MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden

Total Repeats: 5076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006832	AATG	2	8	59	66	50 %	25 %	25 %	0 %	58578665
2	NC_006832	GATT	2	8	154	161	25 %	50 %	25 %	0 %	58578665
3	NC_006832	ACTA	2	8	601	608	50 %	25 %	0 %	25 %	58578665
4	NC_006832	TTAG	2	8	758	765	25 %	50 %	25 %	0 %	58578665
5	NC_006832	ATTT	2	8	937	944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006832	TATT	2	8	1297	1304	25 %	75 %	0 %	0 %	58578666
7	NC_006832	TTTA	2	8	1807	1814	25 %	75 %	0 %	0 %	58578667
8	NC_006832	ACAG	2	8	1976	1983	50 %	0 %	25 %	25 %	58578667
9	NC_006832	AGTA	2	8	3299	3306	50 %	25 %	25 %	0 %	58578669
10	NC_006832	GGTA	2	8	4070	4077	25 %	25 %	50 %	0 %	58578669
11	NC_006832	GTAT	2	8	4299	4306	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006832	TTAC	2	8	4460	4467	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_006832	ATTA	2	8	4850	4857	50 %	50 %	0 %	0 %	58578670
14	NC_006832	ATTT	2	8	5017	5024	25 %	75 %	0 %	0 %	58578670
15	NC_006832	GATT	2	8	5429	5436	25 %	50 %	25 %	0 %	58578670
16	NC_006832	CTCA	2	8	5753	5760	25 %	25 %	0 %	50 %	58578671
17	NC_006832	GTAT	2	8	6339	6346	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006832	TGTT	2	8	6585	6592	0 %	75 %	25 %	0 %	161598458
19	NC_006832	ATGG	2	8	7013	7020	25 %	25 %	50 %	0 %	161598458
20	NC_006832	GTTA	2	8	7764	7771	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006832	ATTT	2	8	9095	9102	25 %	75 %	0 %	0 %	58578674
22	NC_006832	ATAA	2	8	9723	9730	75 %	25 %	0 %	0 %	58578675
23	NC_006832	ATTT	2	8	9819	9826	25 %	75 %	0 %	0 %	58578675
24	NC_006832	TACA	2	8	9938	9945	50 %	25 %	0 %	25 %	58578675
25	NC_006832	ATCT	2	8	10438	10445	25 %	50 %	0 %	25 %	58578676
26	NC_006832	AAAT	2	8	11580	11587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006832	TTTA	2	8	11666	11673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006832	TAAA	2	8	11798	11805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006832	AAAT	2	8	11907	11914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006832	AAGT	2	8	12053	12060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006832	TTAC	2	8	12082	12089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_006832	TATT	2	8	12111	12118	25 %	75 %	0 %	0 %	58578677
33	NC_006832	TGTA	2	8	12548	12555	25 %	50 %	25 %	0 %	58578677
34	NC_006832	CATA	2	8	12698	12705	50 %	25 %	0 %	25 %	58578677
35	NC_006832	GAAT	2	8	13140	13147	50 %	25 %	25 %	0 %	58578677
36	NC_006832	GTAC	2	8	13657	13664	25 %	25 %	25 %	25 %	58578677
37	NC_006832	TTTC	2	8	13902	13909	0 %	75 %	0 %	25 %	58578677
38	NC_006832	AATA	2	8	14415	14422	75 %	25 %	0 %	0 %	58578677
39	NC_006832	TTTA	2	8	14550	14557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006832	TACT	2	8	14889	14896	25 %	50 %	0 %	25 %	58578678
41	NC_006832	AACA	2	8	15639	15646	75 %	0 %	0 %	25 %	58578679
42	NC_006832	TAGA	2	8	15746	15753	50 %	25 %	25 %	0 %	58578679
43	NC_006832	ATTT	2	8	15864	15871	25 %	75 %	0 %	0 %	58578679
44	NC_006832	AATT	2	8	16199	16206	50 %	50 %	0 %	0 %	58578679
45	NC_006832	GTAG	2	8	16489	16496	25 %	25 %	50 %	0 %	58578679
46	NC_006832	ATTC	2	8	16978	16985	25 %	50 %	0 %	25 %	58578680
47	NC_006832	TGTT	2	8	17452	17459	0 %	75 %	25 %	0 %	58578680
48	NC_006832	TTAC	2	8	17697	17704	25 %	50 %	0 %	25 %	58578680
49	NC_006832	TCAT	2	8	17806	17813	25 %	50 %	0 %	25 %	58578681
50	NC_006832	CTTA	2	8	18399	18406	25 %	50 %	0 %	25 %	58578681
51	NC_006832	TATT	2	8	18533	18540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006832	TAAT	2	8	18630	18637	50 %	50 %	0 %	0 %	58578682
