MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006814	AGGA	2	8	10224	10231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006814	AAAT	2	8	15330	15337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006814	AAGA	2	8	17408	17415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006814	TTAG	2	8	17724	17731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006814	GATT	2	8	19564	19571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006814	TGAG	2	8	20475	20482	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006814	TAAT	2	8	20850	20857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006814	TGTA	2	8	20953	20960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006814	AAAT	2	8	22378	22385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006814	AAAT	2	8	27336	27343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006814	GTTT	2	8	30266	30273	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006814	TATG	2	8	37919	37926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006814	ACCA	2	8	39856	39863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_006814	AATT	2	8	41528	41535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006814	GATT	2	8	45036	45043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006814	TTCA	2	8	45075	45082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_006814	TCAA	2	8	45125	45132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006814	TAAT	2	8	45161	45168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006814	GAAA	2	8	47933	47940	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006814	TTTG	2	8	47947	47954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006814	AGCA	2	8	49908	49915	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_006814	TAAA	2	8	51251	51258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006814	TAAT	2	8	51661	51668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006814	CGTT	2	8	54029	54036	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_006814	ACGA	2	8	58742	58749	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_006814	AGAA	2	8	58759	58766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006814	CGAA	2	8	58850	58857	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_006814	GAAA	2	8	58979	58986	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006814	GCAA	2	8	59192	59199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_006814	CGAG	2	8	59316	59323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_006814	GTGA	2	8	59679	59686	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006814	AGCG	2	8	59849	59856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_006814	ATAG	2	8	61179	61186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006814	TCAA	2	8	61187	61194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_006814	AGAA	2	8	61238	61245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006814	GCGA	2	8	61267	61274	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_006814	TAGT	2	8	61489	61496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006814	TAGG	2	8	63148	63155	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006814	AAGG	2	8	63160	63167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006814	CTGC	2	8	64085	64092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_006814	ATTA	2	8	64740	64747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006814	TTAA	2	8	65044	65051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006814	CTTT	2	8	65108	65115	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_006814	ATTA	2	8	71105	71112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006814	CTTT	2	8	72029	72036	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_006814	AGCC	2	8	72174	72181	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_006814	AGTA	2	8	74069	74076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006814	ATTT	2	8	74273	74280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006814	AAGG	2	8	79296	79303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006814	AATC	2	8	79785	79792	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_006814	CTTT	2	8	80663	80670	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_006814	AATA	2	8	80690	80697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006814	AATA	2	8	87217	87224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006814	AATT	2	8	88671	88678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006814	AGAA	2	8	88719	88726	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006814	TTTA	2	8	89118	89125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006814	AAAT	2	8	90941	90948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006814	TTAT	2	8	104838	104845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006814	AATT	2	8	106447	106454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006814	TAAA	2	8	109946	109953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006814	AAAC	2	8	109968	109975	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_006814	AATC	2	8	112584	112591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_006814	GAAA	2	8	113446	113453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006814	TAAT	2	8	116396	116403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006814	AATA	2	8	116407	116414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006814	TTTA	2	8	124146	124153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006814	TGAT	2	8	125304	125311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006814	ATAG	2	8	125330	125337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006814	TAAT	2	8	126963	126970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006814	TAAT	2	8	130534	130541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006814	GTAT	2	8	140323	140330	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006814	GTTT	2	8	143267	143274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006814	AATA	2	8	146657	146664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006814	AAAT	2	8	147331	147338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006814	TAAA	2	8	149354	149361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006814	TTTC	2	8	152740	152747	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_006814	AAAT	2	8	163175	163182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006814	GCAA	2	8	163270	163277	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_006814	TATT	2	8	163435	163442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006814	TTAC	2	8	163520	163527	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_006814	TTTA	2	8	164094	164101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006814	AAAT	2	8	164103	164110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006814	CTAA	2	8	164771	164778	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_006814	GTAA	2	8	165089	165096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006814	TGGG	2	8	171148	171155	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006814	TGAA	2	8	173763	173770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006814	GTTT	2	8	177549	177556	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006814	TAAA	2	8	179348	179355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006814	TTTG	2	8	185515	185522	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006814	GTGG	2	8	187140	187147	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006814	AATG	2	8	188970	188977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006814	AGCA	2	8	202217	202224	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_006814	AATA	2	8	204268	204275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006814	TAGC	2	8	206582	206589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_006814	ATTA	2	8	214053	214060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006814	TTAT	2	8	214961	214968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006814	CTAT	2	8	216455	216462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_006814	TAAA	2	8	216485	216492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006814	TATT	2	8	217686	217693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006814	TAAA	2	8	217730	217737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006814	AGGT	2	8	217751	217758	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006814	TAGT	2	8	220540	220547	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006814	TAAA	2	8	221695	221702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006814	TATT	2	8	232540	232547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006814	ATTG	2	8	239603	239610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006814	TTTG	2	8	239671	239678	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006814	ATTG	2	8	239755	239762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006814	TAAT	2	8	241391	241398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006814	CAAA	2	8	241612	241619	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_006814	ATAA	2	8	241736	241743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006814	AATT	2	8	241794	241801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006814	TATG	2	8	244157	244164	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006814	TTTA	2	8	244388	244395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006814	AAAT	2	8	247481	247488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006814	TTAT	2	8	249916	249923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006814	TACA	2	8	251699	251706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_006814	GAAA	2	8	256364	256371	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006814	ATTA	2	8	261677	261684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006814	CTGT	2	8	275745	275752	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_006814	TATT	2	8	275763	275770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006814	TTAC	2	8	276308	276315	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_006814	CGAG	2	8	290585	290592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_006814	TTAA	2	8	293396	293403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006814	AGGA	2	8	293689	293696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006814	CTTT	2	8	313265	313272	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_006814	TAAT	2	8	313278	313285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006814	TATC	2	8	313339	313346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_006814	TAAA	2	8	313372	313379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006814	AGAA	2	8	317597	317604	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006814	TGTA	2	8	317640	317647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006814	TCTT	2	8	317733	317740	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_006814	TAAG	2	8	317812	317819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006814	AATT	2	8	317904	317911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006814	TAGA	2	8	318058	318065	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006814	CTTT	2	8	319046	319053	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_006814	TAAT	2	8	319778	319785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006814	ATTA	2	8	322296	322303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006814	TTAG	2	8	322460	322467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006814	ATTA	2	8	322567	322574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006814	TAAT	2	8	325969	325976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006814	TTTC	2	8	329616	329623	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_006814	TAAA	2	8	333354	333361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006814	GTTT	2	8	338360	338367	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006814	AAAG	2	8	338405	338412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006814	TAAT	2	8	348895	348902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006814	GGCT	2	8	354624	354631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_006814	AAAG	2	8	354717	354724	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006814	GTAA	2	8	362892	362899	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006814	TTAT	2	8	369789	369796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006814	ATAA	3	12	369833	369844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_006814	AACA	2	8	393252	393259	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_006814	ATTT	2	8	393321	393328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_006814	TTAG	2	8	393338	393345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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