MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Gluconobacter oxydans 621H plasmid pGOX1

Total Repeats: 346

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006672	GT	3	6	839	844	0 %	50 %	50 %	0 %	58038255
2	NC_006672	GA	3	6	969	974	50 %	0 %	50 %	0 %	58038255
3	NC_006672	TC	3	6	1017	1022	0 %	50 %	0 %	50 %	58038255
4	NC_006672	GC	3	6	1281	1286	0 %	0 %	50 %	50 %	58038255
5	NC_006672	GC	3	6	1422	1427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_006672	TC	4	8	1494	1501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_006672	TC	3	6	1545	1550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_006672	GC	3	6	1580	1585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_006672	CG	3	6	1619	1624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_006672	AC	3	6	2479	2484	50 %	0 %	0 %	50 %	58038256
11	NC_006672	GC	3	6	2840	2845	0 %	0 %	50 %	50 %	58038257
12	NC_006672	CT	3	6	2855	2860	0 %	50 %	0 %	50 %	58038257
13	NC_006672	CA	4	8	2969	2976	50 %	0 %	0 %	50 %	58038257
14	NC_006672	TC	3	6	2985	2990	0 %	50 %	0 %	50 %	58038257
15	NC_006672	GC	3	6	3615	3620	0 %	0 %	50 %	50 %	58038258
16	NC_006672	CG	3	6	3934	3939	0 %	0 %	50 %	50 %	58038259
17	NC_006672	GA	4	8	4306	4313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006672	TC	3	6	4529	4534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_006672	CT	3	6	4965	4970	0 %	50 %	0 %	50 %	58038261
20	NC_006672	CG	3	6	5319	5324	0 %	0 %	50 %	50 %	58038261
21	NC_006672	CG	3	6	5812	5817	0 %	0 %	50 %	50 %	58038262
22	NC_006672	AG	3	6	6186	6191	50 %	0 %	50 %	0 %	58038263
23	NC_006672	GA	3	6	6320	6325	50 %	0 %	50 %	0 %	58038263
24	NC_006672	CA	3	6	6683	6688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006672	CG	3	6	6853	6858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006672	GA	3	6	7006	7011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006672	CA	3	6	7460	7465	50 %	0 %	0 %	50 %	58038264
28	NC_006672	GC	3	6	7816	7821	0 %	0 %	50 %	50 %	58038264
29	NC_006672	TC	3	6	7851	7856	0 %	50 %	0 %	50 %	58038264
30	NC_006672	AT	3	6	8213	8218	50 %	50 %	0 %	0 %	58038264
31	NC_006672	CG	3	6	8250	8255	0 %	0 %	50 %	50 %	58038264
32	NC_006672	CG	3	6	8428	8433	0 %	0 %	50 %	50 %	58038264
33	NC_006672	CG	3	6	8669	8674	0 %	0 %	50 %	50 %	58038264
34	NC_006672	TC	3	6	8682	8687	0 %	50 %	0 %	50 %	58038264
35	NC_006672	GC	4	8	9039	9046	0 %	0 %	50 %	50 %	58038264
36	NC_006672	GA	3	6	9065	9070	50 %	0 %	50 %	0 %	58038264
37	NC_006672	GC	4	8	9643	9650	0 %	0 %	50 %	50 %	58038265
38	NC_006672	CT	3	6	10410	10415	0 %	50 %	0 %	50 %	58038266
39	NC_006672	CG	3	6	10788	10793	0 %	0 %	50 %	50 %	58038266
40	NC_006672	TC	3	6	12357	12362	0 %	50 %	0 %	50 %	58038268
41	NC_006672	TC	3	6	16208	16213	0 %	50 %	0 %	50 %	58038271
42	NC_006672	GC	3	6	16741	16746	0 %	0 %	50 %	50 %	58038271
43	NC_006672	CT	3	6	16876	16881	0 %	50 %	0 %	50 %	58038272
44	NC_006672	AG	3	6	17809	17814	50 %	0 %	50 %	0 %	58038272
45	NC_006672	TA	3	6	18617	18622	50 %	50 %	0 %	0 %	58038273
46	NC_006672	GC	3	6	19267	19272	0 %	0 %	50 %	50 %	58038274
47	NC_006672	AC	3	6	20311	20316	50 %	0 %	0 %	50 %	58038276
48	NC_006672	CT	3	6	20640	20645	0 %	50 %	0 %	50 %	58038276
49	NC_006672	GC	3	6	20994	20999	0 %	0 %	50 %	50 %	58038276
50	NC_006672	GA	3	6	21024	21029	50 %	0 %	50 %	0 %	58038276
51	NC_006672	CG	3	6	21542	21547	0 %	0 %	50 %	50 %	58038276
