MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Gardel

Total Repeats: 1689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006831	AAAAT	2	10	1519	1528	80 %	20 %	0 %	0 %	58616729
2	NC_006831	GCATA	2	10	1775	1784	40 %	20 %	20 %	20 %	58616730
3	NC_006831	GCCTT	2	10	4118	4127	0 %	40 %	20 %	40 %	58616732
4	NC_006831	ACTAA	2	10	5561	5570	60 %	20 %	0 %	20 %	58616734
5	NC_006831	TAAAA	2	10	6125	6134	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006831	TTGAT	2	10	6200	6209	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006831	CTATA	2	10	6938	6947	40 %	40 %	0 %	20 %	161986614
8	NC_006831	TTTAT	2	10	7675	7684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006831	TTTGT	2	10	8346	8355	0 %	80 %	20 %	0 %	58616736
10	NC_006831	ATATA	2	10	8451	8460	60 %	40 %	0 %	0 %	58616736
11	NC_006831	ATGTA	2	10	11324	11333	40 %	40 %	20 %	0 %	58616739
12	NC_006831	GTAGA	2	10	14810	14819	40 %	20 %	40 %	0 %	58616741
13	NC_006831	TGGTA	2	10	15057	15066	20 %	40 %	40 %	0 %	58616741
14	NC_006831	TTTAT	2	10	17318	17327	20 %	80 %	0 %	0 %	58616743
15	NC_006831	TTGAC	2	10	17835	17844	20 %	40 %	20 %	20 %	58616744
16	NC_006831	CTATC	2	10	17893	17902	20 %	40 %	0 %	40 %	58616744
17	NC_006831	TTATT	2	10	18918	18927	20 %	80 %	0 %	0 %	58616745
18	NC_006831	TTAAT	2	10	19922	19931	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006831	GTGTT	2	10	22191	22200	0 %	60 %	40 %	0 %	58616746
20	NC_006831	ATTTT	2	10	22528	22537	20 %	80 %	0 %	0 %	58616746
21	NC_006831	TTTAA	2	10	22654	22663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006831	ATACT	2	10	23021	23030	40 %	40 %	0 %	20 %	58616747
23	NC_006831	ATTTT	2	10	23111	23120	20 %	80 %	0 %	0 %	58616747
24	NC_006831	AATCA	2	10	24756	24765	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_006831	ATTAA	2	10	24916	24925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006831	TAAAT	2	10	25392	25401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006831	GTTTA	2	10	27145	27154	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006831	GATAC	2	10	27249	27258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_006831	ATCAA	2	10	28384	28393	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_006831	TTCTT	2	10	28580	28589	0 %	80 %	0 %	20 %	58616751
31	NC_006831	TATAA	2	10	28608	28617	60 %	40 %	0 %	0 %	58616751
32	NC_006831	TTTTA	2	10	28708	28717	20 %	80 %	0 %	0 %	58616751
33	NC_006831	TTTTA	2	10	28795	28804	20 %	80 %	0 %	0 %	58616751
34	NC_006831	TCTAT	2	10	30441	30450	20 %	60 %	0 %	20 %	58616753
35	NC_006831	ATTCT	2	10	30472	30481	20 %	60 %	0 %	20 %	58616753
36	NC_006831	CAAGC	2	10	32485	32494	40 %	0 %	20 %	40 %	58616755
37	NC_006831	TTTAT	2	10	33521	33530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006831	TATGA	2	10	34454	34463	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006831	TTGAT	2	10	35475	35484	20 %	60 %	20 %	0 %	58616757
40	NC_006831	TTAAT	2	10	37098	37107	40 %	60 %	0 %	0 %	58616758
41	NC_006831	TAATA	2	10	38201	38210	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006831	TGTAA	2	10	38476	38485	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006831	TGTAA	2	10	38989	38998	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006831	ATTTT	2	10	39214	39223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006831	ATGGT	2	10	40318	40327	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006831	ATTTC	2	10	41452	41461	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_006831	ATTTC	2	10	41739	41748	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_006831	ATTTC	2	10	42023	42032	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_006831	ATTTC	2	10	43689	43698	20 %	60 %	0 %	20 %	58616760
50	NC_006831	ATAGT	2	10	43908	43917	40 %	40 %	20 %	0 %	58616760
51	NC_006831	TTTTA	2	10	44123	44132	20 %	80 %	0 %	0 %	58616761
52	NC_006831	TATAT	2	10	44666	44675	40 %	60 %	0 %	0 %	58616761
53	NC_006831	TAACG	2	10	45855	45864	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_006831	TTTTG	2	10	46243	46252	0 %	80 %	20 %	0 %	58616763
55	NC_006831	TATGA	2	10	46589	46598	40 %	40 %	20 %	0 %	58616763
56	NC_006831	TGTGT	2	10	48223	48232	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006831	TTTAT	2	10	48573	48582	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006831	TGGAG	2	10	49982	49991	20 %	20 %	60 %	0 %	58616765
59	NC_006831	ATATT	2	10	52654	52663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006831	TGTAT	2	10	53037	53046	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006831	AAACA	2	10	53793	53802	80 %	0 %	0 %	20 %	58616766
