MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Gardel

Total Repeats: 876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006831	AAAAT	2	10	1519	1528	80 %	20 %	0 %	0 %	58616729
2	NC_006831	GCATA	2	10	1775	1784	40 %	20 %	20 %	20 %	58616730
3	NC_006831	GCCTT	2	10	4118	4127	0 %	40 %	20 %	40 %	58616732
4	NC_006831	ACTAA	2	10	5561	5570	60 %	20 %	0 %	20 %	58616734
5	NC_006831	CTATA	2	10	6938	6947	40 %	40 %	0 %	20 %	161986614
6	NC_006831	TTTGT	2	10	8346	8355	0 %	80 %	20 %	0 %	58616736
7	NC_006831	ATATA	2	10	8451	8460	60 %	40 %	0 %	0 %	58616736
8	NC_006831	ATGTA	2	10	11324	11333	40 %	40 %	20 %	0 %	58616739
9	NC_006831	GTAGA	2	10	14810	14819	40 %	20 %	40 %	0 %	58616741
10	NC_006831	TGGTA	2	10	15057	15066	20 %	40 %	40 %	0 %	58616741
11	NC_006831	TTTAT	2	10	17318	17327	20 %	80 %	0 %	0 %	58616743
12	NC_006831	TTGAC	2	10	17835	17844	20 %	40 %	20 %	20 %	58616744
13	NC_006831	CTATC	2	10	17893	17902	20 %	40 %	0 %	40 %	58616744
14	NC_006831	TTATT	2	10	18918	18927	20 %	80 %	0 %	0 %	58616745
15	NC_006831	GTGTT	2	10	22191	22200	0 %	60 %	40 %	0 %	58616746
16	NC_006831	ATTTT	2	10	22528	22537	20 %	80 %	0 %	0 %	58616746
17	NC_006831	ATACT	2	10	23021	23030	40 %	40 %	0 %	20 %	58616747
18	NC_006831	ATTTT	2	10	23111	23120	20 %	80 %	0 %	0 %	58616747
19	NC_006831	TTCTT	2	10	28580	28589	0 %	80 %	0 %	20 %	58616751
20	NC_006831	TATAA	2	10	28608	28617	60 %	40 %	0 %	0 %	58616751
21	NC_006831	TTTTA	2	10	28708	28717	20 %	80 %	0 %	0 %	58616751
22	NC_006831	TTTTA	2	10	28795	28804	20 %	80 %	0 %	0 %	58616751
23	NC_006831	TCTAT	2	10	30441	30450	20 %	60 %	0 %	20 %	58616753
24	NC_006831	ATTCT	2	10	30472	30481	20 %	60 %	0 %	20 %	58616753
25	NC_006831	CAAGC	2	10	32485	32494	40 %	0 %	20 %	40 %	58616755
26	NC_006831	TTGAT	2	10	35475	35484	20 %	60 %	20 %	0 %	58616757
27	NC_006831	TTAAT	2	10	37098	37107	40 %	60 %	0 %	0 %	58616758
28	NC_006831	ATTTC	2	10	43689	43698	20 %	60 %	0 %	20 %	58616760
29	NC_006831	ATAGT	2	10	43908	43917	40 %	40 %	20 %	0 %	58616760
30	NC_006831	TTTTA	2	10	44123	44132	20 %	80 %	0 %	0 %	58616761
31	NC_006831	TATAT	2	10	44666	44675	40 %	60 %	0 %	0 %	58616761
32	NC_006831	TTTTG	2	10	46243	46252	0 %	80 %	20 %	0 %	58616763
33	NC_006831	TATGA	2	10	46589	46598	40 %	40 %	20 %	0 %	58616763
34	NC_006831	TGGAG	2	10	49982	49991	20 %	20 %	60 %	0 %	58616765
35	NC_006831	AAACA	2	10	53793	53802	80 %	0 %	0 %	20 %	58616766
36	NC_006831	ATGCT	2	10	57794	57803	20 %	40 %	20 %	20 %	58616770
37	NC_006831	TTGAT	2	10	58378	58387	20 %	60 %	20 %	0 %	58616770
38	NC_006831	TGGTG	2	10	63152	63161	0 %	40 %	60 %	0 %	58616774
39	NC_006831	TGTAT	2	10	63673	63682	20 %	60 %	20 %	0 %	58616775
40	NC_006831	ACGAT	2	10	65008	65017	40 %	20 %	20 %	20 %	58616776
41	NC_006831	ACCAA	2	10	65673	65682	60 %	0 %	0 %	40 %	58616776
42	NC_006831	ATTTT	2	10	69028	69037	20 %	80 %	0 %	0 %	58616778
43	NC_006831	TCTGA	2	10	69604	69613	20 %	40 %	20 %	20 %	58616778
44	NC_006831	ATTAC	2	10	69907	69916	40 %	40 %	0 %	20 %	58616778
45	NC_006831	TTATT	2	10	79096	79105	20 %	80 %	0 %	0 %	58616784
46	NC_006831	GAAAA	2	10	79637	79646	80 %	0 %	20 %	0 %	58616784
47	NC_006831	GTTGT	2	10	80224	80233	0 %	60 %	40 %	0 %	58616784
48	NC_006831	TATGA	2	10	81729	81738	40 %	40 %	20 %	0 %	58616784
