MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus epidermidis RP62A plasmid pSERP

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006663	ATTT	2	8	32	39	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006663	TTCA	2	8	182	189	25 %	50 %	0 %	25 %	57854753
3	NC_006663	TAAA	2	8	364	371	75 %	25 %	0 %	0 %	57854753
4	NC_006663	ATCA	2	8	615	622	50 %	25 %	0 %	25 %	57854753
5	NC_006663	CAAC	2	8	639	646	50 %	0 %	0 %	50 %	57854753
6	NC_006663	AATG	2	8	817	824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006663	TCTT	2	8	1101	1108	0 %	75 %	0 %	25 %	57854754
8	NC_006663	ATGT	2	8	1335	1342	25 %	50 %	25 %	0 %	57854754
9	NC_006663	TTAA	2	8	1907	1914	50 %	50 %	0 %	0 %	57854755
10	NC_006663	TTTA	2	8	1996	2003	25 %	75 %	0 %	0 %	57854755
11	NC_006663	TGCT	2	8	2778	2785	0 %	50 %	25 %	25 %	57854756
12	NC_006663	AAAG	2	8	3351	3358	75 %	0 %	25 %	0 %	57854756
13	NC_006663	CATT	2	8	3494	3501	25 %	50 %	0 %	25 %	57854756
14	NC_006663	TTAA	2	8	3533	3540	50 %	50 %	0 %	0 %	57854756
15	NC_006663	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	57854756
16	NC_006663	AAAG	2	8	3785	3792	75 %	0 %	25 %	0 %	57854756
17	NC_006663	ATTT	2	8	3827	3834	25 %	75 %	0 %	0 %	57854756
18	NC_006663	TGGA	2	8	4073	4080	25 %	25 %	50 %	0 %	57854756
19	NC_006663	ATTT	2	8	4593	4600	25 %	75 %	0 %	0 %	57854757
20	NC_006663	TAAG	2	8	4927	4934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006663	TAGA	2	8	5229	5236	50 %	25 %	25 %	0 %	57854758
22	NC_006663	GTTA	2	8	5266	5273	25 %	50 %	25 %	0 %	57854758
23	NC_006663	AACG	2	8	5282	5289	50 %	0 %	25 %	25 %	57854758
24	NC_006663	TAAA	2	8	5475	5482	75 %	25 %	0 %	0 %	57854758
25	NC_006663	ACTT	2	8	5493	5500	25 %	50 %	0 %	25 %	57854758
26	NC_006663	ACAT	2	8	6651	6658	50 %	25 %	0 %	25 %	57854760
27	NC_006663	AAGA	2	8	6885	6892	75 %	0 %	25 %	0 %	57854760
28	NC_006663	AGCT	2	8	7465	7472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_006663	ACTT	2	8	7871	7878	25 %	50 %	0 %	25 %	57854762
30	NC_006663	AGTA	2	8	8043	8050	50 %	25 %	25 %	0 %	57854762
31	NC_006663	CTCA	2	8	8207	8214	25 %	25 %	0 %	50 %	57854762
32	NC_006663	TTCC	2	8	8275	8282	0 %	50 %	0 %	50 %	57854762
33	NC_006663	TTCC	2	8	8407	8414	0 %	50 %	0 %	50 %	57854762
34	NC_006663	TTCC	2	8	8490	8497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_006663	ATCC	2	8	9327	9334	25 %	25 %	0 %	50 %	57854764
36	NC_006663	AAAG	2	8	9982	9989	75 %	0 %	25 %	0 %	57854765
37	NC_006663	CCAT	2	8	10625	10632	25 %	25 %	0 %	50 %	57854766
38	NC_006663	CCAG	2	8	10710	10717	25 %	0 %	25 %	50 %	57854766
39	NC_006663	GCGA	2	8	10726	10733	25 %	0 %	50 %	25 %	57854766
40	NC_006663	TTTC	2	8	10780	10787	0 %	75 %	0 %	25 %	57854766
41	NC_006663	TTAT	2	8	10813	10820	25 %	75 %	0 %	0 %	57854767
42	NC_006663	TTCA	2	8	10833	10840	25 %	50 %	0 %	25 %	57854767
43	NC_006663	CTTT	2	8	10970	10977	0 %	75 %	0 %	25 %	57854767
