MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 4907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006814	TCTT	2	8	207	214	0 %	75 %	0 %	25 %	58336355
2	NC_006814	AAAT	2	8	429	436	75 %	25 %	0 %	0 %	58336355
3	NC_006814	TATT	2	8	494	501	25 %	75 %	0 %	0 %	58336355
4	NC_006814	TCAA	2	8	628	635	50 %	25 %	0 %	25 %	58336355
5	NC_006814	ATGC	2	8	1306	1313	25 %	25 %	25 %	25 %	58336355
6	NC_006814	AAGA	2	8	2656	2663	75 %	0 %	25 %	0 %	58336356
7	NC_006814	AATT	2	8	2678	2685	50 %	50 %	0 %	0 %	58336356
8	NC_006814	ATTT	2	8	3281	3288	25 %	75 %	0 %	0 %	58336358
9	NC_006814	TTAA	2	8	3521	3528	50 %	50 %	0 %	0 %	58336358
10	NC_006814	AAAT	2	8	3576	3583	75 %	25 %	0 %	0 %	58336358
11	NC_006814	TTCT	2	8	3693	3700	0 %	75 %	0 %	25 %	58336358
12	NC_006814	TGAT	2	8	5901	5908	25 %	50 %	25 %	0 %	58336359
13	NC_006814	TTCT	2	8	6323	6330	0 %	75 %	0 %	25 %	58336360
14	NC_006814	CCAC	2	8	6497	6504	25 %	0 %	0 %	75 %	58336360
15	NC_006814	ATTT	2	8	6519	6526	25 %	75 %	0 %	0 %	58336360
16	NC_006814	TTGA	2	8	7761	7768	25 %	50 %	25 %	0 %	58336360
17	NC_006814	CTTT	2	8	10321	10328	0 %	75 %	0 %	25 %	58336364
18	NC_006814	AACT	2	8	10446	10453	50 %	25 %	0 %	25 %	58336364
19	NC_006814	ATTT	2	8	10741	10748	25 %	75 %	0 %	0 %	58336364
20	NC_006814	ACTT	2	8	11058	11065	25 %	50 %	0 %	25 %	58336364
21	NC_006814	TGAT	2	8	11603	11610	25 %	50 %	25 %	0 %	58336364
22	NC_006814	CTTA	2	8	11650	11657	25 %	50 %	0 %	25 %	58336364
23	NC_006814	AATT	2	8	12125	12132	50 %	50 %	0 %	0 %	58336364
24	NC_006814	GGGC	2	8	12150	12157	0 %	0 %	75 %	25 %	58336364
25	NC_006814	GTTT	2	8	12539	12546	0 %	75 %	25 %	0 %	58336365
26	NC_006814	CAAG	2	8	12557	12564	50 %	0 %	25 %	25 %	58336365
27	NC_006814	TGAT	2	8	12746	12753	25 %	50 %	25 %	0 %	58336366
28	NC_006814	ATGA	2	8	13136	13143	50 %	25 %	25 %	0 %	58336366
29	NC_006814	TAAC	2	8	13155	13162	50 %	25 %	0 %	25 %	58336366
30	NC_006814	TACC	2	8	13305	13312	25 %	25 %	0 %	50 %	58336366
31	NC_006814	AATT	2	8	13359	13366	50 %	50 %	0 %	0 %	58336366
32	NC_006814	GATT	2	8	13515	13522	25 %	50 %	25 %	0 %	58336366
33	NC_006814	CAAA	2	8	14530	14537	75 %	0 %	0 %	25 %	58336367
34	NC_006814	CATG	2	8	15864	15871	25 %	25 %	25 %	25 %	58336368
35	NC_006814	GATG	2	8	15894	15901	25 %	25 %	50 %	0 %	58336368
36	NC_006814	AAAG	2	8	16045	16052	75 %	0 %	25 %	0 %	58336368
37	NC_006814	ACAA	2	8	16053	16060	75 %	0 %	0 %	25 %	58336368
38	NC_006814	GTAA	2	8	16359	16366	50 %	25 %	25 %	0 %	58336368
39	NC_006814	AATT	2	8	17279	17286	50 %	50 %	0 %	0 %	58336369
40	NC_006814	AAAT	2	8	17679	17686	75 %	25 %	0 %	0 %	58336370
41	NC_006814	TATT	2	8	18058	18065	25 %	75 %	0 %	0 %	58336372
42	NC_006814	GAAG	2	8	19111	19118	50 %	0 %	50 %	0 %	58336372
43	NC_006814	GATA	2	8	19181	19188	50 %	25 %	25 %	0 %	58336372
44	NC_006814	TAGT	2	8	20008	20015	25 %	50 %	25 %	0 %	58336373
45	NC_006814	TAAT	2	8	20455	20462	50 %	50 %	0 %	0 %	58336373
46	NC_006814	ATTG	2	8	20652	20659	25 %	50 %	25 %	0 %	58336374
47	NC_006814	TAAA	2	8	21426	21433	75 %	25 %	0 %	0 %	58336375
