MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae NTUH-K2044 plasmid pK2044

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006625	CGGTA	2	10	3770	3779	20 %	20 %	40 %	20 %	168998572
2	NC_006625	TAACA	2	10	4989	4998	60 %	20 %	0 %	20 %	168998573
3	NC_006625	GATCA	2	10	5249	5258	40 %	20 %	20 %	20 %	168998574
4	NC_006625	GCAAA	2	10	5291	5300	60 %	0 %	20 %	20 %	168998574
5	NC_006625	CGAGG	2	10	8379	8388	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_006625	CCTTA	2	10	9676	9685	20 %	40 %	0 %	40 %	168998581
7	NC_006625	GGGGA	2	10	11342	11351	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006625	TCCTT	2	10	13468	13477	0 %	60 %	0 %	40 %	168998585
9	NC_006625	ACTCC	2	10	14689	14698	20 %	20 %	0 %	60 %	168998586
10	NC_006625	CTTAA	2	10	15860	15869	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_006625	GTCAA	2	10	16294	16303	40 %	20 %	20 %	20 %	168998587
12	NC_006625	GCGCC	2	10	16334	16343	0 %	0 %	40 %	60 %	168998587
13	NC_006625	CAGCC	2	10	18045	18054	20 %	0 %	20 %	60 %	168998588
14	NC_006625	CCACG	2	10	19341	19350	20 %	0 %	20 %	60 %	168998588
15	NC_006625	CCGTC	2	10	20285	20294	0 %	20 %	20 %	60 %	168998588
16	NC_006625	TCCTT	2	10	23538	23547	0 %	60 %	0 %	40 %	168998591
17	NC_006625	TCAGT	2	10	26083	26092	20 %	40 %	20 %	20 %	168998594
18	NC_006625	GGTGC	2	10	27688	27697	0 %	20 %	60 %	20 %	168998595
19	NC_006625	GTACA	2	10	28645	28654	40 %	20 %	20 %	20 %	168998595
20	NC_006625	TCCAG	2	10	29057	29066	20 %	20 %	20 %	40 %	168998595
21	NC_006625	TTTTA	2	10	33420	33429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006625	CTGAG	2	10	34722	34731	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_006625	ACCAG	2	10	37359	37368	40 %	0 %	20 %	40 %	168998610
24	NC_006625	ACCGA	2	10	37602	37611	40 %	0 %	20 %	40 %	168998610
25	NC_006625	CAACG	2	10	39454	39463	40 %	0 %	20 %	40 %	168998615
26	NC_006625	CACTG	2	10	39715	39724	20 %	20 %	20 %	40 %	168998615
27	NC_006625	TCACG	2	10	41193	41202	20 %	20 %	20 %	40 %	168998616
28	NC_006625	TTTGG	2	10	41684	41693	0 %	60 %	40 %	0 %	168998616
29	NC_006625	ATTTG	2	10	43584	43593	20 %	60 %	20 %	0 %	168998618
30	NC_006625	ATAAC	2	10	45020	45029	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_006625	GGACA	2	10	45825	45834	40 %	0 %	40 %	20 %	168998620
32	NC_006625	GGCCG	2	10	46172	46181	0 %	0 %	60 %	40 %	168998621
33	NC_006625	GCAGG	2	10	46777	46786	20 %	0 %	60 %	20 %	168998624
34	NC_006625	CGTTG	2	10	47952	47961	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_006625	TGGAA	2	10	50722	50731	40 %	20 %	40 %	0 %	168998627
36	NC_006625	AGCAA	2	10	53561	53570	60 %	0 %	20 %	20 %	168998630
37	NC_006625	ATTTT	2	10	56278	56287	20 %	80 %	0 %	0 %	168998634
38	NC_006625	GTTAT	2	10	57218	57227	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006625	ATCAG	2	10	57728	57737	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_006625	TAACA	2	10	59255	59264	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_006625	CGTAT	2	10	60969	60978	20 %	40 %	20 %	20 %	168998639
42	NC_006625	TCGAT	2	10	62051	62060	20 %	40 %	20 %	20 %	168998640
43	NC_006625	TTCCT	2	10	62347	62356	0 %	60 %	0 %	40 %	168998640
44	NC_006625	CAGTC	2	10	62614	62623	20 %	20 %	20 %	40 %	168998641
