MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Gardel

Total Repeats: 813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006831	TAAAA	2	10	6125	6134	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006831	TTGAT	2	10	6200	6209	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006831	TTTAT	2	10	7675	7684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006831	TTAAT	2	10	19922	19931	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006831	TTTAA	2	10	22654	22663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006831	AATCA	2	10	24756	24765	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_006831	ATTAA	2	10	24916	24925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006831	TAAAT	2	10	25392	25401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006831	GTTTA	2	10	27145	27154	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006831	GATAC	2	10	27249	27258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_006831	ATCAA	2	10	28384	28393	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006831	TTTAT	2	10	33521	33530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006831	TATGA	2	10	34454	34463	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006831	TAATA	2	10	38201	38210	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006831	TGTAA	2	10	38476	38485	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006831	TGTAA	2	10	38989	38998	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006831	ATTTT	2	10	39214	39223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006831	ATGGT	2	10	40318	40327	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006831	ATTTC	2	10	41452	41461	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_006831	ATTTC	2	10	41739	41748	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_006831	ATTTC	2	10	42023	42032	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_006831	TAACG	2	10	45855	45864	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_006831	TGTGT	2	10	48223	48232	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006831	TTTAT	2	10	48573	48582	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006831	ATATT	2	10	52654	52663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006831	TGTAT	2	10	53037	53046	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006831	AAAAG	2	10	55529	55538	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006831	AAGAT	2	10	61835	61844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006831	ATATT	2	10	62517	62526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006831	AATTT	2	10	64425	64434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006831	TTAAT	2	10	66912	66921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006831	ATATA	2	10	73925	73934	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006831	AAAAT	2	10	74235	74244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006831	GTTAT	2	10	74442	74451	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006831	GTAAT	2	10	75517	75526	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006831	TATGT	2	10	76420	76429	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006831	AATAT	2	10	76585	76594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006831	TCTTG	2	10	76644	76653	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_006831	AATCA	2	10	90457	90466	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_006831	TATTT	2	10	90808	90817	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006831	AGTTA	2	10	90895	90904	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006831	TTATA	2	10	91216	91225	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006831	TAATG	2	10	94481	94490	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006831	ACATG	2	10	94550	94559	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_006831	TAATT	2	10	94751	94760	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006831	AGATT	2	10	94860	94869	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006831	AGGAA	2	10	95356	95365	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006831	ATCAA	2	10	97451	97460	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_006831	TTATT	2	10	98156	98165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006831	AGACT	2	10	100407	100416	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_006831	GTTAT	2	10	103457	103466	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006831	AATAA	2	10	104036	104045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006831	AGTTA	2	10	104187	104196	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006831	CAGTA	2	10	106993	107002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_006831	TGCTA	2	10	110039	110048	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_006831	TATAT	2	10	111157	111166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006831	CATAT	2	10	114434	114443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_006831	TGTTA	2	10	114472	114481	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006831	CATAT	2	10	114572	114581	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_006831	TGTTA	2	10	114610	114619	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006831	TGTTA	2	10	114748	114757	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006831	TTATA	2	10	124246	124255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006831	TGTAT	2	10	128859	128868	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006831	AAATA	2	10	130481	130490	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006831	TTATG	2	10	135048	135057	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006831	TATTT	2	10	136081	136090	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006831	AATTT	2	10	136267	136276	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006831	GTAGA	2	10	136430	136439	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006831	TTAAT	2	10	138236	138245	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006831	AGATT	2	10	140091	140100	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006831	TGTTT	2	10	143706	143715	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006831	TATTT	2	10	148284	148293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006831	TTAAT	2	10	149210	149219	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006831	TAGTC	2	10	151065	151074	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_006831	TTCAT	2	10	156070	156079	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_006831	GAATA	2	10	157628	157637	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006831	TAATG	2	10	159111	159120	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006831	TATTT	2	10	159273	159282	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006831	GTAGT	2	10	164092	164101	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006831	ATTGT	2	10	165849	165858	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006831	GGTTA	2	10	168674	168683	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006831	GTAAA	2	10	171809	171818	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006831	GTATA	2	10	171884	171893	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006831	TTATT	2	10	172253	172262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006831	TGTAA	2	10	177687	177696	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006831	TTATA	2	10	178728	178737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006831	TTATT	2	10	178874	178883	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006831	GTTTT	2	10	178939	178948	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006831	TGAAT	2	10	179318	179327	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006831	ATATA	2	10	181959	181968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006831	TTAGT	2	10	186046	186055	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006831	TATAT	2	10	186460	186469	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006831	AAAGT	2	10	192104	192113	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006831	AAAGT	2	10	192291	192300	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006831	TATAA	2	10	192310	192319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006831	TTAAT	2	10	195084	195093	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006831	GTTGT	2	10	195111	195120	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006831	TTTAA	2	10	195303	195312	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006831	TTAAA	2	10	195940	195949	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006831	TGAGT	2	10	196579	196588	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006831	AATTA	2	10	196679	196688	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006831	AAGTT	2	10	199208	199217	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006831	TAATA	2	10	200494	200503	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006831	TATAT	2	10	202604	202613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006831	CTATT	2	10	202647	202656	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_006831	TAATA	2	10	209101	209110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006831	TGTGT	2	10	213705	213714	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006831	TTTTA	2	10	214058	214067	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006831	AATTA	2	10	214508	214517	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006831	TATAT	2	10	215076	215085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006831	AAGTT	2	10	218650	218659	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006831	AATTA	2	10	220353	220362	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006831	TAGAT	2	10	220620	220629	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006831	ACTTA	2	10	220780	220789	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_006831	GATTA	2	10	226543	226552	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006831	TAATA	2	10	231188	231197	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006831	TTAAT	2	10	232201	232210	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006831	TTATT	2	10	237394	237403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006831	AATTA	2	10	237837	237846	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006831	AAATT	2	10	238845	238854	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006831	TTAGT	2	10	238889	238898	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006831	ATAAG	2	10	239367	239376	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006831	CTATT	2	10	243096	243105	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_006831	TTAAG	2	10	244597	244606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006831	TAATT	2	10	244627	244636	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006831	TTACT	2	10	244733	244742	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_006831	TATAT	2	10	244749	244758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006831	TGTAT	2	10	249473	249482	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006831	TGTAT	2	10	249622	249631	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006831	TGTAT	2	10	249769	249778	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006831	TGTAT	2	10	249917	249926	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006831	GTATT	2	10	252681	252690	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006831	GTTAA	2	10	252790	252799	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006831	TTGTA	2	10	252970	252979	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006831	ATTAT	2	10	253082	253091	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006831	GTTTA	2	10	255254	255263	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006831	GGTGT	2	10	255315	255324	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006831	TATTG	2	10	255939	255948	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006831	AGTGT	2	10	256181	256190	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006831	TCTTA	2	10	273027	273036	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_006831	CTTAT	2	10	274839	274848	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_006831	ATATT	2	10	276034	276043	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006831	TAAAT	2	10	278336	278345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006831	CTTTA	2	10	284224	284233	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_006831	ATGTA	2	10	285270	285279	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006831	TAGAT	2	10	288226	288235	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006831	TATGA	2	10	288274	288283	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006831	TTGTA	2	10	289228	289237	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006831	AAAAT	2	10	291771	291780	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_006831	TAATA	2	10	292374	292383	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_006831	TTAAT	2	10	363234	363243	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_006831	ACAAA	2	10	971771	971780	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

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