62	NC_006831	AAAAG	2	10	55529	55538	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006831	ATGCT	2	10	57794	57803	20 %	40 %	20 %	20 %	58616770
64	NC_006831	TTGAT	2	10	58378	58387	20 %	60 %	20 %	0 %	58616770
65	NC_006831	AAGAT	2	10	61835	61844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006831	ATATT	2	10	62517	62526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006831	TGGTG	2	10	63152	63161	0 %	40 %	60 %	0 %	58616774
68	NC_006831	TGTAT	2	10	63673	63682	20 %	60 %	20 %	0 %	58616775
69	NC_006831	AATTT	2	10	64425	64434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006831	ACGAT	2	10	65008	65017	40 %	20 %	20 %	20 %	58616776
71	NC_006831	ACCAA	2	10	65673	65682	60 %	0 %	0 %	40 %	58616776
72	NC_006831	TTAAT	2	10	66912	66921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006831	ATTTT	2	10	69028	69037	20 %	80 %	0 %	0 %	58616778
74	NC_006831	TCTGA	2	10	69604	69613	20 %	40 %	20 %	20 %	58616778
75	NC_006831	ATTAC	2	10	69907	69916	40 %	40 %	0 %	20 %	58616778
76	NC_006831	ATATA	2	10	73925	73934	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006831	AAAAT	2	10	74235	74244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006831	GTTAT	2	10	74442	74451	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006831	GTAAT	2	10	75517	75526	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006831	TATGT	2	10	76420	76429	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006831	AATAT	2	10	76585	76594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006831	TCTTG	2	10	76644	76653	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_006831	TTATT	2	10	79096	79105	20 %	80 %	0 %	0 %	58616784
84	NC_006831	GAAAA	2	10	79637	79646	80 %	0 %	20 %	0 %	58616784
85	NC_006831	GTTGT	2	10	80224	80233	0 %	60 %	40 %	0 %	58616784
86	NC_006831	TATGA	2	10	81729	81738	40 %	40 %	20 %	0 %	58616784
87	NC_006831	GTCAT	2	10	82204	82213	20 %	40 %	20 %	20 %	58616784
88	NC_006831	AAAAT	2	10	82603	82612	80 %	20 %	0 %	0 %	58616784
89	NC_006831	AGTTT	2	10	83148	83157	20 %	60 %	20 %	0 %	58616784
90	NC_006831	ATCAC	2	10	83880	83889	40 %	20 %	0 %	40 %	58616784
91	NC_006831	AGTCA	2	10	83974	83983	40 %	20 %	20 %	20 %	58616784
92	NC_006831	AAGTA	2	10	84749	84758	60 %	20 %	20 %	0 %	58616784
93	NC_006831	TGTAT	2	10	85507	85516	20 %	60 %	20 %	0 %	58616784
94	NC_006831	ACTTT	2	10	85628	85637	20 %	60 %	0 %	20 %	58616784
95	NC_006831	GAACA	2	10	86299	86308	60 %	0 %	20 %	20 %	58616784
96	NC_006831	GTAGA	2	10	88228	88237	40 %	20 %	40 %	0 %	58616784
97	NC_006831	AATCA	2	10	90457	90466	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_006831	TATTT	2	10	90808	90817	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006831	AGTTA	2	10	90895	90904	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006831	TTATA	2	10	91216	91225	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006831	GGTAT	2	10	93880	93889	20 %	40 %	40 %	0 %	58616787
102	NC_006831	TAATG	2	10	94481	94490	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006831	ACATG	2	10	94550	94559	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_006831	TAATT	2	10	94751	94760	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006831	AGATT	2	10	94860	94869	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006831	AGGAA	2	10	95356	95365	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006831	ACTAT	2	10	95935	95944	40 %	40 %	0 %	20 %	58616788
108	NC_006831	ATCAA	2	10	97451	97460	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_006831	TTATT	2	10	98156	98165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006831	CTACC	2	10	99614	99623	20 %	20 %	0 %	60 %	58616789
111	NC_006831	TACTA	2	10	99781	99790	40 %	40 %	0 %	20 %	58616789
112	NC_006831	AGACT	2	10	100407	100416	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_006831	AGTCA	2	10	100842	100851	40 %	20 %	20 %	20 %	58616790
114	NC_006831	TAATA	2	10	101605	101614	60 %	40 %	0 %	0 %	58616790
115	NC_006831	GTTAT	2	10	103457	103466	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006831	AGCTG	2	10	103819	103828	20 %	20 %	40 %	20 %	58616791
117	NC_006831	AATAA	2	10	104036	104045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006831	AGTTA	2	10	104187	104196	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006831	CAGTA	2	10	106993	107002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_006831	GATAT	2	10	108174	108183	40 %	40 %	20 %	0 %	58616793
121	NC_006831	TGCTA	2	10	110039	110048	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_006831	TATAT	2	10	111157	111166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006831	TAGTT	2	10	111899	111908	20 %	60 %	20 %	0 %	58616794