45	NC_006625	CTTGT	2	10	63856	63865	0 %	60 %	20 %	20 %	168998642
46	NC_006625	GCGGT	2	10	64591	64600	0 %	20 %	60 %	20 %	168998642
47	NC_006625	CCAGT	2	10	65822	65831	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_006625	GACGC	2	10	66012	66021	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_006625	TCCCT	2	10	69606	69615	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
50	NC_006625	CCTGC	2	10	70078	70087	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_006625	TGAAG	2	10	70369	70378	40 %	20 %	40 %	0 %	168998652
52	NC_006625	ATAGC	2	10	70679	70688	40 %	20 %	20 %	20 %	168998652
53	NC_006625	ATAAG	2	10	71222	71231	60 %	20 %	20 %	0 %	168998653
54	NC_006625	ATGTT	2	10	71265	71274	20 %	60 %	20 %	0 %	168998653
55	NC_006625	GTTTT	2	10	72154	72163	0 %	80 %	20 %	0 %	168998655
56	NC_006625	GACTG	2	10	72566	72575	20 %	20 %	40 %	20 %	168998655
57	NC_006625	CTTCT	2	10	75806	75815	0 %	60 %	0 %	40 %	168998663
58	NC_006625	GATCA	2	10	76585	76594	40 %	20 %	20 %	20 %	168998665
59	NC_006625	GCAAA	2	10	76627	76636	60 %	0 %	20 %	20 %	168998665
60	NC_006625	CGTCT	2	10	78443	78452	0 %	40 %	20 %	40 %	168998667
61	NC_006625	CGATG	2	10	80140	80149	20 %	20 %	40 %	20 %	168998667
62	NC_006625	CAGCG	2	10	83645	83654	20 %	0 %	40 %	40 %	168998670
63	NC_006625	AGACC	2	10	87126	87135	40 %	0 %	20 %	40 %	168998673
64	NC_006625	CATCG	2	10	87433	87442	20 %	20 %	20 %	40 %	168998673
65	NC_006625	TTCCC	2	10	88519	88528	0 %	40 %	0 %	60 %	168998675
66	NC_006625	AGTTA	2	10	88650	88659	40 %	40 %	20 %	0 %	168998675
67	NC_006625	GGTCA	2	10	92319	92328	20 %	20 %	40 %	20 %	168998678
68	NC_006625	TAAAT	2	10	92520	92529	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006625	AATGA	2	10	92549	92558	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006625	CGTAT	2	10	93660	93669	20 %	40 %	20 %	20 %	168998681
71	NC_006625	ACGCA	2	10	94476	94485	40 %	0 %	20 %	40 %	168998683
72	NC_006625	GACAG	2	10	96504	96513	40 %	0 %	40 %	20 %	168998683
73	NC_006625	ATTCG	2	10	97025	97034	20 %	40 %	20 %	20 %	168998684
74	NC_006625	CGTCG	2	10	98609	98618	0 %	20 %	40 %	40 %	168998685
75	NC_006625	CTGTC	2	10	98740	98749	0 %	40 %	20 %	40 %	168998685
76	NC_006625	AGCTC	2	10	105049	105058	20 %	20 %	20 %	40 %	168998690
77	NC_006625	TTATC	2	10	106175	106184	20 %	60 %	0 %	20 %	168998690
78	NC_006625	AATCC	2	10	107219	107228	40 %	20 %	0 %	40 %	168998692
79	NC_006625	AATTT	2	10	107544	107553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006625	CATGC	2	10	107664	107673	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_006625	TGATA	2	10	107946	107955	40 %	40 %	20 %	0 %	168998693
82	NC_006625	ACCCA	2	10	108468	108477	40 %	0 %	0 %	60 %	168998693
83	NC_006625	CCCTG	2	10	110603	110612	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_006625	TGGAA	2	10	111049	111058	40 %	20 %	40 %	0 %	168998695
85	NC_006625	GCAGC	2	10	112090	112099	20 %	0 %	40 %	40 %	168998697
86	NC_006625	AACCA	2	10	115980	115989	60 %	0 %	0 %	40 %	168998699
87	NC_006625	AAATT	2	10	116018	116027	60 %	40 %	0 %	0 %	168998699
88	NC_006625	TTCAT	2	10	116978	116987	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_006625	TGGAC	2	10	117196	117205	20 %	20 %	40 %	20 %	168998702