48	NC_006814	ATTG	2	8	21468	21475	25 %	50 %	25 %	0 %	58336375
49	NC_006814	TTAT	2	8	22165	22172	25 %	75 %	0 %	0 %	58336375
50	NC_006814	CTTT	2	8	22835	22842	0 %	75 %	0 %	25 %	58336377
51	NC_006814	TATC	2	8	23107	23114	25 %	50 %	0 %	25 %	58336377
52	NC_006814	TTAC	2	8	23187	23194	25 %	50 %	0 %	25 %	58336377
53	NC_006814	TTTA	2	8	23200	23207	25 %	75 %	0 %	0 %	58336377
54	NC_006814	TTAA	2	8	23999	24006	50 %	50 %	0 %	0 %	58336378
55	NC_006814	AAAC	2	8	24226	24233	75 %	0 %	0 %	25 %	58336378
56	NC_006814	TAAT	2	8	25250	25257	50 %	50 %	0 %	0 %	58336379
57	NC_006814	TTAC	2	8	25291	25298	25 %	50 %	0 %	25 %	58336379
58	NC_006814	TTGA	2	8	25796	25803	25 %	50 %	25 %	0 %	58336380
59	NC_006814	GTTA	2	8	25969	25976	25 %	50 %	25 %	0 %	58336381
60	NC_006814	AGAC	2	8	26725	26732	50 %	0 %	25 %	25 %	58336381
61	NC_006814	TTAA	2	8	26786	26793	50 %	50 %	0 %	0 %	58336381
62	NC_006814	TTTA	2	8	27012	27019	25 %	75 %	0 %	0 %	58336381
63	NC_006814	TTTC	2	8	27095	27102	0 %	75 %	0 %	25 %	58336381
64	NC_006814	GTTA	2	8	27159	27166	25 %	50 %	25 %	0 %	58336381
65	NC_006814	TTAA	2	8	27832	27839	50 %	50 %	0 %	0 %	58336383
66	NC_006814	GTCG	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	58336385
67	NC_006814	TACT	2	8	31174	31181	25 %	50 %	0 %	25 %	58336386
68	NC_006814	TGAT	2	8	32022	32029	25 %	50 %	25 %	0 %	58336387
69	NC_006814	GGTA	2	8	32641	32648	25 %	25 %	50 %	0 %	58336387
70	NC_006814	AGTT	2	8	32686	32693	25 %	50 %	25 %	0 %	58336387
71	NC_006814	ATTA	2	8	32863	32870	50 %	50 %	0 %	0 %	58336387
72	NC_006814	TGGC	2	8	33373	33380	0 %	25 %	50 %	25 %	58336388
73	NC_006814	ATTT	2	8	33712	33719	25 %	75 %	0 %	0 %	58336388
74	NC_006814	CAAA	2	8	34095	34102	75 %	0 %	0 %	25 %	58336388
75	NC_006814	AAAG	2	8	34948	34955	75 %	0 %	25 %	0 %	58336390
76	NC_006814	TAAA	2	8	35017	35024	75 %	25 %	0 %	0 %	58336390
77	NC_006814	TCTT	2	8	35759	35766	0 %	75 %	0 %	25 %	58336392
78	NC_006814	CAAA	2	8	36595	36602	75 %	0 %	0 %	25 %	58336392
79	NC_006814	TTGA	2	8	37275	37282	25 %	50 %	25 %	0 %	58336392
80	NC_006814	AATC	2	8	37324	37331	50 %	25 %	0 %	25 %	58336392
81	NC_006814	TTGT	2	8	38198	38205	0 %	75 %	25 %	0 %	58336393
82	NC_006814	GCGA	2	8	38213	38220	25 %	0 %	50 %	25 %	58336393
83	NC_006814	ATTT	2	8	39430	39437	25 %	75 %	0 %	0 %	58336394
84	NC_006814	TTAA	2	8	39533	39540	50 %	50 %	0 %	0 %	58336394
85	NC_006814	GTAG	2	8	40493	40500	25 %	25 %	50 %	0 %	58336395
86	NC_006814	AAAG	2	8	40918	40925	75 %	0 %	25 %	0 %	58336395
87	NC_006814	TTTC	2	8	40974	40981	0 %	75 %	0 %	25 %	58336395
88	NC_006814	CAAT	2	8	41099	41106	50 %	25 %	0 %	25 %	58336395
89	NC_006814	TTCA	2	8	41220	41227	25 %	50 %	0 %	25 %	58336395
90	NC_006814	GTTT	2	8	41346	41353	0 %	75 %	25 %	0 %	58336395
91	NC_006814	ATTT	2	8	41972	41979	25 %	75 %	0 %	0 %	58336396
92	NC_006814	AGAT	2	8	42505	42512	50 %	25 %	25 %	0 %	58336397
93	NC_006814	GATA	2	8	43115	43122	50 %	25 %	25 %	0 %	58336398
94	NC_006814	GAGC	2	8	43345	43352	25 %	0 %	50 %	25 %	58336398
95	NC_006814	CTTT	2	8	43870	43877	0 %	75 %	0 %	25 %	58336399
