MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus epidermidis RP62A plasmid pSERP

Total Repeats: 380

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006663	GAA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854753
2	NC_006663	TAA	2	6	134	139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854753
3	NC_006663	ATA	2	6	175	180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854753
4	NC_006663	ATG	2	6	196	201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57854753
5	NC_006663	ATA	2	6	295	300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854753
6	NC_006663	ATG	2	6	319	324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57854753
7	NC_006663	AAT	2	6	329	334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854753
8	NC_006663	ACT	2	6	338	343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854753
9	NC_006663	CAA	2	6	459	464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57854753
10	NC_006663	TAA	2	6	482	487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854753
11	NC_006663	AGA	3	9	515	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854753
12	NC_006663	ATT	2	6	535	540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854753
13	NC_006663	CGA	2	6	553	558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57854753
14	NC_006663	ATA	2	6	559	564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854753
15	NC_006663	AAG	2	6	583	588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854753
16	NC_006663	GAA	2	6	600	605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854753
17	NC_006663	ACA	2	6	623	628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57854753
18	NC_006663	TAA	2	6	709	714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854753
19	NC_006663	AAG	2	6	715	720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854753
20	NC_006663	GAA	2	6	732	737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854753
21	NC_006663	ATA	2	6	757	762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854753
22	NC_006663	AGG	2	6	763	768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57854753
23	NC_006663	ACC	2	6	773	778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57854753
24	NC_006663	TTC	2	6	801	806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57854753
25	NC_006663	ATC	2	6	889	894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_006663	TAT	2	6	895	900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006663	TAG	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006663	TAA	2	6	989	994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854754
29	NC_006663	ATT	2	6	1196	1201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854754
30	NC_006663	TGC	2	6	1210	1215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57854754
31	NC_006663	TCA	2	6	1403	1408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854754
32	NC_006663	TAA	2	6	1421	1426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854754
33	NC_006663	TTC	2	6	1442	1447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57854754
34	NC_006663	ATG	2	6	1501	1506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57854754
35	NC_006663	TAG	2	6	1571	1576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57854754
36	NC_006663	AGA	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006663	CAT	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854755
38	NC_006663	TAT	2	6	1929	1934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854755
39	NC_006663	AGC	2	6	2017	2022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57854755
40	NC_006663	GTT	2	6	2121	2126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57854755
41	NC_006663	CCA	2	6	2141	2146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57854755
42	NC_006663	TAT	2	6	2175	2180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854755
43	NC_006663	ATC	2	6	2269	2274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854755
44	NC_006663	TTA	2	6	2303	2308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854755
45	NC_006663	TAA	2	6	2584	2589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006663	TAT	2	6	2621	2626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006663	AAT	2	6	2628	2633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006663	AAG	2	6	2637	2642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006663	TAA	2	6	2664	2669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854756
50	NC_006663	GTA	2	6	2675	2680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57854756
51	NC_006663	TAA	2	6	2830	2835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854756
52	NC_006663	AAT	2	6	2840	2845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854756
53	NC_006663	ACC	2	6	2897	2902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57854756
54	NC_006663	ATA	2	6	2958	2963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854756
55	NC_006663	TTA	2	6	2991	2996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854756
56	NC_006663	TTA	2	6	3023	3028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854756
57	NC_006663	TCT	2	6	3306	3311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57854756
58	NC_006663	TAA	2	6	3400	3405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854756
59	NC_006663	TAT	2	6	3442	3447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854756
60	NC_006663	AGA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854756
61	NC_006663	AAG	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854756
62	NC_006663	GAA	2	6	3754	3759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854756
63	NC_006663	CAT	2	6	3854	3859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854756
64	NC_006663	ATG	2	6	4130	4135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57854756
65	NC_006663	TCT	2	6	4178	4183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57854756
66	NC_006663	ATT	2	6	4186	4191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854756
67	NC_006663	TAA	2	6	4258	4263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854756
68	NC_006663	GGT	2	6	4266	4271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57854756
69	NC_006663	TAT	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854756
70	NC_006663	AAG	2	6	4510	4515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854757
71	NC_006663	TCA	2	6	4605	4610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854757
72	NC_006663	AGA	2	6	4619	4624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854757
73	NC_006663	TAA	2	6	4658	4663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854757
74	NC_006663	GAA	2	6	4713	4718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854757
75	NC_006663	GAA	2	6	4737	4742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854757
76	NC_006663	ATA	2	6	4798	4803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006663	TTA	2	6	4827	4832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006663	TAA	2	6	4845	4850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006663	TTA	2	6	4864	4869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006663	CAA	2	6	4964	4969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006663	AGG	2	6	5094	5099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57854758
82	NC_006663	TTG	2	6	5214	5219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57854758
83	NC_006663	GGA	2	6	5251	5256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57854758
84	NC_006663	AGA	2	6	5311	5316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854758
