MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Azoarcus sp. EbN1 plasmid 2

Total Repeats: 3605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006824	TCA	2	6	218137	218142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616612
3502	NC_006824	GTG	2	6	218193	218198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616612
3503	NC_006824	AAG	2	6	218217	218222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58616612
3504	NC_006824	CGG	2	6	218249	218254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616612
3505	NC_006824	GCG	2	6	218262	218267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616612
3506	NC_006824	CCG	2	6	218458	218463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58616612
3507	NC_006824	TAC	2	6	218499	218504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616612
3508	NC_006824	CAT	2	6	218549	218554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616612
3509	NC_006824	CGG	2	6	218564	218569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616612
3510	NC_006824	CAA	2	6	218702	218707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616612
3511	NC_006824	AAG	2	6	218733	218738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58616612
3512	NC_006824	CTG	2	6	218790	218795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616612
3513	NC_006824	CCT	2	6	218809	218814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58616612
3514	NC_006824	TGG	2	6	218872	218877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616612
3515	NC_006824	CCA	2	6	218914	218919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58616612
3516	NC_006824	CTT	2	6	219008	219013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616612
3517	NC_006824	ACA	2	6	219031	219036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616612
3518	NC_006824	AAC	2	6	219042	219047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616612
3519	NC_006824	CGC	2	6	219056	219061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58616612
3520	NC_006824	TTC	2	6	219072	219077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616612
3521	NC_006824	CAA	2	6	219083	219088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616612
3522	NC_006824	ACA	2	6	219100	219105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616612
3523	NC_006824	GGC	2	6	219137	219142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616612
3524	NC_006824	CAA	2	6	219146	219151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616612
3525	NC_006824	CGA	2	6	219277	219282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58616613
3526	NC_006824	GTC	2	6	219283	219288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616613
3527	NC_006824	CTG	2	6	219424	219429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616613
3528	NC_006824	AAG	2	6	219466	219471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58616613
3529	NC_006824	AAG	2	6	219529	219534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58616613
3530	NC_006824	CGC	2	6	219585	219590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58616613
3531	NC_006824	CGG	2	6	219675	219680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616613
3532	NC_006824	ACA	2	6	219689	219694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616613
3533	NC_006824	GCG	2	6	219860	219865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616613
3534	NC_006824	GAG	2	6	219889	219894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58616613
3535	NC_006824	CAA	2	6	219897	219902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616613
3536	NC_006824	GGC	2	6	219982	219987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616613
3537	NC_006824	CTT	2	6	219993	219998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616613
3538	NC_006824	ACG	2	6	220001	220006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58616613
3539	NC_006824	AAG	2	6	220115	220120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58616613
3540	NC_006824	GAG	2	6	220129	220134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58616613
3541	NC_006824	CGC	2	6	220220	220225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58616613
3542	NC_006824	CGG	2	6	220277	220282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616613
3543	NC_006824	GAT	2	6	220326	220331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616613
3544	NC_006824	ACC	2	6	220334	220339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58616613
3545	NC_006824	TAC	3	9	220378	220386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616613
3546	NC_006824	GCG	2	6	220394	220399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616613
3547	NC_006824	AAT	2	6	220508	220513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616613
3548	NC_006824	GAG	2	6	220515	220520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_006824	GTG	2	6	220632	220637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616614
3550	NC_006824	TCG	2	6	220681	220686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616614
3551	NC_006824	TGG	2	6	220710	220715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616614
3552	NC_006824	GCT	2	6	220769	220774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616614
3553	NC_006824	TGG	2	6	220792	220797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616614
3554	NC_006824	CGC	2	6	220816	220821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58616614
3555	NC_006824	CGC	2	6	220850	220855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58616614
3556	NC_006824	ACA	2	6	220897	220902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616614
3557	NC_006824	TCT	2	6	220987	220992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616614
3558	NC_006824	GCC	2	6	221015	221020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_006824	GAG	2	6	221051	221056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_006824	GAA	2	6	221224	221229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58616615
3561	NC_006824	AAG	2	6	221253	221258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58616615
3562	NC_006824	GCC	2	6	221327	221332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58616615
3563	NC_006824	GCG	2	6	221444	221449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616615
3564	NC_006824	TTC	2	6	221483	221488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616615
3565	NC_006824	CGA	2	6	221542	221547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58616615
3566	NC_006824	CCA	2	6	221551	221556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58616615
3567	NC_006824	CAA	2	6	221608	221613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616615
3568	NC_006824	CGA	2	6	221704	221709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58616615
3569	NC_006824	CTG	2	6	221780	221785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616615
3570	NC_006824	TCT	2	6	221799	221804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616615
3571	NC_006824	CGC	2	6	221838	221843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58616615
3572	NC_006824	TGG	2	6	221856	221861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616615
3573	NC_006824	CGG	2	6	221862	221867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616615
3574	NC_006824	AAT	2	6	221920	221925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616616
3575	NC_006824	GTC	3	9	221942	221950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616616
3576	NC_006824	GGC	2	6	222034	222039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616616
3577	NC_006824	AGG	2	6	222066	222071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58616616
3578	NC_006824	CGT	2	6	222079	222084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616616
3579	NC_006824	CGC	2	6	222136	222141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58616616
3580	NC_006824	GTG	2	6	222215	222220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616616
3581	NC_006824	CGG	2	6	222222	222227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616616
3582	NC_006824	CTG	2	6	222239	222244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616616
3583	NC_006824	CGG	3	9	222265	222273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616616
3584	NC_006824	CTG	2	6	222302	222307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616616
3585	NC_006824	GTC	2	6	222347	222352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616616
3586	NC_006824	GGC	2	6	222484	222489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616616
3587	NC_006824	CGC	2	6	222499	222504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58616616
3588	NC_006824	TCC	2	6	222542	222547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58616616
3589	NC_006824	CGA	2	6	222574	222579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58616616
3590	NC_006824	CGG	2	6	222600	222605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616616
3591	NC_006824	AGG	2	6	222639	222644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58616616
3592	NC_006824	CGG	2	6	222657	222662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616616
3593	NC_006824	ACG	2	6	222681	222686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58616616
3594	NC_006824	CGC	3	9	222721	222729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58616616
3595	NC_006824	CAG	2	6	222821	222826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58616616
3596	NC_006824	ATC	3	9	222998	223006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616616
3597	NC_006824	CGG	2	6	223069	223074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58616616
3598	NC_006824	CTT	2	6	223236	223241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_006824	GCC	2	6	223293	223298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_006824	GGC	2	6	223302	223307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_006824	GCG	2	6	223326	223331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_006824	CTA	2	6	223379	223384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_006824	GCT	2	6	223505	223510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_006824	GCA	2	6	223561	223566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_006824	GGC	2	6	223595	223600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.