52	NC_006672	TC	3	6	21745	21750	0 %	50 %	0 %	50 %	58038276
53	NC_006672	CG	3	6	22113	22118	0 %	0 %	50 %	50 %	58038276
54	NC_006672	GA	3	6	22146	22151	50 %	0 %	50 %	0 %	58038276
55	NC_006672	GA	3	6	22606	22611	50 %	0 %	50 %	0 %	58038277
56	NC_006672	TC	3	6	22842	22847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_006672	GC	3	6	22966	22971	0 %	0 %	50 %	50 %	58038278
58	NC_006672	CG	3	6	23115	23120	0 %	0 %	50 %	50 %	58038278
59	NC_006672	CA	3	6	23998	24003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_006672	CG	3	6	24353	24358	0 %	0 %	50 %	50 %	58038279
61	NC_006672	CG	3	6	25019	25024	0 %	0 %	50 %	50 %	58038280
62	NC_006672	GC	3	6	25793	25798	0 %	0 %	50 %	50 %	58038281
63	NC_006672	CT	3	6	26015	26020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_006672	CG	4	8	26162	26169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_006672	CG	3	6	26454	26459	0 %	0 %	50 %	50 %	58038282
66	NC_006672	GC	3	6	26675	26680	0 %	0 %	50 %	50 %	58038282
67	NC_006672	CG	3	6	27045	27050	0 %	0 %	50 %	50 %	58038283
68	NC_006672	GC	3	6	27408	27413	0 %	0 %	50 %	50 %	58038284
69	NC_006672	GT	3	6	27625	27630	0 %	50 %	50 %	0 %	58038285
70	NC_006672	CG	3	6	27757	27762	0 %	0 %	50 %	50 %	58038285
71	NC_006672	CG	4	8	27907	27914	0 %	0 %	50 %	50 %	58038285
72	NC_006672	GC	3	6	28012	28017	0 %	0 %	50 %	50 %	58038285
73	NC_006672	CT	3	6	28468	28473	0 %	50 %	0 %	50 %	58038286
74	NC_006672	CT	3	6	28490	28495	0 %	50 %	0 %	50 %	58038286
75	NC_006672	CG	3	6	28526	28531	0 %	0 %	50 %	50 %	58038286
76	NC_006672	GC	3	6	28566	28571	0 %	0 %	50 %	50 %	58038286
77	NC_006672	GC	3	6	28711	28716	0 %	0 %	50 %	50 %	58038286
78	NC_006672	GC	3	6	29119	29124	0 %	0 %	50 %	50 %	58038287
79	NC_006672	CG	3	6	29221	29226	0 %	0 %	50 %	50 %	58038287
80	NC_006672	CG	3	6	29374	29379	0 %	0 %	50 %	50 %	58038287
81	NC_006672	GC	3	6	30063	30068	0 %	0 %	50 %	50 %	58038288
82	NC_006672	CT	3	6	30498	30503	0 %	50 %	0 %	50 %	58038288
83	NC_006672	CG	3	6	30540	30545	0 %	0 %	50 %	50 %	58038288
84	NC_006672	GA	3	6	31233	31238	50 %	0 %	50 %	0 %	58038289
85	NC_006672	CG	3	6	31551	31556	0 %	0 %	50 %	50 %	58038289
86	NC_006672	CG	3	6	31930	31935	0 %	0 %	50 %	50 %	58038290
87	NC_006672	GC	3	6	31936	31941	0 %	0 %	50 %	50 %	58038290
88	NC_006672	GC	3	6	32516	32521	0 %	0 %	50 %	50 %	58038290
89	NC_006672	CG	3	6	32553	32558	0 %	0 %	50 %	50 %	58038290
90	NC_006672	CG	3	6	33426	33431	0 %	0 %	50 %	50 %	58038290
91	NC_006672	CT	3	6	34037	34042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_006672	CG	3	6	34100	34105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_006672	GC	3	6	34109	34114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_006672	CT	3	6	34157	34162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_006672	CG	3	6	34618	34623	0 %	0 %	50 %	50 %	58038293
96	NC_006672	GC	3	6	35172	35177	0 %	0 %	50 %	50 %	58038294
97	NC_006672	CG	3	6	35344	35349	0 %	0 %	50 %	50 %	58038294
98	NC_006672	CT	3	6	35504	35509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_006672	TC	3	6	35518	35523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_006672	CG	3	6	35569	35574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_006672	GC	3	6	35578	35583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_006672	CA	3	6	36047	36052	50 %	0 %	0 %	50 %	58038295
