MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Gluconobacter oxydans 621H plasmid pGOX1

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006672	CCCTG	2	10	4079	4088	0 %	20 %	20 %	60 %	58038259
2	NC_006672	GGGGC	2	10	4914	4923	0 %	0 %	80 %	20 %	58038261
3	NC_006672	GGTCC	2	10	5452	5461	0 %	20 %	40 %	40 %	58038262
4	NC_006672	CAGGA	2	10	7537	7546	40 %	0 %	40 %	20 %	58038264
5	NC_006672	AGCAA	2	10	8128	8137	60 %	0 %	20 %	20 %	58038264
6	NC_006672	TCGAT	2	10	9315	9324	20 %	40 %	20 %	20 %	58038265
7	NC_006672	GGCGT	2	10	11722	11731	0 %	20 %	60 %	20 %	58038267
8	NC_006672	GACGC	2	10	13965	13974	20 %	0 %	40 %	40 %	58038270
9	NC_006672	GGCAG	2	10	15917	15926	20 %	0 %	60 %	20 %	58038271
10	NC_006672	GCCGT	2	10	16081	16090	0 %	20 %	40 %	40 %	58038271
11	NC_006672	TTATT	2	10	17984	17993	20 %	80 %	0 %	0 %	58038273
12	NC_006672	TCGTG	2	10	21199	21208	0 %	40 %	40 %	20 %	58038276
13	NC_006672	CGGTC	2	10	23775	23784	0 %	20 %	40 %	40 %	58038278
14	NC_006672	CCGGT	2	10	24826	24835	0 %	20 %	40 %	40 %	58038280
15	NC_006672	GCCAT	2	10	25805	25814	20 %	20 %	20 %	40 %	58038281
16	NC_006672	TGATC	2	10	27052	27061	20 %	40 %	20 %	20 %	58038283
17	NC_006672	GCACG	2	10	30042	30051	20 %	0 %	40 %	40 %	58038288
18	NC_006672	CCACA	2	10	31323	31332	40 %	0 %	0 %	60 %	58038289
19	NC_006672	GGAAT	2	10	31571	31580	40 %	20 %	40 %	0 %	58038289
20	NC_006672	CTGCC	2	10	32822	32831	0 %	20 %	20 %	60 %	58038290
21	NC_006672	ACGAT	2	10	35486	35495	40 %	20 %	20 %	20 %	58038294
22	NC_006672	TCGTC	2	10	37967	37976	0 %	40 %	20 %	40 %	58038295
23	NC_006672	TGCCG	2	10	39459	39468	0 %	20 %	40 %	40 %	58038295
24	NC_006672	AGCTG	2	10	40757	40766	20 %	20 %	40 %	20 %	58038295
25	NC_006672	GCCCG	2	10	41248	41257	0 %	0 %	40 %	60 %	58038296
26	NC_006672	CCTGT	2	10	42527	42536	0 %	40 %	20 %	40 %	58038298
27	NC_006672	AACGA	2	10	46482	46491	60 %	0 %	20 %	20 %	58038301
28	NC_006672	GGGCA	2	10	47862	47871	20 %	0 %	60 %	20 %	58038302
29	NC_006672	CGGGA	2	10	48312	48321	20 %	0 %	60 %	20 %	58038302
30	NC_006672	GCAGG	2	10	48440	48449	20 %	0 %	60 %	20 %	58038302
31	NC_006672	CGCGG	2	10	48525	48534	0 %	0 %	60 %	40 %	58038302
32	NC_006672	AGAGG	2	10	48646	48655	40 %	0 %	60 %	0 %	58038302
33	NC_006672	CCAGG	2	10	50301	50310	20 %	0 %	40 %	40 %	58038305
34	NC_006672	TCTGA	2	10	54227	54236	20 %	40 %	20 %	20 %	58038309
35	NC_006672	CACTG	2	10	56517	56526	20 %	20 %	20 %	40 %	58038312
36	NC_006672	GCCTT	2	10	62396	62405	0 %	40 %	20 %	40 %	58038317
37	NC_006672	GCGTT	2	10	62722	62731	0 %	40 %	40 %	20 %	58038317
38	NC_006672	GGCGT	2	10	62860	62869	0 %	20 %	60 %	20 %	58038317
