MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Gluconobacter oxydans 621H plasmid pGOX1

Total Repeats: 444

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006672	TGGC	2	8	142	149	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_006672	CCGT	2	8	367	374	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006672	CCTT	2	8	613	620	0 %	50 %	0 %	50 %	58038255
4	NC_006672	GCCC	2	8	1007	1014	0 %	0 %	25 %	75 %	58038255
5	NC_006672	AAGG	2	8	1190	1197	50 %	0 %	50 %	0 %	58038255
6	NC_006672	CTGC	2	8	1736	1743	0 %	25 %	25 %	50 %	58038256
7	NC_006672	ACCT	2	8	1797	1804	25 %	25 %	0 %	50 %	58038256
8	NC_006672	GCGG	2	8	3069	3076	0 %	0 %	75 %	25 %	58038257
9	NC_006672	CCGG	2	8	3139	3146	0 %	0 %	50 %	50 %	58038257
10	NC_006672	GCGG	2	8	3358	3365	0 %	0 %	75 %	25 %	58038258
11	NC_006672	GCAG	2	8	3755	3762	25 %	0 %	50 %	25 %	58038258
12	NC_006672	GGAT	2	8	3863	3870	25 %	25 %	50 %	0 %	58038259
13	NC_006672	ATCC	2	8	4110	4117	25 %	25 %	0 %	50 %	58038259
14	NC_006672	CCAG	2	8	4148	4155	25 %	0 %	25 %	50 %	58038259
15	NC_006672	GCAG	2	8	4316	4323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_006672	ACGC	2	8	5271	5278	25 %	0 %	25 %	50 %	58038261
17	NC_006672	CCCG	2	8	5552	5559	0 %	0 %	25 %	75 %	58038262
18	NC_006672	GGAC	2	8	5871	5878	25 %	0 %	50 %	25 %	58038262
19	NC_006672	AGCC	2	8	6249	6256	25 %	0 %	25 %	50 %	58038263
20	NC_006672	GAGC	2	8	6800	6807	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_006672	ACTG	2	8	6839	6846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_006672	GATC	2	8	7123	7130	25 %	25 %	25 %	25 %	58038264
23	NC_006672	GATC	2	8	8066	8073	25 %	25 %	25 %	25 %	58038264
24	NC_006672	GAAA	2	8	8285	8292	75 %	0 %	25 %	0 %	58038264
25	NC_006672	CGGT	2	8	8893	8900	0 %	25 %	50 %	25 %	58038264
26	NC_006672	CGCT	2	8	8902	8909	0 %	25 %	25 %	50 %	58038264
27	NC_006672	GACA	2	8	9212	9219	50 %	0 %	25 %	25 %	58038264
28	NC_006672	GTCG	2	8	9531	9538	0 %	25 %	50 %	25 %	58038265
29	NC_006672	TTCC	2	8	9681	9688	0 %	50 %	0 %	50 %	58038265
30	NC_006672	CGAC	2	8	10481	10488	25 %	0 %	25 %	50 %	58038266
31	NC_006672	GACA	2	8	10551	10558	50 %	0 %	25 %	25 %	58038266
32	NC_006672	ATTT	2	8	10560	10567	25 %	75 %	0 %	0 %	58038266
33	NC_006672	TGAT	2	8	11239	11246	25 %	50 %	25 %	0 %	58038267
34	NC_006672	CAGC	2	8	11447	11454	25 %	0 %	25 %	50 %	58038267
35	NC_006672	GTCG	2	8	11610	11617	0 %	25 %	50 %	25 %	58038267
36	NC_006672	TCGC	2	8	12407	12414	0 %	25 %	25 %	50 %	58038268
37	NC_006672	TGAT	2	8	12738	12745	25 %	50 %	25 %	0 %	58038269
38	NC_006672	ACGG	2	8	13571	13578	25 %	0 %	50 %	25 %	58038270
39	NC_006672	AGGA	2	8	13646	13653	50 %	0 %	50 %	0 %	58038270
40	NC_006672	TCGA	2	8	13681	13688	25 %	25 %	25 %	25 %	58038270
41	NC_006672	CGGT	2	8	14567	14574	0 %	25 %	50 %	25 %	58038270
