MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Gardel

Total Repeats: 16402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006831	CTC	2	6	113	118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58616728
2	NC_006831	TAG	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616728
3	NC_006831	ATT	2	6	232	237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616728
4	NC_006831	CTC	2	6	247	252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58616728
5	NC_006831	CAT	2	6	375	380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616728
6	NC_006831	AGT	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616728
7	NC_006831	TAC	2	6	465	470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616728
8	NC_006831	TCT	2	6	722	727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616728
9	NC_006831	TAT	2	6	768	773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616728
10	NC_006831	GTT	2	6	776	781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616728
11	NC_006831	TCT	2	6	803	808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616728
12	NC_006831	ATA	2	6	952	957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616729
13	NC_006831	GTA	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616729
14	NC_006831	TAT	2	6	1021	1026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616729
15	NC_006831	CAA	2	6	1081	1086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616729
16	NC_006831	TTA	2	6	1116	1121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616729
17	NC_006831	TTG	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616729
18	NC_006831	ATA	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616729
19	NC_006831	TCT	2	6	1198	1203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616729
20	NC_006831	GCT	2	6	1206	1211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616729
21	NC_006831	CAT	2	6	1220	1225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616729
22	NC_006831	AGG	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58616729
23	NC_006831	ATT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616729
24	NC_006831	ATC	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616729
25	NC_006831	ATT	3	9	1403	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616729
26	NC_006831	TTA	2	6	1421	1426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616729
27	NC_006831	TAA	3	9	1468	1476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616729
28	NC_006831	AAT	2	6	1727	1732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616730
29	NC_006831	TAG	3	9	1756	1764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616730
30	NC_006831	AAT	2	6	1868	1873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616730
31	NC_006831	TTG	2	6	1913	1918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616730
32	NC_006831	ATT	2	6	1936	1941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616730
33	NC_006831	GTT	2	6	1963	1968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616730
34	NC_006831	TAT	2	6	2023	2028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616730
35	NC_006831	CAA	2	6	2272	2277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616731
36	NC_006831	TCT	2	6	2316	2321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616731
37	NC_006831	TTA	2	6	2559	2564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616731
38	NC_006831	ATA	2	6	2602	2607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616731
39	NC_006831	GTA	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616731
40	NC_006831	TAA	2	6	2677	2682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616731
41	NC_006831	TTA	2	6	2854	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616731
42	NC_006831	CCA	2	6	2867	2872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58616731
43	NC_006831	AGT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616731
44	NC_006831	CTA	2	6	3164	3169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616732
45	NC_006831	ATT	2	6	3253	3258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
46	NC_006831	CTT	2	6	3281	3286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616732
47	NC_006831	TAT	2	6	3324	3329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
48	NC_006831	ATT	2	6	3487	3492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
49	NC_006831	TAT	2	6	3507	3512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
50	NC_006831	TTA	2	6	3596	3601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
51	NC_006831	TTG	2	6	3611	3616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616732
52	NC_006831	TCC	2	6	3732	3737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58616732
53	NC_006831	CTT	2	6	3782	3787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616732
54	NC_006831	TGT	2	6	3839	3844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616732
55	NC_006831	ATT	2	6	3949	3954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
56	NC_006831	GCA	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58616732
57	NC_006831	ATA	2	6	4590	4595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616733
58	NC_006831	AAT	2	6	4889	4894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616733
59	NC_006831	ATA	2	6	4904	4909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616733
60	NC_006831	AAT	2	6	4981	4986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616733
61	NC_006831	TCC	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58616733
62	NC_006831	TGA	2	6	5065	5070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616733
63	NC_006831	TGG	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616733
64	NC_006831	TAG	2	6	5121	5126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616733
65	NC_006831	GAT	2	6	5135	5140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616733
66	NC_006831	ATA	2	6	5184	5189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616733
67	NC_006831	AGA	2	6	5263	5268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58616733
68	NC_006831	GGT	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616733
69	NC_006831	GTG	2	6	5349	5354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616733
70	NC_006831	GAT	2	6	5378	5383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616733
71	NC_006831	ATG	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616734
72	NC_006831	CTT	2	6	5691	5696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616734
73	NC_006831	TAG	2	6	5713	5718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616734
74	NC_006831	TAG	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616734
75	NC_006831	TAT	3	9	5854	5862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616734
76	NC_006831	ACA	2	6	5879	5884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616734
77	NC_006831	TTA	2	6	5933	5938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616734
78	NC_006831	GTG	2	6	6362	6367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986614