53	NC_006832	GTTA	2	8	18725	18732	25 %	50 %	25 %	0 %	58578682
54	NC_006832	AATG	2	8	18782	18789	50 %	25 %	25 %	0 %	58578682
55	NC_006832	GAAT	2	8	19023	19030	50 %	25 %	25 %	0 %	58578682
56	NC_006832	TATC	2	8	19567	19574	25 %	50 %	0 %	25 %	58578682
57	NC_006832	TAAA	2	8	19841	19848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006832	GATT	2	8	20344	20351	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006832	TATT	2	8	20809	20816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006832	TAAT	2	8	20850	20857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006832	TAAA	2	8	20976	20983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006832	TTAT	2	8	21106	21113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006832	ATTT	2	8	21341	21348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006832	TTTC	2	8	21410	21417	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_006832	GTGG	2	8	21555	21562	0 %	25 %	75 %	0 %	58578683
66	NC_006832	GTTT	2	8	22406	22413	0 %	75 %	25 %	0 %	58578683
67	NC_006832	TAAA	2	8	23291	23298	75 %	25 %	0 %	0 %	58578685
68	NC_006832	ATTT	2	8	24659	24666	25 %	75 %	0 %	0 %	58578686
69	NC_006832	TAAA	2	8	24833	24840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006832	TAAA	2	8	24865	24872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006832	TGTT	2	8	24912	24919	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006832	TATT	2	8	24940	24947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006832	TCCT	2	8	25264	25271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_006832	GTGG	2	8	26811	26818	0 %	25 %	75 %	0 %	58578687
75	NC_006832	TTTG	2	8	27983	27990	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006832	TTTA	2	8	28378	28385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006832	ATTA	2	8	28481	28488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006832	CAGT	2	8	29109	29116	25 %	25 %	25 %	25 %	58578688
79	NC_006832	CCTT	2	8	29328	29335	0 %	50 %	0 %	50 %	58578688
80	NC_006832	ATGT	2	8	29954	29961	25 %	50 %	25 %	0 %	58578690
81	NC_006832	TCTT	2	8	30272	30279	0 %	75 %	0 %	25 %	58578691
82	NC_006832	TGCT	2	8	30535	30542	0 %	50 %	25 %	25 %	58578691
83	NC_006832	ATGT	2	8	30812	30819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006832	TTAT	2	8	30962	30969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006832	AAAT	2	8	31164	31171	75 %	25 %	0 %	0 %	161598457
86	NC_006832	AATG	2	8	31187	31194	50 %	25 %	25 %	0 %	161598457
87	NC_006832	TTAT	2	8	32019	32026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006832	ATAA	2	8	32227	32234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006832	AAGT	2	8	32316	32323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006832	TTGA	2	8	32814	32821	25 %	50 %	25 %	0 %	58578693
91	NC_006832	TAGT	2	8	33869	33876	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006832	AAGA	2	8	34378	34385	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006832	GTTA	2	8	34535	34542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006832	TGAG	2	8	36129	36136	25 %	25 %	50 %	0 %	58578694
95	NC_006832	AAAT	2	8	36668	36675	75 %	25 %	0 %	0 %	58578695
96	NC_006832	GTAA	2	8	36999	37006	50 %	25 %	25 %	0 %	58578695
97	NC_006832	AAAG	2	8	37023	37030	75 %	0 %	25 %	0 %	58578695
98	NC_006832	AAGG	2	8	37152	37159	50 %	0 %	50 %	0 %	58578695
99	NC_006832	ACAA	2	8	37772	37779	75 %	0 %	0 %	25 %	58578695
100	NC_006832	TAAG	2	8	38197	38204	50 %	25 %	25 %	0 %	58578695
101	NC_006832	TTAC	2	8	38433	38440	25 %	50 %	0 %	25 %	58578695