42	NC_006672	CGGG	2	8	14605	14612	0 %	0 %	75 %	25 %	58038270
43	NC_006672	ATGA	2	8	14622	14629	50 %	25 %	25 %	0 %	58038270
44	NC_006672	AGGC	2	8	15521	15528	25 %	0 %	50 %	25 %	58038271
45	NC_006672	CACG	2	8	15652	15659	25 %	0 %	25 %	50 %	58038271
46	NC_006672	CCGA	2	8	16000	16007	25 %	0 %	25 %	50 %	58038271
47	NC_006672	CGGA	2	8	16042	16049	25 %	0 %	50 %	25 %	58038271
48	NC_006672	CGTG	2	8	16568	16575	0 %	25 %	50 %	25 %	58038271
49	NC_006672	GCAG	2	8	16720	16727	25 %	0 %	50 %	25 %	58038271
50	NC_006672	GCGG	2	8	16765	16772	0 %	0 %	75 %	25 %	58038271
51	NC_006672	GTGC	2	8	16891	16898	0 %	25 %	50 %	25 %	58038272
52	NC_006672	GCGA	2	8	17073	17080	25 %	0 %	50 %	25 %	58038272
53	NC_006672	TTGG	2	8	17117	17124	0 %	50 %	50 %	0 %	58038272
54	NC_006672	ATGG	2	8	17423	17430	25 %	25 %	50 %	0 %	58038272
55	NC_006672	TACA	2	8	18993	19000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_006672	TCTT	2	8	19083	19090	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_006672	CATG	2	8	19344	19351	25 %	25 %	25 %	25 %	58038274
58	NC_006672	GCTG	2	8	19697	19704	0 %	25 %	50 %	25 %	58038275
59	NC_006672	TCAT	2	8	19905	19912	25 %	50 %	0 %	25 %	58038275
60	NC_006672	TGAA	2	8	20057	20064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006672	AGTC	2	8	20118	20125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_006672	ATGG	2	8	20456	20463	25 %	25 %	50 %	0 %	58038276
63	NC_006672	CGAC	2	8	20478	20485	25 %	0 %	25 %	50 %	58038276
64	NC_006672	CGGG	2	8	20847	20854	0 %	0 %	75 %	25 %	58038276
65	NC_006672	GGTC	2	8	21868	21875	0 %	25 %	50 %	25 %	58038276
66	NC_006672	CCCA	2	8	21909	21916	25 %	0 %	0 %	75 %	58038276
67	NC_006672	AACA	2	8	22584	22591	75 %	0 %	0 %	25 %	58038277
68	NC_006672	GCGG	2	8	22858	22865	0 %	0 %	75 %	25 %	58038278
69	NC_006672	CAGC	2	8	23043	23050	25 %	0 %	25 %	50 %	58038278
70	NC_006672	TCAC	2	8	23168	23175	25 %	25 %	0 %	50 %	58038278
71	NC_006672	GACA	2	8	23240	23247	50 %	0 %	25 %	25 %	58038278
72	NC_006672	TACC	2	8	23523	23530	25 %	25 %	0 %	50 %	58038278
73	NC_006672	TTCG	2	8	24028	24035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_006672	AAGC	2	8	24062	24069	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_006672	GGTT	2	8	24695	24702	0 %	50 %	50 %	0 %	58038280
76	NC_006672	TTCA	2	8	24905	24912	25 %	50 %	0 %	25 %	58038280
77	NC_006672	GCGA	2	8	24939	24946	25 %	0 %	50 %	25 %	58038280
78	NC_006672	TGCC	2	8	25590	25597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_006672	GCGG	2	8	26056	26063	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_006672	TCCC	2	8	26140	26147	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_006672	CTTC	2	8	26149	26156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_006672	CAGA	2	8	26298	26305	50 %	0 %	25 %	25 %	58038282