39	NC_006672	TCAGG	2	10	62984	62993	20 %	20 %	40 %	20 %	58038317
40	NC_006672	CCGGG	2	10	65603	65612	0 %	0 %	60 %	40 %	58038318
41	NC_006672	TGGCG	2	10	67799	67808	0 %	20 %	60 %	20 %	58038320
42	NC_006672	CGCTG	2	10	69398	69407	0 %	20 %	40 %	40 %	58038321
43	NC_006672	CCTGT	2	10	70595	70604	0 %	40 %	20 %	40 %	58038322
44	NC_006672	TCTGA	2	10	73777	73786	20 %	40 %	20 %	20 %	58038325
45	NC_006672	CACTC	2	10	74843	74852	20 %	20 %	0 %	60 %	58038326
46	NC_006672	CCGAC	2	10	75558	75567	20 %	0 %	20 %	60 %	58038327
47	NC_006672	ACGAG	2	10	76812	76821	40 %	0 %	40 %	20 %	58038328
48	NC_006672	AACAG	2	10	76895	76904	60 %	0 %	20 %	20 %	58038328
49	NC_006672	GACAT	2	10	77621	77630	40 %	20 %	20 %	20 %	58038329
50	NC_006672	GATCG	2	10	78363	78372	20 %	20 %	40 %	20 %	58038330
51	NC_006672	AACGC	2	10	79494	79503	40 %	0 %	20 %	40 %	58038331
52	NC_006672	GTGGC	2	10	83675	83684	0 %	20 %	60 %	20 %	58038337
53	NC_006672	GCCAC	2	10	85377	85386	20 %	0 %	20 %	60 %	58038339
54	NC_006672	GCTGG	2	10	85886	85895	0 %	20 %	60 %	20 %	58038339
55	NC_006672	CAGGA	2	10	87879	87888	40 %	0 %	40 %	20 %	58038343
56	NC_006672	CGTGA	2	10	88583	88592	20 %	20 %	40 %	20 %	58038344
57	NC_006672	GTCCG	2	10	89474	89483	0 %	20 %	40 %	40 %	58038345
58	NC_006672	CCCAG	2	10	89509	89518	20 %	0 %	20 %	60 %	58038345
59	NC_006672	CGCAC	2	10	91604	91613	20 %	0 %	20 %	60 %	58038348
60	NC_006672	TGGCG	2	10	94229	94238	0 %	20 %	60 %	20 %	58038350
61	NC_006672	CACTC	2	10	94932	94941	20 %	20 %	0 %	60 %	58038350
62	NC_006672	CAGAA	2	10	96372	96381	60 %	0 %	20 %	20 %	58038352
63	NC_006672	CAGAG	2	10	96677	96686	40 %	0 %	40 %	20 %	58038352
64	NC_006672	GCCGC	2	10	99655	99664	0 %	0 %	40 %	60 %	58038354
65	NC_006672	TGCTG	2	10	101199	101208	0 %	40 %	40 %	20 %	58038356
66	NC_006672	TCCGG	2	10	101819	101828	0 %	20 %	40 %	40 %	58038357
67	NC_006672	AGGAC	2	10	101917	101926	40 %	0 %	40 %	20 %	58038357
68	NC_006672	GCCAG	2	10	103080	103089	20 %	0 %	40 %	40 %	58038359
69	NC_006672	AACGA	2	10	103104	103113	60 %	0 %	20 %	20 %	58038359
70	NC_006672	TGTGG	2	10	103692	103701	0 %	40 %	60 %	0 %	58038361
71	NC_006672	GCCCC	2	10	104247	104256	0 %	0 %	20 %	80 %	58038361
72	NC_006672	CAGTC	2	10	104349	104358	20 %	20 %	20 %	40 %	58038361
73	NC_006672	TCGCC	2	10	105069	105078	0 %	20 %	20 %	60 %	58038361
74	NC_006672	GCCAC	2	10	107261	107270	20 %	0 %	20 %	60 %	58038362
75	NC_006672	CCTGC	2	10	108134	108143	0 %	20 %	20 %	60 %	58038363
76	NC_006672	TTCCC	2	10	108161	108170	0 %	40 %	0 %	60 %	58038363
77	NC_006672	AATGG	2	10	109524	109533	40 %	20 %	40 %	0 %	58038365
78	NC_006672	GCCGG	2	10	110254	110263	0 %	0 %	60 %	40 %	58038366