90	NC_006625	GGCGA	2	10	117288	117297	20 %	0 %	60 %	20 %	168998702
91	NC_006625	GATGA	2	10	119875	119884	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006625	CGAGT	2	10	120353	120362	20 %	20 %	40 %	20 %	168998706
93	NC_006625	ACCTG	2	10	121635	121644	20 %	20 %	20 %	40 %	168998709
94	NC_006625	GATCT	2	10	123882	123891	20 %	40 %	20 %	20 %	168998713
95	NC_006625	GCAGA	2	10	124313	124322	40 %	0 %	40 %	20 %	168998714
96	NC_006625	ATGAC	2	10	125008	125017	40 %	20 %	20 %	20 %	168998715
97	NC_006625	GCACT	2	10	125068	125077	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_006625	GACTG	2	10	125433	125442	20 %	20 %	40 %	20 %	168998717
99	NC_006625	CCGCC	2	10	126976	126985	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
100	NC_006625	CTTCT	2	10	128235	128244	0 %	60 %	0 %	40 %	168998720
101	NC_006625	TTGTC	2	10	129086	129095	0 %	60 %	20 %	20 %	168998720
102	NC_006625	CGCTG	2	10	134436	134445	0 %	20 %	40 %	40 %	168998728
103	NC_006625	GCCGG	2	10	134983	134992	0 %	0 %	60 %	40 %	168998728
104	NC_006625	GCTCT	2	10	135091	135100	0 %	40 %	20 %	40 %	168998728
105	NC_006625	GCAAA	2	10	135606	135615	60 %	0 %	20 %	20 %	168998728
106	NC_006625	ATGGA	2	10	136766	136775	40 %	20 %	40 %	0 %	168998730
107	NC_006625	TGCAA	2	10	138853	138862	40 %	20 %	20 %	20 %	168998733
108	NC_006625	ATACG	2	10	139387	139396	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_006625	AAAGA	2	10	141406	141415	80 %	0 %	20 %	0 %	168998738
110	NC_006625	TGTCC	2	10	142150	142159	0 %	40 %	20 %	40 %	168998740
111	NC_006625	ACCCA	2	10	142643	142652	40 %	0 %	0 %	60 %	168998740
112	NC_006625	CAGAC	2	10	142979	142988	40 %	0 %	20 %	40 %	168998740
113	NC_006625	TAAAT	2	10	143399	143408	60 %	40 %	0 %	0 %	168998742
114	NC_006625	TTTGC	2	10	144609	144618	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_006625	TGATC	2	10	144651	144660	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_006625	CACAG	2	10	144863	144872	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_006625	ATGAC	2	10	147614	147623	40 %	20 %	20 %	20 %	168998745
118	NC_006625	AGCGC	2	10	151264	151273	20 %	0 %	40 %	40 %	168998750
119	NC_006625	AGCCG	2	10	152506	152515	20 %	0 %	40 %	40 %	168998751
120	NC_006625	GCACG	2	10	154218	154227	20 %	0 %	40 %	40 %	168998753
121	NC_006625	CGCTA	2	10	159801	159810	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_006625	GGCCT	2	10	159926	159935	0 %	20 %	40 %	40 %	168998760
123	NC_006625	CGAAG	2	10	160629	160638	40 %	0 %	40 %	20 %	168998761
124	NC_006625	AACAT	2	10	161230	161239	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_006625	ACGCA	2	10	161424	161433	40 %	0 %	20 %	40 %	168998763
126	NC_006625	GCTCA	2	10	161777	161786	20 %	20 %	20 %	40 %	168998764
127	NC_006625	GTCAG	2	10	163123	163132	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_006625	ACTTT	2	10	165267	165276	20 %	60 %	0 %	20 %	168998768
129	NC_006625	GCGCC	2	10	168067	168076	0 %	0 %	40 %	60 %	168998770
130	NC_006625	TCATA	2	10	169693	169702	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_006625	AATAA	2	10	169959	169968	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006625	TTTAT	2	10	169999	170008	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006625	TTCAT	2	10	170117	170126	20 %	60 %	0 %	20 %	168998773