79	NC_006831	AGC	2	6	6378	6383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986614
80	NC_006831	AAT	2	6	6534	6539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161986614
81	NC_006831	GTA	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986614
82	NC_006831	TAT	2	6	6608	6613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986614
83	NC_006831	TGG	2	6	6636	6641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986614
84	NC_006831	TCC	2	6	6738	6743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161986614
85	NC_006831	TAA	2	6	6747	6752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161986614
86	NC_006831	GTC	2	6	6789	6794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986614
87	NC_006831	ATT	2	6	6840	6845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986614
88	NC_006831	GCT	2	6	6952	6957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986614
89	NC_006831	TTA	2	6	7036	7041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986614
90	NC_006831	TAT	2	6	7094	7099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986614
91	NC_006831	AAT	2	6	7110	7115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161986614
92	NC_006831	TAA	2	6	7134	7139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161986614
93	NC_006831	TTA	2	6	7162	7167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986614
94	NC_006831	ATC	2	6	7174	7179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986614
95	NC_006831	TAT	2	6	7250	7255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986614
96	NC_006831	GAT	2	6	7283	7288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986614
97	NC_006831	ATA	2	6	7330	7335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161986614
98	NC_006831	TGC	3	9	7344	7352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986614
99	NC_006831	CAG	2	6	7448	7453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986614
100	NC_006831	AAG	2	6	7513	7518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161986614
101	NC_006831	TAT	2	6	7800	7805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616736
102	NC_006831	TGC	2	6	7845	7850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616736
103	NC_006831	ATA	2	6	8054	8059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616736
104	NC_006831	ATT	2	6	8105	8110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616736
105	NC_006831	TTA	2	6	8117	8122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616736
106	NC_006831	TGG	2	6	8237	8242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616736
107	NC_006831	AAT	2	6	8248	8253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616736
108	NC_006831	GGA	2	6	8269	8274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58616736
109	NC_006831	GTT	2	6	8275	8280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616736
110	NC_006831	TAA	2	6	8439	8444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616736
111	NC_006831	ATT	2	6	8539	8544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616736
112	NC_006831	TGA	2	6	8569	8574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616737
113	NC_006831	CGT	2	6	8610	8615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616737
114	NC_006831	ATT	2	6	8650	8655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616737
115	NC_006831	ACA	2	6	8730	8735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616737
116	NC_006831	ATT	2	6	8787	8792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616737
117	NC_006831	TTC	2	6	8921	8926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616737
118	NC_006831	GAA	2	6	9053	9058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58616737
119	NC_006831	TTA	2	6	9192	9197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616737
120	NC_006831	CTG	2	6	9244	9249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616737
121	NC_006831	GAA	2	6	9282	9287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58616737
122	NC_006831	CTT	2	6	9346	9351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616737
123	NC_006831	TAA	2	6	9371	9376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616737
124	NC_006831	TCA	2	6	9829	9834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616738
125	NC_006831	ATT	2	6	9843	9848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616738
126	NC_006831	ATC	2	6	9876	9881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616738
127	NC_006831	ATG	2	6	10279	10284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616739
128	NC_006831	AGG	2	6	10345	10350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58616739
129	NC_006831	GAT	2	6	10401	10406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616739
130	NC_006831	GTG	2	6	10459	10464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616739
131	NC_006831	GAA	2	6	10476	10481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58616739
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133	NC_006831	GTG	2	6	10555	10560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616739
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259	NC_006831	AAT	2	6	17198	17203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616743
260	NC_006831	TAT	2	6	17220	17225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616743
261	NC_006831	ATT	2	6	17284	17289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616743
262	NC_006831	ATA	2	6	17356	17361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616743
263	NC_006831	ATT	2	6	17434	17439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616743
264	NC_006831	CTT	2	6	17471	17476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616743
265	NC_006831	ATG	2	6	17528	17533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616743
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267	NC_006831	TAC	2	6	17647	17652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616743
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275	NC_006831	TAT	2	6	18167	18172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616744
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280	NC_006831	ATA	2	6	18355	18360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616744
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289	NC_006831	TAA	2	6	19345	19350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616745
290	NC_006831	TAG	2	6	19459	19464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616745
291	NC_006831	ATA	2	6	19709	19714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616745
292	NC_006831	TCA	2	6	21691	21696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616746
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380	NC_006831	AAT	2	6	29032	29037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616751
381	NC_006831	CAT	2	6	29106	29111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616751
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