96	NC_006814	TACA	2	8	44177	44184	50 %	25 %	0 %	25 %	58336399
97	NC_006814	GGAC	2	8	44253	44260	25 %	0 %	50 %	25 %	58336399
98	NC_006814	TTGT	2	8	44368	44375	0 %	75 %	25 %	0 %	58336399
99	NC_006814	ACCG	2	8	44393	44400	25 %	0 %	25 %	50 %	58336399
100	NC_006814	TGTC	2	8	44403	44410	0 %	50 %	25 %	25 %	58336399
101	NC_006814	TACC	2	8	44737	44744	25 %	25 %	0 %	50 %	58336399
102	NC_006814	TTTA	2	8	44771	44778	25 %	75 %	0 %	0 %	58336399
103	NC_006814	GATG	2	8	45460	45467	25 %	25 %	50 %	0 %	58336400
104	NC_006814	TATT	2	8	46343	46350	25 %	75 %	0 %	0 %	58336401
105	NC_006814	CATG	2	8	46966	46973	25 %	25 %	25 %	25 %	58336401
106	NC_006814	AAAT	2	8	47490	47497	75 %	25 %	0 %	0 %	58336401
107	NC_006814	ATGA	2	8	47563	47570	50 %	25 %	25 %	0 %	58336401
108	NC_006814	ATGG	2	8	48052	48059	25 %	25 %	50 %	0 %	58336402
109	NC_006814	ACAA	2	8	48127	48134	75 %	0 %	0 %	25 %	58336402
110	NC_006814	AATT	2	8	48164	48171	50 %	50 %	0 %	0 %	58336402
111	NC_006814	TATT	2	8	48866	48873	25 %	75 %	0 %	0 %	58336403
112	NC_006814	GTTG	2	8	48932	48939	0 %	50 %	50 %	0 %	58336403
113	NC_006814	TAAT	2	8	48990	48997	50 %	50 %	0 %	0 %	58336403
114	NC_006814	GAAC	2	8	49023	49030	50 %	0 %	25 %	25 %	58336403
115	NC_006814	AAAT	2	8	49371	49378	75 %	25 %	0 %	0 %	58336404
116	NC_006814	GATT	2	8	50427	50434	25 %	50 %	25 %	0 %	58336405
117	NC_006814	GCTT	2	8	50494	50501	0 %	50 %	25 %	25 %	58336405
118	NC_006814	CTTC	2	8	51026	51033	0 %	50 %	0 %	50 %	58336405
119	NC_006814	GATT	2	8	52217	52224	25 %	50 %	25 %	0 %	58336406
120	NC_006814	TGGA	2	8	52400	52407	25 %	25 %	50 %	0 %	58336406
121	NC_006814	TGAT	2	8	52465	52472	25 %	50 %	25 %	0 %	58336406
122	NC_006814	TGGA	2	8	52864	52871	25 %	25 %	50 %	0 %	58336407
123	NC_006814	AATT	2	8	53167	53174	50 %	50 %	0 %	0 %	58336407
124	NC_006814	TGCT	2	8	53313	53320	0 %	50 %	25 %	25 %	58336407
125	NC_006814	TTAC	2	8	53432	53439	25 %	50 %	0 %	25 %	58336407
126	NC_006814	GTAT	2	8	53805	53812	25 %	50 %	25 %	0 %	58336407
127	NC_006814	TTTG	2	8	54445	54452	0 %	75 %	25 %	0 %	58336408
128	NC_006814	GTAA	2	8	54665	54672	50 %	25 %	25 %	0 %	58336408
129	NC_006814	ATTT	2	8	54978	54985	25 %	75 %	0 %	0 %	58336408
130	NC_006814	TATT	2	8	55638	55645	25 %	75 %	0 %	0 %	58336408
131	NC_006814	ATTT	2	8	56337	56344	25 %	75 %	0 %	0 %	58336408
132	NC_006814	GCAA	2	8	57496	57503	50 %	0 %	25 %	25 %	58336409
133	NC_006814	TCAT	2	8	57757	57764	25 %	50 %	0 %	25 %	58336409
134	NC_006814	GCGG	2	8	67042	67049	0 %	0 %	75 %	25 %	58336413
135	NC_006814	CATT	2	8	69604	69611	25 %	50 %	0 %	25 %	58336417
136	NC_006814	AATA	2	8	69827	69834	75 %	25 %	0 %	0 %	58336417
137	NC_006814	TCTT	2	8	69969	69976	0 %	75 %	0 %	25 %	58336417
138	NC_006814	CCAT	2	8	70210	70217	25 %	25 %	0 %	50 %	58336418
139	NC_006814	TAAA	2	8	70754	70761	75 %	25 %	0 %	0 %	58336418
140	NC_006814	GTAA	2	8	70837	70844	50 %	25 %	25 %	0 %	58336418
141	NC_006814	ATTA	2	8	71006	71013	50 %	50 %	0 %	0 %	58336418
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