102	NC_006832	TGGA	2	8	38554	38561	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006832	GTTT	2	8	38928	38935	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006832	TTTA	2	8	38991	38998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006832	TTAG	2	8	39004	39011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006832	GTAG	2	8	39015	39022	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006832	TTTA	2	8	39245	39252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006832	TTAG	2	8	39258	39265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006832	TTTA	2	8	39998	40005	25 %	75 %	0 %	0 %	58578696
110	NC_006832	TAAA	2	8	40096	40103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006832	GTAT	2	8	40434	40441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006832	ATAA	2	8	40604	40611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006832	ATTG	2	8	40695	40702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006832	TTAG	2	8	40895	40902	25 %	50 %	25 %	0 %	58578697
115	NC_006832	AAGT	2	8	41233	41240	50 %	25 %	25 %	0 %	58578697
116	NC_006832	TTAT	2	8	41912	41919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006832	TTAT	2	8	42197	42204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006832	TTGT	2	8	42834	42841	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006832	TTAA	2	8	42906	42913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006832	ATAA	2	8	43011	43018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006832	ATTA	2	8	43228	43235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006832	TAAT	2	8	43480	43487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006832	TTAT	2	8	43862	43869	25 %	75 %	0 %	0 %	58578698
124	NC_006832	TTGT	2	8	44053	44060	0 %	75 %	25 %	0 %	58578698
125	NC_006832	TTAA	2	8	44172	44179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006832	GCTT	2	8	44967	44974	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_006832	AAAT	2	8	45084	45091	75 %	25 %	0 %	0 %	58578700
128	NC_006832	TAAT	2	8	47056	47063	50 %	50 %	0 %	0 %	58578701
129	NC_006832	ACCT	2	8	47167	47174	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_006832	TGTA	2	8	47178	47185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006832	TATG	2	8	47279	47286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006832	ATAA	2	8	47552	47559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006832	AGTT	2	8	48313	48320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006832	TTAT	2	8	48384	48391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006832	ATAA	2	8	48505	48512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006832	CTTT	2	8	48792	48799	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_006832	GTAT	2	8	48815	48822	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006832	GTTG	2	8	48901	48908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006832	AATT	2	8	50229	50236	50 %	50 %	0 %	0 %	58578703
140	NC_006832	AATT	2	8	50401	50408	50 %	50 %	0 %	0 %	58578703
141	NC_006832	ATCA	2	8	50866	50873	50 %	25 %	0 %	25 %	58578703
142	NC_006832	ATTA	2	8	50905	50912	50 %	50 %	0 %	0 %	58578703
143	NC_006832	TAAA	2	8	50955	50962	75 %	25 %	0 %	0 %	58578703
144	NC_006832	TTAA	2	8	51212	51219	50 %	50 %	0 %	0 %	58578703
145	NC_006832	CCTT	2	8	51266	51273	0 %	50 %	0 %	50 %	58578703
146	NC_006832	ATTG	2	8	51292	51299	25 %	50 %	25 %	0 %	58578703
147	NC_006832	ATTA	2	8	51478	51485	50 %	50 %	0 %	0 %	58578703
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