85	NC_006663	ATT	3	9	5353	5361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854758
86	NC_006663	GCA	2	6	5372	5377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57854758
87	NC_006663	ATC	2	6	5413	5418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854758
88	NC_006663	GCA	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57854758
89	NC_006663	CTA	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_006663	AAT	2	6	5656	5661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006663	ATA	2	6	5743	5748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006663	TAA	3	9	5768	5776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006663	ATA	2	6	5816	5821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006663	TCA	2	6	5853	5858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006663	TAA	2	6	5875	5880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006663	CAA	2	6	5888	5893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_006663	ATA	2	6	5991	5996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854759
98	NC_006663	TAC	2	6	6074	6079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854759
99	NC_006663	AAG	2	6	6094	6099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854759
100	NC_006663	ATT	2	6	6106	6111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006663	TAA	2	6	6201	6206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006663	TCA	2	6	6247	6252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_006663	AGA	2	6	6294	6299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006663	TCT	2	6	6353	6358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_006663	CTA	2	6	6417	6422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854760
106	NC_006663	GTG	2	6	6473	6478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57854760
107	NC_006663	TCA	2	6	6486	6491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854760
108	NC_006663	GAA	2	6	6546	6551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57854760
109	NC_006663	TTA	2	6	6567	6572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854760
110	NC_006663	TGA	2	6	6585	6590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57854760
111	NC_006663	CAT	2	6	7017	7022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854760
112	NC_006663	CTG	2	6	7166	7171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57854761
113	NC_006663	CCG	2	6	7190	7195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57854761
114	NC_006663	CGG	2	6	7209	7214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57854761
115	NC_006663	CTT	2	6	7277	7282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57854761
116	NC_006663	ATT	2	6	7354	7359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854761
117	NC_006663	TCC	2	6	7420	7425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_006663	ATA	2	6	7712	7717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854762
119	NC_006663	TTC	2	6	7778	7783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57854762
120	NC_006663	TCC	2	6	7791	7796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57854762
121	NC_006663	TCT	2	6	7998	8003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57854762
122	NC_006663	CAT	2	6	8233	8238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854762
123	NC_006663	CAT	2	6	8291	8296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854762
124	NC_006663	CAT	2	6	8314	8319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854762
125	NC_006663	GGT	2	6	8321	8326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57854762
126	NC_006663	CCA	2	6	8377	8382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57854762
127	NC_006663	TAT	2	6	8484	8489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006663	AAG	2	6	8526	8531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006663	GTT	2	6	8611	8616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57854763
130	NC_006663	TCT	2	6	8816	8821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57854763
131	NC_006663	GTA	2	6	8884	8889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57854763
132	NC_006663	CCT	2	6	8937	8942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57854763
133	NC_006663	AAT	2	6	9298	9303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854764
134	NC_006663	CAG	2	6	9456	9461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57854764
135	NC_006663	TAA	2	6	9527	9532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57854764
136	NC_006663	GCA	2	6	9561	9566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57854764
137	NC_006663	ATC	2	6	9567	9572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854764
138	NC_006663	TTA	2	6	9665	9670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854764
139	NC_006663	ATC	2	6	9738	9743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854764
140	NC_006663	TTC	2	6	9771	9776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57854764
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142	NC_006663	TCC	2	6	9796	9801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57854764
143	NC_006663	CAT	2	6	9810	9815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854764
144	NC_006663	TAT	2	6	9816	9821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854764
145	NC_006663	TCA	2	6	9844	9849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854764
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159	NC_006663	CTA	2	6	10582	10587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57854766
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162	NC_006663	CTC	2	6	10797	10802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57854767
163	NC_006663	ATT	2	6	10995	11000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854767
164	NC_006663	ATT	2	6	11317	11322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57854767
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171	NC_006663	CTG	2	6	11665	11670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_006663	CTG	2	6	11772	11777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_006663	ATG	2	6	12002	12007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_006663	TAT	2	6	18517	18522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_006663	ATT	2	6	18532	18537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_006663	CAA	2	6	18583	18588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_006663	AAT	2	6	18602	18607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_006663	TAA	2	6	18680	18685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_006663	AAT	2	6	18707	18712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_006663	AAT	2	6	18727	18732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_006663	ATC	2	6	18743	18748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_006663	TCA	2	6	19013	19018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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260	NC_006663	AGA	2	6	19056	19061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_006663	ATA	2	6	19099	19104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_006663	AAC	2	6	19190	19195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57854775
263	NC_006663	AAC	2	6	19316	19321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57854775
264	NC_006663	TCT	2	6	19407	19412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57854775
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.