134	NC_006625	AAGAT	2	10	173601	173610	60 %	20 %	20 %	0 %	168998776
135	NC_006625	GTTCA	2	10	174121	174130	20 %	40 %	20 %	20 %	168998777
136	NC_006625	CCTGA	2	10	175855	175864	20 %	20 %	20 %	40 %	168998779
137	NC_006625	ATGAT	2	10	177056	177065	40 %	40 %	20 %	0 %	168998780
138	NC_006625	CTGGG	2	10	181187	181196	0 %	20 %	60 %	20 %	168998786
139	NC_006625	AAACC	2	10	181695	181704	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_006625	CTGTC	2	10	182490	182499	0 %	40 %	20 %	40 %	168998787
141	NC_006625	GATCA	2	10	184445	184454	40 %	20 %	20 %	20 %	168998789
142	NC_006625	GCAAA	2	10	184487	184496	60 %	0 %	20 %	20 %	168998789
143	NC_006625	CGCTG	2	10	184743	184752	0 %	20 %	40 %	40 %	168998789
144	NC_006625	GAAGC	2	10	185632	185641	40 %	0 %	40 %	20 %	168998791
145	NC_006625	TAACG	2	10	188429	188438	40 %	20 %	20 %	20 %	168998794
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147	NC_006625	ACAGC	2	10	193995	194004	40 %	0 %	20 %	40 %	168998798
148	NC_006625	TTCTT	2	10	194005	194014	0 %	80 %	0 %	20 %	168998798
149	NC_006625	AAAAC	2	10	194182	194191	80 %	0 %	0 %	20 %	168998798
150	NC_006625	TTTTA	2	10	194590	194599	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_006625	TTTCG	2	10	194885	194894	0 %	60 %	20 %	20 %	168998799
152	NC_006625	GGGCT	2	10	195812	195821	0 %	20 %	60 %	20 %	168998801
153	NC_006625	ACAGA	2	10	195824	195833	60 %	0 %	20 %	20 %	168998801
154	NC_006625	CGCAG	2	10	201597	201606	20 %	0 %	40 %	40 %	168998807
155	NC_006625	CGTCC	2	10	202461	202470	0 %	20 %	20 %	60 %	168998810
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158	NC_006625	TAATC	2	10	203800	203809	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_006625	AGAAA	2	10	204309	204318	80 %	0 %	20 %	0 %	168998813
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161	NC_006625	CAGCG	2	10	207400	207409	20 %	0 %	40 %	40 %	168998817
162	NC_006625	ATTCT	2	10	208111	208120	20 %	60 %	0 %	20 %	168998818
163	NC_006625	TTCTT	2	10	209503	209512	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
164	NC_006625	CCAGC	2	10	210246	210255	20 %	0 %	20 %	60 %	168998822
165	NC_006625	CGCAG	2	10	214775	214784	20 %	0 %	40 %	40 %	168998824
166	NC_006625	TGCGG	2	10	215751	215760	0 %	20 %	60 %	20 %	168998825
167	NC_006625	GGGAA	2	10	218211	218220	40 %	0 %	60 %	0 %	168998827
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169	NC_006625	CCAGA	2	10	219411	219420	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
170	NC_006625	TGTGG	2	10	219845	219854	0 %	40 %	60 %	0 %	168998829
171	NC_006625	TAGAA	2	10	220707	220716	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_006625	TTGGC	2	10	220890	220899	0 %	40 %	40 %	20 %	168998831
173	NC_006625	AGTGA	2	10	221421	221430	40 %	20 %	40 %	0 %	168998832
174	NC_006625	CCAAT	2	10	222498	222507	40 %	20 %	0 %	40 %	168998835
175	NC_006625	GTCAT	2	10	222771	222780	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
176	NC_006625	ATTTT	2	10	223140	223149	20 %	80 %	0 %	0 %	168998836

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.