MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Azoarcus sp. EbN1 plasmid 1

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006823	GGCGG	2	10	3164	3173	0 %	0 %	80 %	20 %	58616154
2	NC_006823	TGCCG	2	10	3919	3928	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_006823	GGTCG	2	10	4610	4619	0 %	20 %	60 %	20 %	58616156
4	NC_006823	CCTCG	2	10	5559	5568	0 %	20 %	20 %	60 %	58616157
5	NC_006823	CGAGC	2	10	5885	5894	20 %	0 %	40 %	40 %	58616157
6	NC_006823	AAGCG	2	10	6123	6132	40 %	0 %	40 %	20 %	58616157
7	NC_006823	TGCCC	2	10	7021	7030	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_006823	GCGTT	2	10	7354	7363	0 %	40 %	40 %	20 %	58616158
9	NC_006823	ACACA	2	10	9779	9788	60 %	0 %	0 %	40 %	58616161
10	NC_006823	TGAAA	2	10	10075	10084	60 %	20 %	20 %	0 %	58616162
11	NC_006823	TTGCG	2	10	12318	12327	0 %	40 %	40 %	20 %	58616164
12	NC_006823	GCGTG	2	10	13921	13930	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_006823	TCCCC	2	10	15690	15699	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
14	NC_006823	CCGCA	2	10	18510	18519	20 %	0 %	20 %	60 %	58616174
15	NC_006823	CCGCC	2	10	18581	18590	0 %	0 %	20 %	80 %	58616174
16	NC_006823	GTTCG	2	10	19571	19580	0 %	40 %	40 %	20 %	58616175
17	NC_006823	CCTCC	2	10	20052	20061	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
18	NC_006823	CCCAC	2	10	22954	22963	20 %	0 %	0 %	80 %	58616180
19	NC_006823	CCCTG	2	10	27332	27341	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_006823	GAACA	2	10	31377	31386	60 %	0 %	20 %	20 %	58616190
21	NC_006823	CCCGC	2	10	32730	32739	0 %	0 %	20 %	80 %	58616191
22	NC_006823	TGCTT	2	10	33213	33222	0 %	60 %	20 %	20 %	58616191
23	NC_006823	GAGCA	2	10	36465	36474	40 %	0 %	40 %	20 %	58616196
24	NC_006823	GCTTG	2	10	37571	37580	0 %	40 %	40 %	20 %	58616197
25	NC_006823	GCCTG	2	10	37995	38004	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_006823	CACAT	2	10	38045	38054	40 %	20 %	0 %	40 %	58616198
27	NC_006823	TCCCA	2	10	38985	38994	20 %	20 %	0 %	60 %	58616198
28	NC_006823	GACAG	2	10	40586	40595	40 %	0 %	40 %	20 %	58616200
29	NC_006823	TCGAT	2	10	41866	41875	20 %	40 %	20 %	20 %	58616202
30	NC_006823	CTCCG	2	10	42801	42810	0 %	20 %	20 %	60 %	58616203
31	NC_006823	TCCCC	2	10	43577	43586	0 %	20 %	0 %	80 %	58616204
32	NC_006823	ATCAG	2	10	43603	43612	40 %	20 %	20 %	20 %	58616204
33	NC_006823	TGCGC	2	10	43818	43827	0 %	20 %	40 %	40 %	58616204
34	NC_006823	CTGAC	2	10	47513	47522	20 %	20 %	20 %	40 %	58616210
35	NC_006823	CCTGC	2	10	47943	47952	0 %	20 %	20 %	60 %	58616210
36	NC_006823	CAAGC	2	10	48086	48095	40 %	0 %	20 %	40 %	58616210
37	NC_006823	TTCCA	2	10	51258	51267	20 %	40 %	0 %	40 %	58616212
38	NC_006823	CTGCA	2	10	58400	58409	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_006823	AGCGA	2	10	59108	59117	40 %	0 %	40 %	20 %	58616225
40	NC_006823	AAGAG	2	10	59130	59139	60 %	0 %	40 %	0 %	58616225
41	NC_006823	GGCTG	2	10	60002	60011	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_006823	ACCAG	2	10	61292	61301	40 %	0 %	20 %	40 %	58616227
43	NC_006823	CCATC	2	10	61309	61318	20 %	20 %	0 %	60 %	58616227
44	NC_006823	ATTCA	2	10	64705	64714	40 %	40 %	0 %	20 %	58616232
