MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden

Total Repeats: 16343

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006832	CTC	2	6	113	118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578665
2	NC_006832	TAG	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578665
3	NC_006832	ATT	2	6	232	237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578665
4	NC_006832	CTC	2	6	247	252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578665
5	NC_006832	CAT	2	6	375	380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578665
6	NC_006832	AGT	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578665
7	NC_006832	TAC	2	6	465	470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578665
8	NC_006832	TCT	2	6	722	727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578665
9	NC_006832	TAT	2	6	768	773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578665
10	NC_006832	GTT	2	6	776	781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578665
11	NC_006832	TCT	2	6	803	808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578665
12	NC_006832	ATA	2	6	952	957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578666
13	NC_006832	GTA	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578666
14	NC_006832	TAT	2	6	1021	1026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578666
15	NC_006832	CAA	2	6	1081	1086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578666
16	NC_006832	TTA	2	6	1116	1121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578666
17	NC_006832	TTG	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578666
18	NC_006832	ATA	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578666
19	NC_006832	TCT	2	6	1198	1203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578666
20	NC_006832	GCT	2	6	1206	1211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58578666
21	NC_006832	AGG	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58578666
22	NC_006832	ATT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578666
23	NC_006832	ATC	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578666
24	NC_006832	ATT	3	9	1403	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578666
25	NC_006832	TAA	3	9	1468	1476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578666
26	NC_006832	AAT	2	6	1727	1732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578667
27	NC_006832	TAG	3	9	1756	1764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578667
28	NC_006832	TTC	2	6	1822	1827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578667
29	NC_006832	AAT	2	6	1868	1873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578667
30	NC_006832	TTG	2	6	1913	1918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578667
31	NC_006832	GTT	2	6	1963	1968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578667
32	NC_006832	TAT	2	6	2023	2028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578667
33	NC_006832	CAA	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578668
34	NC_006832	TCT	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578668
35	NC_006832	TTA	2	6	2560	2565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578668
36	NC_006832	ATA	2	6	2603	2608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578668
37	NC_006832	GTA	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578668
38	NC_006832	TTA	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578668
39	NC_006832	CCA	2	6	2868	2873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58578668
40	NC_006832	AGT	2	6	2917	2922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578668
41	NC_006832	CTA	2	6	3165	3170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578669
42	NC_006832	TTC	2	6	3235	3240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578669
43	NC_006832	ATT	2	6	3254	3259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
44	NC_006832	CTT	2	6	3282	3287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578669
45	NC_006832	TAT	2	6	3325	3330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
46	NC_006832	ATT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
47	NC_006832	TAT	2	6	3508	3513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
48	NC_006832	TTA	2	6	3597	3602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
49	NC_006832	TCC	2	6	3733	3738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578669
50	NC_006832	CTT	2	6	3783	3788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578669
51	NC_006832	TGT	2	6	3840	3845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578669
52	NC_006832	ATT	2	6	3950	3955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
53	NC_006832	GCA	2	6	3956	3961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58578669
54	NC_006832	ATA	2	6	4591	4596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
55	NC_006832	AAT	2	6	4890	4895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
56	NC_006832	ATA	2	6	4905	4910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
57	NC_006832	AAT	2	6	4982	4987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
58	NC_006832	TCC	2	6	4994	4999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578670
59	NC_006832	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578670
60	NC_006832	TGG	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578670
61	NC_006832	TAG	2	6	5122	5127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578670
62	NC_006832	GAT	2	6	5136	5141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578670
63	NC_006832	ATA	2	6	5185	5190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
64	NC_006832	AGA	2	6	5264	5269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578670
65	NC_006832	GGT	2	6	5286	5291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578670
66	NC_006832	GTG	2	6	5350	5355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578670
67	NC_006832	GAT	2	6	5379	5384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578670
68	NC_006832	ATG	2	6	5491	5496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578671
69	NC_006832	TTC	2	6	5505	5510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578671
70	NC_006832	CTT	2	6	5692	5697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578671
71	NC_006832	TAG	2	6	5714	5719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578671
72	NC_006832	TAG	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578671