44	NC_006663	CATT	2	8	11813	11820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_006663	CGTA	2	8	12138	12145	25 %	25 %	25 %	25 %	57854768
46	NC_006663	ATAA	2	8	12315	12322	75 %	25 %	0 %	0 %	57854768
47	NC_006663	AAAT	2	8	12342	12349	75 %	25 %	0 %	0 %	57854768
48	NC_006663	TAAA	2	8	12744	12751	75 %	25 %	0 %	0 %	57854769
49	NC_006663	CACT	2	8	14541	14548	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_006663	TACT	2	8	15093	15100	25 %	50 %	0 %	25 %	57854771
51	NC_006663	CTAT	2	8	15144	15151	25 %	50 %	0 %	25 %	57854771
52	NC_006663	ATTT	2	8	15175	15182	25 %	75 %	0 %	0 %	57854771
53	NC_006663	ACAT	2	8	15983	15990	50 %	25 %	0 %	25 %	57854772
54	NC_006663	AAGA	2	8	16217	16224	75 %	0 %	25 %	0 %	57854772
55	NC_006663	ACAT	2	8	16655	16662	50 %	25 %	0 %	25 %	57854773
56	NC_006663	AAGA	2	8	16889	16896	75 %	0 %	25 %	0 %	57854773
57	NC_006663	ATCA	2	8	17551	17558	50 %	25 %	0 %	25 %	57854774
58	NC_006663	TATC	2	8	17994	18001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_006663	AGTT	2	8	18377	18384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006663	TAGT	2	8	18406	18413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006663	TTCT	2	8	18661	18668	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_006663	TTCT	2	8	18909	18916	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_006663	TCCA	2	8	18990	18997	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_006663	AATA	2	8	19078	19085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006663	AGAC	2	8	19171	19178	50 %	0 %	25 %	25 %	57854775
66	NC_006663	TGAC	2	8	19224	19231	25 %	25 %	25 %	25 %	57854775
67	NC_006663	ATAA	2	8	19590	19597	75 %	25 %	0 %	0 %	57854775
68	NC_006663	GTAA	2	8	20347	20354	50 %	25 %	25 %	0 %	57854776
69	NC_006663	AATT	2	8	20751	20758	50 %	50 %	0 %	0 %	57854776
70	NC_006663	AACC	2	8	20921	20928	50 %	0 %	0 %	50 %	57854776
71	NC_006663	CTGG	2	8	21017	21024	0 %	25 %	50 %	25 %	57854776
72	NC_006663	CATT	2	8	21031	21038	25 %	50 %	0 %	25 %	57854776
73	NC_006663	TTTA	2	8	21071	21078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006663	ATAA	2	8	21705	21712	75 %	25 %	0 %	0 %	57854745
75	NC_006663	CAAC	2	8	22624	22631	50 %	0 %	0 %	50 %	57854747
76	NC_006663	TTCT	2	8	22772	22779	0 %	75 %	0 %	25 %	57854748
77	NC_006663	AACG	2	8	24125	24132	50 %	0 %	25 %	25 %	57854750
78	NC_006663	TTTA	2	8	24530	24537	25 %	75 %	0 %	0 %	57854751
79	NC_006663	TAAA	2	8	24684	24691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006663	ACAT	2	8	25204	25211	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_006663	AAGA	2	8	25438	25445	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006663	TGCT	2	8	25759	25766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_006663	TAAA	2	8	26054	26061	75 %	25 %	0 %	0 %	57854752
84	NC_006663	CTTG	2	8	26971	26978	0 %	50 %	25 %	25 %	57854752

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.