MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Gardel

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006831	TGTTTT	2	12	20148	20159	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006831	TGTAAT	2	12	20670	20681	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006831	ACAGTT	2	12	27461	27472	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_006831	ATAAAT	2	12	38336	38347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006831	TAATAT	2	12	38819	38830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006831	ATTAAT	2	12	45991	46002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006831	TTAAAT	2	12	67129	67140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006831	TGTTAT	2	12	68543	68554	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006831	TATAAA	2	12	70332	70343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006831	GTTTTG	2	12	76250	76261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006831	TTTATA	2	12	91154	91165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006831	TGTTTT	2	12	94234	94245	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006831	AATATA	2	12	95206	95217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006831	CAATAT	2	12	96881	96892	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_006831	TATTAA	2	12	100395	100406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006831	TCTAAT	2	12	114417	114428	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_006831	TTCTAA	2	12	114554	114565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_006831	TCTAAT	2	12	114693	114704	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_006831	TTTATA	2	12	118433	118444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006831	TAGTTT	2	12	118833	118844	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006831	TTGTCA	2	12	119302	119313	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_006831	TATAAA	2	12	136655	136666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006831	TTCTGA	2	12	141295	141306	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_006831	ATATTT	2	12	151602	151613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006831	ATTTTT	2	12	151985	151996	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006831	ATTTAA	2	12	155902	155913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006831	TAGATA	2	12	172739	172750	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006831	TGGATA	2	12	195451	195462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006831	TTAATA	2	12	199339	199350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006831	AATACT	2	12	209219	209230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_006831	TAATTT	2	12	214540	214551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006831	AATTAA	2	12	247383	247394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006831	TATGAA	2	12	288474	288485	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006831	AAATAT	2	12	289196	289207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006831	TATAAT	2	12	292291	292302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006831	TTAGTA	2	12	295487	295498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006831	TTGTAT	2	12	312242	312253	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006831	TGTAAT	2	12	331951	331962	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006831	TGTTAT	2	12	342777	342788	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006831	GTTAAT	2	12	349220	349231	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006831	TGTATA	2	12	349413	349424	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006831	AATTAA	2	12	362773	362784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006831	AATATA	2	12	389550	389561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006831	TATGTT	2	12	416749	416760	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006831	TAACAA	2	12	427002	427013	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_006831	ATTTTT	2	12	469338	469349	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006831	TAGAAT	2	12	478455	478466	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006831	CAAAAA	2	12	486096	486107	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_006831	TTGTAT	2	12	488299	488310	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006831	AATGTA	2	12	492462	492473	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006831	AATGTA	2	12	492606	492617	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006831	TTTATA	2	12	504982	504993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006831	ATTAAA	2	12	516198	516209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006831	TTTGTA	2	12	523212	523223	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006831	TTATAA	2	12	545342	545353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006831	GTTTTA	2	12	547503	547514	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006831	GTTTTA	2	12	547637	547648	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006831	TGGTTT	2	12	547769	547780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006831	TGTATT	2	12	553513	553524	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006831	ATATAA	2	12	553818	553829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006831	ATATTT	2	12	566562	566573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006831	AGTGTG	2	12	571473	571484	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006831	ATATTT	2	12	576474	576485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006831	ACTTTT	2	12	577650	577661	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_006831	TATGTA	2	12	581973	581984	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006831	AAATAA	2	12	582899	582910	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006831	ATTTTA	2	12	596614	596625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006831	ATTTTT	2	12	597533	597544	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006831	TTTATT	2	12	599851	599862	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006831	TATTAA	2	12	602028	602039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006831	ATATTG	2	12	602360	602371	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006831	ATTGAT	2	12	602542	602553	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006831	ATTTTT	2	12	612738	612749	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006831	TATATT	2	12	613771	613782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006831	GCTATC	2	12	614727	614738	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006831	AATAAA	2	12	615060	615071	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006831	TTATGT	2	12	625610	625621	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006831	TATTTT	2	12	625841	625852	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006831	TATTTT	2	12	647440	647451	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006831	AGTATA	2	12	655067	655078	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006831	AATATA	2	12	655645	655656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006831	TTGTAG	2	12	658147	658158	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006831	ATTATC	2	12	661156	661167	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_006831	ATTTTT	2	12	685977	685988	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006831	TCTATA	2	12	687212	687223	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_006831	TATTTT	2	12	688559	688570	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006831	AATACA	2	12	703730	703741	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_006831	AAAATA	2	12	710704	710715	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006831	TTAAAA	2	12	721079	721090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006831	AAAACA	3	18	721403	721420	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_006831	ATAACA	2	12	727038	727049	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_006831	AAATTA	2	12	727506	727517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006831	TAATAT	2	12	729321	729332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006831	AGTATT	2	12	743991	744002	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006831	TAATAT	2	12	772435	772446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006831	TAAAAT	2	12	776112	776123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006831	TATTTA	2	12	806052	806063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006831	ATATTT	2	12	814873	814884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006831	AATAGA	2	12	817426	817437	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006831	ATATAA	2	12	830015	830026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006831	TTAAAA	2	12	849338	849349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006831	CCAAAG	2	12	852686	852697	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_006831	AAAATA	2	12	876205	876216	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006831	TAACAA	2	12	876304	876315	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_006831	TTAACA	2	12	881009	881020	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_006831	TAGCTA	2	12	891078	891089	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_006831	TAGACT	2	12	893506	893517	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_006831	AAAAAT	2	12	899736	899747	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006831	ATACAA	2	12	902115	902126	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_006831	ATGCTT	2	12	910483	910494	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_006831	ATGCTT	2	12	910685	910696	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_006831	ATGCTT	2	12	910887	910898	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_006831	ATACTA	2	12	914129	914140	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_006831	AAAAAT	2	12	927726	927737	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006831	CAATTT	2	12	935953	935964	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_006831	AATATA	2	12	946622	946633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006831	AAATAT	2	12	949465	949476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006831	TAAAAT	2	12	950185	950196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006831	ACTATT	2	12	953874	953885	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_006831	ACTATT	2	12	954036	954047	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_006831	AAGTTC	2	12	959428	959439	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_006831	TAAATT	2	12	961413	961424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006831	ATACAT	2	12	978373	978384	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_006831	AAATAA	2	12	978882	978893	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006831	TTTATA	2	12	1001087	1001098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006831	AATTAT	2	12	1001140	1001151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006831	CAAAAT	2	12	1003265	1003276	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_006831	AATACT	2	12	1018543	1018554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_006831	TAAATA	2	12	1018574	1018585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006831	TATCAA	2	12	1018856	1018867	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_006831	TAATTT	2	12	1033225	1033236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006831	AATATA	2	12	1038985	1038996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006831	AAATTA	2	12	1041509	1041520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006831	CATATA	2	12	1043618	1043629	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_006831	TATACC	2	12	1044707	1044718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_006831	TAAATT	2	12	1056125	1056136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006831	TTAATA	2	12	1056220	1056231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006831	TATATT	2	12	1066801	1066812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006831	TATCAA	2	12	1072187	1072198	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_006831	TAAATA	2	12	1076733	1076744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006831	TTATAA	2	12	1091841	1091852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_006831	TAACAA	2	12	1107601	1107612	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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149	NC_006831	TCAATA	2	12	1118224	1118235	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.