79	NC_006672	GCACA	2	10	111115	111124	40 %	0 %	20 %	40 %	58038368
80	NC_006672	CGGAT	2	10	111846	111855	20 %	20 %	40 %	20 %	58038368
81	NC_006672	TTCTC	2	10	112783	112792	0 %	60 %	0 %	40 %	58038369
82	NC_006672	CAGGA	2	10	113175	113184	40 %	0 %	40 %	20 %	58038369
83	NC_006672	CGGAC	2	10	113421	113430	20 %	0 %	40 %	40 %	58038370
84	NC_006672	AGGCG	2	10	115871	115880	20 %	0 %	60 %	20 %	58038372
85	NC_006672	TCAGT	2	10	116395	116404	20 %	40 %	20 %	20 %	58038373
86	NC_006672	CGGCC	2	10	116405	116414	0 %	0 %	40 %	60 %	58038373
87	NC_006672	TCGCG	2	10	117644	117653	0 %	20 %	40 %	40 %	58038373
88	NC_006672	GGTTC	2	10	121744	121753	0 %	40 %	40 %	20 %	58038376
89	NC_006672	AACGA	2	10	121760	121769	60 %	0 %	20 %	20 %	58038376
90	NC_006672	GAAAA	2	10	123100	123109	80 %	0 %	20 %	0 %	58038377
91	NC_006672	TGACC	2	10	124801	124810	20 %	20 %	20 %	40 %	58038379
92	NC_006672	CAGAC	2	10	124829	124838	40 %	0 %	20 %	40 %	58038379
93	NC_006672	GGACC	2	10	126977	126986	20 %	0 %	40 %	40 %	58038380
94	NC_006672	ATGCG	2	10	127629	127638	20 %	20 %	40 %	20 %	58038381
95	NC_006672	GGCTG	2	10	129297	129306	0 %	20 %	60 %	20 %	58038383
96	NC_006672	CCCTT	2	10	130161	130170	0 %	40 %	0 %	60 %	58038384
97	NC_006672	GGAAC	2	10	130552	130561	40 %	0 %	40 %	20 %	58038384
98	NC_006672	CGCGC	2	10	132362	132371	0 %	0 %	40 %	60 %	58038387
99	NC_006672	CGATC	2	10	134499	134508	20 %	20 %	20 %	40 %	58038390
100	NC_006672	GATCG	2	10	138317	138326	20 %	20 %	40 %	20 %	58038392
101	NC_006672	ACGGC	2	10	139673	139682	20 %	0 %	40 %	40 %	58038393
102	NC_006672	GCATG	2	10	144535	144544	20 %	20 %	40 %	20 %	58038396
103	NC_006672	ATGGC	2	10	144927	144936	20 %	20 %	40 %	20 %	58038396
104	NC_006672	CCTGG	2	10	146056	146065	0 %	20 %	40 %	40 %	58038397
105	NC_006672	TCCGA	2	10	146218	146227	20 %	20 %	20 %	40 %	58038397
106	NC_006672	TATGA	2	10	146635	146644	40 %	40 %	20 %	0 %	58038398
107	NC_006672	GTCGC	2	10	147282	147291	0 %	20 %	40 %	40 %	58038398
108	NC_006672	CCGCG	2	10	148672	148681	0 %	0 %	40 %	60 %	58038400
109	NC_006672	GCTCG	2	10	152661	152670	0 %	20 %	40 %	40 %	58038404
110	NC_006672	GCTAT	2	10	153241	153250	20 %	40 %	20 %	20 %	58038405
111	NC_006672	TGGAA	2	10	153775	153784	40 %	20 %	40 %	0 %	58038406
112	NC_006672	GCCGG	2	10	154819	154828	0 %	0 %	60 %	40 %	58038407
113	NC_006672	CAGCG	2	10	156228	156237	20 %	0 %	40 %	40 %	58038409
114	NC_006672	ATTCC	2	10	156821	156830	20 %	40 %	0 %	40 %	58038409
115	NC_006672	TCAGA	2	10	161377	161386	40 %	20 %	20 %	20 %	58038415
116	NC_006672	CGCGG	2	10	161483	161492	0 %	0 %	60 %	40 %	58038415

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.