MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azoarcus sp. EbN1 plasmid 2

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006824	GGCC	2	8	9610	9617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006824	GAAG	2	8	9810	9817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006824	GATG	2	8	11657	11664	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006824	TCGC	2	8	11892	11899	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_006824	ATAA	2	8	12638	12645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006824	AGGC	2	8	12692	12699	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_006824	CTCG	2	8	25818	25825	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_006824	TCAG	2	8	26029	26036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_006824	GGTT	2	8	32974	32981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006824	GCGG	2	8	37432	37439	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_006824	ACCG	2	8	39690	39697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_006824	GTCG	2	8	40054	40061	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_006824	TCGC	2	8	43763	43770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_006824	CGAA	2	8	43800	43807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_006824	CCGG	2	8	43813	43820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_006824	TGGC	2	8	43949	43956	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_006824	CTGG	2	8	61197	61204	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006824	CTCC	2	8	62020	62027	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_006824	GAAC	2	8	64056	64063	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_006824	GCAG	2	8	64088	64095	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_006824	CAGA	2	8	64103	64110	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_006824	CAAT	2	8	64133	64140	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_006824	TCGC	2	8	65477	65484	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_006824	GCAG	2	8	65728	65735	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_006824	TCGG	2	8	72292	72299	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_006824	ATGC	2	8	72450	72457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_006824	CGGG	2	8	78612	78619	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_006824	ACCG	2	8	78822	78829	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_006824	AGCC	2	8	78833	78840	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_006824	TGAC	2	8	81176	81183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_006824	CGGC	2	8	81400	81407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_006824	GGCC	2	8	81418	81425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_006824	CCTG	2	8	81440	81447	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_006824	GACG	2	8	81492	81499	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_006824	GGCA	2	8	82572	82579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_006824	TGCC	2	8	85512	85519	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_006824	CGCC	2	8	85595	85602	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_006824	CCGC	2	8	85648	85655	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_006824	CAGC	2	8	85713	85720	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_006824	GAAG	2	8	85788	85795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006824	TGCC	2	8	85801	85808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_006824	CCCT	2	8	87859	87866	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_006824	CATC	2	8	88180	88187	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_006824	GCAG	2	8	88506	88513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_006824	ACGA	2	8	92195	92202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_006824	ACGA	2	8	92696	92703	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_006824	CCAG	2	8	93622	93629	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006824	ACGG	2	8	95013	95020	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_006824	CCCA	2	8	95100	95107	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_006824	GCCC	2	8	101355	101362	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_006824	GCCC	2	8	101425	101432	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_006824	ACGC	2	8	109414	109421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_006824	CCGT	2	8	114268	114275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_006824	CTGG	2	8	115659	115666	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_006824	TCGC	2	8	116592	116599	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_006824	CCGA	2	8	116772	116779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_006824	CAAG	2	8	124829	124836	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_006824	CTTG	2	8	127375	127382	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_006824	AGGT	2	8	134210	134217	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006824	CCCT	2	8	138052	138059	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_006824	TGGT	2	8	138197	138204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006824	TCCC	2	8	138457	138464	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_006824	AGCC	2	8	140409	140416	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_006824	TCCC	2	8	140437	140444	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_006824	CTTT	2	8	142860	142867	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_006824	TCGG	2	8	143005	143012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_006824	TCGG	2	8	143119	143126	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_006824	CTTC	2	8	143246	143253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006824	AGAC	2	8	147287	147294	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_006824	TCCT	2	8	149376	149383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_006824	GGCG	2	8	150831	150838	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_006824	TGCG	2	8	151581	151588	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_006824	CCAC	2	8	151633	151640	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_006824	AGCC	2	8	153747	153754	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_006824	CGCC	2	8	154120	154127	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_006824	GGCG	2	8	154828	154835	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_006824	CCCT	2	8	158359	158366	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_006824	CCCG	2	8	158750	158757	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_006824	ACCC	2	8	158842	158849	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_006824	CCAG	2	8	164782	164789	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006824	CGAA	2	8	164797	164804	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_006824	GGCG	2	8	165968	165975	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_006824	CGGG	2	8	170310	170317	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_006824	GGGC	2	8	170381	170388	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_006824	GTAT	2	8	170942	170949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006824	CCAC	2	8	172218	172225	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_006824	GCCC	2	8	173005	173012	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_006824	CCGC	2	8	174698	174705	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_006824	GCTC	2	8	181114	181121	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_006824	AGGA	2	8	181270	181277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006824	TCGT	2	8	182140	182147	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_006824	AATT	2	8	185057	185064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006824	AGGT	2	8	185570	185577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006824	CACG	2	8	185612	185619	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_006824	GCCG	2	8	187115	187122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_006824	CTGG	2	8	187209	187216	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_006824	GCCG	2	8	195144	195151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_006824	GAGT	2	8	195199	195206	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006824	GCAA	2	8	196074	196081	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_006824	CGGA	2	8	196175	196182	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_006824	CGCT	2	8	196195	196202	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_006824	CGGC	2	8	197139	197146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_006824	AGCC	2	8	197843	197850	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_006824	AGGG	2	8	200507	200514	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006824	TCGG	2	8	203067	203074	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_006824	GCCG	2	8	204195	204202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_006824	TATG	2	8	204313	204320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006824	AACA	2	8	204358	204365	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_006824	TCTT	2	8	204510	204517	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_006824	GTTA	2	8	205721	205728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006824	ATGG	2	8	208905	208912	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006824	CCCG	2	8	211551	211558	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_006824	TCAA	2	8	213965	213972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_006824	CCGG	2	8	214984	214991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.