49	NC_006831	GTCAT	2	10	82204	82213	20 %	40 %	20 %	20 %	58616784
50	NC_006831	AAAAT	2	10	82603	82612	80 %	20 %	0 %	0 %	58616784
51	NC_006831	AGTTT	2	10	83148	83157	20 %	60 %	20 %	0 %	58616784
52	NC_006831	ATCAC	2	10	83880	83889	40 %	20 %	0 %	40 %	58616784
53	NC_006831	AGTCA	2	10	83974	83983	40 %	20 %	20 %	20 %	58616784
54	NC_006831	AAGTA	2	10	84749	84758	60 %	20 %	20 %	0 %	58616784
55	NC_006831	TGTAT	2	10	85507	85516	20 %	60 %	20 %	0 %	58616784
56	NC_006831	ACTTT	2	10	85628	85637	20 %	60 %	0 %	20 %	58616784
57	NC_006831	GAACA	2	10	86299	86308	60 %	0 %	20 %	20 %	58616784
58	NC_006831	GTAGA	2	10	88228	88237	40 %	20 %	40 %	0 %	58616784
59	NC_006831	GGTAT	2	10	93880	93889	20 %	40 %	40 %	0 %	58616787
60	NC_006831	ACTAT	2	10	95935	95944	40 %	40 %	0 %	20 %	58616788
61	NC_006831	CTACC	2	10	99614	99623	20 %	20 %	0 %	60 %	58616789
62	NC_006831	TACTA	2	10	99781	99790	40 %	40 %	0 %	20 %	58616789
63	NC_006831	AGTCA	2	10	100842	100851	40 %	20 %	20 %	20 %	58616790
64	NC_006831	TAATA	2	10	101605	101614	60 %	40 %	0 %	0 %	58616790
65	NC_006831	AGCTG	2	10	103819	103828	20 %	20 %	40 %	20 %	58616791
66	NC_006831	GATAT	2	10	108174	108183	40 %	40 %	20 %	0 %	58616793
67	NC_006831	TAGTT	2	10	111899	111908	20 %	60 %	20 %	0 %	58616794
68	NC_006831	ATAAA	2	10	115292	115301	80 %	20 %	0 %	0 %	58616795
69	NC_006831	AACAT	2	10	116129	116138	60 %	20 %	0 %	20 %	58616795
70	NC_006831	GGTAT	2	10	116478	116487	20 %	40 %	40 %	0 %	58616795
71	NC_006831	TAGTA	2	10	120634	120643	40 %	40 %	20 %	0 %	58616799
72	NC_006831	CTAAT	2	10	125883	125892	40 %	40 %	0 %	20 %	58616804
73	NC_006831	TACAA	2	10	127898	127907	60 %	20 %	0 %	20 %	58616806
74	NC_006831	CTTAT	2	10	129920	129929	20 %	60 %	0 %	20 %	58616807
75	NC_006831	TGGAA	2	10	132886	132895	40 %	20 %	40 %	0 %	58616808
76	NC_006831	TATAT	2	10	137767	137776	40 %	60 %	0 %	0 %	58616810
77	NC_006831	GTATT	2	10	141776	141785	20 %	60 %	20 %	0 %	58616813
78	NC_006831	TTTTA	2	10	147769	147778	20 %	80 %	0 %	0 %	58616817
79	NC_006831	GTTGT	2	10	153496	153505	0 %	60 %	40 %	0 %	58616819
80	NC_006831	AAGTA	2	10	154703	154712	60 %	20 %	20 %	0 %	58616820
81	NC_006831	AATTT	2	10	155615	155624	40 %	60 %	0 %	0 %	58616820
82	NC_006831	CTTAT	2	10	160833	160842	20 %	60 %	0 %	20 %	58616824
83	NC_006831	TAGAA	2	10	166123	166132	60 %	20 %	20 %	0 %	58616826
84	NC_006831	TATAT	2	10	166700	166709	40 %	60 %	0 %	0 %	58616827
85	NC_006831	ATGTT	2	10	169461	169470	20 %	60 %	20 %	0 %	58616830
86	NC_006831	ATGTT	2	10	170061	170070	20 %	60 %	20 %	0 %	58616831
87	NC_006831	AATCA	2	10	170340	170349	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
88	NC_006831	AATCA	2	10	170406	170415	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
89	NC_006831	AATCA	2	10	170472	170481	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
90	NC_006831	AATCA	2	10	170538	170547	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
91	NC_006831	AATCA	2	10	170604	170613	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
92	NC_006831	AATCA	2	10	170670	170679	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
93	NC_006831	AATCA	2	10	170736	170745	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
94	NC_006831	AATCA	2	10	170802	170811	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