45	NC_006823	AATCC	2	10	67286	67295	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_006823	CTGCC	2	10	67778	67787	0 %	20 %	20 %	60 %	58616236
47	NC_006823	CGGGT	2	10	70599	70608	0 %	20 %	60 %	20 %	58616240
48	NC_006823	GCCTT	2	10	72005	72014	0 %	40 %	20 %	40 %	58616242
49	NC_006823	CACGG	2	10	74245	74254	20 %	0 %	40 %	40 %	58616244
50	NC_006823	CTCGA	2	10	75509	75518	20 %	20 %	20 %	40 %	58616244
51	NC_006823	TAGGG	2	10	75657	75666	20 %	20 %	60 %	0 %	58616244
52	NC_006823	TTGCC	2	10	75825	75834	0 %	40 %	20 %	40 %	58616244
53	NC_006823	CGTCT	2	10	76953	76962	0 %	40 %	20 %	40 %	58616247
54	NC_006823	AAACG	2	10	77946	77955	60 %	0 %	20 %	20 %	58616247
55	NC_006823	CGCGT	2	10	80975	80984	0 %	20 %	40 %	40 %	58616248
56	NC_006823	CTGCT	2	10	82841	82850	0 %	40 %	20 %	40 %	58616251
57	NC_006823	GATCG	2	10	85149	85158	20 %	20 %	40 %	20 %	58616253
58	NC_006823	AGTGA	2	10	87627	87636	40 %	20 %	40 %	0 %	58616257
59	NC_006823	CGAAC	2	10	89096	89105	40 %	0 %	20 %	40 %	58616258
60	NC_006823	TCAAT	2	10	90202	90211	40 %	40 %	0 %	20 %	58616261
61	NC_006823	CAAGC	2	10	91140	91149	40 %	0 %	20 %	40 %	58616262
62	NC_006823	CAAAA	2	10	93581	93590	80 %	0 %	0 %	20 %	58616265
63	NC_006823	CGAGG	2	10	94284	94293	20 %	0 %	60 %	20 %	58616266
64	NC_006823	CTGCC	2	10	95006	95015	0 %	20 %	20 %	60 %	58616267
65	NC_006823	AAGGC	2	10	97211	97220	40 %	0 %	40 %	20 %	58616268
66	NC_006823	TTGCA	2	10	99645	99654	20 %	40 %	20 %	20 %	58616271
67	NC_006823	ACCTC	2	10	101745	101754	20 %	20 %	0 %	60 %	58616273
68	NC_006823	ACGTT	2	10	102538	102547	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_006823	GCTGT	2	10	104371	104380	0 %	40 %	40 %	20 %	58616276
70	NC_006823	TGGTG	2	10	105000	105009	0 %	40 %	60 %	0 %	58616276
71	NC_006823	CGGTG	2	10	110235	110244	0 %	20 %	60 %	20 %	58616285
72	NC_006823	CGGCC	2	10	111236	111245	0 %	0 %	40 %	60 %	58616286
73	NC_006823	ACCCC	2	10	111500	111509	20 %	0 %	0 %	80 %	58616287
74	NC_006823	ACCCT	2	10	111677	111686	20 %	20 %	0 %	60 %	58616287
75	NC_006823	GCGCT	2	10	112877	112886	0 %	20 %	40 %	40 %	58616287
76	NC_006823	GGAGC	2	10	113306	113315	20 %	0 %	60 %	20 %	58616288
77	NC_006823	GCTTG	2	10	115007	115016	0 %	40 %	40 %	20 %	58616291
78	NC_006823	TTGCC	2	10	115879	115888	0 %	40 %	20 %	40 %	58616292
79	NC_006823	AGCCA	2	10	117118	117127	40 %	0 %	20 %	40 %	58616294
80	NC_006823	TGCGG	2	10	118754	118763	0 %	20 %	60 %	20 %	58616297
81	NC_006823	ATGCG	2	10	119610	119619	20 %	20 %	40 %	20 %	58616300
82	NC_006823	CTACC	2	10	122054	122063	20 %	20 %	0 %	60 %	58616307
83	NC_006823	CTGCA	2	10	124644	124653	20 %	20 %	20 %	40 %	58616315
84	NC_006823	GTTGC	2	10	126107	126116	0 %	40 %	40 %	20 %	58616317
85	NC_006823	GCTGC	2	10	126843	126852	0 %	20 %	40 %	40 %	58616318
86	NC_006823	TGTCG	2	10	127204	127213	0 %	40 %	40 %	20 %	58616319
87	NC_006823	GCCAG	2	10	127469	127478	20 %	0 %	40 %	40 %	58616319
88	NC_006823	CTCGC	2	10	130823	130832	0 %	20 %	20 %	60 %	58616324
89	NC_006823	AGCGC	2	10	130856	130865	20 %	0 %	40 %	40 %	58616324
90	NC_006823	CCTGC	2	10	132267	132276	0 %	20 %	20 %	60 %	58616327
