MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Azoarcus sp. EbN1 plasmid 1

Total Repeats: 224

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006823	CGA	2	6	48	53	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006823	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006823	GCA	2	6	159	164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006823	GAA	2	6	2687	2692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006823	GCT	2	6	3885	3890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_006823	CCG	2	6	3960	3965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_006823	AAC	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006823	CGG	2	6	3993	3998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006823	GCG	2	6	4549	4554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_006823	GCC	2	6	4599	4604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_006823	CCT	2	6	7009	7014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_006823	TCC	2	6	7015	7020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_006823	GCC	2	6	7043	7048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_006823	AGG	2	6	7075	7080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006823	CAG	2	6	7766	7771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006823	TTG	2	6	8377	8382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006823	GAG	2	6	8409	8414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006823	GCT	2	6	8657	8662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_006823	CAG	2	6	8735	8740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006823	GCA	2	6	8783	8788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_006823	AGG	2	6	8860	8865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006823	TTG	2	6	9244	9249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006823	TGC	2	6	9255	9260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006823	TCT	2	6	10277	10282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006823	CGA	2	6	10336	10341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_006823	GCA	2	6	10654	10659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_006823	ATG	4	12	10663	10674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006823	TCA	2	6	10765	10770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_006823	GTC	2	6	10827	10832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006823	GGA	2	6	10841	10846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006823	TGA	2	6	11797	11802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006823	GAT	2	6	12443	12448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006823	CAA	2	6	12577	12582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006823	TGC	2	6	13635	13640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_006823	GCG	2	6	13740	13745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006823	TTC	2	6	13746	13751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_006823	AAG	2	6	13756	13761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006823	CGG	2	6	13843	13848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006823	GCT	2	6	13853	13858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006823	TCC	2	6	15705	15710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_006823	CCT	2	6	16514	16519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_006823	TCC	2	6	16532	16537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_006823	TCC	2	6	16608	16613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_006823	TCC	2	6	16618	16623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_006823	GCC	3	9	16656	16664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_006823	CTG	2	6	16667	16672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_006823	CCG	2	6	17328	17333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_006823	CAC	2	6	17356	17361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_006823	CAG	3	9	17397	17405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006823	ACA	3	9	17406	17414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_006823	ACT	2	6	20787	20792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_006823	AGT	2	6	20860	20865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006823	ACC	2	6	20956	20961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_006823	GCC	2	6	21011	21016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_006823	CAG	3	9	23525	23533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006823	CAA	2	6	23566	23571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_006823	CCG	2	6	25172	25177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_006823	GCA	2	6	25185	25190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006823	AGC	2	6	25256	25261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006823	GCG	2	6	25275	25280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006823	GTG	2	6	25284	25289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006823	TCC	2	6	28244	28249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_006823	AAT	2	6	28291	28296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006823	GTT	2	6	29110	29115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006823	TGC	2	6	29222	29227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_006823	AAT	2	6	29228	29233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006823	ATC	2	6	29244	29249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006823	GCC	2	6	30077	30082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_006823	GAA	2	6	31571	31576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006823	CCT	2	6	33405	33410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_006823	AGG	2	6	33428	33433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006823	GCC	2	6	33728	33733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_006823	TCA	2	6	37177	37182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006823	GAT	2	6	37221	37226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006823	CTG	2	6	37289	37294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006823	CTG	2	6	37395	37400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_006823	TGC	2	6	39730	39735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_006823	TCT	2	6	41995	42000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006823	CCA	2	6	42142	42147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_006823	CCG	2	6	42197	42202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_006823	GCC	2	6	44609	44614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_006823	CCT	2	6	45032	45037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_006823	GGC	2	6	45123	45128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006823	AAG	2	6	46173	46178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006823	TCC	2	6	54414	54419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_006823	GGA	2	6	54440	54445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006823	GAA	2	6	54462	54467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006823	TCT	2	6	55541	55546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_006823	TAG	2	6	55549	55554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006823	CGC	2	6	55984	55989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_006823	GAA	2	6	59830	59835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006823	TTC	2	6	59899	59904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_006823	GCA	2	6	59976	59981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_006823	CAA	2	6	59987	59992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006823	AGA	2	6	65326	65331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006823	CTG	2	6	65428	65433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_006823	CGG	2	6	65511	65516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_006823	CCG	2	6	65560	65565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_006823	GCC	2	6	66884	66889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_006823	GCA	2	6	66892	66897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006823	AGG	2	6	66924	66929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006823	GAA	2	6	67151	67156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006823	TCC	2	6	69983	69988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_006823	GGA	2	6	70062	70067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006823	GTA	2	6	71752	71757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006823	TTG	2	6	73867	73872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006823	TCC	2	6	76386	76391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_006823	GAG	2	6	76441	76446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006823	TGC	2	6	76457	76462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006823	ATC	2	6	76469	76474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_006823	GAG	2	6	76506	76511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006823	GCC	2	6	76774	76779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_006823	GGC	2	6	76789	76794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_006823	AGG	2	6	95152	95157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006823	CAT	2	6	95163	95168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_006823	GGC	2	6	102614	102619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_006823	AGA	2	6	102625	102630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006823	TGA	2	6	102643	102648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006823	AGC	2	6	104199	104204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_006823	GGC	2	6	105708	105713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006823	TTC	2	6	106552	106557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006823	CTT	2	6	107034	107039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_006823	CCG	2	6	108345	108350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_006823	CTT	2	6	108386	108391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_006823	GCC	2	6	108403	108408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_006823	ACC	2	6	108437	108442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_006823	CAG	2	6	108449	108454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_006823	GTC	2	6	110861	110866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_006823	AGA	2	6	110867	110872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006823	TGC	2	6	111432	111437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_006823	TCC	2	6	114706	114711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_006823	TAC	2	6	116520	116525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_006823	CGT	2	6	117010	117015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_006823	GAG	2	6	117027	117032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006823	ACC	2	6	117696	117701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_006823	GGA	2	6	118436	118441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006823	GTC	2	6	118545	118550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_006823	GGT	2	6	118638	118643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006823	CAA	2	6	118676	118681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_006823	GCC	2	6	122629	122634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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142	NC_006823	TGG	2	6	124067	124072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006823	TGT	2	6	124159	124164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006823	GTC	2	6	124169	124174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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154	NC_006823	TCC	2	6	127665	127670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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163	NC_006823	CCG	2	6	140543	140548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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169	NC_006823	ACC	2	6	142534	142539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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171	NC_006823	GTC	2	6	145251	145256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_006823	AGA	2	6	145257	145262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_006823	GTC	2	6	145322	145327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_006823	CCG	2	6	146766	146771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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181	NC_006823	CCG	2	6	148199	148204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_006823	GCG	2	6	149756	149761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.