83	NC_006672	GGTC	2	8	26558	26565	0 %	25 %	50 %	25 %	58038282
84	NC_006672	CGGC	2	8	26872	26879	0 %	0 %	50 %	50 %	58038283
85	NC_006672	CAGC	2	8	27394	27401	25 %	0 %	25 %	50 %	58038284
86	NC_006672	AAGG	2	8	27569	27576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006672	GGCA	2	8	28187	28194	25 %	0 %	50 %	25 %	58038285
88	NC_006672	ACCC	2	8	28431	28438	25 %	0 %	0 %	75 %	58038286
89	NC_006672	CTCC	2	8	28510	28517	0 %	25 %	0 %	75 %	58038286
90	NC_006672	CTCG	2	8	28929	28936	0 %	25 %	25 %	50 %	58038286
91	NC_006672	CGAC	2	8	29420	29427	25 %	0 %	25 %	50 %	58038287
92	NC_006672	GGCG	2	8	29576	29583	0 %	0 %	75 %	25 %	58038287
93	NC_006672	AAAG	2	8	29597	29604	75 %	0 %	25 %	0 %	58038287
94	NC_006672	ACAG	2	8	30474	30481	50 %	0 %	25 %	25 %	58038288
95	NC_006672	ACAG	2	8	32172	32179	50 %	0 %	25 %	25 %	58038290
96	NC_006672	GGCC	2	8	32403	32410	0 %	0 %	50 %	50 %	58038290
97	NC_006672	CGTC	2	8	32718	32725	0 %	25 %	25 %	50 %	58038290
98	NC_006672	CCGG	2	8	32984	32991	0 %	0 %	50 %	50 %	58038290
99	NC_006672	CTCC	2	8	32997	33004	0 %	25 %	0 %	75 %	58038290
100	NC_006672	AGGC	2	8	33165	33172	25 %	0 %	50 %	25 %	58038290
101	NC_006672	AGGC	2	8	34202	34209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_006672	CGCA	2	8	34439	34446	25 %	0 %	25 %	50 %	58038292
103	NC_006672	CCGG	2	8	34543	34550	0 %	0 %	50 %	50 %	58038293
104	NC_006672	CTGC	2	8	35223	35230	0 %	25 %	25 %	50 %	58038294
105	NC_006672	CGGG	2	8	35605	35612	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_006672	GCCC	2	8	35617	35624	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_006672	GACG	2	8	38508	38515	25 %	0 %	50 %	25 %	58038295
108	NC_006672	GCTG	2	8	38828	38835	0 %	25 %	50 %	25 %	58038295
109	NC_006672	GCAG	2	8	38942	38949	25 %	0 %	50 %	25 %	58038295
110	NC_006672	CCAG	2	8	39074	39081	25 %	0 %	25 %	50 %	58038295
111	NC_006672	CCTT	2	8	39433	39440	0 %	50 %	0 %	50 %	58038295
112	NC_006672	TCCC	2	8	39696	39703	0 %	25 %	0 %	75 %	58038295
113	NC_006672	CCAG	2	8	39734	39741	25 %	0 %	25 %	50 %	58038295
114	NC_006672	TTTC	2	8	40655	40662	0 %	75 %	0 %	25 %	58038295
115	NC_006672	ACGG	2	8	41274	41281	25 %	0 %	50 %	25 %	58038296
116	NC_006672	ACCC	2	8	41282	41289	25 %	0 %	0 %	75 %	58038296
117	NC_006672	TGAC	2	8	41503	41510	25 %	25 %	25 %	25 %	58038296
118	NC_006672	CCTC	2	8	41942	41949	0 %	25 %	0 %	75 %	58038297
119	NC_006672	CCGG	2	8	42033	42040	0 %	0 %	50 %	50 %	58038298
120	NC_006672	CAGG	2	8	42086	42093	25 %	0 %	50 %	25 %	58038298
121	NC_006672	CATC	2	8	42229	42236	25 %	25 %	0 %	50 %	58038298
122	NC_006672	GTGC	2	8	43243	43250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_006672	GGCC	2	8	43301	43308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_006672	GGAC	2	8	43486	43493	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_006672	CGAC	2	8	43519	43526	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_006672	TATC	2	8	43557	43564	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_006672	CCGC	2	8	45379	45386	0 %	0 %	25 %	75 %	58038300