91	NC_006823	CGACA	2	10	133508	133517	40 %	0 %	20 %	40 %	58616329
92	NC_006823	ACTTC	2	10	136424	136433	20 %	40 %	0 %	40 %	58616335
93	NC_006823	CGCGT	2	10	137902	137911	0 %	20 %	40 %	40 %	58616337
94	NC_006823	GACGG	2	10	138376	138385	20 %	0 %	60 %	20 %	58616337
95	NC_006823	CGAGG	2	10	139936	139945	20 %	0 %	60 %	20 %	58616339
96	NC_006823	CCTGC	2	10	140451	140460	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_006823	GCCTC	2	10	141541	141550	0 %	20 %	20 %	60 %	58616342
98	NC_006823	GGTTC	2	10	141920	141929	0 %	40 %	40 %	20 %	58616342
99	NC_006823	CGGTG	2	10	144625	144634	0 %	20 %	60 %	20 %	58616347
100	NC_006823	CGCTG	2	10	146662	146671	0 %	20 %	40 %	40 %	58616351
101	NC_006823	CGCGC	2	10	152877	152886	0 %	0 %	40 %	60 %	58616360
102	NC_006823	GTCGA	2	10	153261	153270	20 %	20 %	40 %	20 %	58616361
103	NC_006823	GCCCT	2	10	158369	158378	0 %	20 %	20 %	60 %	58616364
104	NC_006823	CTTTG	2	10	158395	158404	0 %	60 %	20 %	20 %	58616364
105	NC_006823	CGCTG	2	10	158451	158460	0 %	20 %	40 %	40 %	58616364
106	NC_006823	CTTGC	2	10	166043	166052	0 %	40 %	20 %	40 %	58616371
107	NC_006823	CTCTC	2	10	167125	167134	0 %	40 %	0 %	60 %	58616372
108	NC_006823	GGCGT	2	10	168442	168451	0 %	20 %	60 %	20 %	58616374
109	NC_006823	GTGAA	2	10	169047	169056	40 %	20 %	40 %	0 %	58616375
110	NC_006823	CCCCT	2	10	170497	170506	0 %	20 %	0 %	80 %	58616376
111	NC_006823	AGCAA	2	10	171129	171138	60 %	0 %	20 %	20 %	58616376
112	NC_006823	CCGGT	2	10	173760	173769	0 %	20 %	40 %	40 %	58616380
113	NC_006823	TGGGA	2	10	175637	175646	20 %	20 %	60 %	0 %	58616383
114	NC_006823	ACCGG	2	10	175862	175871	20 %	0 %	40 %	40 %	58616383
115	NC_006823	GTTCG	2	10	176636	176645	0 %	40 %	40 %	20 %	58616384
116	NC_006823	CCGCC	2	10	178282	178291	0 %	0 %	20 %	80 %	58616386
117	NC_006823	ATTGC	2	10	178826	178835	20 %	40 %	20 %	20 %	58616386
118	NC_006823	GGTTC	2	10	181589	181598	0 %	40 %	40 %	20 %	58616389
119	NC_006823	CTTCG	2	10	181685	181694	0 %	40 %	20 %	40 %	58616389
120	NC_006823	CAGCC	2	10	186667	186676	20 %	0 %	20 %	60 %	58616396
121	NC_006823	GAACT	2	10	187568	187577	40 %	20 %	20 %	20 %	58616398
122	NC_006823	GACTC	2	10	187937	187946	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_006823	CGTTC	2	10	189090	189099	0 %	40 %	20 %	40 %	58616401
124	NC_006823	ATCGA	2	10	189819	189828	40 %	20 %	20 %	20 %	58616403
125	NC_006823	CCTGC	2	10	190696	190705	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_006823	AGTCG	2	10	193812	193821	20 %	20 %	40 %	20 %	58616408
127	NC_006823	CCTGC	2	10	194747	194756	0 %	20 %	20 %	60 %	58616409
128	NC_006823	ACCAA	2	10	197972	197981	60 %	0 %	0 %	40 %	58616411
129	NC_006823	TCATC	2	10	198491	198500	20 %	40 %	0 %	40 %	58616412
130	NC_006823	CATGA	2	10	198963	198972	40 %	20 %	20 %	20 %	58616413
131	NC_006823	GCACA	2	10	200335	200344	40 %	0 %	20 %	40 %	58616415
132	NC_006823	CAGCG	2	10	200757	200766	20 %	0 %	40 %	40 %	58616416
133	NC_006823	CACGG	2	10	201405	201414	20 %	0 %	40 %	40 %	58616417
134	NC_006823	GCGGT	2	10	204177	204186	0 %	20 %	60 %	20 %	58616418
135	NC_006823	GTTCG	2	10	206242	206251	0 %	40 %	40 %	20 %	58616420

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.