73	NC_006832	TAT	3	9	5855	5863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578671
74	NC_006832	ACA	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578671
75	NC_006832	TTA	2	6	5934	5939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578671
76	NC_006832	GTG	2	6	6386	6391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161598458
77	NC_006832	AGC	2	6	6402	6407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161598458
78	NC_006832	ATT	2	6	6543	6548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
79	NC_006832	AAT	2	6	6558	6563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161598458
80	NC_006832	GTA	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161598458
81	NC_006832	TAT	2	6	6632	6637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
82	NC_006832	TGG	2	6	6660	6665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161598458
83	NC_006832	TCC	2	6	6762	6767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161598458
84	NC_006832	TAA	2	6	6771	6776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161598458
85	NC_006832	GTC	2	6	6813	6818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161598458
86	NC_006832	ATT	2	6	6864	6869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
87	NC_006832	GCT	2	6	6976	6981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161598458
88	NC_006832	TTA	2	6	7060	7065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
89	NC_006832	TAT	2	6	7118	7123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
90	NC_006832	AAT	2	6	7134	7139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161598458
91	NC_006832	TAA	2	6	7158	7163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161598458
92	NC_006832	TTA	2	6	7186	7191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
93	NC_006832	ATC	2	6	7198	7203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161598458
94	NC_006832	TAT	2	6	7274	7279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
95	NC_006832	GAT	2	6	7307	7312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161598458
96	NC_006832	ATA	2	6	7354	7359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161598458
97	NC_006832	TGC	3	9	7368	7376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161598458
98	NC_006832	CAG	2	6	7472	7477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161598458
99	NC_006832	AAG	2	6	7537	7542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161598458
100	NC_006832	TAT	2	6	7824	7829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578673
101	NC_006832	TGC	2	6	7869	7874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58578673
102	NC_006832	ATA	2	6	8078	8083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578673
103	NC_006832	ATT	2	6	8129	8134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578673
104	NC_006832	TTA	2	6	8141	8146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578673
105	NC_006832	TGG	2	6	8261	8266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578673
106	NC_006832	AAT	2	6	8272	8277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578673
107	NC_006832	GGA	2	6	8293	8298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58578673
108	NC_006832	GTT	2	6	8299	8304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578673
109	NC_006832	TAA	2	6	8463	8468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578673
110	NC_006832	ATT	2	6	8563	8568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578673
111	NC_006832	TGA	2	6	8593	8598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578674
112	NC_006832	CGT	2	6	8634	8639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58578674
113	NC_006832	ATT	2	6	8674	8679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578674
114	NC_006832	ACA	2	6	8754	8759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578674
115	NC_006832	ATT	2	6	8811	8816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578674
116	NC_006832	TTC	2	6	8945	8950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578674
117	NC_006832	GAA	2	6	9077	9082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578674
118	NC_006832	TTA	2	6	9216	9221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578674
119	NC_006832	CTG	2	6	9268	9273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58578674
120	NC_006832	GAA	2	6	9306	9311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578674
121	NC_006832	CTT	2	6	9370	9375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578674
122	NC_006832	TAA	2	6	9395	9400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578674
123	NC_006832	TCA	2	6	9853	9858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578675
124	NC_006832	TTG	2	6	9868	9873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578675
125	NC_006832	ATC	2	6	9900	9905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578675
126	NC_006832	ATG	2	6	10303	10308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578676
127	NC_006832	AGG	2	6	10369	10374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58578676
128	NC_006832	GAT	2	6	10425	10430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578676
129	NC_006832	TGA	2	6	10484	10489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578676
130	NC_006832	GAA	2	6	10500	10505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578676
131	NC_006832	ATC	2	6	10507	10512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578676
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133	NC_006832	GTG	2	6	10579	10584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578676
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260	NC_006832	TCT	2	6	16918	16923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578679
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262	NC_006832	TAT	2	6	17021	17026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578680
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275	NC_006832	TAC	2	6	17600	17605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578680
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382	NC_006832	CCT	3	9	29076	29084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578688
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384	NC_006832	CAT	2	6	29164	29169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578688
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