103	NC_006672	GC	3	6	36117	36122	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
104	NC_006672	CG	3	6	36288	36293	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
105	NC_006672	CG	3	6	36800	36805	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
106	NC_006672	GC	4	8	38195	38202	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
107	NC_006672	GC	3	6	38308	38313	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
108	NC_006672	GC	3	6	38648	38653	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
109	NC_006672	TG	3	6	39028	39033	0 %	50 %	50 %	0 %	58038295
110	NC_006672	GC	3	6	39217	39222	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
111	NC_006672	GC	3	6	39239	39244	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
112	NC_006672	GC	3	6	39268	39273	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
113	NC_006672	CG	3	6	39322	39327	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
114	NC_006672	GC	3	6	40814	40819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_006672	GC	3	6	40883	40888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_006672	GC	3	6	40952	40957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_006672	GC	3	6	40988	40993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_006672	TG	3	6	41130	41135	0 %	50 %	50 %	0 %	58038296
119	NC_006672	CT	3	6	41334	41339	0 %	50 %	0 %	50 %	58038296
120	NC_006672	GC	3	6	41873	41878	0 %	0 %	50 %	50 %	58038297
121	NC_006672	GC	3	6	42461	42466	0 %	0 %	50 %	50 %	58038298
122	NC_006672	CA	3	6	43142	43147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_006672	TC	3	6	43537	43542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_006672	GC	3	6	43635	43640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_006672	CT	4	8	43763	43770	0 %	50 %	0 %	50 %	58038299
126	NC_006672	TG	3	6	44493	44498	0 %	50 %	50 %	0 %	58038299
127	NC_006672	CT	3	6	45362	45367	0 %	50 %	0 %	50 %	58038300
128	NC_006672	TC	3	6	45541	45546	0 %	50 %	0 %	50 %	58038300
129	NC_006672	GA	3	6	45554	45559	50 %	0 %	50 %	0 %	58038300
130	NC_006672	CG	3	6	46366	46371	0 %	0 %	50 %	50 %	58038301
131	NC_006672	AC	3	6	47161	47166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_006672	CG	3	6	47949	47954	0 %	0 %	50 %	50 %	58038302
133	NC_006672	GT	3	6	48509	48514	0 %	50 %	50 %	0 %	58038302
134	NC_006672	GC	3	6	48550	48555	0 %	0 %	50 %	50 %	58038302
135	NC_006672	GA	3	6	49412	49417	50 %	0 %	50 %	0 %	58038303
136	NC_006672	GC	3	6	49823	49828	0 %	0 %	50 %	50 %	58038304
137	NC_006672	GT	3	6	49930	49935	0 %	50 %	50 %	0 %	58038304
138	NC_006672	CG	3	6	50093	50098	0 %	0 %	50 %	50 %	58038305
139	NC_006672	TG	3	6	50211	50216	0 %	50 %	50 %	0 %	58038305
140	NC_006672	AG	3	6	50375	50380	50 %	0 %	50 %	0 %	58038305
141	NC_006672	GC	3	6	50496	50501	0 %	0 %	50 %	50 %	58038305
142	NC_006672	AT	3	6	50837	50842	50 %	50 %	0 %	0 %	58038306
143	NC_006672	GC	3	6	50967	50972	0 %	0 %	50 %	50 %	58038306
144	NC_006672	AT	3	6	51958	51963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006672	GA	3	6	52287	52292	50 %	0 %	50 %	0 %	58038308
146	NC_006672	CT	3	6	52538	52543	0 %	50 %	0 %	50 %	58038308
147	NC_006672	TG	3	6	52666	52671	0 %	50 %	50 %	0 %	58038308
148	NC_006672	CG	3	6	53067	53072	0 %	0 %	50 %	50 %	58038308
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.