 %	0 %	20 %	58578732
70	NC_006832	GATAT	2	10	108822	108831	40 %	40 %	20 %	0 %	58578733
71	NC_006832	CTTAT	2	10	109171	109180	20 %	60 %	0 %	20 %	58578733
72	NC_006832	TAGTT	2	10	112542	112551	20 %	60 %	20 %	0 %	58578734
73	NC_006832	ATAAA	2	10	115939	115948	80 %	20 %	0 %	0 %	58578735
74	NC_006832	AACAT	2	10	116776	116785	60 %	20 %	0 %	20 %	58578735
75	NC_006832	GGTAT	2	10	117125	117134	20 %	40 %	40 %	0 %	58578735
76	NC_006832	TAGTA	2	10	121561	121570	40 %	40 %	20 %	0 %	58578739
77	NC_006832	CTAAT	2	10	126807	126816	40 %	40 %	0 %	20 %	58578744
78	NC_006832	TACAA	2	10	128822	128831	60 %	20 %	0 %	20 %	58578746
79	NC_006832	CTTAT	2	10	131109	131118	20 %	60 %	0 %	20 %	58578747
80	NC_006832	TGGAA	2	10	134079	134088	40 %	20 %	40 %	0 %	58578748
81	NC_006832	TATAT	2	10	138971	138980	40 %	60 %	0 %	0 %	58578750
82	NC_006832	GTATT	2	10	143628	143637	20 %	60 %	20 %	0 %	58578754
83	NC_006832	TTTTA	2	10	149766	149775	20 %	80 %	0 %	0 %	58578758
84	NC_006832	GTTGT	2	10	155514	155523	0 %	60 %	40 %	0 %	58578760
85	NC_006832	CTTAT	2	10	163164	163173	20 %	60 %	0 %	20 %	58578765
86	NC_006832	ACAAT	2	10	163269	163278	60 %	20 %	0 %	20 %	58578765
87	NC_006832	TATGA	2	10	163837	163846	40 %	40 %	20 %	0 %	58578765
88	NC_006832	TAGAA	2	10	168575	168584	60 %	20 %	20 %	0 %	58578767
89	NC_006832	TATAT	2	10	169152	169161	40 %	60 %	0 %	0 %	58578768
90	NC_006832	ATGTT	2	10	171917	171926	20 %	60 %	20 %	0 %	58578771
91	NC_006832	ATGTT	2	10	172516	172525	20 %	60 %	20 %	0 %	58578772
92	NC_006832	GTATT	2	10	176256	176265	20 %	60 %	20 %	0 %	58578773
93	NC_006832	TTGTA	2	10	183109	183118	20 %	60 %	20 %	0 %	58578777
94	NC_006832	TAGTT	2	10	183537	183546	20 %	60 %	20 %	0 %	58578777
95	NC_006832	ACATT	2	10	188583	188592	40 %	40 %	0 %	20 %	58578780
96	NC_006832	CTTTG	2	10	190730	190739	0 %	60 %	20 %	20 %	58578781
97	NC_006832	ATTAT	2	10	191011	191020	40 %	60 %	0 %	0 %	58578781
98	NC_006832	GTTTG	2	10	191606	191615	0 %	60 %	40 %	0 %	58578781
99	NC_006832	CAGCT	2	10	191930	191939	20 %	20 %	20 %	40 %	58578781
100	NC_006832	TAGTT	2	10	192511	192520	20 %	60 %	20 %	0 %	58578782
101	NC_006832	TAAAT	2	10	194975	194984	60 %	40 %	0 %	0 %	58578782
102	NC_006832	GGTAA	2	10	196483	196492	40 %	20 %	40 %	0 %	58578783
103	NC_006832	CTTGT	2	10	197321	197330	0 %	60 %	20 %	20 %	58578783
104	NC_006832	TGGTT	2	10	201320	201329	0 %	60 %	40 %	0 %	58578784
105	NC_006832	ATAAA	2	10	204077	204086	80 %	20 %	0 %	0 %	58578788
106	NC_006832	TAATA	2	10	204255	204264	60 %	40 %	0 %	0 %	58578788
107	NC_006832	CAGTG	2	10	206176	206185	20 %	20 %	40 %	20 %	58578789
108	NC_006832	GTATG	2	10	207193	207202	20 %	40 %	40 %	0 %	58578789
109	NC_006832	ATATG	2	10	208268	208277	40 %	40 %	20 %	0 %	58578790
110	NC_006832	TTTGG	2	10	212919	212928	0 %	60 %	40 %	0 %	58578791
111	NC_006832	AAGAT	2	10	213024	213033	60 %	20 %	20 %	0 %	58578791
112	NC_006832	TGGTA	2	10	214923	214932	20 %	40 %	40 %	0 %	58578793
113	NC_006832	ATAGT	2	10	216145	216154	40 %	40 %	20 %	0 %	58578793
114	NC_006832	ATATC	2	10	218668	218677	40 %	40 %	0 %	20 %	58578795
115	NC_006832	AGTGA	2	10	218785	218794	40 %	20 %	40 %	0 %	58578796
116	NC_006832	ATATT	2	10	218852	218861	40 %	60 %	0 %	0 %	58578796
117	NC_006832	ATTTA	2	10	222208	222217	40 %	60 %	0 %	0 %	58578800
118	NC_006832	AAGAA	2	10	223048	223057	80 %	0 %	20 %	0 %	58578800
119	NC_006832	ATATC	2	10	225221	225230	40 %	40 %	0 %	20 %	58578802
120	NC_006832	AGAAC	2	10	226386	226395	60 %	0 %	20 %	20 %	58578802
121	NC_006832	ATGTG	2	10	227049	227058	20 %	40 %	40 %	0 %	58578803
122	NC_006832	TATAA	2	10	228956	228965	60 %	40 %	0 %	0 %	58578803
123	NC_006832	TTGAT	2	10	230731	230740	20 %	60 %	20 %	0 %	58578804
124	NC_006832	ATTTG	2	10	231573	231582	20 %	60 %	20 %	0 %	58578805
125	NC_006832	AATAT	2	10	233421	233430	60 %	40 %	0 %	0 %	58578807
126	NC_006832	TTTTG	2	10	235711	235720	0 %	80 %	20 %	0 %	58578808
127	NC_006832	TTCTA	2	10	235796	235805	20 %	60 %	0 %	20 %	58578808
128	NC_006832	CTGTA	2	10	236566	236575	20 %	40 %	20 %	20 %	58578809
129	NC_006832	TGGTA	2	10	237828	237837	20 %	40 %	40 %	0 %	58578810
130	NC_006832	AAATT	2	10	239570	239579	60 %	40 %	0 %	0 %	58578810
131	NC_006832	TAGAA	2	10	239826	239835	60 %	20 %	20 %	0 %	58578810
132	NC_006832	GTTGT	2	10	240236	240245	0 %	60 %	40 %	0 %	58578810
133	NC_006832	TATAT	2	10	243387	243396	40 %	60 %	0 %	0 %	58578812
134	NC_006832	GATAA	2	10	243607	243616	60 %	20 %	20 %	0 %	58578812
135	NC_006832	ATTAA	2	10	246115	246124	60 %	40 %	0 %	0 %	58578815
136	NC_006832	TTGTT	2	10	246658	246667	0 %	80 %	20 %	0 %	58578815
137	NC_006832	TATCA	2	10	247878	247887	40 %	40 %	0 %	20 %	58578816
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