MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Gluconobacter oxydans 621H plasmid pGOX1

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006672	TGGC	2	8	142	149	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_006672	CCGT	2	8	367	374	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006672	GCAG	2	8	4316	4323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_006672	GAGC	2	8	6800	6807	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_006672	ACTG	2	8	6839	6846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_006672	TACA	2	8	18993	19000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_006672	TCTT	2	8	19083	19090	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_006672	TGAA	2	8	20057	20064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006672	AGTC	2	8	20118	20125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_006672	TTCG	2	8	24028	24035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_006672	AAGC	2	8	24062	24069	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_006672	TGCC	2	8	25590	25597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006672	GCGG	2	8	26056	26063	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_006672	TCCC	2	8	26140	26147	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_006672	CTTC	2	8	26149	26156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_006672	AAGG	2	8	27569	27576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006672	AGGC	2	8	34202	34209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006672	CGGG	2	8	35605	35612	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_006672	GCCC	2	8	35617	35624	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_006672	GTGC	2	8	43243	43250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_006672	GGCC	2	8	43301	43308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006672	GGAC	2	8	43486	43493	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_006672	CGAC	2	8	43519	43526	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_006672	TATC	2	8	43557	43564	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_006672	GAAC	2	8	47516	47523	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_006672	GCCA	2	8	49455	49462	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_006672	AGCG	2	8	52027	52034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_006672	CCTG	2	8	53190	53197	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_006672	GCGG	2	8	53643	53650	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_006672	GAAT	2	8	60267	60274	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006672	AATC	2	8	60816	60823	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_006672	ATTG	2	8	60934	60941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006672	CGAT	2	8	61061	61068	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_006672	ATGA	2	8	69826	69833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006672	GCTC	2	8	72527	72534	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_006672	CATA	2	8	72664	72671	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_006672	GCCC	2	8	72871	72878	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_006672	TTGA	2	8	75901	75908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006672	AATG	2	8	78921	78928	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006672	GAGC	2	8	81958	81965	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_006672	GTCT	2	8	84120	84127	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_006672	AAAC	2	8	85016	85023	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_006672	CCGT	2	8	87393	87400	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_006672	AGAA	2	8	94162	94169	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006672	TAGG	2	8	95188	95195	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006672	AGTG	2	8	97862	97869	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006672	GGCC	2	8	98142	98149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006672	CTGA	2	8	101308	101315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_006672	TGCC	2	8	112385	112392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_006672	GGAA	2	8	112488	112495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006672	CATC	2	8	114691	114698	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006672	AACG	2	8	136185	136192	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_006672	GTCT	2	8	136239	136246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_006672	TACG	2	8	142755	142762	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_006672	ATAG	2	8	145856	145863	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006672	ATGG	2	8	146582	146589	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006672	TCCG	2	8	152499	152506	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_006672	CAGG	2	8	153914	153921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_006672	GATG	2	8	153991	153998	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006672	CGGG	2	8	162235	162242	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_006672	GCCG	2	8	162243	162250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_006672	ATTT	2	8	163125	163132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.