128	NC_006672	CAAG	2	8	45854	45861	50 %	0 %	25 %	25 %	58038300
129	NC_006672	CGAC	2	8	45933	45940	25 %	0 %	25 %	50 %	58038300
130	NC_006672	CGAT	2	8	45951	45958	25 %	25 %	25 %	25 %	58038300
131	NC_006672	CTCG	2	8	46140	46147	0 %	25 %	25 %	50 %	58038301
132	NC_006672	CTGC	2	8	46958	46965	0 %	25 %	25 %	50 %	58038301
133	NC_006672	GTCA	2	8	46984	46991	25 %	25 %	25 %	25 %	58038301
134	NC_006672	GAAC	2	8	47516	47523	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_006672	GCGG	2	8	48432	48439	0 %	0 %	75 %	25 %	58038302
136	NC_006672	GTCA	2	8	48597	48604	25 %	25 %	25 %	25 %	58038302
137	NC_006672	GCCA	2	8	49455	49462	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_006672	ACGC	2	8	50352	50359	25 %	0 %	25 %	50 %	58038305
139	NC_006672	ACGG	2	8	50588	50595	25 %	0 %	50 %	25 %	58038305
140	NC_006672	CTGG	2	8	51093	51100	0 %	25 %	50 %	25 %	58038306
141	NC_006672	CTGC	2	8	51144	51151	0 %	25 %	25 %	50 %	58038306
142	NC_006672	ACCG	2	8	51284	51291	25 %	0 %	25 %	50 %	58038306
143	NC_006672	GCGG	2	8	51495	51502	0 %	0 %	75 %	25 %	58038307
144	NC_006672	CTGG	2	8	51648	51655	0 %	25 %	50 %	25 %	58038307
145	NC_006672	CGCC	2	8	51711	51718	0 %	0 %	25 %	75 %	58038307
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423	NC_006672	GGCG	2	8	153761	153768	0 %	0 %	75 %	25 %	58038406
424	NC_006672	CAGG	2	8	153914	153921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
425	NC_006672	GATG	2	8	153991	153998	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
426	NC_006672	CGGA	2	8	154484	154491	25 %	0 %	50 %	25 %	58038407
427	NC_006672	GGCA	2	8	154914	154921	25 %	0 %	50 %	25 %	58038407
428	NC_006672	CCCG	2	8	155518	155525	0 %	0 %	25 %	75 %	58038408
429	NC_006672	GGCG	2	8	155824	155831	0 %	0 %	75 %	25 %	58038408
430	NC_006672	GGTC	2	8	158053	158060	0 %	25 %	50 %	25 %	58038410
431	NC_006672	GTCC	2	8	158082	158089	0 %	25 %	25 %	50 %	58038410
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434	NC_006672	ACAT	2	8	159131	159138	50 %	25 %	0 %	25 %	58038412
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439	NC_006672	ACGC	2	8	160559	160566	25 %	0 %	25 %	50 %	58038414
440	NC_006672	TCCG	2	8	160868	160875	0 %	25 %	25 %	50 %	58038414
441	NC_006672	CGGA	2	8	161601	161608	25 %	0 %	50 %	25 %	58038415
442	NC_006672	CGGG	2	8	162235	162242	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
443	NC_006672	GCCG	2	8	162243	162250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
444	NC_006672	ATTT	2	8	163125	163132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.