95	NC_006831	AATCA	2	10	170868	170877	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
96	NC_006831	AATCA	2	10	170934	170943	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
97	NC_006831	AATCA	2	10	171000	171009	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
98	NC_006831	AATCA	2	10	171066	171075	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
99	NC_006831	AATCA	2	10	171132	171141	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
100	NC_006831	AATCA	2	10	171198	171207	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
101	NC_006831	AATCA	2	10	171264	171273	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
102	NC_006831	AATCA	2	10	171330	171339	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
103	NC_006831	AATCA	2	10	171396	171405	60 %	20 %	0 %	20 %	58616831
104	NC_006831	GTCAA	2	10	173387	173396	40 %	20 %	20 %	20 %	58616832
105	NC_006831	GTATT	2	10	173582	173591	20 %	60 %	20 %	0 %	58616832
106	NC_006831	TTGTA	2	10	180008	180017	20 %	60 %	20 %	0 %	58616836
107	NC_006831	TAGTT	2	10	180436	180445	20 %	60 %	20 %	0 %	58616836
108	NC_006831	ACATT	2	10	185474	185483	40 %	40 %	0 %	20 %	58616839
109	NC_006831	CTTTG	2	10	187621	187630	0 %	60 %	20 %	20 %	58616840
110	NC_006831	ATTAT	2	10	187902	187911	40 %	60 %	0 %	0 %	58616840
111	NC_006831	GTTTG	2	10	188497	188506	0 %	60 %	40 %	0 %	58616840
112	NC_006831	CAGCT	2	10	188821	188830	20 %	20 %	20 %	40 %	58616840
113	NC_006831	TAGTT	2	10	189402	189411	20 %	60 %	20 %	0 %	58616841
114	NC_006831	GATAA	2	10	190870	190879	60 %	20 %	20 %	0 %	58616841
115	NC_006831	TAAAT	2	10	191866	191875	60 %	40 %	0 %	0 %	58616841
116	NC_006831	GGTAA	2	10	193562	193571	40 %	20 %	40 %	0 %	58616842
117	NC_006831	TTGAT	2	10	194322	194331	20 %	60 %	20 %	0 %	58616842
118	NC_006831	CTTGT	2	10	194400	194409	0 %	60 %	20 %	20 %	58616842
119	NC_006831	TGGTT	2	10	198087	198096	0 %	60 %	40 %	0 %	58616843
120	NC_006831	ATAAA	2	10	200843	200852	80 %	20 %	0 %	0 %	58616847
121	NC_006831	TAATA	2	10	201021	201030	60 %	40 %	0 %	0 %	58616847
122	NC_006831	ATTAT	2	10	202859	202868	40 %	60 %	0 %	0 %	58616848
123	NC_006831	CAGTG	2	10	203251	203260	20 %	20 %	40 %	20 %	58616848
124	NC_006831	GTATG	2	10	204271	204280	20 %	40 %	40 %	0 %	58616848
125	NC_006831	AACAT	2	10	205581	205590	60 %	20 %	0 %	20 %	58616849
126	NC_006831	AGTAA	2	10	206438	206447	60 %	20 %	20 %	0 %	58616849
127	NC_006831	GATGT	2	10	207371	207380	20 %	40 %	40 %	0 %	58616849
128	NC_006831	TTTAA	2	10	208085	208094	40 %	60 %	0 %	0 %	58616849
129	NC_006831	TTTGG	2	10	209998	210007	0 %	60 %	40 %	0 %	58616850
130	NC_006831	AAGAT	2	10	210103	210112	60 %	20 %	20 %	0 %	58616850
131	NC_006831	TGGTA	2	10	211993	212002	20 %	40 %	40 %	0 %	58616852
132	NC_006831	ATTAT	2	10	215231	215240	40 %	60 %	0 %	0 %	58616854
133	NC_006831	ATATC	2	10	215735	215744	40 %	40 %	0 %	20 %	58616854
134	NC_006831	AGTGA	2	10	215852	215861	40 %	20 %	40 %	0 %	58616855
135	NC_006831	ATATT	2	10	215919	215928	40 %	60 %	0 %	0 %	58616855
136	NC_006831	ATTTA	2	10	219274	219283	40 %	60 %	0 %	0 %	58616859
137	NC_006831	AAGAA	2	10	220114	220123	80 %	0 %	20 %	0 %	58616859
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