MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus epidermidis RP62A plasmid pSERP

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006663	AAGAGA	2	12	673	684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854753
2	NC_006663	GTTTAA	2	12	1176	1187	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	57854754
3	NC_006663	GCAATT	2	12	2513	2524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57854755
4	NC_006663	ATTATA	2	12	3657	3668	50 %	50 %	0 %	0 %	57854756
5	NC_006663	ACAGGT	2	12	4229	4240	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	57854756
6	NC_006663	TTAAAC	2	12	6806	6817	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57854760
7	NC_006663	ATTTAA	2	12	12111	12122	50 %	50 %	0 %	0 %	57854768
8	NC_006663	CTTTTA	2	12	12463	12474	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	57854768
9	NC_006663	GATATA	2	12	14438	14449	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	57854770
10	NC_006663	CTTTTG	2	12	15055	15066	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	57854771
11	NC_006663	TTATAA	2	12	15543	15554	50 %	50 %	0 %	0 %	57854771
12	NC_006663	TTAAAC	2	12	16138	16149	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57854772
13	NC_006663	TTAAAC	2	12	16810	16821	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57854773
14	NC_006663	TTAACT	2	12	17242	17253	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	57854774
15	NC_006663	ACCATA	2	12	20077	20088	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	57854776
16	NC_006663	GTTTAG	2	12	21537	21548	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	57854745
17	NC_006663	TTTTGA	2	12	22102	22113	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006663	TTAAAG	2	12	22451	22462	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	57854747
19	NC_006663	CACAAA	2	12	24028	24039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57854750
20	NC_006663	TTAAAC	2	12	25359	25370	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_006663	AATATA	2	12	25702	25713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.