MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae NTUH-K2044 plasmid pK2044

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006625	TGTCAG	2	12	3896	3907	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	168998572
2	NC_006625	ACTTAT	2	12	8590	8601	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	168998578
3	NC_006625	TATATT	2	12	12352	12363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	168998584
4	NC_006625	CTTTGA	2	12	14427	14438	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	168998586
5	NC_006625	AATTAA	2	12	15517	15528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	168998586
6	NC_006625	CAGCTC	2	12	19174	19185	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	168998588
7	NC_006625	ATCGCC	2	12	19530	19541	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	168998588
8	NC_006625	ATGCTC	2	12	22016	22027	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	168998589
9	NC_006625	ACCTCC	2	12	23499	23510	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	168998590
10	NC_006625	TTCATA	2	12	25237	25248	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	168998593
11	NC_006625	GTTATC	2	12	27270	27281	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	168998595
12	NC_006625	AGGCAA	2	12	30396	30407	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	168998599
13	NC_006625	TCCGGC	2	12	38885	38896	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	168998615
14	NC_006625	CATCAG	2	12	40144	40155	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	168998615
15	NC_006625	ATGCTG	2	12	47243	47254	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_006625	GGTGAT	2	12	50135	50146	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	168998627
17	NC_006625	TTCGAT	2	12	50342	50353	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	168998627
18	NC_006625	CTCTGA	2	12	58148	58159	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	168998636
19	NC_006625	ATAACG	2	12	59771	59782	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	168998638
20	NC_006625	ATCAAC	2	12	65752	65763	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	168998643
21	NC_006625	GCTTGC	2	12	67106	67117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	168998646
22	NC_006625	AATCAT	2	12	71237	71248	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	168998653
23	NC_006625	TCAGGC	2	12	87630	87641	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	168998673
24	NC_006625	CGGCAA	2	12	91526	91537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	168998678
25	NC_006625	TAGGTG	2	12	91726	91737	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	168998678
26	NC_006625	TTCATT	2	12	91768	91779	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	168998678
27	NC_006625	TTGATG	2	12	94238	94249	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	168998682
28	NC_006625	CCGTGG	2	12	94263	94274	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	168998682
29	NC_006625	GACTGA	2	12	95333	95344	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	168998683
30	NC_006625	CCCACC	2	12	95473	95484	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	168998683
31	NC_006625	TTCAGG	2	12	97543	97554	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	168998685
32	NC_006625	GATATC	2	12	98513	98524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	168998685
33	NC_006625	ACATAC	2	12	100413	100424	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	168998685
34	NC_006625	TCCATA	2	12	101782	101793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	168998686
35	NC_006625	TAATTT	2	12	103872	103883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	168998688
36	NC_006625	GATTGC	2	12	105315	105326	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	168998690
37	NC_006625	AATCAT	2	12	115850	115861	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	168998699
38	NC_006625	AGATGA	3	18	116482	116499	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	168998700
39	NC_006625	GGATGA	3	18	116506	116523	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	168998700
40	NC_006625	TGTTGC	2	12	120474	120485	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	168998707
41	NC_006625	CAGCTG	2	12	122467	122478	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	168998710
42	NC_006625	TATTCA	2	12	124418	124429	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	168998715
43	NC_006625	GTACTG	2	12	129046	129057	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	168998720
44	NC_006625	GCTGAT	2	12	134203	134214	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	168998727
45	NC_006625	TCCGGT	2	12	135198	135209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	168998728
46	NC_006625	CGCAAG	2	12	137703	137714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	168998732
47	NC_006625	CAGGGT	2	12	151307	151318	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	168998750
48	NC_006625	CAAACG	2	12	153752	153763	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	168998752
49	NC_006625	GATCCC	2	12	156279	156290	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	168998755
50	NC_006625	GGCCTG	2	12	156961	156972	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	168998757
51	NC_006625	CGGCAG	2	12	160650	160661	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	168998761
52	NC_006625	CTCCTG	2	12	161481	161492	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	168998763
53	NC_006625	TTCCAT	2	12	162540	162551	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	168998766
54	NC_006625	CATCAA	2	12	164217	164228	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	168998767
55	NC_006625	CGGCAT	2	12	165084	165095	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	168998768
56	NC_006625	GCGGTG	2	12	167710	167721	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	168998770
57	NC_006625	AACCTG	2	12	174938	174949	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	168998778
58	NC_006625	TTTTCC	2	12	176735	176746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	168998779
59	NC_006625	GCCAGC	2	12	187423	187434	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	168998794
60	NC_006625	CGGTGT	2	12	190087	190098	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	168998794
61	NC_006625	CAAACA	2	12	203983	203994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006625	GTTCAT	2	12	207642	207653	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_006625	GCACCG	2	12	207733	207744	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	168998818
64	NC_006625	TAATCT	2	12	209548	209559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_006625	ACCACT	2	12	213760	213771	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	168998824
66	NC_006625	CTGCCA	2	12	214299	214310	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	168998824
67	NC_006625	AATCAA	2	12	220105	220116	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_006625	TGGGTG	2	12	222051	222062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	168998833

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.