124	NC_006831	CATAT	2	10	114434	114443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_006831	TGTTA	2	10	114472	114481	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006831	CATAT	2	10	114572	114581	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_006831	TGTTA	2	10	114610	114619	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006831	TGTTA	2	10	114748	114757	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006831	ATAAA	2	10	115292	115301	80 %	20 %	0 %	0 %	58616795
130	NC_006831	AACAT	2	10	116129	116138	60 %	20 %	0 %	20 %	58616795
131	NC_006831	GGTAT	2	10	116478	116487	20 %	40 %	40 %	0 %	58616795
132	NC_006831	TAGTA	2	10	120634	120643	40 %	40 %	20 %	0 %	58616799
133	NC_006831	TTATA	2	10	124246	124255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006831	CTAAT	2	10	125883	125892	40 %	40 %	0 %	20 %	58616804
135	NC_006831	TACAA	2	10	127898	127907	60 %	20 %	0 %	20 %	58616806
136	NC_006831	TGTAT	2	10	128859	128868	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006831	CTTAT	2	10	129920	129929	20 %	60 %	0 %	20 %	58616807
138	NC_006831	AAATA	2	10	130481	130490	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006831	TGGAA	2	10	132886	132895	40 %	20 %	40 %	0 %	58616808
140	NC_006831	TTATG	2	10	135048	135057	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006831	TATTT	2	10	136081	136090	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006831	AATTT	2	10	136267	136276	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006831	GTAGA	2	10	136430	136439	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006831	TATAT	2	10	137767	137776	40 %	60 %	0 %	0 %	58616810
145	NC_006831	TTAAT	2	10	138236	138245	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_006831	TTAAT	2	10	149210	149219	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_006831	GTTTT	2	10	178939	178948	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_006831	AGAAC	2	10	223043	223052	60 %	0 %	20 %	20 %	58616861
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261	NC_006831	TTAAT	2	10	232201	232210	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_006831	TTTTG	2	10	232719	232728	0 %	80 %	20 %	0 %	58616867
263	NC_006831	TTCTA	2	10	232804	232813	20 %	60 %	0 %	20 %	58616867
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267	NC_006831	TTATT	2	10	237394	237403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_006831	AATTA	2	10	237837	237846	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_006831	AAATT	2	10	238845	238854	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_006831	TTAGT	2	10	238889	238898	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
271	NC_006831	ATAAG	2	10	239367	239376	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
272	NC_006831	GATAA	2	10	240607	240616	60 %	20 %	20 %	0 %	58616871
273	NC_006831	CTATT	2	10	243096	243105	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
274	NC_006831	ATTAA	2	10	243115	243124	60 %	40 %	0 %	0 %	58616874
275	NC_006831	TTGTT	2	10	243658	243667	0 %	80 %	20 %	0 %	58616874
276	NC_006831	TTAAG	2	10	244597	244606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
277	NC_006831	TAATT	2	10	244627	244636	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_006831	TTACT	2	10	244733	244742	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
279	NC_006831	TATAT	2	10	244749	244758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_006831	TATAC	2	10	245903	245912	40 %	40 %	0 %	20 %	58616876
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284	NC_006831	TGTAT	2	10	249622	249631	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
285	NC_006831	TGTAT	2	10	249769	249778	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
286	NC_006831	TGTAT	2	10	249917	249926	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_006831	AACTT	2	10	251921	251930	40 %	40 %	0 %	20 %	58616879
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410	NC_006831	ATTAT	2	10	362429	362438	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_006831	TTATG	2	10	362939	362948	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
412	NC_006831	ATTAT	2	10	363164	363173	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_006831	TTAAT	2	10	363234	363243	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_006831	TTAAA	2	10	365096	365105	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_006831	TATAT	2	10	366427	366436	40 %	60 %	0 %	0 %	58616951
416	NC_006831	TATAT	2	10	367266	367275	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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